BGIOSGA028471
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA028471 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA028471, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0030G18.7 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA028471-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA028471-PA |
| Length |
8900 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:15857229..15866128 |
| Sequence Coding Region |
15857229..15857263,15857691..15857799,15860141..15860795,15860988..15861958,15862812..15863857 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:15857229..15866128 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:15857229..15866128 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAGCCTTCTGGTGATTGCTGCCTGCCAATTAGGAATGGTCGCTTTCTCCTCCAGTCACTGGGGAATATATTGCCACCTTCAGCAGTGTTAGACTCAGAGGAAGCTCTGAACAAGGGGAGTACAACAGCAACTGATGTTTTTGTTTACTCTCAGTCGCAAGTTACTCTGAAGATTCCGAAGTCAATACTATGTGGCTCAGAATTCATGGTCATGGGATTTCCTCAATGCGCAAATGCCTATTATCTGTTGATGCAACTTGATAAGAGCTTTAAGCCTGTTTTTTGTTTGCTTGAGATACAAAGTAATGAAGGTGACAATAATAATGCTGATGCAACTACTGATGCTAAAGAAGCTATAAGGTTTATCAGGATTGACATTAGCAAATTAAAAATAGATGAAGATGTGCAAATTGGCAATTTTTTTGATAAAGATAAATTACTGGCGCTACAAAATGTGGAAGATAGACCTCAAAGACAAAGTGGAGCTGATGAGCCTCTTCCTGCACGACCTTCATTTTTTTCCATTGTTGATGAAGTATTTCGATGTGACAGAGGTTCTCCAATAACAGAAAGTCAACGACTCCCACCCAATAGTTTACCCTCTAGTCATTCGAGTTATCAAGTTGGTCTTCATGGGTTTAGTGGTGGAGCTGGCTCACCTGATCAAGATTATGGGTCTCTACAATCTAACATTAATGCTGCAAAAGTTACTTCTGGTACTGGTTTGAACAATTATCTGCTCAGTAATTCAAAGAATGCACAAAGTACAAGTGCCTTCTCTGGTTCAGTTCCTGCAGGTTTGGGTAATGTCTCCAGTTCACGCTCTGAAGGTGCATATAAAAAGCGTTCTCTTTCTGAGTTCTTGCAAAATATCCCATCGTCAAAGCAATCTATAATTGGTGATGGGCCAGGTAAGAGAAGAAAGCTGTCAGAATTTATGCTGGATGGCCTTCCTTTGAAGGCTAATTCACCCAACATGCAACCTAGGACGTCCCTCACCTATGGAAAATTACTTGAAGAAGTACATAATTGCATTACAGCGAATATCTATTCCTCTGTGCTTCTTCATGTCATAAAGCACTGTTCAATTTGCATTAAATATGCTCAGTTGACTGCTCAGATGGATTCTCTTAATATTCCACATGTAGAAGAAGTGGGCATGCCGACATCATCCTCTAATCTTTGGTTGCGCTTACCTTTTGCTCACGATGCTTCCTGGAAACATATTTGCTTACACCTTGGTAAAGCTGGAAGTATGTCTTGGGATGTTCGGATCAATGATCCACACTATGGTGCACTGTGGAAACTCCATGGTGGTAGCACTACTACAGAATGGGGTTCTGGTGTTCGTGTTGCAAACACATCTGAGGTGGATTCACATATCTCTTTTGATGATGATGGGGTCCTCTTGACTTACAACACTGTTGAGGCTGATAGTATACAGAGGCTTGTCTCAGATTTACAACGCCTCTCACATGCTCGTGCATTTTCTTGTGGAATGCGGAGATTGATCGGTGTAAAATTAGATGGCAAGCTAGCTGAGCATCAGACAGCTGCAGAGACAAAATTACACTCTAGAAGAAAAGCTAGCAGGGACAGGTTATCTGAACAGATGAGGAAAACTTTTAGAATTGAGGCTGTTGGTTTGATGAGCTTGTGGTTCAGTTATGGTGCTGTGCCTATGGTTTACTTTGTCGTTGAATGGGAGACCGGTAAGAGTGGTTGCACAATGCGAGTTTCTCCAGATCAACTATGGCCACACACGAAGTTTTTGGAAGATTTTGTGAATGGGGATGAGATAGCATCATTCTTGGATTGCATCAGGCTCACAGCAGGACCTTTACTTGCCCTTGGCGGCGCTATTCGTCCTGCAAAGATGCCTGTAACTGTTCCTGCCGGTTACAGTGCTCTACCAAAGCAAAACAATATTCTTACAACAGCGGGATCAGCAAACAGTCTATCATCAAGTACTGTGCACAATATGTCTGTCCCGCAGGGTGCTGCAGTAGCACATTCAAACAGCCAGCTTCAGACTTCTTCCATGCTGTCTGTTGCAGGACGGACTGCTCCTGGACTAGTTCCTAGCTCCTTGCTACCTTTTGATGTTTCTGTTGTGCTCCGTGGGCCTTACTGGATACGTATTATATACCGCAACAAGTTCTCTGTTGACATGCGCTGCTTTGCTGGGGATCAGGTCTGGCTTCAGCCAGCAACACCTCCTAAAGGTGGACCTTCAGTTGGTGGATCATTACCTTGCCCACAATTTCGACCTTTCATAATGGAACATGTTGCACAGGGTCTAAATGCTCTGGAGCCAAATCTGCTGAATGCTAGACATACTGGTCCACCGTTGAATGCCAGTGCCAACACTGTTTCTGGAAACCAACAATTAGCTTCTGCTCCTAACCGTTTTGGTGGTGCTCCTGGGGTAGCTAGGCCAACTTCAACTGTTGCTAACCAGGTAGCAAGTAGTTTGAGTCGTGCAGGCAATGCCATGATGCCTTCGGGATTTGCTTCAGGAATTGCTGGAGCTCCTGCGCACCTTTCTCCTGGAAACGTTCCTGCTCATATGAAAGGAGAGTTGAACACAGCTTTTATTGGGCTTGGTGATGATGGTGGCTATGGTGGTGGCTGGGTTCCTCTTGCTGCTCTTAAGAAGGTTTTGCGAGGCATCCTTAAGTACCTTGGAGTTCTATGGTTGTTTGCGCAGTTGCCTGATCTCCTGAAGGAAATACTGGGTTCAGTTTTGAAAGATAATGAAGGCGCACTTCTAAATTTAGATCATGAGCAACCGGCATTGCGCTTCTTCGTGGGTGGTTATGTATTTGCTGTTAGTGTTCATAGAGTTCAACTGCTGCTTCAAGTTCTCAATGTGAAACGGTTTCACCATCAGCAACAACAGCAACAGCAAACTCCTCAGAACAATGGGCAGGAAGAGCTAACAGTTCCTGAGATAAGCGAGATCTGTGACTATTTCAGCAGACGTGTTGCCTCTGAACCCTATGATGCTTCTAGGGTTGCATCTTTTATCACTTTGCTTACTTTGCCTATTTCAGTTCTTCGAGAATTTATAAAACTAATTGCATGGAAGAAAAGTTTGCCCCAAGCTCATGCGGACAATGCTACTACACACAGGGCACGGATTGAGATCTGTTTGGAAAAGCACCCTAGATTGGTTTCAGATGATTACACTGCAAGCTCTTCATCATCAAAGAGCAATATTCATCATGATAGAGCCAACAATTCAGTAGATTTTGCCCTAACTTTTGTACTTGATCAGGCCCTTGTACCCCACATGAGCATATCTGGTGGAGCTGCTTGGTTGCCATATTGTGTTTCTGTGAGAGTAAGGTACACCTTTGGAGAAGATAGTCACATTGCATTCCTTGCAATGGATGGGAGCCATAGCGGCAGGGCTTGTTGGTTACAACATGAGGATTGGGAGAGGTGTAAACAGAGGGTTTCCAGAGCAGTGGAGACTATGAATGGGTCCGCAGCAGTTGGAGATATGAGCCAGGGAAGACTGAGGATGGTTGCTGAGATGGTTCAAAAGCAACTGCAACTCAGCCTATTGCAGCTTAGAGATAGCCCAGTCTCTACTGGCTCTGCCGCATCATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEPSGDCCLPIRNGRFLLQSLGNILPPSAVLDSEEALNKGSTTATDVFVYSQSQVTLKIPKSILCGSEFMVMGFPQCANAYYLLMQLDKSFKPVFCLLEIQSNEGDNNNADATTDAKEAIRFIRIDISKLKIDEDVQIGNFFDKDKLLALQNVEDRPQRQSGADEPLPARPSFFSIVDEVFRCDRGSPITESQRLPPNSLPSSHSSYQVGLHGFSGGAGSPDQDYGSLQSNINAAKVTSGTGLNNYLLSNSKNAQSTSAFSGSVPAGLGNVSSSRSEGAYKKRSLSEFLQNIPSSKQSIIGDGPGKRRKLSEFMLDGLPLKANSPNMQPRTSLTYGKLLEEVHNCITANIYSSVLLHVIKHCSICIKYAQLTAQMDSLNIPHVEEVGMPTSSSNLWLRLPFAHDASWKHICLHLGKAGSMSWDVRINDPHYGALWKLHGGSTTTEWGSGVRVANTSEVDSHISFDDDGVLLTYNTVEADSIQRLVSDLQRLSHARAFSCGMRRLIGVKLDGKLAEHQTAAETKLHSRRKASRDRLSEQMRKTFRIEAVGLMSLWFSYGAVPMVYFVVEWETGKSGCTMRVSPDQLWPHTKFLEDFVNGDEIASFLDCIRLTAGPLLALGGAIRPAKMPVTVPAGYSALPKQNNILTTAGSANSLSSSTVHNMSVPQGAAVAHSNSQLQTSSMLSVAGRTAPGLVPSSLLPFDVSVVLRGPYWIRIIYRNKFSVDMRCFAGDQVWLQPATPPKGGPSVGGSLPCPQFRPFIMEHVAQGLNALEPNLLNARHTGPPLNASANTVSGNQQLASAPNRFGGAPGVARPTSTVANQVASSLSRAGNAMMPSGFASGIAGAPAHLSPGNVPAHMKGELNTAFIGLGDDGGYGGGWVPLAALKKVLRGILKYLGVLWLFAQLPDLLKEILGSVLKDNEGALLNLDHEQPALRFFVGGYVFAVSVHRVQLLLQVLNVKRFHHQQQQQQQTPQNNGQEELTVPEISEICDYFSRRVASEPYDASRVASFITLLTLPISVLREFIKLIAWKKSLPQAHADNATTHRARIEICLEKHPRLVSDDYTASSSSSKSNIHHDRANNSVDFALTFVLDQALVPHMSISGGAAWLPYCVSVRVRYTFGEDSHIAFLAMDGSHSGRACWLQHEDWERCKQRVSRAVETMNGSAAVGDMSQGRLRMVAEMVQKQLQLSLLQLRDSPVSTGSAAS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..35#463..571#2913..3567#3760..4730#5584..6629#8096..8900#ATGGAGCCTTCTGGTGATTGCTGCCTGCCAATTAGGTGTGTAGGTAACGCCATTACAGTTATGGTTAAATACCTTAACAATGTGTCATGGTAAGTGGTAACGATGTCAATGTGGATATCAGTATGACTTTTAAGGAGCATATATGACTTGATTTGTAGTGAAAGGTCTATTTTCCTGCTGTCCTGCAAGGTGCAGTGATGACTTCTTTTTATTCCAATTTCTACCGATATTAGGAGGGAGTCATATGCGGTTAAGAGTTCCCTTCAATAGGTGTAGCATGCATCAATGTGTTCATTTTTTCACAAAAATAGAGAGCACATTAATCTGTAGGCATAAGCCATTTTGGGCACGATATTATGAAGGTGGGAATAATAAGATATTTTGTGAACTGTATCTAATCCCTATATTTATTCCATGGTCAGTTTCCTTTCCAAATCATGTAGCTTTTTTGTTTCTACATAGGAATGGTCGCTTTCTCCTCCAGTCACTGGGGAATATATTGCCACCTTCAGCAGTGTTAGACTCAGAGGAAGCTCTGAACAAGGGGAGTACAACAGCAACTGATGTTTTTGTGAGTTTAAGGACCAGAAGCATCCTCCACTTATTTGCTGCCACTGGAAGTTCTTTGGGCCTAAAGGTTGTCTCATTAACTTGCCTTGTTATTCCTTCCCCTTGTATTTTCACTTTTCAGCTCTTAGAGTTTATTTCTACGTTCTTCTTTAATACTGAAAATTTAGAGCATGGGCGATTCAGATAATCTTGCACACGATTAAATTTAAACACTTTCTAAATACAAACAATCATTTCTGTTATGAATAAATTATTGAACAGAGTTCCTATGAGATATATGCTGTCATACTTAGTCTTGCATTAATCATTTTCTCAAGCCCAGCAATTTGTTGATTTGGCTAAACTATTTTCTTAAAATACTTTCTGGATTGAATCTAGTCTTCATATCCACATCTGAATCAGTCTATCCAAATTCATTGAAATTTTACATTTGGTAGTAAAATGTACCAAAAATCTTGGCCCAATTACTAGGTCAAAGTCTACTACTCCCCTCAACTCTTTCGGAAATTCAGTTTTCACCCCTCAACTCTGAATCTGGATAAAAATCGATCCCTCAAATTTCAATACCAATAGATTATTATTTATACCCCCGAGTCCAATACGCAAGATGATTTTGTTCCATGTCAACATAGTGGATAAGCCACTCACCAAGTCACCATCCTTGTCACGGCTATGTGTTTAGGTATTTGGGGCAGAAGAGTGGGTGTTAGAACTTCAATGGTTACTCTCATTGAGAAGAGGATGGCACTCAGAGTGGGGCAATTTTCTGGTTTTCTTCATTCACAAACTCAAAAGCCATACCTACCCGAGGGAGGTTGGATACATATATATAGCCATAGCTGGCTGCTAGCCTATTGCTGCACCCTCCTAGTCTAAAATTCAAAATTTAAATGGGATGCTGTCCTAGAGGGCATCCAAACTTAATAAAGCATAAAGGAGGCATAAAGGAGATGCTAACTGCTGCTGTCCTACTAACCGCAGCTTTCCTAGCAACTGAAAAATATGCTAAAGGGGTAGATGCTGTCCTGAAAAGGTGAAACTACCCAAAAGCAAAAAGAAGAATCACGACCAAGGACCACAAAGACTTATCCAACAGTGGGAAGAGAAAATGGGAGAGGGAGAGAAACACAGTTATGAGTGCCTACCCCTGTGCTGGCATGGTGTTAGGGCCACTGTGGCAGTGAATTTTGTGCAAACCGTCTTTTTGGCTCTGGGTGTGATTTTCTGGTATTAAAATAGGTGGTTCCTTTATCCAGTTTAAGGATTGAGCAATGAATAGTAAACTATGGGAAGAGATGAGGGGGCATAAAGTAGATTTTTCCTGTGTGAAAAATATTGTAGAGCTTCTTTTGTCTTATTTTATTAATTATTGAATAGTTTTCTCGTTAACAGTTTTATACTGAGGGCATAGCTTATAGGATGTCTTCGTGAGATGCTACTCATTGTGTCAGCACAACGATCTCGATGTCATAATTCTTTTTGGAGGTCACCTGAGGCTAGGTGCCAGCCCCTTGCTCAGGCCACTGATCTGATATTTCCCACCCAGGCAGCTGCCTAGTTCGTCTCTGTTATTTACACCTTGCAATTAGAACCATTTTGCTATATGTACTGGGAGCATGATCTAGGGCAACACATGTTGACAGTCTTGCCTTGAGAACAATTTTGCAATGAGAACAATTATAGCAGTAACTTGAATATACTGGGCTGCAAATCTCTGGACAGAGGTTTTTGATTAGATGAAATTAGGTGTCACTGTTCAGTTTCAGTCTGGCCTTCTGCACCGTGTCATAATGGTTCCTGTTCATCTTAAACCAGAGAAAGATTGCGGTAGTCTCTAGTTGGTGTTAAAATATGTGGGATTATGTGGAAAATATTACTACATTCTGTAGTTCTGTGAGGCAAGTATACCTATTGTTAAGTGCATTCTCTTCAACTTATAGTATGGTCTAAAGTCAATGCTTCATACGCACCATTCTTAGCGAAGTTTGATGTACAAGTGAACGTGGATGTGGCAGATTGGCAGTTAAGCGTCTTCAATATGTTAGAACTTTTCCCTGAAGGTCCCACACTTCCGCTACATATGCTAATCTTATAATCTGGCATCCCTGTGAGCAATTGTTAGATTTTCGTGATTTTTCTGCTATGCCAGTCGAAGATACATCTCTGGTCACTAAGGAGTTCTGTTTCAGGATACACAGCACAGTAGATTTGTGCTCTGGAATCTTTGTCTATCGTAGATTAATATCTGTATGTGTGCATGAAGGTGATGTGGATTTGTCCAAAACATCATTCTTTGTGACTGGAGGGAGAACTAAATTATACTTTTCTGATGGTTATTCCAGGTTTACTCTCAGTCGCAAGTTACTCTGAAGATTCCGAAGTCAATACTATGTGGCTCAGAATTCATGGTCATGGGATTTCCTCAATGCGCAAATGCCTATTATCTGTTGATGCAACTTGATAAGAGCTTTAAGCCTGTTTTTTGTTTGCTTGAGATACAAAGTAATGAAGGTGACAATAATAATGCTGATGCAACTACTGATGCTAAAGAAGCTATAAGGTTTATCAGGATTGACATTAGCAAATTAAAAATAGATGAAGATGTGCAAATTGGCAATTTTTTTGATAAAGATAAATTACTGGCGCTACAAAATGTGGAAGATAGACCTCAAAGACAAAGTGGAGCTGATGAGCCTCTTCCTGCACGACCTTCATTTTTTTCCATTGTTGATGAAGTATTTCGATGTGACAGAGGTTCTCCAATAACAGAAAGTCAACGACTCCCACCCAATAGTTTACCCTCTAGTCATTCGAGTTATCAAGTTGGTCTTCATGGGTTTAGTGGTGGAGCTGGCTCACCTGATCAAGATTATGGGTCTCTACAATCTAACATTAATGCTGCAAAAGTTACTTCTGGTACTGGTTTGAACAATTATCTGCTCAGTAATTCAAAGAATGCACAAAGTACAAGTGCCTTCTCTGGTTCAGTTCCTGCAGGTAATTTATACAAGTTGCCACCTTGTAAATTTGGTCATGAACATGGTACCAAATAGACCAGAAACTATCATCCTGTGCCCCTAATAAATAAAGATAGAGTTTGTTTTTCCTAAATATTGAAGTAGCTATTTATGCAATTATTTAATAATGAGGTAGCATTCTTATTGTATGTTTTTCCATGGAAATTGGCAGGTTTGGGTAATGTCTCCAGTTCACGCTCTGAAGGTGCATATAAAAAGCGTTCTCTTTCTGAGTTCTTGCAAAATATCCCATCGTCAAAGCAATCTATAATTGGTGATGGGCCAGGTAAGAGAAGAAAGCTGTCAGAATTTATGCTGGATGGCCTTCCTTTGAAGGCTAATTCACCCAACATGCAACCTAGGACGTCCCTCACCTATGGAAAATTACTTGAAGAAGTACATAATTGCATTACAGCGAATATCTATTCCTCTGTGCTTCTTCATGTCATAAAGCACTGTTCAATTTGCATTAAATATGCTCAGTTGACTGCTCAGATGGATTCTCTTAATATTCCACATGTAGAAGAAGTGGGCATGCCGACATCATCCTCTAATCTTTGGTTGCGCTTACCTTTTGCTCACGATGCTTCCTGGAAACATATTTGCTTACACCTTGGTAAAGCTGGAAGTATGTCTTGGGATGTTCGGATCAATGATCCACACTATGGTGCACTGTGGAAACTCCATGGTGGTAGCACTACTACAGAATGGGGTTCTGGTGTTCGTGTTGCAAACACATCTGAGGTGGATTCACATATCTCTTTTGATGATGATGGGGTCCTCTTGACTTACAACACTGTTGAGGCTGATAGTATACAGAGGCTTGTCTCAGATTTACAACGCCTCTCACATGCTCGTGCATTTTCTTGTGGAATGCGGAGATTGATCGGTGTAAAATTAGATGGCAAGCTAGCTGAGCATCAGACAGCTGCAGAGACAAAATTACACTCTAGAAGAAAAGCTAGCAGGGACAGGTTATCTGAACAGATGAGGAAAACTTTTAGAATTGAGGCTGTTGGTTTGATGAGCTTGTGGTTCAGTTATGGTGCTGTGCCTATGGTTTACTTTGTCGTTGAATGGGAGACCGGTAAGAGTGGTTGCACAATGCGAGTTTCTCCAGATCAACTATGGCCACACACGAAGGTTGGGTTTTGACATCTATATTTACTGCCTACTTTGCATGTGCTAGTATTTAGGACAACTTTTTTGAAAATTTGCTGCCCGACTTTTTTTTATTTGACATTGATAAAAGATAGTGAGTATTGATGTCCTTGTTACACTGTTTGATGTGCTAACCGTGTATTGTTGTACTGCATTTGCTTTGTGATGTATATAGATGT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