BGIOSGA003476
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA003476 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:J023044E12, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA003476, complete gene. |
| LocusTag |
B1051E10.48-1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA003476-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA003476-PA |
| Length |
7457 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:15514584..15522040 |
| Sequence Coding Region |
15514584..15514654,15515174..15515262,15515413..15515841,15519476..15519663,15520103..15520161 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:15514584..15522040 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:15514584..15522040 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCTTACTGCATCCGCCACTCTCCGGGCCGCTGCCAGTGCTATCCGTCGCCGCCTACCACGTCACAACGGTTGGGCTTGCCCAATCCAAATTCTATACTGCCAGGGACTGTAAGGGAAAACGGGCAGGGCATGGTGCTGCAAATAAACATTCCCCCAGATAGCCAGCAGGAGTCCGTCGCCGTTGGTGGGAACGAGACGGTGGCCGCGCCCGCGCGCGAGATCGGAGCTCCGGGGAGGCGAGGCGCAGGCGCAGGTGGGCGCGTGTTCTACGTCGGGGGCACCCCGTTCGCGCTCTACCGGGAGGGATCCGCGGGGCGGGGAGTGGTGGGGAACGCCGCGAGCGCAGCCGGGATGGGCGCCGAGGAGGAGGAGGAGCCGGCGTCGGCCGTCGGGAGGGAGGGGGGAGGAGGAGGAGGCGGGGCGAGGGCCGCGGGGGCGGGGGCGGGGGGCGACACCGCCGACGACGACGACAGCGGGGAGAGCGCCGCGGCGGTGGTCCCGTGCTCGATCTGCCTCGACGCGGTGGTCGCCGGCGGCGGGGACAGGTCCACGGCGAGGCTGCAGTGCGGCCACGAGTTCCACCTCGATTGCATTGGTTCAGCATTTAATGCCAAAGGAGTTATGCAATGCCCCAACTGTCGCCAAATTGAGAGGGGGAATTGGCTCTATGCAAATGGTTCGCGTCCATCACAGGATGTAAGTAATGATGATTGGGGTCATGATGAAGACTTTTATGATGCTAATCAACCAGAGACATCAAGGAGTGTCTTTTTGCCATTCCGCTTCCAATGGTGTCCTATTGGCCGCTTAGCCCAACTTCCATCTGTATTTGATGAAGGAGAGTCAGCACCACCCGTAACCTTTCATGATTTCATGGGACAGAACTTCACTTCTGAGCATTTGCCTGTATCAGCACCTGGGGCAACTCCTCCAGGCCCATATATCGCTTACTTTCAGCCTCTTCAATCATCGGCATCATCATCAAGTTCCCATGTCACTGAAAGAACTATGGATGGCACCACCTATCATGATCACTGGAACCCCCTACCTGGGCCATCAGATGGTCGACCATTGGCTACAGTGCATCCCATTGATTTCCATCATAACCACTGGACGCACCTGCCCAACTCCTATTCTCAACCCAACAGCAATAATGGTGTAGCTGAGCAGATGGCAATTCCTGTGGTACCAATGAGGGTTGGGGGCCTTGATAGTGATAGCCAACAGCGAGGATCTCTCCCCTCAGTTTATGGAAATGGATCTGGATCAAGGTCTAGAATTCCAAGTGTTCCTCCTATGGCACCACAATTCATGAGGCCGCATGGTAACATCAACGAACAATATCAGCAGAATTCGTCCAGCCTGTATGCTGCGCCGCAGCGTAGGACTGCCGTGCAGGCTGTCCAAGACAGCATGAACTTTACCCTGTTCCCGCAGGCTCCAACTGGCCCTAATTCAATGGAGACGGAGGATGCCGGAGGCAACCAGTTCTATGCCTGGGAGAGGGACCGCTTCGCCCCTTACCCGCTAATGCCCGTAGATTCTGAAGCAAACTGGTGGGGCAGCACGCCGCAATCCCATGGCGTGACGGATCATTCAGCTGCCCCCGGTAGGAGGCTATTTGGTCAATGGATCGGCGCCGGGAGGTCGCCACCGCCGCCTCCACCGCCACCAGCGGAGAACAGATCACCGGACAACTCGTCGTACCGACAGATGCACATCCCTCGGATGTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAYCIRHSPGRCQCYPSPPTTSQRLGLPNPNSILPGTVRENGQGMVLQINIPPDSQQESVAVGGNETVAAPAREIGAPGRRGAGAGGRVFYVGGTPFALYREGSAGRGVVGNAASAAGMGAEEEEEPASAVGREGGGGGGGARAAGAGAGGDTADDDDSGESAAAVVPCSICLDAVVAGGGDRSTARLQCGHEFHLDCIGSAFNAKGVMQCPNCRQIERGNWLYANGSRPSQDVSNDDWGHDEDFYDANQPETSRSVFLPFRFQWCPIGRLAQLPSVFDEGESAPPVTFHDFMGQNFTSEHLPVSAPGATPPGPYIAYFQPLQSSASSSSSHVTERTMDGTTYHDHWNPLPGPSDGRPLATVHPIDFHHNHWTHLPNSYSQPNSNNGVAEQMAIPVVPMRVGGLDSDSQQRGSLPSVYGNGSGSRSRIPSVPPMAPQFMRPHGNINEQYQQNSSSLYAAPQRRTAVQAVQDSMNFTLFPQAPTGPNSMETEDAGGNQFYAWERDRFAPYPLMPVDSEANWWGSTPQSHGVTDHSAAPGRRLFGQWIGAGRSPPPPPPPPAENRSPDNSSYRQMHIPRM</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..71#591..679#830..1258#4893..5080#5520..5578#6027..6055#6151..6547#6983..7457#ATGGCTTACTGCATCCGCCACTCTCCGGGCCGCTGCCAGTGCTATCCGTCGCCGCCTACCACGTCACAACGGTAAGCAGATCTCCCTATGCCTTGCCGTTATTCTCAATCCCCGGAGGTGCCCCTTTTGAACATAGCTCAACTCTCAGGTCATCGTCGGCGACCCACACAGGCAACTTCCATCGAATGGATGAAAGCCCTCGAGTCACGACGGCGCCTCCTCCTCAACGGCATACCAACAACGGCAGATCTATAGTGGTTATACTCAAATCAGAATCTCCAATAACCGGCTATGTGTAAGTCCATTCCAGATCTATTCATTTTGCGATTCACCCTAGATCTAGAGTCTTCTGCAACCTTTAAGCTCAAAAGTGTTAGATCCACAAATGTGTACTCTATCCGCCCAAAAATATTATAACTTTTGAGTGGATGGGACACTTTCTGCTACTATGAATCTGGACATGTGTTTGTCTAGATTCACAGTATTAGGATGTGTCCCATCCACTCAAATACTGCTATATTTTAGGACGAATGAAAATTATGGTTTATCTAAATCAACCTTCCTTTTTTTTTTCTTTTTTACAACCATAGGTTGGGCTTGCCCAATCCAAATTCTATACTGCCAGGGACTGTAAGGGAAAACGGGCAGGGCATGGTGCTGCAAATAAACATTCCCCCAGGTACCCCGACGAAAAAAACCCCAACTTTTTATTTCCTGCCGTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTCCTTTTCCTTTTTTATTCTCGTCTAGTATTATTTTTGCTTTGCTTTCCTCCTTCCTTAATAATATTTCTGGTGGACGGACACGGAGCAGATAGCCAGCAGGAGTCCGTCGCCGTTGGTGGGAACGAGACGGTGGCCGCGCCCGCGCGCGAGATCGGAGCTCCGGGGAGGCGAGGCGCAGGCGCAGGTGGGCGCGTGTTCTACGTCGGGGGCACCCCGTTCGCGCTCTACCGGGAGGGATCCGCGGGGCGGGGAGTGGTGGGGAACGCCGCGAGCGCAGCCGGGATGGGCGCCGAGGAGGAGGAGGAGCCGGCGTCGGCCGTCGGGAGGGAGGGGGGAGGAGGAGGAGGCGGGGCGAGGGCCGCGGGGGCGGGGGCGGGGGGCGACACCGCCGACGACGACGACAGCGGGGAGAGCGCCGCGGCGGTGGTCCCGTGCTCGATCTGCCTCGACGCGGTGGTCGCCGGCGGCGGGGACAGGTCCACGGCGAGGCTGCAGTGCGGCCACGAGTTCCACCTCGGTGAGTGGCTTTCTGCCTCGAGATCTCCCCCCGCTTCTTCTTCATAATAATAAGAGTTGTTATAAAGCGACGTTTCTTGTTTCTTGGGGCGTTAGAAATTTAGTGGATGAAACAATGGTCGTGAATTCTTGGAAAGGGGTAATTAGGGATTCTTCTATTACCGGTATTACAATTCGGAAAGGTGGAATTTTGGGAATGGATTAGGTTCGGGGAGATGATCAGTGTGTGTGTACGTAATGATTCGACCACATATTTCAAATATGGTAACTTCATAAGATTTACTCTTTAGAAAATATAAGAATTTCTGTATTTGAGTTGCGTACTCTTGGGATTTATGGAAGTTATATGGCCAGTATATGCTCGATTTTGTAATTAAGGTTTGTAATTTGGAAAAGGAGATTTTGGGATGGGATTTAGTGCATTCCGCACCATATTCTGCAATCTTTGTGCAAGTATATGTTCTATGTGCTTCACTACAAGAATTATGTGTCCTAAGGAGAAACATTGCACCTTTCGTTGTTGAATTGAATAATATGAATGCTGCAGCCCCCTTTGGCAGCTTGCTTCAGTGCAATATCATCTTTTGCTTACTCATAAGCAGGTATAGAATCCTGCTATTTGGCAGCACTTAGTGGTGAAGCTGTTCCAAAGGGTTCCCATGTTGCAAGAAAAGCATAAGTTGTCACTTTTGTCGTATCTTCACTGTTTCGGACTGGTGATGAGCTTGGTGTAATTATATGTCGATTTGAAACTTTTCATTGTGCTTCGATATTGTGTTGGAACTTGGTACCTCCATTTCTCTTTTGTGTTTTTGCATAGGATCAGACTTATGGGGAGAATTGGTATCTTGATGATAGAAGCCGGAGATTATGAAGTTCAGTGCACTTACAGGAATATGTTTATGTTTTTTATATACTTGTGTGATCGTTAGGGCACTTGATGTTCATTTACTTATGTGCATACTTTGGTGCCAAGGGTAACCTTTTTGTAAGCTATATAGATATTAGAAAGCTATGCATGTGTCAGTTTGCTGGTAGTTGTGGTTTGGTAGGTTCTTGATAGATCTTTTTTACAAATTGGACTAAGGGATTTGGTAGGTACATACAACTTTTTTTTACAATGTTAAATTTTCTTAAAAATGAATTTGGGCAAACTTAATGGCTGGAAGTTTGAAGATTTTTCTTGAGAGCTGGACCAAACATGTTTAACTTTGCAATGTAGTAGGAATATGTGATATATATAATCAAGGAAAAATGTACGATAATCTATCACCTAAATGCGATTTGATGTGTTGGGAAAAAATACAGCTATTTGATGGTGATTTTGTTATTGATCACTACTGCATTTTTCCTGGACATGCTGAAGTCTGGTTCTTGATATTATGATGAGCCTGATGTTATTTGGATGTACTGTGTCTATATTTGGTTTACACAGTTGTGCCATTTTGTGTTCTTTATAAGTTTCTTGTCATCTGTATCAAACTATTTGCTTTTTTTAAAAAATAATGAACTAGATAGGAGAGAAATTGAGGATCTTCCATTCCCAAATTGGCATTTGATTATTTTCCATCCTATGTCTCATTGATATTTCACAATTTTTTGTGTGTTTTGTTCACTTCATCCTTCTTATGGTCCTTTCCTGACATAATTTGTGCCACTGCCAAAAATGATCTCCTTTCTGATTGTAACATAGCAATTGATGTCCAGCATATTAAGAATTTTGTCATTAGGTAGTGTACTAGCTTATTAGCAATTAACAAAATGCTACTGTTCACCTGGACAGATCAACCTGTGGGCACTGTTGTGCCTCCCTTTGTACAATGCACCAATGACTTGTCCTAATACTCCAATCATATTGTATCATGTGATTGATTGCTTAGTAGTCCGAGCTGATGACTGTGAATTTAAATCTAAATGTCTAGTGTGAGCTGGTTTTGTTTCGTAAGTGTCCCCATTGAATGCTTGTTGGTTGAGTATTATATTATATATATGGCTACATAGGAGCAAACTATGTAAATGTGTGTTTTTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTTTGTATGTGTGGAGCTAAAACAACAGCCATTTTGGACGAGGGGCATTAAATTCATTCATACTACCTCTGCGTTTAAATATGAAAGAAGTCTATTTTACTCCCTCAAACTATTTCGTCGGATCATTTAACCCCATAAACTATTTTTAAGCTCATTTTACACCCCCTAATAGCATTTCTCCTTTTTTTTGTTTCTTTTTATATAAGCTATATTTTCAACTACAATTTTGTAGTCATGGATGACACCATTTGCATAACTGTTTGCATGAACTTTATAATCTCGATATTCAAATCAATCCTAGGTGCTTTCAGTCTAGGTAAACATTTAGAAAAAAATAAAAATGTTGAGACATAAGTTGTAATATATCTATCACCATTCTACCAAATTCCAGTGAAAATACAACTTATGGGGTGAAACAAAAAAGAGAAATACTGTTAGGGAGTAAAGTGAATTGTTTTCAATACTTTGGCTGTGTAAAATGAGCCGAGAAATAATTTAGGGGGTAATTGCTCCTGGGAAATAGTTTGAGGGAGTAAAATGGACTTTTTGATTAAATATATGCTGTTGTTGACTTTTGGACATGACTTTGACCATTCATCTTATTAAAAAAGTTATGTAAATACTGCATGCGTTTCATATTATAAGTCGTTTTGACTTTTTCCAAAGTCAAACTTCATTAGCTTTGACCAAGTTTAAGAAAAATATATCAATATTTTCAGCATAAAACAAAGAAACTATCAAAATATATTAAATGTTAGATTTAATAATTTGGTGCTATAAATGCTGCTATATTTTTCAATAAACTTGGTCAAATTTTCAAGAAGTTTGACCTTAAAAAAGTCAAAGCAACTTATAATATGGAAAGGAGGGAGTATCATTTGTCTTGTTGTGATTTGTTTTATCATCAAAGGTATTTTAAGCATGACTTGTATTTTTCCTTGTTAGAAATAAAATTTTGAATCAGACAAATGGTCAAACATCATGTCTAAAATATCGTATATTTAAAAATAGATAGAAGTAAGTATTAGTTCTGTACTTGTTTCACCTTTTCCAATTCCCTTTTACTTCATATCTTTTGGTAATATGTCCTAACGACTTGGCCCCATCGTCTAAATTTCCTAACACTAATCCAGAGAGGAAGTTAGTAATCACTAATCAATATATACTGCTAGTACTACATCAAAAAATTGTTTTAGAATGTTTCATGTTGATTTGGTAGCAAATGTTCAGCATTGAGCTGAGTGCACACTAGTTCGGTTGCCTATGATATGTTCCTATCCATTTTGTCATCGTAATTAATGTGCCTGCAATAATAATAGATTCAGTTTATAGCTTTACACCAAGGAGCTCTGTGGTCTGATCAAAATACACTGTTACAAAAGATGTATGGCAGTTTAAATATATGTTGATAGCAGCTGTATAAAAATATCCTTGCATGTGAGGCTGAAAACACAATTTATGCTTCATAGTGTCCTGTGTTTGTTATATTGTCACAGTTGAGCTTTCTTGTTCTGTACAATAAAATTATGCATTTGTATTGCTCTTTATTGATTTTAATGCTGCCTATACATTTCATCAGATTGCATTGGTTCA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