BGIOSGA000002

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA000002

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA000002, complete gene.

LocusTag

OsI_05440

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA000002-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA000002-PA

Length

12432

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:47247293..47259724

Sequence Coding Region

47259551..47259724,47259199..47259261,47258441..47258518,47258327..47258376,47257303..47257405
,47256255..47256407,47255968..47256060,47254084..47254742,47253532..47254009
,47252210..47252694,47250943..47251741,47250010..47250697,47249512..47249924
,47248862..47249032,47248710..47248787,47248332..47248652,47247606..47247836
,47247293..47247520

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGGGAAGCACAAGGGCCGAGCTGCCAGCAGCGGCTTGGCGGCGTCGCTGCTGCCGCATGCGCAGGGTGCCGTCCCCATCGTTGGTTTCGGGGGTTACCATGGCGCCTCCCGTGTTGAGCCCGCCGCGCCTTCGTCCTCGACCGACCCCGATGCCTCGATTCTCCTCCCTCCCGATGTGGACAGTGAGGTGCTGCAGCACCTAAGGAGATTAGGAAGGAAGGATCCAACAACAAAGCTCAAGGCATTATCTACGCTCTCTATGCTCTTTGCACAAAAACCTGGTCAGGAAGTTGTGCAAATTGTTCCACAATGGAGTATAAGTGATCCTTCTTTACAACCCTTTTTACCATCCTTAGTATTTATGAAGGGTCTTGCTCCGCATCTTAAGGCTTTGATGGGTCCTTGGTGGTTTTCTCAGTTTGACCCTGCTCTTGAGGTTGCACAGGCTGCTCGGCATTCGTTTGAGGCTGCCTTCCCACAATCAGATAAAAGGTTGGATGCTTTAATGTTATGTGTGAAGGAAACATTTCTTCACTTGAACGAGAATTTGAAGTTAACAACACAAGCATTGTCTGACAAGGCTACACCAATGGATGAACTAGAAGATATGCACCAGAGGGGAGGCATTGAGGCAGGTCAGGTTACTGGCACAGTATGTCACAAGTCACTGCAACAACCAAGTGACGAGCACAAACAGTTATTCGTTGGATGGGTAATATCATCATCATTGTTAGCAATGGCAACTCTGATTGACATTTTGCTAGGTGTAAAATTACAAAATTGTGTCCGTGACAATTCCAGTTCTGAAAATACGAGTCTTTCAAAAGTTCTATCTGGCACATTGTCTTCTGCTGAATCTGCATTTTCTATGAATAAATATTTTCTTGATTTCCTCAAGTCAAAAAGTGCGATTATACGGTCTGCCACATACTCACTGCTTGCAAGTTATATCAAACATGTTTCTCATGTTTTCAATGAAGAATCCATGAAGGTACTATCTCCTGCTTTACTTGGTGCCTTCAATGAAAAGGACCCATCATGTCACTCCTCTATGTGGGATGCATTTCTTGCTTTCTCTAGAAGGTTTCCAGAGGCTTGGTCATATTGCAACATTCACAAGGTTGTTTTCAGCCGGTTTTGGCACTTTCTACAAAATGGATGCTATGGATCCAAGCAAGCCTCATACCCTCTCCTGGTTCAGTTTTTGGAGTCTATACCATCTAAAGCTGTAACTACAGAGCAATTTGTTTTTGACTTCTTACATAATCTCTGGGCTGGAAGAAACCAGAGGCAATTATCAGCTGCTGACAGTTTGGCATTCTTTACTACCTTTAAACAGAGTTTCTTGTGGCTTCTAAAAGTTCTACCGAGACATTCTGGAGGAGGTTCTTCGGATGATATTCCTATCAAGCTCATAACAAAAGTTGTTTGGCATGATTACCTTCGAATACCATCTTCCAAAAACCAGGATATTAGTTTGAGTGGATTGTCTGATGAAGCAATCAGTGGTGATTGTCAGTTATCTCATAAGGAGTCACTGTTGGCATCAAGCACACGCTACCCAACTTATTATCTTCAGGATTTGGGGAAATGCATCATTGAAATATTGGATGAGATTTCAGCTATGGAAAATCATTTGTTAAATATTGCTTGTGAGACTCTATTGAAGGACTGTTTGGATATAATCCATCAAAGGGAGAGTTTGCCAAATTTTCAGTATCATGTGGAACAAGTTGTGTCCTTTTTTATTTCGTTGGATCAGCTCATTGTACAGAAAGGTAAAACATGGCCATTGGAAAGCTTAGCAAGACCACTGATTGAACAATCTGTGCCAGCTATCAAGTCTATGGACACTCCAATTGTTGTTAAACTTCTATCAGTTTTGGTTGAAATATTCAGGCCTGTCCCTTTGTTCTTGAAGAATTCACAGAAAGAGAGTGAGGAATCTGTCCAAGGTTATCTGGATGTGTTCAATGGTGACTTTGTCCCCTGGTGTTTGGATAGGAAATATAGTACTTGTAGCTCAAAGATCGATCTGTTGCTCTCTTTAATTATAGATGAGTGCTTCTTTGACCAGTGGTGTACGATTATTAAATATACTAGTGCTAAGCAAAAGCACCCTGTTGATAATAAGAACTCACACGTTGATGACCAATTTGAATTGCTGGCACTTATACTTCAAAAGGTGAGAGAAAGAATTGCTGGGGGCAAGTTGAGAAATTTGCAGAAAAATGGCTCTCTACCAGAACATTGGCGGCATGACCTATTAGATTCTGCTGCAGAATCTGTCTTCTGTGATTTGCCTGCTACAGATTCCCATGTCCATTATGTATGTGCTGCACTTGGTGGCTCAGATCAAGATGACCAAATTTGTTTTCTTTCTTCTGATACTGTCCACAAAATGCTCGGGTCCATTTTGAAGTGTTTGACATCAGTACTCATGACATCAACTTTTGAGTGGGCAAGGTTTGCATATGTGGTGTTATTGCCTACTGAACCAAAGGACTCGAAGGTTATAGGAGCACAATCCTTTTCATCAAACATTAAGATGGCTCATTTTGCTTTCAAAGTTCTTGAGGGTAGCTTATTTGCCCTGAGAAGACTAGAGGAAGATTCTTTATTTCCTTCTGTTCTGGCAGCTCTGTTTATCATTGAATGGGAATATAGCATGGCCTTAACACTCGATGAAGAACATGACTTGAAAGGTTATAAAGAAGATATTGATGTTGGGTCTTCTGCATGCAACAGTTCAGATGATCATTTGGATGAGGGAATACATTTGAAAGCTAACCTTGCAGAGAGTATACATACCTTTTGCCAAAGCTTAAGTCCATCCTTTTGGAGTGATCTTCATCCATTCACCTTGAATAATTTGTTAAATATTTTAGCTCAATCTGTCAGGTGTGCTTTATTTCAGACACTAGAGTTGCCAACTGAGAGCACATCAGTCTTATGCTCAGAGTGGATGGTGAACATGTTGAAGCTCATCTCTCTTGATCACACAAAATTGCAGAGTTTTTTTTATCTTCTTTTATCTGAGGGAGAATATTGGCCACTCTGGGTGAAACCATCTTTACAAAATGAGAATGCACCAGTGAAGATCAAATTTGAGCCAGTTATTACAAATGAAACGCTGAAACACCATCAATTTGTTGCTTTTGGTGAACAGCTTGTTCTTAATCTTGGCTTTGGTGAAGTGATCTTAGGTGTTCCAGGAAATACATGTTACAACACATCACAATCAATTGATACTACTTCAACTGTTCCTTCATTGTCTAGAGCATGGGTTGCTGCTGAGATTCTTTGCACTTGGAAATGGAAAGGGGGGAGTGTATTCAGCACATTCTTGCCTTCTATGATTCAGCACTTGAAAATGGAATCATGTGCAGAGGTCAGCATATTGTCCATATTGCTTGACACATTGTTGGAAGGAGCTTTTCATGAGTGTAACCAGTGGGTACTGTTCAATGCTTGGCACATTTCTGACAATGAGATTGAGAAAATTCAAGATCATTTTCTACGTGCTCTTGTGGCTTTGCTATTTAGTATCAATAGCATCAATGAGTGTATTTGGAGAGAATCCGAGGCACTTGTATTTTTTGAGAAACTACTGAGCAATCTTTTTATTGGTTCCACAGTAAATAGAAAATGTGTAAAGACTCTTCCCTTTGTCATGAGTACAATCATCAAACCGTTGTCAGGCAAACTGAAATTAAATGAAGCTTCTTGTTACACTGATTTGGTGGGGCAAAACATACTGAGTTGGCTTGATGTAGCCATCTCTTGCCTATCATCCAGCCCGAGGGAAGTACTTCAACAAGACATTGTTGATTGGATGCAAGTGGTGTTGTCTTGCTTCCCGTTGAATATAACATGTGGAACCCAGAAACTAGAAGTTAAGATTGAACGAGAGATCAGTGATACAGAAAGATCATTATTGCTGACTCTTTTTCAGAAGTACAAGATTTTCTGTGCCATTGAAGCTCCGTCGCTGTCCACCAGTGGAACTACCCCGTCAACAATGGTTGAACTATTGGGGGTGAAACTGATAGCAGTTATGGTTGGCTATTGCTGGACAGAACTTCAGGAAAATGATTTGCATTTTGTGTTTCATACAGTACAGAAGTGGATTGAATCAGCTGTTTTGCTCGTGGAAGAAATGACAGATGCCATCAATGATGCTGTAATAAACCAGAAATCAAATGAAGATACTTTGGAGAAGCTTAAATTAGTGGAGTGTTCTCTGGGATCAAATAGACCACTGACTCAGGAATCTTGCATGGGACAAAGTATTGAGTTGATGCCAGATTCAGAGAAGACACTAGATCTGAGAGAAGAACTCTCATCGTTAATTGAGATGCCTACTTCTGAACTTCTCCAGACAGATCTGTTAGCCCATGATAGGGTTGATGCCTTCATTGCCTGGTCATTGTTGTTGTCCCACCTGCAATTACTACCACCAGCTTCCATTACTAGGGAAAGGCATATTCCTTTAAGGACTGGTGCACCTTGTGGAAAGAAAAAAGATGCTGAACTCATGCCTGAAGCAGAAGTTGCTGCGCAAGCTTCTAAGAATGCCATAATTACATGTTCACTGCTCCCATGCATTGAATCCCTTTGGCCAGTTGGGACATGGCAAATGGCCTCACTTGCAGGGGGACTCTATGGGATGATGATTAGGCTGTTGCCTTCCTATGTGCGTACATGGTTTACTAGTTTAAGAGATCGTTCATTGTCATCCTCAATCGAGTCCTTCACTAGAGCATGGTGCAGTCCTCCTCTTCTACTTGATGAATTTTCTCAGGTCAAGGACTCTCTGTATGCTGATGATAATTTCTCAGTTAGTGTTAACCGCTCGGCGTACGAAATTGTTGCTACATACAAGAAGGAGGAGACAGGAATTGATCTTGTCATACGCCTCCCGAGCTGTTACCCTCTGCGCCATGTGGATGTTGAATGTACCAGAAGTTTGGGCATCAGTGAAGTGAA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Protein Sequence

<aaseq>MGKHKGRAASSGLAASLLPHAQGAVPIVGFGGYHGASRVEPAAPSSSTDPDASILLPPDVDSEVLQHLRRLGRKDPTTKLKALSTLSMLFAQKPGQEVVQIVPQWSISDPSLQPFLPSLVFMKGLAPHLKALMGPWWFSQFDPALEVAQAARHSFEAAFPQSDKRLDALMLCVKETFLHLNENLKLTTQALSDKATPMDELEDMHQRGGIEAGQVTGTVCHKSLQQPSDEHKQLFVGWVISSSLLAMATLIDILLGVKLQNCVRDNSSSENTSLSKVLSGTLSSAESAFSMNKYFLDFLKSKSAIIRSATYSLLASYIKHVSHVFNEESMKVLSPALLGAFNEKDPSCHSSMWDAFLAFSRRFPEAWSYCNIHKVVFSRFWHFLQNGCYGSKQASYPLLVQFLESIPSKAVTTEQFVFDFLHNLWAGRNQRQLSAADSLAFFTTFKQSFLWLLKVLPRHSGGGSSDDIPIKLITKVVWHDYLRIPSSKNQDISLSGLSDEAISGDCQLSHKESLLASSTRYPTYYLQDLGKCIIEILDEISAMENHLLNIACETLLKDCLDIIHQRESLPNFQYHVEQVVSFFISLDQLIVQKGKTWPLESLARPLIEQSVPAIKSMDTPIVVKLLSVLVEIFRPVPLFLKNSQKESEESVQGYLDVFNGDFVPWCLDRKYSTCSSKIDLLLSLIIDECFFDQWCTIIKYTSAKQKHPVDNKNSHVDDQFELLALILQKVRERIAGGKLRNLQKNGSLPEHWRHDLLDSAAESVFCDLPATDSHVHYVCAALGGSDQDDQICFLSSDTVHKMLGSILKCLTSVLMTSTFEWARFAYVVLLPTEPKDSKVIGAQSFSSNIKMAHFAFKVLEGSLFALRRLEEDSLFPSVLAALFIIEWEYSMALTLDEEHDLKGYKEDIDVGSSACNSSDDHLDEGIHLKANLAESIHTFCQSLSPSFWSDLHPFTLNNLLNILAQSVRCALFQTLELPTESTSVLCSEWMVNMLKLISLDHTKLQSFFYLLLSEGEYWPLWVKPSLQNENAPVKIKFEPVITNETLKHHQFVAFGEQLVLNLGFGEVILGVPGNTCYNTSQSIDTTSTVPSLSRAWVAAEILCTWKWKGGSVFSTFLPSMIQHLKMESCAEVSILSILLDTLLEGAFHECNQWVLFNAWHISDNEIEKIQDHFLRALVALLFSINSINECIWRESEALVFFEKLLSNLFIGSTVNRKCVKTLPFVMSTIIKPLSGKLKLNEASCYTDLVGQNILSWLDVAISCLSSSPREVLQQDIVDWMQVVLSCFPLNITCGTQKLEVKIEREISDTERSLLLTLFQKYKIFCAIEAPSLSTSGTTPSTMVELLGVKLIAVMVGYCWTELQENDLHFVFHTVQKWIESAVLLVEEMTDAINDAVINQKSNEDTLEKLKLVECSLGSNRPLTQESCMGQSIELMPDSEKTLDLREELSSLIEMPTSELLQTDLLAHDRVDAFIAWSLLLSHLQLLPPASITRERHIPLRTGAPCGKKKDAELMPEAEVAAQASKNAIITCSLLPCIESLWPVGTWQMASLAGGLYGMMIRLLPSYVRTWFTSLRDRSLSSSIESFTRAWCSPPLLLDEFSQVKDSLYADDNFSVSVNRSAYEIVATYKKEETGIDLVIRLPSCYPLRHVDVECTRSLGISEVKCRKWLLSLTAFVRNQNGAIAEAIHTWKSNFDKEFEGVEECPICYSILHTSNHSLPRLACKTCRHKFHGACLYKWFSTSNKSTCPLCQTPF</aaseq>

Gene Sequence

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