Os11g0169100
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Structured Information
| Gene Name |
Os11g0169100 |
|---|---|
| Description |
Sec1-like protein family protein |
| Version |
NM_001072381.1 GI:115484374 GeneID:4349884 |
| Length |
6514 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os11g0169100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:3315660..3322173 |
| Sequence Coding Region |
3315872..3315919,3316422..3316565,3317322..3317474,3318095..3318604,3318700..3320235 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008404:3315660..3322173 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008404:3315660..3322173 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggggtcggtggatctgatcgccgcctgcctcgactccatccgccagattggagatgagattgcagatgcactagtgtaccttgatgcaggcactctggaggcgtttcagtttattggagctttccccttgcttcttgagcttggtgctcgtgcaatttgcagcttggagaatgcatctccgcttgatgctgctgctgaatggcactcaagttttgcacatccagcaaggaagatagtagtgattacatcacgcctgcttagtgatgcacatcggtatattttgcgctgcctgggaaaccatggaactatttcacattgtactgtgttgacagctatttccgaggttggtcactcagcatatgttgattccccatttggaccagatgccttccgggagtatgagacattacttactcaggaccatgaggaacttctgaagaagtatgaaaagtcagatgagcacaaagataccactttttacacaggaaaagatttcacatcggatggtggtagatactccaattgggaatctggggtgcattatggctctaattctgaatctagcccaacaaaaaaggatttgtttgctgatgagtcaagccagctagaaactaaaggaaaaagattatctgtaactgtgactcactttccgatgattttctctcctatttcctctaggacttttgttttgccatctgaaggcacaatggctgaatcatgtttatcaaaccatcatgaagattcccttagtccagggctacctcccatatctactggtagatcttttgatggtgatgagattccccccggagtgacattgactgcccagttcctttaccatctggccagtaagatggacctaaagctcgatatattttcacttggagatacatcaaaggtcatcgggaagctgatgatggatatgtcaagtctatatgatgttggtcgtaataagagatctgctggcctgctgatcgtagatcgtacacttgatctccttactccttgtttccacggtgactcatttcttgataggatgctgtcctccttgacacgcaaggaagggacttcatcctattttgtgtccaaaaatccacaaactccaagcaagcattctgaagctactgttaaacgtatcccactagatataaaggtcccttttgaaaaggtcttcagcaaggaagaacctaagagtaggaccagtatgttacccgaaagtatcatgtcatttgtgtctggatggaactctgctgaagttgaatctgaagtaacctggctacctgattacgcggataaagctcatgatgacaaactcagcagtcaacatggtagtttaaatggttcattcctatccaattatgctggagtgtgctacttggaatcattactcgacagaggagcaaaagatgggttaatgttgattaagaaatggcttatggaagctttacaacatgagaagttatccttcccatccaaaggtcggcaaggagctgcctctgtttcagagcttcattctatggttcaaatgctctctcgagaccagttatccttagtaagaaacagaggggttatccaattggcactggctgctgaaatggctctccaggagcctcaaagttctcgctgggatgcctttacaagtgcagagagaatattaagtgtaacatctgcagagacaactcaaagtcttgccagtgagcttcgtgattttatcaacactagcacttcagttgaatctcacaagcaagctaataaaactgagtcctctcagggccttctaagtttccaggatgttttgcttctaacaattatcgggtatatcttggctggtgaaaattttcctacatcgattgctggtggtccattctcttgggaagacgagcggtctttgaaagatattgtggtggactctatccttgacaggccatcatctgtgaagctcagatttcttgttggcttggagaatgagcttgaagctaaagctagacctaaagatggtgacaaaagtaatgactccatcgaagcttctaagagtactgatgattttgatgaccaatgggatagctggggtgatgatgatgataatactgatgatcagaaggatgaagcttatggggacatgcaacttaagttggaagtacgagacagagttgaccagctttttaagttctttcacaatttgtccagtatgaggttaaggaaccaaactcttggagaaggcctagcagcactgagcagatttgagactgacatatactcaagaaaaggcttgctctataagttgctattagctgtcttggcaaggtatgacattcctggccttgaatatcactcatcagctgttggacgtttatttaaaagtggactggggaggtttgggctaggacagtctaaaccaagctttggcgaccaaagcattctcatcgtttttgttgtgggaggcatcaatgcccttgaggtccgggaagtcatgaaggcaatatcagacagcagcagacctgatgtggagcttattcttgggggaacaacccttcttaccccagatgacatgtttgagttgatgttgggctcatccagctttagttag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGSVDLIAACLDSIRQIGDEIADALVYLDAGTLEAFQFIGAFPL LLELGARAICSLENASPLDAAAEWHSSFAHPARKIVVITSRLLSDAHRYILRCLGNHG TISHCTVLTAISEVGHSAYVDSPFGPDAFREYETLLTQDHEELLKKYEKSDEHKDTTF YTGKDFTSDGGRYSNWESGVHYGSNSESSPTKKDLFADESSQLETKGKRLSVTVTHFP MIFSPISSRTFVLPSEGTMAESCLSNHHEDSLSPGLPPISTGRSFDGDEIPPGVTLTA QFLYHLASKMDLKLDIFSLGDTSKVIGKLMMDMSSLYDVGRNKRSAGLLIVDRTLDLL TPCFHGDSFLDRMLSSLTRKEGTSSYFVSKNPQTPSKHSEATVKRIPLDIKVPFEKVF SKEEPKSRTSMLPESIMSFVSGWNSAEVESEVTWLPDYADKAHDDKLSSQHGSLNGSF LSNYAGVCYLESLLDRGAKDGLMLIKKWLMEALQHEKLSFPSKGRQGAASVSELHSMV QMLSRDQLSLVRNRGVIQLALAAEMALQEPQSSRWDAFTSAERILSVTSAETTQSLAS ELRDFINTSTSVESHKQANKTESSQGLLSFQDVLLLTIIGYILAGENFPTSIAGGPFS WEDERSLKDIVVDSILDRPSSVKLRFLVGLENELEAKARPKDGDKSNDSIEASKSTDD FDDQWDSWGDDDDNTDDQKDEAYGDMQLKLEVRDRVDQLFKFFHNLSSMRLRNQTLGE GLAALSRFETDIYSRKGLLYKLLLAVLARYDIPGLEYHSSAVGRLFKSGLGRFGLGQS KPSFGDQSILIVFVVGGINALEVREVMKAISDSSRPDVELILGGTTLLTPDDMFELML GSSSFS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>213..260#763..906#1663..1815#2436..2945#3041..4576#4658..4726#5670..5798#ccgtcgtctcgtctcgtctcctccgccgccgcgattcatccgacaccaccggcggcatctccggcgagcggcagcgccgaacacccccaaccccaccgagttctttacggctggtgtctcccctcccatcctcgctaccgcgtcgccggcgcacggggagggtgggggcgtggcggcgaagagattcctgggatctcaggggatagtggactatggggtcggtggatctgatcgccgcctgcctcgactccatccgccaggtcggatctcttcgcgacttctctctcttaccttgcctgctcggattcctcattgtttgttcgatttctttttattatcatgtaagagattaattttgtccgggttaaactgaatgtgtaagaagattcccagaattttcagtttctaattatctgaattttgcactttggagatgaatatgagactactgcgtttaattggactattggagcgatgaaattgttctttaaaaaaaaacccatctttacagcttcctgaccgtatttctttctcgttccaaaacgataaattacaggagctgcttaacttggtaaagatttatccttttagcttctgagctgacaagtcgctgttattcgttcgtgattaacttaagctgtggataactttgagaaaacaaattcctatttgatgatttgcatgtaaaactaatggactttatcttcgtggctttcactatagaaatttatgttctttttttggtctgttgctgctttgcagattggagatgagattgcagatgcactagtgtaccttgatgcaggcactctggaggcgtttcagtttattggagctttccccttgcttcttgagcttggtgctcgtgcaatttgcagcttggagaatgcatctccgcttgatgctgtgagattacttaaatcccttgccataaaagtcaattaattatactagtaataaagaatagatatggtaataatgcatactacctcccaaggtagttagccagtaagctaatagcaatgcctcccaaaagttgcaatgttgtctgctcagtagtaatttatgtgtcaaactgaatgcagcatgttgagtgcaccaaagctcaagcatttttagtgtgtgtctggcacatgagtggcaaagtttaggaagaaaccatagttgcaagtggcatttgtttcttgatttgtgtcaacttagagctaaggactactccctctatcccaaaatataaggcatggtcaaactcgtcacggtctccaaaactaatctttgactcataatttctcatatactataaagtttgtaggaacaaaattatagccatttgaaagtgtattcaaatgtcaatccaatgatactattagcaaataaaattcaatttatattatggtatggagggactacctttttggtcctatgacatcttgaatttctgtacttcatatttctttttcattctgaacttcttatagatgagaagcagtgcacctaacagccttcatgttaaccttagtgtcaaactcatattttcttatataaaaccataattttctttgttcatgtacaaaaagtaagaaaaaattatgcttttttttaatgacaaatgtgccatcctgttctttacatgatcaaaatgccgtaacttgtgtttggcaggctgctgaatggcactcaagttttgcacatccagcaaggaagatagtagtgattacatcacgcctgcttagtgatgcacatcggtatattttgcgctgcctgggaaaccatggaactatttcacattgtactgtgttgacagctatttccgaggtacttcattcctgcaagaatttgttactttgatgcctgtattgcttctgaaatgcttgaacatccagccattattttcctacaattatcttctgttcacatcaaaatggctttagattttattttattttattttttgcctggggcttaagttcctatttaatttcctttgaaaaaggtacatagtccatgttagtttccatattatcatgaaggtatcatatactatatctggattgtttgatttatcctttctccaggggatggtctcaacactcatgtatgtagtttgtattgttgcatgttgtccatttggaagcttatctaaaccattatttattgtatgaataatcttaatgtcctcttgaattatttgttgtacatagtatagctgaacacatatgagtgtattagtatgagctaatttgtggactttgttttgtttgcaacctgtggtaacttctgtggtgctcaaccaaatgttgataaacagcaatcttgcttcaacccatattataagatttttttttctttttgcaaaacttaagagtttttttattgaaagcaaaatcatcttaagttctgcaagcaggatttgaatcatttgtgatatattgcaggttggtcactcagcatatgttgattccccatttggaccagatgccttccgggagtatgagacattacttactcaggaccatgaggaacttctgaagaagtatgaaaagtcagatgagcacaaagataccactttttacacaggaaaagatttcacatcggatggtggtagatactccaattgggaatctggggtgcattatggctctaattctgaatctagcccaacaaaaaaggatttgtttgctgatgagtcaagccagctagaaactaaaggaaaaagattatctgtaactgtgactcactttccgatgattttctctcctatttcctctaggacttttgttttgccatctgaaggcacaatggctgaatcatgtttatcaaaccatcatgaagattcccttagtccagggctacctcccatatctactggtagatcttttgatggtgatgagattccccccggagtgacattgactgcccagttcctttaccatctggccagtaaggtaaagatttatcataagaacatatttcttactagtggcttcttatttttcattcatataaccacttagtgatccgtattacaaaacatgtgtagatggacctaaagctcgatatattttcacttggagatacatcaaaggtcatcgggaagctgatgatggatatgtcaagtctatatgatgttggtcgtaataagagatctgctggcctgctgatcgtagatcgtacacttgatctccttactccttgtttccacggtgactcatttcttgataggatgctgtcctccttgacacgcaaggaagggacttcatcctattttgtgtccaaaaatccacaaactccaagcaagcattctgaagctactgttaaacgtatcccactagatataaaggtcccttttgaaaaggtcttcagcaaggaagaacctaagagtaggaccagtatgttacccgaaagtatcatgtcatttgtgtctggatggaactctgctgaagttgaatctgaagtaacctggctacctgattacgcggataaagctcatgatgacaaactcagcagtcaacatggtagtttaaatggttcattcctatccaattatgctggagtgtgctacttggaatcattactcgacagaggagcaaaagatgggttaatgttgattaagaaatggcttatggaagctttacaacatgagaagttatccttcccatccaaaggtcggcaaggagctgcctctgtttcagagcttcattctatggttcaaatgctctctcgagaccagttatccttagtaagaaacagaggggttatccaattggcactggctgctgaaatggctctccaggagcctcaaagttctcgctgggatgcctttacaagtgcagagagaatattaagtgtaacatctgcagagacaactcaaagtcttgccagtgagcttcgtgattttatcaacactagcacttcagttgaatctcacaagcaagctaataaaactgagtcctctcagggccttctaagtttccaggatgttttgcttctaacaattatcgggtatatcttggctggtgaaaattttcctacatcgattgctggtggtccattctcttgggaagacgagcggtctttgaaagatattgtggtggactctatccttgacaggccatcatctgtgaagctcagatttcttgttggcttggagaatgagcttgaagctaaagctagacctaaagatggtgacaaaagtaatgactccatcgaagcttctaagagtactgatgattttgatgaccaatgggatagctggggtgatgatgatgataatactgatgatcagaaggatgaagcttatggggacatgcaacttaagttggaagtacgagacagagttgaccagctttttaagttctttcacaatttgtccagtatgaggttaaggaaccaaactcttggagaaggcctagcagcactgagcagatttgagactgacatatactcaagaaaaggcttgctctataagttgctattagctgtcttggcaaggtatgacattcctggccttgaatatcactcatcagctgttggacgtttatttaaaagtggactggggaggtttgggctaggacaggtgagttattagtttgtacttccttggttcctttgccaccactctgtagctatcctttctcacactcaatactatctgcagtctaaaccaagctttggcgaccaaagcattctcatcgtttttgttgtgggaggcatcaatgcccttgaggtatggtccatattctttggtttcaagtattcaatcataccagtatggcattattgaagctgtgtttctattatactgtttggtgtttaaatataaatatttgtttattttgtttaaaactacagtaagaatcctcaaatttgacctatattttctatgttttgctagtgtactggtagtgtggcac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