BGIOSGA027954
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA027954 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:J033050O03, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA027954, complete gene. |
| LocusTag |
' |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA027954-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA027954-PA |
| Length |
8441 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:2171084..2179524 |
| Sequence Coding Region |
2171084..2171096,2171191..2171282,2172630..2172803,2172890..2172963,2173553..2173633 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:2171084..2179524 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:2171084..2179524 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTACGGCGGCGATGAGGTCTCGGCCATCGTCATCGACGTGGGGTCCTACAGCTGCAAGGCGGGGTACGCCGGTGATGACACCCCCAAGGCCGTCTTCCCCTCGGTTGTTGGTTCAATTGAGCAAACGGGAGAAACTGATGAAGCAAAGGCAGACAAGGAGGCTGAAGCTGCATCAGATTCTAAGAATGGAGCCAAACCTATGGATGTGGACAAAGCCAAGACAAAGCGCAAATTGTATGTTGGTCAAGAATTGGAGTTCAGGAGGGATCATATGGAGGTGATTTCACCAATGAAAGATGGAACAGTTACTGATTGGGATATTGTTGACAATATATGGAATCATGCTTTCAGGCAGCGGCTATTGATCAATCCTGAGGAGCATCCTATGTTGATAGCTGAACCATCTACAAACACAGGGCAGCAAAGAGAGAAAGCAGCAGAACTTATGTTTGAGAAGTACAAAGTGCCGGCACTGTTCCTAGCGAAAAATGCAGTTCTCACATCTTTTGCATCTGGACGTGCTACATCGTTGGTAGTTGACAGCGGTGGTGGGTCTACTGTGGTTGCTGCTGTTCACGATGGTTATGTATTGCAAAAGTCTGTGGCGACTTCTCCAATTGGTGGTGAATTTTTAACTGACTGTATGATGAAAAGCTTGGAGAGCAAGGGCGTTGTTATAAGGCCCAGGTATTCATTCAAGAAGAAGGAAGTCGGCCCTGGCGAATATAAGGTTGTAGATCTTGATCTTCCAAACACAACGGAGAGTTACAAGTTATACTGCATGAGAGCTATTGCTAGTGATATCAAGGAGTCAGTTTGCAGGGTTCCAGATACTGCCTTCGATGAAGTGGCATATGCAAACGTTCCTACAACTTCATATGAGCTTCCAGATGGACAAACCATTGAAGTTGGTGCAGACAGATTCAAGATTCCTGATATTCTGTTTAATCCATCTCTTTCTCAGACTATTCCTGGAGTTGATGGATTTGCAGATTCAATGTCAGTTCGTGGCCTTCCACGAATGGTCATTGATAGTGTAAATAGGTGCGATGTTGACATTCGCAAGGAACTGCTAAGCAGTATTCTGCTTTCAGGTGGTTCATCATCAATTCTGCAGTTGAAGGAGAGGCTAGAAAAAGAAGTACTTGAGGAATCTTCTGGTAATACTCGTGTAAAGGTTTTGGCAAGTGGAAATTCAGTAGAGAGGCGATTCAGTGTTTGGATTGGAGGGAGCATTCTAGCATCCCTTGGGTCGTTCCAGCAAATGTGGTTCTCCAAAGCAGAATACGAAGAACATGGAGTATCTTACATCCAAAGGAAGTGCCCATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MYGGDEVSAIVIDVGSYSCKAGYAGDDTPKAVFPSVVGSIEQTGETDEAKADKEAEAASDSKNGAKPMDVDKAKTKRKLYVGQELEFRRDHMEVISPMKDGTVTDWDIVDNIWNHAFRQRLLINPEEHPMLIAEPSTNTGQQREKAAELMFEKYKVPALFLAKNAVLTSFASGRATSLVVDSGGGSTVVAAVHDGYVLQKSVATSPIGGEFLTDCMMKSLESKGVVIRPRYSFKKKEVGPGEYKVVDLDLPNTTESYKLYCMRAIASDIKESVCRVPDTAFDEVAYANVPTTSYELPDGQTIEVGADRFKIPDILFNPSLSQTIPGVDGFADSMSVRGLPRMVIDSVNRCDVDIRKELLSSILLSGGSSSILQLKERLEKEVLEESSGNTRVKVLASGNSVERRFSVWIGGSILASLGSFQQMWFSKAEYEEHGVSYIQRKCP</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..13#108..199#1547..1720#1807..1880#2470..2550#2929..2989#3060..3109#3901..3955#4222..4299#4380..4433#5324..5377#5467..5527#5851..5902#6740..6806#7015..7074#7168..7230#7374..7436#7959..8023#8242..8310#8396..8441#ATGTACGGCGGCGGTAAGTTCCCCCCTCTCTCGCCCCCGTCCATCCCCGAGCTAAACCCTAAACCCTAGAGATCTGTGGCACTGGCGCTGCTTGGTTTTTTTCGCAGATGAGGTCTCGGCCATCGTCATCGACGTGGGGTCCTACAGCTGCAAGGCGGGGTACGCCGGTGATGACACCCCCAAGGCCGTCTTCCCCTCGGTGAGGCAGAATGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCCCCTCCTGGGTTGGCTCGCTGTAATTCTGTCTCGGAGTTGGAACTGTGTGGTCCGTGTTTTGTTGGTGAGAGTTCGTGCGGGTGGTGTCATGGAAATGATAGGGCTCTGTGCGCAATGCAATCCCACTGGCAATTTTGTGTGTTTTCTCCCCATAATTTTGAGCTGTTTTAGGTCGTTGACTTTGAATTCTGATTTGAAAAAAAAAAGAATGATGTGTTAGTGTGTGGCGTCATGATATACAGACATATGTTTATTATTTAGGTCAAGCTGTGAATTTTGCTGCGTGCATTAGTTCCTCCTAGGTCCCCAGCCACCTGATTAATGGTTTTATTCGAGCACTGGATCTTAGTCTGGGAACATGAATAACAGCAGTTTTTTTTTTTAAAAAAAAATGTTAGTAGCAGGCTAACTCAGATATTGGATAGTACCACAGATAAGACCTGCACTTACCTTTTGATTTTGACATATGCGTGCAAAATTATGATGTATTGACTGCATTGTTAGTTTACCTTTCAGCTTTGTCTTAGCTGCAAACCTGTGCCATTGCTCGCATAGGTAGTAGTTAGCAGTGTTGCATATGTGCACTGAGAGTCAAATGCCAAACTGAATTTTTAAAGTGCTAAAAGAATCTGCATTGTGGTTTCTGTGGAATTGCTACATGTTGGTACTAGACGTTAACTTCAAATGCTATGACAGGTGAACTTCTGGTTACTGTGTTTGTAACGGGAAGTACTTTTCTTGTGTATTATGTCAAATAGGATTGTACTCTTTCTGTCCCAAAATATAAGTATTTCTAGAGTTTTGCACGGGTATTAAGGAAGTAGGTGGAATTAAATGGGGGATATGATTTTTTTGATTGGTTGAGATGAGGAAGTAGGGGGTGAAGTTACTATATTTTGGGATGCGGTATTTTTTTTTCTTAGGTTCTACAGTATTATTTTTAAAAAAAATTTTCTTCCTTTAGTTAACAGACTTATATTGGGGTAATTTGAATTCTTGGAGTAGATTGCTAATTTCTCTTTGTTGCTGAGGAAGTGAGAAAACATATAATTTAGTGACATATAGCAAAACAATCAGCTGTAAGGTACTAAAAAGTGGTGTGTGAATCACACAGAAAAAGTGTTTTTGAGTTTCACTATTTGATGTCGCTGCTAATAGATTAGCATATTTTCTTCTCCTTTTTCTACATAACGTGGCAGTAGTTGCAAGATATGTCATTGGTTCATGGGATTATGCATCTGAGCTACCTAATGGTTAATTTGGTTTTAGAAGTTCTTACTGTGGTTGGTGCACATTCTGTTGTGTTAAGGTTGTTGGTTCAATTGAGCAAACGGGAGAAACTGATGAAGCAAAGGCAGACAAGGAGGCTGAAGCTGCATCAGATTCTAAGAATGGAGCCAAACCTATGGATGTGGACAAAGCCAAGACAAAGCGCAAATTGTATGTTGGTCAAGAATTGGAGTTCAGGAGGGATCATATGGAGGTTAGTTTATGCAGATTCTCAAGTATCAATATTGATGCTCATGATTTTGTTAACTATTGTTTACTGATTCTCTTCCTACCCAATAGGTGATTTCACCAATGAAAGATGGAACAGTTACTGATTGGGATATTGTTGACAATATATGGAATCATGCTTTCAGGTGAGTTTAACTATCTATTTGATGTAGATCTGAGTAATGTCGTGCCAAAAGTGCGCGCTGAAAGAGCTGGCCACACTTGTGGCAAAACTTGACTAGAAAATAAATATCTGACATGCGGGGCACTTGAGTAACAAGGTTTGGCACATTGCTTGTGTGGTTTGCCAAACACTTGCCAGTTGCTGCAAAAGGCCAAACATGCCTTCCTTGATTCTGGGGAAGTTTGGGATGAACCATACTCTCTATTTAACATAGTTTGCTTAGAATCTGCAACAAAGTTCATCTTCTAGGCCTCTAGGGCATCTTTTGGATGTCAACATGGTTACTGCTTTATGCCATTGCCCACCATCTTTTTACCTTACATATTAATATTGTGCTTTTCAAATATACTGATAGTGAAATTCCTTCTTACGTGTACAAACTGGATAAGGCTTTCCTTCTTGGGTTATTTACTTTTATTGGATTCTGTGGCATCTCTATTAGCTAACATTGATTAAATACTAGGATTTCCTCTATATGGTGTGGATATGCAACTATTGAAGTTTCTGCTTTGTTAGCTTTTATCTTCACACTGACTTGCTCTACATTTCAGGCAGCGGCTATTGATCAATCCTGAGGAGCATCCTATGTTGATAGCTGAACCATCTACAAACACAGGGCAGCAAAGAGAGAAGTATGCCTATATGTTCTGTATTTAAATTAATTGTGTTGCTAAGTTGCGTCAAACCTGAAAAACATTGCTTGTTATATGAACTAGCTGATTTATAGCACATTTATCTTCCATGACTCTTATCAGTCATGAGAACTGTATTGGTACCAGGATTTACTGCATGCTTTTCTACTTCTCCATTTAATGTCAGAAATGTTAGTTTTTCTGTGTTTCTGTACTTCAGGAATGGACAAATATGGAATTGTTGATCACCCTGTAAAACTTATAAATACCAATAAGCACAAGCTGAGATGATATGAATCCGAGTTATATCTATTCATTGCCTATTATTTTTGTATGGTTCTATGAAAAAGACCTGACTGTTTTTCTCATGTTCCATAGAGCAGCAGAACTTATGTTTGAGAAGTACAAAGTGCCGGCACTGTTCCTAGCGAAAAATGCAGTATGTATTTGTCAAAAGTGATAATTCGTGTAATTAGTTTATTAGTTCTAATTGTTGATTTGGTTGTCAGGTTCTCACATCTTTTGCATCTGGACGTGCTACATCGTTGGTAGTTGACAGGTGAGCATGTCCTTAATTAAATTTTATTTCTGCAGCTGTAACTTACTGTCTCCTTGTAGATAAAATGTTTCATTTAGCCTTAACTTATAAACAAATGCATTATAACTTTTGAATTCTGAAATATTTTTCCACCAGTAAGTGTTAGGGCGTTAGGCACAGTGCACAAATATTGGGTGTATCTTACCTTGTCTATCCTCCTTAGAATATGATGACAAATGTCCATGGAAGTAGAAAATGGCTGTTATATCAAAGTCAATCTGTCATGCACAGTATTTCAAATATAAAACCAAACTACACATAGACAAACAAGACAAATCCTGTTGAAACTGAACTTAGAAATCAAAAAGCAATTTTTAATGACCATCTGCATCATTTTTTATGAAGGATGCACTTGCATCCAAGGGTGGAAAGCGAGAAACACTATCCTTGTCTGTTCTGTCAATCCCACTTCCCACACCATTCAAGAATCAGGACATCAATATTTTCTTTACTGGTCATCAATATTGTACTTGAGTTGATTGATGCTCTTCTTTCCCCCTTTACTGTATCATAAATTCCTAACATCATCTTGGTATAGGGTGTAAGCATAACCATCTAAATTCTTTCAGCATGTTTTAAGCCATTGTATCTGATTGTCTCAAATTTGATGCCTGACATGTCCACCGATGTCTCTATTGGACTTTAATGGTGTCAAGCATTTTATGACTTATTTCATTTTTTTTCTCATGGCTTTTGGGCTTTGTTATGAGAAACATTACTGGAATGAGACAATGTTGTCATTTTTTGTGCAGCGGTGGTGGGTCTACTGTGGTTGCTGCTGTTCACGATGGTTATGTATTGCAAAAGGTATGATCTACTATTTAATACTGATTGTCAAGGCAAAGTGCATAATGCACTACTTGCATGTGTCTAATTAGTTATTTTTACCCTTTTTATTCTCTACTTTCTCATCTGAAAACTGGGAATAAGGGAATCTTCTTTTAAGACAATAAGTTTCTTTTTCTTGTTTTACATGGACGCTTGCTCACATAACATGGACAGCACTCTCACCTTGCCTCTCAGGAAGTCTACTTTTTTTCCCCTACTTGTTGCTAACTTATTTCATGTTGCAGTCTGTGGCGACTTCTCCAATTGGTGGTGAATTTTTAACTGACTGTATGATGAAAAGCTTGGAGAGCAAGGGCGTTGTTGTAAGCATCTCTCTTGCTTAAGATAGCATACTAGTCTTCTTGTATGTTCATATCCAATTTGTTCAATGTTCAATTTGCAGATAAGGCCCAGGTATTCATTCAAGAAGAAGGAAGTCGGCCCTGGCGAATATAAGGTCTAGTTTATTTAACACTTCGTTGATATTCATATTTTTTCCCTGAGAGCTACAAAGTTGACTGTTTAAGCTTACCTTTTGGTTGAAAATCAACTATAACAATATATGCTTAGCTATTGGTATGTTCGAAATTAGTTCACTTGATAAAAAAATGAAACAGTGAAAGCAGCAAACATAAACTACAAAAATAGTTAACTACCTATGGAGTGACTTCACAGTCCACACATTGGCATTTGATTACTGGCAGAAAAGGTGGAAGATCCTGAGGGGCAGTCTGTTTTTTTGCTGACCTTGTTTTCGGCACCGAATTAAGTCTTCTCCATGCCACATCTCTCAAAATATACTTTCGTGTCCTTCCTCTGAAAGATAAATTTAATCACCAATTCCTTGTATCCCCAAGTGTGGATGACATCCAAAGCATCCAAAAAGTGAAATTAGTCAACTACTACAACACCTTTAGTCTCAAAAAAGTTGGGGTAGGCTAGAGATGAAATTCAAACTGAAGCACCCAAACCAATGTACCACTTAAAAGTGCATGCTTTTGGCACATGGATAGCTACTCTCCACAAACTCCTATCAAAACCAAATCCACACACACTGTGAGTTACCTTGAGTATGTCTATGTCTATTCGTGGAGAGGAATACTATGGTCATTATTTCTTAGCATTTATGTGGGGGCCTATTTCTTGGTGGTCAAACTCATTTAGTCTATTATTAAGGGTCTGCATTGTTGTGTTACTTGATCATGATTATGGTTCCACTTTGATACATGTGGATACCATGATTTTTGCTAATCCCCGGCTTCTACAAGATTTTGCTGCCATTACACTGTATGATTGTAAGGGAACCAACACCATATGGATTATTTGACGGCATGCTTGTCTTTTCAGGTTGTAGATCTTGATCTTCCAAACACAACGGAGAGTTACAAGTTATACTGCATGGTATTTTCATTGACAGATCATTTATTTTTGTTCTCTGTTGTTTAATTTTGTCTGAATGCCTTCAATGGTGATGCTTCATATGTTCACAGAGAGCTATTGCTAGTGATATCAAGGAGTCAGTTTGCAGGGTTCCAGATACTGCCTTCGATGGTATAATATAAACACATTTAATTTATGAATGGGGCATTTGCAAATTTGCCACCGGTTTTTTCAATTTTGCAAGGATGCCACTCGAGTGACAGTTCTAGTGGCATTTTTGCAATTTTCTAGTGGCAGTCTTGCAATAACGATTTAAAGTAGTGGTAAATTTGCAATTGTCCCTGCCGTACACGCACTAGTTGGCTATTTTTTATTATTATCTGAAGTCCTGTAACATAAATTATCTTTGTTGCAGGGACTGTTTTAACCTGTCCTTTTATGTTCTTTTTTTTTATGTTCTGCTGTTTACTTTTCCCTGTTTTATTTTCATGCAGAAGTGGCATATGCAAACGTTCCTACAACTTCATATGAGCTTCCAGATGGACAGTAAGTTGTATATCAAAATTATTTATGCGCATATTTTTTTTCCAGTAGGTTTAGTGGTTTAATTTTGTAATGGCTTATTGACGTGTTCCAATACAGTTAGATTATGAGCTACTTTTCTGCATGTGCATCTGCTGCATCTGTGCATGATACCTCAGTACACCACAATGATTGTTTATAAAATTGATATACCACAATGAAAATCAACAATATATTGACATAAAATTAATACTCCCTCCATCCCAAATTATAAGGCATATATATTTTTTACACGGTCTTCAATGACATACTTTGACCATTAATTTATTCCATGTCATCTTCCCAATGAATATGAAATTAGCATCACATGAAAGTACTTCAAAATATGAATCTGGTGATATAACATGCATAATACTTAGCATTGATATGGTTAGTATTATTATTAGTAAAAAGTTACCGAGTTTGATTTTCCTTAAAAATAAGGGCGTCCTATAATTTGGGACAGACTACAGAGGGAGTATACCACAATTTGAACTAGTTCAGTGAAATGGAAGTCAAATAGAAGGGAGAACTTGAGTGCAGCACTAAGATTTATTGTCCTTTAACCTTCCCATGTACCTTCAGCTTCTATATGTTGTGACTTTGCAGATTGGTAGGTCATCTCATGAACCCAACTTCTTTAAATTGTCATGGTCATTTGCATGTTATTTTGAGAGTGGCGCATGATGCACCAAGAGGGTGTTGAGATGCACCGATATAGCTGAACTTTTCCTTGCTATTTTCTACAACATTATGGTTAAGATTTTGTTTGTGCAATGTACCTTTCAAGCATCTTTAACTTGCTGTCTGATATCTGGACAGAACCATTGAAGTTGGTGCAGACAGATTCAAGATTCCTGATATTCTGTTTAATCCATCTCTTTCTCAGGTGAGGTTTGATGAAGAGAATAATACTTGCTGTACACTTGTATTTCAGGCAGGATTTGTAACTGGTGCTGGTACTAGATTACCTTGTTCCAGAACAAAACCAGCTTGCTGTTTTCTTCTTCAGTAGATGCTGTTGATGGCTTGAAAAATTCTTTTGAACCATGTTGAATTGCTGACTCTCACATGCACACGAATTTTGTGATGCATAGACTATTCCTGGAGTTGATGGATTTGCAGATTCAATGTCAGTTCGTGGCCTTCCACGAATGGTGAGTTAAATGAGAGCTAGACTTGCATTTACTGTTGCGCATCCCTGGCAGTTCTTCATATTACTGAAGTTGCTATTGCTGTTACTTTCTCAGGTCATTGATAGTGTAAATAGGTGCGATGTTGACATTCGCAAGGAACTGCTAAGCAGTATTCTGGTAAATGGCTATAAATTCTTCAACCACATTTTACTAGCTCTCTTGGTGTTGCCATCCATGAGCTTAGTGATATCTTTCCCAAAATTCTCTTGTGAAGTTCTGTTAATACAATTCTAACATCTGCAAACATGCATTGTGGATAGCTTTCAGGTGGTTCATCATCAATTCTGCAGTTGAAGGAGAGGCTAGAAAAAGAAGTACTTGAGGTATATTTTTTCTTCAGAACAAACTAGGACTGCCCTGGCCTCATCCTGTTTATACTTCCCATTTTTAAATGTGCACCATTTTATAGCCTGTGCAGCCAAACTTTTAAATTTTTAACTACTAAAGTACATTGAAAATATTCCGGGGTTGCTACATGGAGAAGTAGTGGTAGGTTTGCCTTTTTCATGAAAAAGTATATTTTATCATTATATGAATAACATATAATTATAAATGCAGAACTTAGAAACAGTTAAAGATTTGTGGTTGGAGTCCTTTGATGTCTCTAATGCCATCTGTTTTCAAACAGAGGAAACAACATATAGGAGTCAAGCCTATGATCTTTTTCTTTGTTCTTGTCCAATATGGAAATACAAGAATAAATGAATCTCATTTTTTTTCTTGGGATAGTTAATAACGGGCCAGAGTGCAAGTTAATAGAACTCTATTCTGTTTTCAGGCTATTGAAAATGTTTCCTTAGACCTTGTGCAAGGCTTGTTCTTATATATACCTCAAAATATTGCAGGAATCTTCTGGTAATACTCGTGTAAAGGTTTTGGCAAGTGGAAATTCAGTAGAGAGGCGATTCAGGTATTCCCTTTTATCTTTGTAGTCTTTATCCTTCCCAAATTCGATTGAACATTTTGCTCTACTGCTCACTGGAGAAGTTTGAATGAGTGCCTTTTGGCTCTGCAAAGTGCAACTCTGTTGCTTGTTTTTATTGCTTGAAAAGCTTAACACATGAACTACCAAAATATACTGATCACTTTGTTCTAGTCATACATACCTTAAGTCATTTTATTCTGCAGTGTTTGGATTGGAGGGAGCATTCTAGCATCCCTTGGGTCGTTCCAGCAAATGTGGTTCTCCAAAGCAGAGTAAGCACAACACAGTATTTTAGGTTATGTTTCCCCTATCTCGTCACGGACAACTCACAAGTTAATGTGATTTATCTCACTATAGATACGAAGAACATGGAGTATCTTACATCCAAAGGAAGTGCCCATGA</dnaseqindica> |
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