BGIOSGA002950
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA002950 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA002950, complete gene. |
| LocusTag |
B1015E06.1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA002950-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA002950-PA |
| Length |
5744 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:5805280..5811023 |
| Sequence Coding Region |
5805280..5805311,5805446..5805557,5805973..5806035,5806106..5806244,5806460..5806515 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:5805280..5811023 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:5805280..5811023 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCGTCGGGAGCTTCAATGATGGCGCCACGGTGCGGGGTTTTGACGGTGGAAATTGAGCATGTCGACGCTGTAACACTCGAGAAGCTTGAGAAACAGGGCATCGATTGTGAGCCCAAAGCCTCCACCATCATGATTATTCAAGACAAGTACAGGCAGAAAACTCATTTCTCAAAATTTGGAATTCCGTTACCTGACTTTGTGGAAGTAGATACTTTAAGTAGCATAGAGAAAGCTGGGGAAATGTTTGGTTATCCTCTAATGGTCAAAAGCAAGAGATTAGCATATGATGGCCGTGGAAATGCTGTTGCTCACGACAAAAAAGAGCTATCTTCTGTTGTTGCTTCTCTTGGTGGGTTTGAGCATGGCTTGTATGTTGAGAGGTGGACATCTTTTGTAAAGGAGCTTTCTGTCATTGTGGCAAGGAGCAGAGACGGTTCTACGGTGTGCTATCCTGTTGTTGAAACCATCCACAAGGATAACATCTGCCATGTTGTTGAGGCTCCTGCCGAGGTGCCTGATAAAATAAAGAAGTTGGCTACTAATGTAGCTGAAAAGGCTATCAAATCATTGGAAGGTGCTGGTGTTTTCGCTGTAGAATTATTTTTAACACAAGATAATCAGGTTTTATTGAATGAAGTAGCTCCAAGGCCTCACAACAGTGGGCATCACACAATTGAGTCATGTTATACCTCGCAATATGAGCAACATTTACGTGCTATTCTTGGCCTTCCTCTTGGTGATCCTTCAATGAAAGCGCCTGCATCAATAATGTACAACATCCTGGGTGAGGATGAGGGTGAGGCAGGATTTACTCAAGCTCATCAGTTGATTGAGAGAGCTTTGGACATTTCAGGTGCATCTGTCCATTGGTATGCAAAACCAGAAATACGGAAGCAGAGAAAGATGGGCCATATTACAATTGTGGGGCCTTCAAAGTACAGTGTAAAAGCACGCTTAGATAAGTTGCTGCAAAGAGACGCATATGACCCCAAGAAAGTTAAACCTCGTGCTGCAATAATAATGGGTTCTGATTCTGATCTTCCTGTCATGAAAGATGCTGCAGTAGTATTGAAGAAATTCAACATACCTTTTGAGCTTACAATTGTTTCGGCTCATCGTACACCAGAGAGGATGTACCATTATGCATTATCTGCTAAAGAAAGAGGCTTAGAGGTCATAATTGCAGGGATGGTGGCTTCATTGACTTCTGTCCCAGTAATAGGAGTACCCATCATGACTTCATCTTTACATGGAACTGATTCCCTCCTATCTATTGTCCAGATGCCGAAAGGTATTCCTGTTGCTACTGTTGCAATTGGAAATGCGGAAAATGCAGGTTTATTGGCAGTTAGGATGCTGGCCTCAAGAGATCCTGAGTTGGGGGACAAGGCAACTGAATACCAGCATGATCTGAGGGATATGGTGTTGGAGAAAGCAAAAAGGCTCGAGGAACTAGGTTGGGAGGGATATACCGAGCTATACTTGAAGAAGCATTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSSGASMMAPRCGVLTVEIEHVDAVTLEKLEKQGIDCEPKASTIMIIQDKYRQKTHFSKFGIPLPDFVEVDTLSSIEKAGEMFGYPLMVKSKRLAYDGRGNAVAHDKKELSSVVASLGGFEHGLYVERWTSFVKELSVIVARSRDGSTVCYPVVETIHKDNICHVVEAPAEVPDKIKKLATNVAEKAIKSLEGAGVFAVELFLTQDNQVLLNEVAPRPHNSGHHTIESCYTSQYEQHLRAILGLPLGDPSMKAPASIMYNILGEDEGEAGFTQAHQLIERALDISGASVHWYAKPEIRKQRKMGHITIVGPSKYSVKARLDKLLQRDAYDPKKVKPRAAIIMGSDSDLPVMKDAAVVLKKFNIPFELTIVSAHRTPERMYHYALSAKERGLEVIIAGMVASLTSVPVIGVPIMTSSLHGTDSLLSIVQMPKGIPVATVAIGNAENAGLLAVRMLASRDPELGDKATEYQHDLRDMVLEKAKRLEELGWEGYTELYLKKH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..32#167..278#694..756#827..965#1181..1236#2448..2521#2630..2777#2865..3038#3169..3256#3356..3469#4088..4185#4287..4377#4800..4894#5032..5138#5636..5744#ATGTCGTCGGGAGCTTCAATGATGGCGCCACGGTTAGCGAGTTCGCAAAGAGGTGGTGGCCCCTAGTTGCAAAGCTCTTATCAAGCTTCATTCGGAGAACACTTGTTTAGTTTCAAGCTCTTATGGTTTACAAACTGTTGTAAAAAATTCCTTTGGTTGCTGTTAGGTGCGGGGTTTTGACGGTGGAAATTGAGCATGTCGACGCTGTAACACTCGAGAAGCTTGAGAAACAGGGCATCGATTGTGAGCCCAAAGCCTCCACCATCATGATTATTCAAGTAAACTTTCACTTCTTGTTCTAACCATCTCTATATTTCGTTGTTGCTAAATTTTAGTACAAGTTATCTTTAGTACCTTTTTACTGTGAAGATGAAACCTTGAATTATAGTTAGCACTTGTGCTATCTAACTAGCGTTATGCATACTGTTAACATTCTGAGCACTTTTGCTAACTAGGTTAATTAGTTGTGGCCATATCTATTGTTCCTACTTCCTCCAAATAGATTGCTACTGTGCATTTTAGTTATTTATAAATTTTATGGCATTCATACCATGTGTCACCTGGAAATTGTATTTGTGGCGACACCTCTTTTTTAGTACAGTTTGCATACAAAATCTTCATGCTACGGCTTGCTGCTTCATATGCCATTTTATCCTTATCTACTTCATTTGATGCATCCATGTTTTATTTCAGGACAAGTACAGGCAGAAAACTCATTTCTCAAAATTTGGAATTCCGTTACCTGACTTTGTGGAAGTAAGGCACTAATTTCTATCTTGTTAGAAACTAATTGAGTGTCTGATATAAATAAAGTAATACATTCCAGGTAGATACTTTAAGTAGCATAGAGAAAGCTGGGGAAATGTTTGGTTATCCTCTAATGGTCAAAAGCAAGAGATTAGCATATGATGGCCGTGGAAATGCTGTTGCTCACGACAAAAAAGAGCTATCTTCTGTTGTTGCTTGTAAGTTGATAAAAATTAATGGAGCTGCTTTCTTTATTTGAATTCCTAAAATTATACTCTCTCAAGGATGCTGTTACTTGGTTTACAGTAGTATTTGACATTTTTTTCAGCTGTTAATTTGTGGCTTATACTTTTGAACAGATGATTAGCTGATCCACTCAGCTGTACAAGTAAATGAGCTGATGAGGATTTTTTTTTTCATTTTTCCCTTGTAGCTCTTGGTGGGTTTGAGCATGGCTTGTATGTTGAGAGGTGGACATCTTTTGTAAAGGTTAGTATCAATTTAATTTTTTTGGGTCAAATTGGCAGCTAGTAATTTAAATTTCTCTTGGTCAAGTAGACAACTAACGCTCTTTAAGTGTCTCATTAGATTGATCACCAAACACTATAGCTAATTTAACACATTTGTTTCATAATTCAGATATTTTTGAATTTTCTAGGCCCTTTTTTTTTTGTAATTTAAATCATCTTCAGTATCATGGTTCACATGGCAGTAGATTTAAGGTCATATGCCTGTGTAGTCACTAGGTCATCGTGTAAATTATGCTACATCCTGGTACCCCTATGGCTCTACAGTCATGCCGCATTCCTTGTTTTCTGTTGATTTTAGGATATCTTCTGCAAGTTCGTTACATGATACTCCCTATGTTCCAAAATATAAGGCCTATAGGTTTTCTACAGTCTCCAATGTAAAATGTTTGCCATTAATTTCTTTCATAATATATTAACAACTACAAATTTGACATTATACAAAAGTGCTTTCAAATACAAGTCTAATGATGTCACATCTATGACACTAAACATATATATTGTTAGCTTGATTCTTAGTCAAGGTTTGCAATGTATATTTTCCTAAAATTGTGGCATCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTATCTTCTTAATGGAAAAATTGCATTTGAGGTCCGCGAAATATTGCCTTTCGTCTATCAAGCTCGTGTACTTTCTAGTTTGTACAGTGAATTTGGCTTTGAAACTTGGCAACATGATAAATATAGTTGGTTTCAGTGCAGGTCAACTGTTTCAGTATTTTTCAATACCACACGTGCCATATTTTGCAAAAGATACATGGGGATGCATCCTAAAAGGGGGATATATTCTAATCTTTCAGATCATAAAATTTCAAATCTATATTCACTCTACAAAGGCCTGTATTGTATCTGGCACATGGGCCATTTTGTCATCAACAGCAGGTGTAATGAAGGGCCTAATTAAACATATTCAAGTAGTTGAGGGACTTGAGCTAACAAATTTAAAGTATTGAGATTTTATTAGACAAAATGCAGCAGTCCAGGTACCTCAATTGCAATTTTGCCCTTTTGTTTTCAGAGTCGTGTTTGAGAATCAGACAAGAATATAACTGTTTGCTCTAATGTTTACGACATTGTCATGGTTTATGGTTGATGACCTTTTGAATTAAGATACTTCTATTATTTATAGTCTGTTGCTTTCTTTCTTGTTTTAGGAGCTTTCTGTCATTGTGGCAAGGAGCAGAGACGGTTCTACGGTGTGCTATCCTGTTGTTGAAACCATCCACAAGTAAGATTTTCTTTTATGATTACCTTGTGTTATTGATTGGCATTGTCTGTGTTGTGCTTTTGCCCTTTGGAATTCCCAAAATATGAATCCTTAGATTGGAACATCCAGGGATAACATCTGCCATGTTGTTGAGGCTCCTGCCGAGGTGCCTGATAAAATAAAGAAGTTGGCTACTAATGTAGCTGAAAAGGCTATCAAATCATTGGAAGGTGCTGGTGTTTTCGCTGTAGAATTATTTTTAACACAAGATAATCAGGTTTGCTGGGAACATACCTGTATCATAAGTTTTAATCCTTCTTGAGTGGTGTTGGCATATTTATACCCATGTTGATAATTTCACTAGGTTTTATTGAATGAAGTAGCTCCAAGGCCTCACAACAGTGGGCATCACACAATTGAGTCATGTTATACCTCGCAATATGAGCAACATTTACGTGCTATTCTTGGCCTTCCTCTTGGTGATCCTTCAATGAAAGCGCCTGCATCAATAATGTACAACATCCTGGGTGAGGATGAGGTAACTATTGCAACACTATCTTTTTACTTATCCTTGCTATTTGGGCCATGTTGAATGTGGATAATTAGGTTTCCATATTCCTGTTACATTATCCAGTTACCTTTATTGGCATTGATAATTTATGATATAGGGTGAGGCAGGATTTACTCAAGCTCATCAGTTGATTGAGAGAGCTTTGGACATTTCAGGTGCATCTGTCCATTGGTATGCAAAACCAGGTTGGTTCACATACTCATCTGATGGTGCTACAGAAAATGAACGTGCCTGCTTCTTGATTTTCATGTTGCTGTTTATAAAATTGTTTCTTTTTCTTTCAGAAATACGGAAGCAGAGAAAGATGGGCCATATTACAATTGTGGGGCCTTCAAAGTACAGTGTAAAAGCACGCTTAGATAAGTTGCTGCAAAGAGACGCATATGACCCCAAGAAAGGTTAGATTATCACATGATGTTTGTAATTCTGATCTTTGTTAACTTCCCCGTTGATAGTGGTAGTTAATAAAGTATCTTCAGGATTGCTGTGTAGTGCAGCACCATAACCTTTTGTTTGGCCTAGGATTGTAAATGGTGAAGTTCAATTTTGTTGAGCTGTTTTCACCAACTTTAGTTATTACAAGGGCATTTTTATTTATTTTCAATTAAGGAGCATCCTGTTCTCTGGGAGTTGCAAAATAGTAGCTTGGAATGGGCAGTAGATTTTAATAGGATCTATTTTAGCCAAATGAAGAAAGAATAACCTGTCAGGATGGAAAGAGACTGTAGGAGGCATGTGTATTCTGAATCATCTATTTAGAACATCCAAGTCTGAGAATACAGTTGAGGCCTGACAAGGATTTAATTGATAGATATCCATGCACACAGCAAATTATATGGTTTGTCTAAATCATAGGTAACTCTGTTTGATGCTCACCGTTGTTGTTTTATCTGCCATGGTAAAACTAATCATGCTTTGTTGTGCCACCTTCTGACCCACTTTACTTTCTAAAAAGTCCTTTCATGTTCTTCATACCAATGGGCTGACAAAGTATAATAATATTGTACTAATTGCAGTTAAACCTCGTGCTGCAATAATAATGGGTTCTGATTCTGATCTTCCTGTCATGAAAGATGCTGCAGTAGTATTGAAGAAATTCAACATACCTTTTGAGGTTTGATCTCTGAAACCCTTCCATTGACAAGTTATGAAATGTTTACATGCTAAGTCAAAATTTTCTAAGGATGCAAAATGATTGACTGTCGAATTTTGTAGCTTACAATTGTTTCGGCTCATCGTACACCAGAGAGGATGTACCATTATGCATTATCTGCTAAAGAAAGAGGCTTAGAGGTCATAATTGCAGGTGCAGGTGGAGCGGCTCACTTACCAGGCAAGTGTGACAGAAAAAACACATGCATGAATGCATCATAATACTTCATATTAGTTCAAGACCAAATTATGTGCATACTGGTACACTTGTGTTTTGTCTAGATTATGGTACTTGGACTCATTTCATTTCGAGCATCAATTCTTGCTGTATTTTTCTTCCAAACTGAGTAATAAGGAATGCTATATAACTGGATCATTTCATTGTGTTCTATTGTAGCAAGTAGCAAGTGCTAGTTTCACCCTGTGCTTGAGTTGCTGAAATGGATGCAACACACGTTTGGATAATGGGTTCGATGTTGGAAATGTAGACCAAACGCTTATTTTATAAAGAAAATTATTCACAATCCATCTTGATTAATGAATGATAATATATAAAAAAAACTATTTTTGGTTCAGGGATGGTGGCTTCATTGACTTCTGTCCCAGTAA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|
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