BGIOSGA001858

From RiceWiki
Revision as of 18:13, 20 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

BGIOSGA001858

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001858, complete gene.

LocusTag

OsI_01481

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA001858-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA001858-PA

Length

6809

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:11514541..11521349

Sequence Coding Region

11520929..11521349,11520689..11520813,11519972..11520079,11519595..11519675,11517593..11517671
,11517035..11517120,11516819..11516943,11516221..11516289,11516041..11516134
,11515126..11515290,11514945..11515037,11514541..11514633

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:11514541..11521349 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:11514541..11521349 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGGTCGCAGTATGCTTCCCGAGCAGCAGGAGGACGTATCGAGGAAGAGCAAGAAGGAGAAGAAGAGCAAGAAAGACAAGAAGCGGAAGCTGGAGGCGGAGGCCGAGGTGGTGGTGGTGGAGGCGGCTGCGGCCACGTCCACGGATGAAGCGACGAAGAGCAGCAAGAAGAAGAGGGCCAAGGGCGATCTGGGCCAAGGAGAGGAGGCGGAGAACGGCGGTGGGAAGGTCGTGGCCGTGACCGGGAAGGGCTCCGCGGACGCCAAGTACGCCCCGCTGTCATCCTTCGCCGCCACCGCGCTTCCTCCCCAGGTGCTCGACTGCTGCAAGGGGTTCGAGCGTCCGTCGCCCATCCAAGCGTACGCCTGGCCTTACCTCCTCGACGGCCGTGACTTCATCGGCATCGCCGCCACCGGATCTGGGAAGACGATTGCGTTTGGTGTGCCGGCTCTGATGCACGTTAGGAGGAAAATGGGGGAGAAATCTGCTAAGAAGGGGGTGCCACGGGTCCTCGTGCTATCGCCAACGAGAGAGCTTGCTCAGCAGATCGCAGATGTACTTTGTGAAGCTGGTGCACCATGTGGGATAAGTTCAGTGTGCCTTTATGGTGGAACTTCCAAAGGACCACAAATTTCTGCCCTTAAATCTGGAGTGGATATTGTCATAGGGACACCTGGTCGTATGAAAGACCTTATTGAAATGGGTATTTGTCGTCTTAATGATGTTTCTTTTGTGGTTCTAGATGAAGCTGATCGAATGCTGGATATGGGTTTTGAACCTGAAGTCAGAGCAATTTTAAGCCAAACTGCATCTGTACGTCAGATGGTTATGTTCAGTGCTACATGGCCTCCTGCTGTCCACCAGCTAGCCCAAGAGTTTATGGATCCAAATCCAATAAAGGTTGTTATTGGATCAGAAGATCTTGCTGCTAACCATGATGTGATGCAAATTGTTGAAGTATTGGATGACAGGTCAAGGGATTCAAGATTAGTCGCTTTGCTCGATAAATACCATAAAGCACAGAGAAACAGGGTGTTGGTTTTTGTGTTGTACAAGAGAGAAGCTACGCGAGTAGAAACAATGTTACAAAGAAGGGGTTGGAGTGCTGTTTCTGTTCATGGAGATAAGGCACAGCATGACAGGACGAAAGCTTTATCTTTATTTAAAGAAGGGTCATGTCCTTTGATGATTGCCACTGATGTCGCATCCCGTGGACTTGATATTCCAGATGTCGAAGTTGTCATTAACTATAGCTATCCTTTGACTACAGAGGATTATGTCCACAGGATTGGGAGGACCGGTCGTGCTGGCAAGAAAGGTGTTGCACATACCTTCTTCACTCAAGAGAACAAGGGACTTGCTGGTGAACTTGTCAATGTTTTGCGGGAGGCTGGTCAGGTCGTTCCTCCTGCACTTACAAAATTTGGCACACACGTCAAGAAAAAGGAATCGCAAATATATGGATCTCATTTCAAAGAAATCAAAGCAGATGCTCCTAAATCAACAAAGATTACGTTTGGTGATTCTGATGAGGACTAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MGRSMLPEQQEDVSRKSKKEKKSKKDKKRKLEAEAEVVVVEAAAATSTDEATKSSKKKRAKGDLGQGEEAENGGGKVVAVTGKGSADAKYAPLSSFAATALPPQVLDCCKGFERPSPIQAYAWPYLLDGRDFIGIAATGSGKTIAFGVPALMHVRRKMGEKSAKKGVPRVLVLSPTRELAQQIADVLCEAGAPCGISSVCLYGGTSKGPQISALKSGVDIVIGTPGRMKDLIEMGICRLNDVSFVVLDEADRMLDMGFEPEVRAILSQTASVRQMVMFSATWPPAVHQLAQEFMDPNPIKVVIGSEDLAANHDVMQIVEVLDDRSRDSRLVALLDKYHKAQRNRVLVFVLYKREATRVETMLQRRGWSAVSVHGDKAQHDRTKALSLFKEGSCPLMIATDVASRGLDIPDVEVVINYSYPLTTEDYVHRIGRTGRAGKKGVAHTFFTQENKGLAGELVNVLREAGQVVPPALTKFGTHVKKKESQIYGSHFKEIKADAPKSTKITFGDSDED</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..421#537..661#1271..1378#1675..1755#3679..3757#4230..4315#4407..4531#5061..5129#5216..5309#6060..6224#6313..6405#6717..6809#ATGGGTCGCAGTATGCTTCCCGAGCAGCAGGAGGACGTATCGAGGAAGAGCAAGAAGGAGAAGAAGAGCAAGAAAGACAAGAAGCGGAAGCTGGAGGCGGAGGCCGAGGTGGTGGTGGTGGAGGCGGCTGCGGCCACGTCCACGGATGAAGCGACGAAGAGCAGCAAGAAGAAGAGGGCCAAGGGCGATCTGGGCCAAGGAGAGGAGGCGGAGAACGGCGGTGGGAAGGTCGTGGCCGTGACCGGGAAGGGCTCCGCGGACGCCAAGTACGCCCCGCTGTCATCCTTCGCCGCCACCGCGCTTCCTCCCCAGGTGCTCGACTGCTGCAAGGGGTTCGAGCGTCCGTCGCCCATCCAAGCGTACGCCTGGCCTTACCTCCTCGACGGCCGTGACTTCATCGGCATCGCCGCCACCGGATCTGGTGCTGAAAAAATTCTCTAATTAGTTAGTTTCTTTTTGTTAATTGGTTAGTACTGCTGCATCGTGCTCGAATTGCTGCTGATGGTTTGTTGTTCGTCGTAATTTGTTGATGCCAGGGAAGACGATTGCGTTTGGTGTGCCGGCTCTGATGCACGTTAGGAGGAAAATGGGGGAGAAATCTGCTAAGAAGGGGGTGCCACGGGTCCTCGTGCTATCGCCAACGAGAGAGCTTGCTCAGCAGGTAAACCCCTGAACTCAATCTTTTAGGGAAGTATAAGGGATGTATGCAACTTCCAGTGGGGATAGGAGAAATTGATTCACATATAAAAGGGGGAGATTTTTGGAATAGTATTTTTTTTCAATTTCCTTGATAAATTCGTAATACACAATTTCATAGACACTTTATAATATCTGCCAATATGTTGTATCATCTGGAAATTAAATTGAGGGCTGTGGTTTTTTTTGAACCTTAGAACCTAATGACCTAGGTTATGTGCCACAAGTTGCAATACCCTGGTTTTGTAACTCTGACCCTAACACGTAGGTTTTCTGAAATTTACTCTAATTTATAAGTGTAGTCTCTCAGCTCACAACCTATATTTTGCTGATGATAAGATCGTTGAGTATCGAACTAATTGATAAGGACCTTTAGTATCGAACAAATTGAAGTGAAAGAGTTGCATGTTCAGATTTTTTACCTTTTTCTATGGTTGTATGGGATTATATAGTTTGTTTGGCCCAGCAGGCGTCATATACTGATGATATGAACTTGTAAGATAGGCATCTGATGGTCTGCAAAAACTACTGCTTTTTAATACACATGAATGATTCATTTTGTATTATATGTTAGATCGCAGATGTACTTTGTGAAGCTGGTGCACCATGTGGGATAAGTTCAGTGTGCCTTTATGGTGGAACTTCCAAAGGACCACAAATTTCTGCCCTTAAATCTGGAGTGGTAAGATGAGACTTACACAATATTTGTTTTACTCTATCTCAGTTCTGGATTATGATATATGACCAATGAATGTTAATTTCTAGAGACATTCATCATATTGTGATGACATTTCAATTTGCTATATTGATTTGAAAAGTTCTCTTTAAATGTATTGTTGAATAATTTTGTTTACTTTCCGAGGATTCAGCAGACTCGCTGCCTTGGATTTTGTTTTGTATCAATTATCCAGAAGTTAGTTACACGGAAATACTCATATTCCTGACCCCCCCCCCTTTTTTCTGCCTATATGCTTTCAGGATATTGTCATAGGGACACCTGGTCGTATGAAAGACCTTATTGAAATGGGTATTTGTCGTCTTAATGATGTTTCTTTTGTGGTAAGTTAACTATGCATTTCATTGTGTTGTTGTCTATGGTTTTGAATTAGTATACACCCATATGGGGGCACCATGGTGCCCGGGCACCAAGGTATGTAATACACAAATTCACTCAAATTTTTGAATTTTTTTCAACTTCTGAGTATATACCCAGGTACAAGAATTTTATTCATACCTATACCTAGCAACAAACAACTCAAATTCAACTTTATTTTACAATCCATTATTACATACCTAACTAATTATAAGTTTGGATGGATGTTATATACCTAGAATCAAAATTTAACAAAAAAACTATTCAAATTAAGTTCAAACTTATATGGACTAGTTAGTAAAGAAGTTAATGTTTATACCTAAACATTTAAATAAATGGTTATATATGCTAAATTCCATGGATAACAAGAGAAAAGAAACAATATTCAAATGAAGGATAAATACTACATGATGTGTGGTCAACTTCCTCTATCTCTGCCCAGAACTACATGTCCCATGCCAGAGCTACACATGCATCATGTACCTCCTTGATCTTTTCTCCTATAGTAACTCTTCATTTGTGAAAGTAATGTCCATTTAGGAAGCACGCATCTTGGAATGATTGAATGGTTGTGATTCATGGTGCAGGTGAAATACATTCTCATCAAATCTCAAGTTCAAACTCAACTTCGTTTAGGAGTAACAAAAAAGACAAATTTCAGGTGAATAGTAACATGACACTATTCACCCGAAATTTGTCTTTTTTGTTTCTCTTAAATGAAGTTGAGTTTGGATTTGAGATTTGGTGAGAATGTATTTCATATCTACACCAATCTCTAGTAATTTTTTTTCATGAATTTACAAAACTTTTAGGTATGATTTTCACGAGTTTCCAACATTTAGATCATTTTCATCGATATGTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATATATATATATATATATATATATATAATTTTATTTATTTGTGAAGTTTGTCATTGATGTTTGAGTGTTTCTTTGAGTTAACAAACAATATGTTTGTGCAGTTGTAATGCATGCACACTAAACAATGATTATGTTGAATCTATTTGTTGTATTACATTGGAGGCCGGAGAACTTCATTGCACCTAACAAATTGTTGGCCACACTTTGTTTGCCATGCCACACCTATGGCAAATTGAGTTGTGGCAATGTTAGGCAACAACCAAACAGACCCTAAGATTCTTAACATGGGACAAGCCTAGAGAGAAACGCAGGTGCATGATTGATCTTTAGGTGGTGTTGTAGCAACACTCATGTCAAGATTGCTTTGTTCGCTGATTTTTTTTTTTTGGTGTTACCCCCTTGATAATAACACCACAAGTTTGGCATCACCTGGTTCCATCAAATTTGAGTAGTTGGGTTGACTGGTCAATGATTGTTTCATAAAATTAATAATGCACAACATGAAAGGAATTATATCATTTTTATAACTTGAATTTGCTGTTACCTAAGAATAATATGGCTGAGGAACTATGCTGGTTTCTAGTGTACATAGTTCATATTGGGTTAAATGGCCACAGTGCATATACACATAAGCAGATAATGTAGTCATTTATAGAAGACAATACAAGTGACACACCAATGTATATGTATTTTCATCCACAAGATCAGGGTTGTGGAACCTACCAGCACTAACAGATTCGGCATTTTAAGATTTGAGTGGTATTTCCTCTTGTCTCTTCCATGCCCTCTCTCCTCTGTCCCCTACTCCCCTTTGTTGAACTGGACTTGACTCGTGAGGATGGTCATAGTCAATGGTAAATATTGGTTCAATAAGTTACACCTGTGATGTTACCTGGATTTTTTATTTTGCGCTGGTCAATTTTCATTCTGTTTAATTGCTTTGCTCATTTGAAGTGTAAGTGTCCTTTCTAACACAGACGTGTCTGGTAACTGATAAAGGTTCTAGATGAAGCTGATCGAATGCTGGATATGGGTTTTGAACCTGAAGTCAGAGCAATTTTAAGCCAAACTGCATCTGGTTTGTCTCCATTACTCTCTTCCTTTCAGGGCATGTGTATGTGCATGTCCACCTTTGCATCGCATGTATTCTTTTCCTTTCATCCCTTTTTATCTGGTTGGACTTATCCACAAAGTCTGTTGCATGTGCCCTCTTGCTCCATAGTTTTTAATACCTTGTTCAGCACACTTGTGCTCATAAGTTAATAGCCACTAGTGACGGCAGAAATGAGCAAGAAATATTGTTCTCAAGATTTTCATACTTCTATATCACGTTGCTAAAAAAACCACTTTAGCCTCATGGCATTCATAACTCTTGGCATATTTTACTTACCATGATATTGAAATTGTGATGAATATACCGCGTAGGTGGAATACATTTGTACATTTTTTTCATGTCAATTTGACACTGCCATTTATTTTATGTGTTACTACACCTAGTTATCTTTTCTGAATATATCTGCAACCATGGCCATATAATTCTTCCTGTGCAGTACGTCAGATGGTTATGTTCAGTGCTACATGGCCTCCTGCTGTCCACCAGCTAGCCCAAGAGTTTATGGATCCAAATCCAATAAAGGTATAGTTTCTCTTTTCTTATCTCTTGTTAATATCTGATTGCTAATGCGGTAATGCTGACCTTCCGTATGTGGTATGCCACCTTGTTGTAGGTTGTTATTGGATCAGAAGATCTTGCTGCTAACCATGATGTGATGCAAATTGTTGAAGTATTGGATGACAGGTCAAGGGATTCAAGATTAGTCGCTTTGCTCGATAAATACCATAAAGCACAGAGGTAGGTATTGCAGTACGGATTTTACTTGTTGCTGTATTAGTCTCCATGAAAGTCTCACTTTCGAAAATCATAGGCAAAAGCATTGCAATCAGCATGCATGCTGGATGCTCTTGAGGATAACAAAAGATTTTAAGCTGAGCAGCTTAGAAAATTATGTATAAGATTGCATGTCATTCGTCTCGTCTTGCAAAATTTTCTACTTTGGATTGTATTCAGTCACATACCAAAGCTGATTGTTCAATTCTATTTGTAGGCTATCTCAGTTTGGCAAACTAAGGAAGTATTCCCTCCGTTTCATATTATAAGACGCTTTAACTTTTTCCTAAGTCAAACTTATTAAGTTTTGACCAAGTTTATATAAAACATAACAACATTTTCAACACCAAACAAACAAATATATTCAATGTTAGGTTTTAATTGAACCTCTGCACATGTTAGTATTATACTAATATCTGCTTCAACAAACTAATTAATCACCATTTGTCTTCATATGGATCTAAGCAGATTGTGCCTGTGTTTTGTGCAACAGAAACAGGGTGTTGGTTTTTGTGTTGTACAAGAGAGAAGCTACGCGAGTAGAAACAATGTTACAAAGAAGGTAGCAGATTTGTTTCCAGTGTGCGACTTAAATATTTGTGAAACTTATGCTCTACTTTCGCTAATCTACACATGCTTGTTGTGAAGGGGTTGGAGTGCTGTTTCTGTTCATGGAGATAAGGCACAGCATGACAGGACGAAAGCTTTATCTTTATTTAAAGAAGGGTCATGTCCTTTGATGGTGCGCTAATTCTAACTAATTTCTACATGGCTGCTTATAAGCATTGATAGTTCAGTTGTGGTTTTTTAATGGCTACTCTCTCTTGATTATTTGTGAGCTTAGTGTAAATCTAGTTTTTAGACTTTGCCCTTGTAAATCTAGTTGTGGTTTCGTTATTTATCCCTTAAGGGATTTTGTTGGGCTTGGTGGTATTCTGCTACTATTTCCTGATCGATGATACTTTGAGAGTTGGAAGTGTTCAACTACTTGCTTGCAACATTGTTATTAATTTAAGGAAAAAGTCTTTCTCATCCCTGAATTCTTTGCTCGGTTTAATTTTCATCTCTTAACTCCTAAACCAAGTAAATACCATCCCTCAACTCTTGAAACCATGTATACCATGAAAAATGAGTCCTGTGCCACCTAGGATCCCACGTGGATGCCAAGTACATAAACTAGAAGAGAAATGAGTTCTAGCTGGTTTTGGGAGCTGAGGGTCTGGTTTTATCAAGTTTTTGAGTTGACGGTTGGAAATCAAACCGAGCCAAGAGTTGAGGTATGATAAATTTTGGAGTATGTGAAATCATTTAACCGATAGTCTCACTTAAAATATGCTACTGAGGTTTTGTAACAGAAATGTACAGTTGTCTGCAACCGTTGTCTGAAAATATTGTGTTTTTATGAATTTGTTTCCTTTTTATCATTGCATCCGTAGCACTTTTATTCTCATCTGTTAACACTTGTTTTTTTTTTCTTTTGTATATTTTGCAGATTGCCACTGATGTCGCATCCCGTGGACTTGATATTCCAGATGTCGAAGTTGTCATTAACTATAGCTATCCTTTGACTACAGAGGATTATGTCCACAGGATTGGGAGGACCGGTCGTGCTGGCAAGAAAGGTGTTGCACATACCTTCTTCACTCAAGAGAACAAGGTATTGGAGATTATGTGCCACACATTAGCCCTTAGGTTTAGCCTTACAACTTAAGTTGTACTTATTGTCACTTCAAAACTATATACAGGGACTTGCTGGTGAACTTGTCAATGTTTTGCGGGAGGCTGGTCAGGTCGTTCCTCCTGCACTTACAAAATTTGGCACACACGTCAAGAAAAAGGTTTGTGTTAACTGTGAAATAGATCTTGTTACATTCTCATTCGTAGAGTGCTTTGTTCATGTCTATAGGTACTACCGTGCTAGTTAACTAGGAATATGTCCTCGAGAAATCGTTTCAATCTATGAAAATACTGTTATATATGCTGATGCTTTATGCTACAGAAAGCTTAGCGACTTACTTTTTTACATTAATCCTTAGAAATGCTGTAACACCTTGCCCTAACGTTGCAAGTTCTAAGAAATAAACACTAAGGACTTTGCATGACATGACTGAGAAATGACCTTACCTTATTGCTAACAATTCATTTGCAGGAATCGCAAATATATGGATCTCATTTCAAAGAAATCAAAGCAGATGCTCCTAAATCAACAAAGATTACGTTTGGTGATTCTGATGAGGACTAG</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA001858