Os11g0298400

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Structured Information

Gene Name	Os11g0298400
Description	Ribulose bisphosphate carboxylase, small chain family protein
Version	NM_001074260.1 GI:115485168 GeneID:4350322
Length	10245 bp
Definition	Oryza sativa Japonica Group Os11g0298400, complete gene.
Source	Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 11
Location	Chromosome 11:11057563..11067807
Sequence Coding Region	11057751..11057832,11057957..11058042,11059534..11059611,11059721..11059852,11060139..11060189 ,11060283..11060423,11060508..11060630,11060743..11060820,11061202..11061291 ,11061374..11061493,11061690..11061773,11062403..11062498,11062589..11062777 ,11063459..11063534,11064261..11064364,11064462..11064721,11065754..11065840 ,11065938..11066165,11067018..11067094,11067166..11067231,11067306..11067415
Expression	GEO Profiles:Os11g0298400
Genome Context	<gbrowseImage1> name=NC_008404:11057563..11067807 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=NC_008404:11057563..11067807 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>atgggaggcgcgcgcgcgcaggtgaacaagccgcacaagacacgcttcgcctccaaggcgtcgcgccacgcgcacaagatcgataaggtcaggaccgggaagccggagggcagccaccgcgccgccgtcaagggggcccgcgccgcgcgcgtccagcggagcaaggcgatccgtgatcagaaacgtgctgctttgctgaaggagaagcgctcttccgttggatcttcgagtgcgccccgtgtcgttgttctttttggcctttcctcgtcggcaaatgtcagatcacttgccaaagaccttttaaccattgcttctggtgatgaagagaaaccaacttcttccactgttgcttctcctacatataaacttcgaaccacggtacttgaagcaccttatggtgatcttacatcatgcatggaactggcaaaggttgctgatttgctagcatttgtactatcagcaaattcattatacgattgtgattcgagcagtccaattgatgattttggatcacaatgcttgtctgtttttcgggccatgggcttacctagtacagctgttttcattcgagatcttccatcagaaaacaaaagtaggcaggaattgaagaaaacagctatttcttttgtttctccagagctacctgaggattgcaagttctatgcagctgacacaaaggatgatttgcacaagttcatgtggcttttcaaggagcagcacctttcatgtccacattggagaaaccagaggccttatgttatgtctgaggaggcctgcataaaacctgatgacagttcagggctgtgcacattgcttatgtctggatatttacgtgcccacaatctttctgtcaaccagcttgtccatctgtcaggtgttggtgattttcagttgggtcaaattgatatcctcaaggatccttttcctattaatgagaggaaaaactccaatgccatggtttctgaagatagtggtattcagattgttgacacctttgttccagacccttcaagtcaagagcctttgcttgttgaaaacaccccagatccacttgaaggggagcagacttggccgacagaagctgagatggaagaagcctatttgaacaacaaacagagaaagctaaaaagaaagcttcctcgaggcacttcagaataccaggctgcttggattgtggatgatacagatgatgaagatggtgattctgagaacgacaaccaggatggtgctggaatggttatagatgagcaagatcactcagacaatggaggtgatggttcagatatggatgtggtatctcactttacggagaaatttgatgaagaaacaattgggggtaccgagatggcagacgatgaaaatttgaccaaagagcagatagaggcagagattaagaaaataaaagaagctaacgctgaagacgaagaatttcccgatgaggtggagacacccttagatgtcccagcaaaaaggcgatttgcaaaatacagagggctaaagtcatttaggacatcatcctgggatccaaaggaatcactgccacaggattatgcaagaatatttgcattcgataactttacaagaacacaaaagcatgttcttgctaaaatggcagagcgagatgaaggaaccttgaaggattgtgctcaaagaggatcatttgtgaggctccatctgaaaaatgttcctactgagattgcctcaaaacttgttcatccatcaaggagattgcctgtggttgtttctggtcttcttcaacatgagtcaaaaatatcggttctccatttcagcataaagaaacatgactcctatgaagctcctatcaaatcaaaggactccttaattttcaatgttgggttccggcagtttactgctaggccattgttttcaactgacaacatcaattgcaataagcataagatggagaggtttctacatcatgggcggttttctgttgcctctgtatatgctccaatttgctttcctccactccctcttattgttctaaagagcagagatggggagcagcctgccattgctgctgttggttcactgaaaagtgtggatccggaccggattattcttaagaaaattgttttgactggttatcctcaacgggtctcaaaactgaaagcagtagtgcgatacatgttctacaatcctgaagatgtcaagtggtttaagcctgtagagttgtggacgaaacatggtcgacgtggccgaatcaaggagactgttggcactcatggtgctatgaaatgcatattcaatagcagcgtccagcagcatgataccgtgtgcatgagcctttacaaacgcgcttaccccaaatggccagaacagctctaccagatatga</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MGGARAQVNKPHKTRFASKASRHAHKIDKVRTGKPEGSHRAAVK GARAARVQRSKAIRDQKRAALLKEKRSSVGSSSAPRVVVLFGLSSSANVRSLAKDLLT IASGDEEKPTSSTVASPTYKLRTTVLEAPYGDLTSCMELAKVADLLAFVLSANSLYDC DSSSPIDDFGSQCLSVFRAMGLPSTAVFIRDLPSENKSRQELKKTAISFVSPELPEDC KFYAADTKDDLHKFMWLFKEQHLSCPHWRNQRPYVMSEEACIKPDDSSGLCTLLMSGY LRAHNLSVNQLVHLSGVGDFQLGQIDILKDPFPINERKNSNAMVSEDSGIQIVDTFVP DPSSQEPLLVENTPDPLEGEQTWPTEAEMEEAYLNNKQRKLKRKLPRGTSEYQAAWIV DDTDDEDGDSENDNQDGAGMVIDEQDHSDNGGDGSDMDVVSHFTEKFDEETIGGTEMA DDENLTKEQIEAEIKKIKEANAEDEEFPDEVETPLDVPAKRRFAKYRGLKSFRTSSWD PKESLPQDYARIFAFDNFTRTQKHVLAKMAERDEGTLKDCAQRGSFVRLHLKNVPTEI ASKLVHPSRRLPVVVSGLLQHESKISVLHFSIKKHDSYEAPIKSKDSLIFNVGFRQFT ARPLFSTDNINCNKHKMERFLHHGRFSVASVYAPICFPPLPLIVLKSRDGEQPAIAAV GSLKSVDPDRIILKKIVLTGYPQRVSKLKAVVRYMFYNPEDVKWFKPVELWTKHGRRG RIKETVGTHGAMKCIFNSSVQQHDTVCMSLYKRAYPKWPEQLYQI</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>189..270#395..480#1972..2049#2159..2290#2577..2627#2721..2861#2946..3068#3181..3258#3640..3729#3812..3931#4128..4211#4841..4936#5027..5215#5897..5972#6699..6802#6900..7159#8192..8278#8376..8603#9456..9532#9604..9669#9744..9853#gttcgcgcccacttccagccaggccaccgccgccgccgccgaccgaagcagccgacggcgaccaccgccgcggcgagggatcggtgcgtaagcttggcggcgggccgctccgcacgcgggagggagcgccgtagccgcccttccccccaccctctacaccccctcgccggcggcgaacacggcgcgcgatgggaggcgcgcgcgcgcaggtgaacaagccgcacaagacacgcttcgcctccaaggcgtcgcgccacgcgcacaagatcggtacggcgcccatggcggtctccccttctccttctcctcgtcctcctcccgcccccggcaatcccattcctcttcttcgttgccttacgctgatggatggcggcgtctttttgttgttcggcagataaggtcaggaccgggaagccggagggcagccaccgcgccgccgtcaagggggcccgcgccgcgcgcgtccagcggagcaaggcggtgaggcttcagctctcgcagtgcatcgcacctttacttttgtgcttggttattagctagagtatgtgcttgactgattgtgacttttgggtagatgtcaaagctggctaattccgattcgggtggctgtatggagctatttttttttcttctgatgtttattttgtgaagcacaaagcatattgataagaccagcagccaattaatacaaatgtttattaaaattgttaagtactccaagaaataagacatgtttccaataaatcaataataatacctgcgacatgatagggaacacatctgacagccagtatactcagtctcagagtgaatggcaattaatctttgacagtgcagactaaaatgatatctgaaaaatagatggctagtggaccgtccaaacttcagcttacacagctgaacttcaaccttcagcttgtacagcttatagcattcccataaaattttagaagaccaacagtgcacctgtgtgttgcatctgaagttgattttcattatactggagtgtaacaacatataaacttttctaacaagaaatgagcttttgctattttagttcttgtgttatgataggtggacaagggacatggatatcttcattacaacacgaactcaagtagtttacaaagtaaaaacaggaatttgtacttttttttttgcttatcctggttcactgtcctcagtgttgttagttgtaaggtccttcagcatgttcaaccattcatctactgaagcattgttgactgttgggtagcaagcctcataggctggtgtcagaggccaatggtgcaaacatctactttaacagcatcttgattatttgtgaagatagaaacatgataattttccagaactagactgacacaagacaggaagtggcctgcaacgcaaggagggatccagcaaggctgggctttttgtatgatcagtgatgtatcctaatgtttattttgaacaaaactatcacttccttctttatgttagatggcagattgatctctgcatattctctattcatccagattcttggaaaatttgttattacagtaatagtttgctagatgcagagatcttgaaagtgtttcttctggttggcttgaagaaaccattgttttgtactattttttttattattatggtaaattcattcaacatatagttagttattctttctgtatttctttgattcatctcctttcatgctagacagtaaagtggaaagtattgcaaattgccgtgcagccactatgttcctttgtcctagttatgatggctccaaagcatgtcttccaactgtcatccaatttatttgttctttaattcattttctctgttttgatctctgctcaacttggattacatatactgatatggtcgctgagcattatgttttggtttgttaagagctcttgttttttctagcctcatcagttttttcttgtttactgtaatggttttgcttggttgcagatccgtgatcagaaacgtgctgctttgctgaaggagaagcgctcttccgttggatcttcgagtgcgccccgtgtcgttgttagtatttatgaacttagctcttgttgtcctactttgattgtcacttttgttgtttcctacggtcagatgatagacatttccttggggtaactgatgattattgcaggttctttttggcctttcctcgtcggcaaatgtcagatcacttgccaaagaccttttaaccattgcttctggtgatgaagagaaaccaacttcttccactgttgcttctcctacatataaacttcgaaccacggttagtttaatttaaatacagttgtaccacacatacctgtaggcaggacacactatttagtaatatctctattttcacgttcaccaaaaaattatgaccattgtatcatctctctgatgtgcatgtgttgaactatagataggtctttgaaccattgtatcagcacttggtctcatgttttagttgttctttatatatattgctgttaatttcttaatttccattcattgaatctgcacacgacatgaatgataacattgcttttatattcatatggttcttgaaggtacttgaagcaccttatggtgatcttacatcatgcatggaactggcaaaggttcattcaatcaaaatcaatttgtcataattgtttttgttgaaatttcttgcctctaatctggatcttgcaaactatatctttcctacataggttgctgatttgctagcatttgtactatcagcaaattcattatacgattgtgattcgagcagtccaattgatgattttggatcacaatgcttgtctgtttttcgggccatgggcttacctagtacagctgttttcattcgagtaagttcccatcataagcatttgtcatgccagacattgtataattgttatcaacttccatcttttaacattggtacttgtcaggatcttccatcagaaaacaaaagtaggcaggaattgaagaaaacagctatttcttttgtttctccagagctacctgaggattgcaagttctatgcagctgacacaaaggatgatttgcacaaggttttctttggaaccatatattattaaataatgaaatgatatttatatttttcttcaccttttctatccttccaatgctgtaatgtaattatttatgcttaaatcttttcagttcatgtggcttttcaaggagcagcacctttcatgtccacattggagaaaccagaggccttatgttatgtctgaggaggtttgaatgatttgatactctatctctcttttttgagtgttgacagctgtatcttggtgtagaatatttggcccaaaatcacatccatgtttcccattttgaaaatttgtctgtgcagtatgcttgacaattaagactggttctgctaaaattaaaataatatgtgaacttttcctaggtgtgttaaatctttgacaaggcatatgcgagattgtgagcacatgcatcacatcaccttaggtttccatgtaatgatatattaagttggctttgaacctacattattcagtgctagtggtgattattcacaagttacaagtcatgttggctttgccttttctttcagtttaaaactgattgacataagatgtttgttttcaggcctgcataaaacctgatgacagttcagggctgtgcacattgcttatgtctggatatttacgtgcccacaatctttctgtcaaccagcttgtaggtgatctatgtttttatttctagtgagctattttatgattttctgttcctattttctaacacctttgccactcaaaaggtccatctgtcaggtgttggtgattttcagttgggtcaaattgatatcctcaaggatccttttcctattaatgagaggaaaaactccaatgccatggtttctgaagatagtggtattcaggttgttatacatcataaattcacttttacaaactgaattatactgttcacaactacattagaatgatctgatgcaagtaatgctatttagtatcataataagcataataatcaatgactaagttatcttttacatgttcagtttcatttattttgataacaccttttaaacttctcattatttggccctttttcagattgttgacacctttgttccagacccttcaagtcaagagcctttgcttgttgaaaacaccccagatccacttgaaggggagcaggtgatctttctcccatttggcttaatgatgtgatgttgacaagccattgttttgagttctgtcgtatcaaaaccttttggtattgaagggaaaatacaaggggtctatctattacttcatatagtcctactcttagaaagttggatttagtgcacagtttctataatagcacattgacttttaaaaagtttcatcattgttactgtgaagcatcttagtgttggtttgacaaaaaaaaatgttggtaatattcttgatgtcacgacttactatttttattttcaatgtgttgtcatctgttgttctgtgttattttcttctcttagatgaagtcagaagtttgtttgcttttaacatactcattaagctctgtatctttcttaaaaatacaacatatgtcatcagatagaatagactcgcttagcttaatggaaacctttgctgtcaatctgtttcttttggctcagattgcattcattatttgtcatattttactgaaccaaacattatgtttcctatgtttgtttcatcctatcaaa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External Link(s)	NCBI Gene:Os11g0298400, RefSeq:Os11g0298400