Os11g0309000
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Structured Information
| Gene Name |
Os11g0309000 |
|---|---|
| Description |
Synaptojanin, N-terminal domain containing protein |
| Version |
NM_001074287.1 GI:115485222 GeneID:4350352 |
| Length |
15587 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os11g0309000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:11830674..11846260 |
| Sequence Coding Region |
11830965..11831095,11831311..11831377,11832362..11832451,11832626..11832719,11833350..11833422 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008404:11830674..11846260 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgagtgttgcaactgaagcatgcccttcaccaaagctacacacaagactaaggctgtgggagtttgcagaccgttacgtatttgaaccagttgacggtcttgctgatttgttcctgtcagttgatcggacaaatggatcaatgagtctagtggaagagttgccacctcgtggtccctctacaaatcctaaagttagaatagtttttggtgtgattggagtgctcaaacttgcagttcggtcgtactttcttgtgatcactggccgtgattgtgttggatcctacttggggcatgcaattttcaaattgacgggactaaaagttctgccatgcaataactcgttaaatacttcttctgctgagcagaagaaaatggaatcagaattttcggaacttctggatgcagcagagaggactataggcctgtacttctcctatgatgtcaacttaacactaacttcacagaggctgcatgatctaggagatcagtttaagtcacttccactttggagacaggcagaaccaagatttctttggaacggttacttgttggagcctctaattgagaacaaactgcaccaatacttactaccagtcattcaaggaagttttcagagtatccatgcagaagttgggtcagagaaggtaaatgtgaccctgattgcacgtcggtgtacacgtaggataggtacccggatgtggaggcgaggagctgatccagagggttatgctgcaaattttgttgaatcagagcagataatgcaatcgaaagaatttacagcatcatatgtgcaagttcgaggttctatgccttttttgtgggaacaaattgttgatttgacatataaacctagttttgatgttgtcagagtagaggaggcgcctcgtgtacttgaacggcattttcatgatttacaaaagaaatatggagctgtcgtggctgttgatcttgtcaatacacatggtggcgaaggtcgcctgtatgaaagatatgcaaaatcaattgagcctatcttgagtgaagatataagatttgtgcattttgacttccatcaaatctgtggtcatattcactttgaacgcctttctcaactgtatgatcaaattgaggattatcttaagaagcataggtacttccttttaaatagtaaaggtgagaaaatggaagagcagaccggaaccgttagaacaaattgtgtcgattgtctggatcgtactaatgtaactcagagcatgatcgggagaaaaatattggaaagccaactgcaaaaaatcagtgttcttggtgacaacaatacaatcagcgattatccggcatttgatgcagattacaaagttttgtgggccaaccatggcgatgcaataagcactcagtactctggaactcctgccttgaagggagactttgtgcggtacggaaagcgaactacacagggaattttaaatgatctgtggaatgcaatggctagatattacctgaacaactttgcagatggtactaaacaggatgccatggatcttcttcaaggacatcacatatcctcagttagtcgggatatgccaactccaaccaaaggacttatagagaatcacgcgtccttccgccttgcttttgctctgcttttggctgccgtgatattcttgataatgtcactgagaagagcacgtaatgatgttttccatttggtgctgtcactactatggtctggtttttgctttggcatcacgcgttatgtcaaagctaacggacggaagttcacgaaccgtcctcgctttcacctatcgcgccattga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSVATEACPSPKLHTRLRLWEFADRYVFEPVDGLADLFLSVDRT NGSMSLVEELPPRGPSTNPKVRIVFGVIGVLKLAVRSYFLVITGRDCVGSYLGHAIFK LTGLKVLPCNNSLNTSSAEQKKMESEFSELLDAAERTIGLYFSYDVNLTLTSQRLHDL GDQFKSLPLWRQAEPRFLWNGYLLEPLIENKLHQYLLPVIQGSFQSIHAEVGSEKVNV TLIARRCTRRIGTRMWRRGADPEGYAANFVESEQIMQSKEFTASYVQVRGSMPFLWEQ IVDLTYKPSFDVVRVEEAPRVLERHFHDLQKKYGAVVAVDLVNTHGGEGRLYERYAKS IEPILSEDIRFVHFDFHQICGHIHFERLSQLYDQIEDYLKKHRYFLLNSKGEKMEEQT GTVRTNCVDCLDRTNVTQSMIGRKILESQLQKISVLGDNNTISDYPAFDADYKVLWAN HGDAISTQYSGTPALKGDFVRYGKRTTQGILNDLWNAMARYYLNNFADGTKQDAMDLL QGHHISSVSRDMPTPTKGLIENHASFRLAFALLLAAVIFLIMSLRRARNDVFHLVLSL LWSGFCFGITRYVKANGRKFTNRPRFHLSRH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>15166..15296#14884..14950#13810..13899#13542..13635#12839..12911#12627..12735#10070..10169#9064..9162#8918..8988#6413..6490#6136..6222#5650..5756#5406..5486#5238..5271#5099..5155#1702..1759#1455..1546#1009..1374#ttcattccaccctcttccgatccccaaccgccgctggtccgtatccattccactctcctccgacccctaccgctgccggagtgctaggtgcgtcaggatctaatccctctttgtgtgcttcgtttcctacggcaattttgaattgtttatacaaaattttggggcgcatgatttgacagtgagaccgtgatggatcgatcttgaggcgctgaacgtactgcttgccaaaatttctcggttttgcgtcgtggtgcgggtgtgtgaggagcgttttgcattttaattttagggtatgaatattgacttgtcagtgcataattatatgaaatcatggaatagcattttgtagaaaaaaagaaaatgtgagtcctaggcactgttggcatgattgatagaaaactgtgtacattttttatgatgcaaggtcaggatcatgtgatgagtattaaaatcaggttatggattttcttttcacattatattatctgtgcattcttatgtaatagctttcttgtttatttgacatttatagttatccggtttgatttccctatctatctattgtgataaaaaggatacatggcagggtaccttccctggcccttttcgtcatacttgtttggcttcttgtctcatatgctctttttgtcttgctatatgcgatatgatatgatcatcggaccatggctatctaacagttctagatgctgaaggatgttggttccatggcccacaaatcccaattagttttttaaggatgttagtttaatgtgcatgtgtttgtattctatgattacaataggcttatccttactaggaaaatcctgacacttgtactgttattggttattttaagagcacgataacattattcaggtattcatctgttactattgttccagtatattatgggcatcacatgtcttgactggttatatctgtggcccatatttatcattctgatgatttaacatttactcatgtattcctctatcagggcatcacacgatgagtgttgcaactgaagcatgcccttcaccaaagctacacacaagactaaggctgtgggagtttgcagaccgttacgtatttgaaccagttgacggtcttgctgatttgttcctgtcagttgatcggacaaatggatcaatgagtctagtggaagagttgccacctcgtggtccctctacaaatcctaaagttagaatagtttttggtgtgattggagtgctcaaacttgcagttcggtcgtactttcttgtgatcactggccgtgattgtgttggatcctacttggggcatgcaattttcaaattgacgggactaaaagttctgccatgcaataactcgttaaatacttcttctgctgagcaggtttggaagtgattatttgggccttatttacaatttctttccatccatattccattagtcattccataaagctcttgcagaagaaaatggaatcagaattttcggaacttctggatgcagcagagaggactataggcctgtacttctcctatgatgtcaacttaacactaacgtgggtacctcaatgaatattatgcctttttttttcttgcaaacatttgcctgaagtgtatagagggggttccatctttcttttttttttgttatcttcctcttctttcgttttaagttggttaagcatttatctctgccccttatatgttgtagttcacagaggctgcatgatctaggagatcagtttaagtcacttccactttggagacaggtttgttgcctagctccttacataattccgtggtttgcttgtgcatgaaattcctgatcttttttatcctttcttatataatctgcaagcttctatagcttgtcctcaacatcttcacatgatttataccgctttccttattatggaacctaattgtatatttggttattacttattagatcagtggattacacttgtgatgtagaaagatggaattgaagttaaaattttctaaatgcaatgtgtttcatttggccgatatttgttttttagataatggaagctttattaagactcagttaaatacaccaagatgatacattccaactgagtccacccccggcctctgcatagaatgcacacaaccaaaaaactggacctaagaacacttccccatcacaaaacatagaaactagtggctatcaatccgtagactagatcgccacccatgctcctgggtaaaaaactcctgtgccacctaatccaaacgttgcgataccaccgcaatagtatcccgaagtccctgtttgtggaggatggcccaggagcgtagccaccgggtgactaaagtagtaacctgcaaaggagaagacaccaccttgttatcaaaaattacctcgtttctgcttagccatatggaccaacaaagagatgctgcacccatcaaaagcagatttctcatgtctttaggaacacaagtaagccaacgcccaaacaagtgagtaatattttgaggaggttgtatgttcgaagccatatgaacaacagaccataccaagcgagaaacacgacattgaaaaaacaaatgttgaatggtctcttccttgtgacaaaagccatgttgaatggccgatatttgtagttgcagctaaaaatttttgatgctcaatttgtggttaatattttttcatgagaagtcacgtgtgacaaaattgtaacgatgtgattttccatttaagaaactcaatttataataccacacactcctagttagcatattccttcctgagaaaatagctatcatacaaatccaagcgaaatgaaccaaatgcatgaaagctatatcggaacatgtcacacaatagattcttacttaatttgtaaattatagtttctagttttaaatagactgtcaaatggaagattctcagttcaatgaacaggtccaagaagcaagcagaagtccatagcgtacctagaataaaatattcatgtgcttcagtttaaaaatattttctagatgtacaatatagtatgtttgcttttatttccttgtcctgatttcttaagaaggatgtggtgggagaaattagcaaaagctgatgttacattttgatttttccgtgatgacatttgcaccgtattttagaatattgctaacactgtgcccattggtaatgattctactagcatcctgcaaaatcttcaagcttatcctttggattcttttaaggttcattgaccttttttttcttgaatatgcaagagaaatacgtatcatttcattaagacaggaaaaaaaaacgaggagggaagaaaaaccctccctcaccctacaaacaaacaggacctgaggttacatatgaaaaggaacaaaaacaaccttacccaaacggggttagcgacctactagggaaatatgtgagcttagaagctccggccatacaccataggtcatactcatttgccaccgtttggatgacagacattacattaggattgacgccgttaaacaaacagtcgttcctatgcttccagatttcccaagccaccaaaatgataactgtattgagccctttttttttggagttttgatcaatgcctcttacactgccttaggccaccaacagcataagcaagtagaattttgacttggagaaatggaaatcagccccaacctttggagaattagtgaccacacttgttgggaaaagacacaagtaactaggatgtgattaatggattcctcagcctggtcagaaagcatacaagtagcaggatgtggcagtccacgcttggcaaggcgattagccgtccagcaatggttattaattggaagacatagaaaaacttgcaccacaagggcgcctagctctcccaaagtcttctgcatagtgagaatctgattgtgccaacaaaggactcatatgctggtttgcacgtgtacgattccgactttgtgaacttccaacgttaccatcctgcaagaccgcattggccactcagtaccaaacttgcaagtattctataatgacctggacagtgaaatgttcattgacttattttacgctttcttattaaatgttataactctgtgagggacagtgagaaaggtggtgcaaaaaaaggaaagaacacacagatggagcccatgtcatgattaagacatcttgtttttcataaagacaatcggaaatagaaatgaacgctagctacgacatacaaatgaaagacaaacatgtcatagcatggttagcaatcacagtgaatatcttttaaaactttgtttgatggtattcactgaaaaaactgttccgtaaacaaaatgaaaaattgagttgtaacaacatatgcaaataatttttcaatccaccgcttatttttattacctttttacaattaagtcattgaccacacttttagtaatactaaggactgttttggtttgataccaagaccccttccaatattttggccacttgaatagtagttgtgatgcatttgggttggagccatatttttggcaatgcccatgtccaaattggcagcagtcgaaagctgtcttaacctacaaagaattggctcataattggcatcaaaccaaaccaaatcaatacaatcctatggaccctaccaaataattggtagtactgaaacttgcctaggtttcagcactaccaaaacagtgtagggtagtaatccaaaacaactttaatcaactaatagagtttgatggtagtggtaaaagtgataggagcatgattttttttctactactttgaagacacagttgcc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