BGIOSGA003552
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA003552 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA003552, complete gene. |
| LocusTag |
OS01G0375200 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA003552-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA003552-PA |
| Length |
17650 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:17221966..17239615 |
| Sequence Coding Region |
17221966..17222153,17226958..17227063,17228232..17228450,17229480..17229826,17236719..17236782 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:17221966..17239615 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:17221966..17239615 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGACGCTCCTGTGCGTGCCGCTGGTGTCGCGCACGGTGGAGGCGATGCAGGCCGACGCGGCAGCCGCCGCGGCCGCCGGCGCCGACCTCGTCGAGATCCGGCTCGACTTCATCGAGGGGTTCCGCCCGCGGGAGCACCTCCCGAGCCTGCTCCGCGGCTGCCCTATCCCCGCCCTCGTCACCTACCGACCCAATTGGGAAGGAGGCCAGTACGATGGTGATGATGCTACAAGATTTGAAGCACTCCGTTTAGCAATGGAGTTAGGCGTAGACTATGTTGATATTGAATTGAAGGTTGCTGACAAATTTATCAGCTTTATTTCTGGCAGTAAGCCAGAGAAGTGTAAACTTATTGTCTCATCACACAATTATGAAAGTACTCCGTCCTGCGAGGAGCTTGCAGATCTTGTGGCTAGAATACAAGCAGTTGGATCTGACATAGTGAAAATCGCAACAACTGCTAGTGACATTGCTGATGTGTCACGGATGTTCCAAGTGATGGTGCACTGCCAAGTGCCTATGATTGGACTAGTGATGAGCGAAAAAGGTTTAATGTCAAGGGTGTTATCCCCCAAGTTTGGAGGATATCTAACCTTTGGGACTCTTGATGCTACAAAGATATCAGCACCTGGGCAGCCAACCGTCAAAGAACTGTTGGACATTTATAATATAAGGCGTATAGGACCTGATACAAAGGTTCTTGGTCTTATTGCCAACCCAGTAAAACAGAGCAAGAGCCCAATTTTGCACAATAAATGTCTTCAATCTATTGGATACAATGCTGTTTATCTTCCACTTTTGGCAGATGACCTTGCTCGATTTCTCAGCACATATTCATCTCCGGATTTTTCAGGATTCAGTTGCTCTCTTCCTTTCAAAGTGGACGCTGTACAGTGTTGCCATGAACATGACCCAGTTGCTAAGTCAATCGGTGCCATAAACACCATAATTAGGAGACCAGATGGCAAACTAGTGGGCTACAATACTGACTACATTGGAGCAATTTCTGCTATTGAGGATGGCATAGGAGGCCCAGGATCAAAGGATGCTGCCATCTCACCTTTGGCTGGCAGGCTTGTTGTTGTTGTAGGTGCTGGTGGAGCTGGTAAGGCAATTGCTTATGGGGCAAAGGAGAAGGGTGCAAGAGTTGTAGTAGCAAATCGTACCTACGAAAAAGCAGTAAGTCTTGCTGCTGCAGTGGGTGGTCATGCCCTGAGATTAGCCGAGCTTGAAACTTTCAGGCCTGAAGAAGGGATGATCCTTGCTAATGCGACATCATTGGGAATGTACCCCAATGTGGACGGCACCCCTATCCCAAAGAAAGCATTAAGCTTCTACGATGTTGTATTTGATGCGGTATATGCCCCGAAAGTTACCCGGCTTCTACGAGAAGCAGAAGAATGTGGGATTAAAGTTGTCAGCGGTGTAGAGATGTTTGTCAGACAAGCCATGGGTCAGTTTGAGCATTTCACAGGTGGTATTGAAGCTCCTGAAAGCCTGATGCGTGAGATAGCTGCCAAATACACATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MTLLCVPLVSRTVEAMQADAAAAAAAGADLVEIRLDFIEGFRPREHLPSLLRGCPIPALVTYRPNWEGGQYDGDDATRFEALRLAMELGVDYVDIELKVADKFISFISGSKPEKCKLIVSSHNYESTPSCEELADLVARIQAVGSDIVKIATTASDIADVSRMFQVMVHCQVPMIGLVMSEKGLMSRVLSPKFGGYLTFGTLDATKISAPGQPTVKELLDIYNIRRIGPDTKVLGLIANPVKQSKSPILHNKCLQSIGYNAVYLPLLADDLARFLSTYSSPDFSGFSCSLPFKVDAVQCCHEHDPVAKSIGAINTIIRRPDGKLVGYNTDYIGAISAIEDGIGGPGSKDAAISPLAGRLVVVVGAGGAGKAIAYGAKEKGARVVVANRTYEKAVSLAAAVGGHALRLAELETFRPEEGMILANATSLGMYPNVDGTPIPKKALSFYDVVFDAVYAPKVTRLLREAEECGIKVVSGVEMFVRQAMGQFEHFTGGIEAPESLMREIAAKYT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..188#4993..5098#6267..6485#7515..7861#14754..14817#14908..15013#15098..15238#17009..17157#17333..17498#17607..17650#ATGACGCTCCTGTGCGTGCCGCTGGTGTCGCGCACGGTGGAGGCGATGCAGGCCGACGCGGCAGCCGCCGCGGCCGCCGGCGCCGACCTCGTCGAGATCCGGCTCGACTTCATCGAGGGGTTCCGCCCGCGGGAGCACCTCCCGAGCCTGCTCCGCGGCTGCCCTATCCCCGCCCTCGTCACCTACCGGTGAGATCCCCATCTCCCTCTCCTCTCGCGCTCTCTACCCCTTCTCTCAGGCGGCGGGCTCCAGATTCTGCGTCCATTTCCCGGTATATCCGCAGCGCGTGCGCAGATGCTTTCACGTGTGTTCTCGTGCGCTTGCAATGTTCGATGCTTTTCAGCTGATTCCTGCTTTGTTTTGGGTGGCGTCGCCCCCGTTTTTGGGATGGATTTTGGGTCAACATCTAGTCATAGCCAACTGCATTTTGTGTTCTCCGTTAGAATCAGCTTGTTTTTGACGCCGCGCCGTTTAGGCCGCCCGATCATAACAAAAATTAACAACAATTGAGTATCCACAAATGGTGGAGGTGAACAATTACAGATAAGTCCGTGGAAGATGTGAAAATTGCAGAAATGCCCCTCGGCAGGTGGATATTTGCAACTTTGTGCCGTTGATCCTTAATATTTGCAAGTATATTCTCGTGAATGTTTAATCTCAGTTGATTATCGTCGACCTTTAGTTCGTCGAGGTAGTAGGGGAGACATGGTGCATGGAGGAACAGGGGAGACTTAGAGGGATAGATTGATTATTCATTGCTTGATTAAATCTCACCTACAAACCTAACACCATCTCTAAGATACAAACCTCATCCTCATGTACTACCAACTATATTGACGATAGGTTGTGGTGCTGAGGATAGGGTAATGTCCTTGGAGACTGTTGGCTCACAGGCAATTGTTAGCAAACTTGCAGGCCGCTGCGCAAGCACCATGACAGGCATGATTGCAGCCATGTCAGTCATGTCAATTTTTTCAACTTCAGTTAAAAATTTATTAGAATAAATAGAGATGCTATGTTCTCTGTGAATACGACTGCTGTGGCTGTCATGGCTTCAATCATGCCATTTGTCAGTTATTCTTTTGGTCTTAACATATATTCCCTCTGTCCCATAATATAATGGATCCTAGTTTTTTTTTGGAGAGATTAAGGATGAATGAAAAAGACTATAATGCCCATCATTAAATGAGGGGGTATCTGTTTTGGGGGGGTGGGGGGGGGAGCAGGAAGGTGATTGGGGGTTAGATTGGGTGGAAATTAAGTGAGAGGTGGTTGAGTGGAGGAAGCAGATATTTTGGGACAAAGTTTGAATTCTTTGGATGCCTTATTATGTGACGGAGGGGATAGTGAATTTGAAGTTGAAATCTGTACATTTCACGTTAATTTTAATACACACACTAATGACAGTTGCATGAGTATATCCAAAAGAGTGACCACATAGCATATGTTGCCTAGAACATGGAATATTTGTTCTCCAAGTGGAGCCCATGTACGCATGCTATTCATAGCATAACCATGGTTTGAAACCTAAAGCCATGTCAAGACTAGATATAAACAAGTTATCTGGAGTGGAGGCATTTATTCTGTCCCAAAGAGAGCACTTGACACAATTAATCTTTGACTAACTATTAAATTCTCAGTACCACATAAAATAAACAGAAACAACATCAATATTCTAGAAAGCTATCCAATGTTTTGATTAAATGAGTACTTGCATCATATGCCTTCCACAGTTTTTTTTATTCAACTCACGGAAGGACCTGTAGCCTAACGAATAGTGCTCAAGTAGCACGTCTAGGTCCTGGGTTTGACTCCCCATGAAGCGAATTTCAGGCCTAGTTAAAAAAAGTCACTCACTGGCCTCTCATAAAAACACGTGTTAAGAATTGACCTATGGCGGGCCCTCATATAGGGAGCAGGGGCCTCAAAGCACAGGTTACGGACTGATCCATAGGGGGTGAGTCCGCGTGTGGGGGGCCAGGGTTCGTGGCTTTTCTCGACCGGTTTGGTTGAGGCTTCTTCTTAATGAAAAGCCATGGGGCAGTCATTCCCGCGCCAGTCGAGTTTTTTTTTTTAATTCAACTCACGAATTGATATGTTTTCTTTTGAAAAGGTATGTTGATAGATTTGGATGATTCATTGAGTGATTGTTCCCTAGGAGTATATTGCAAAACGAGTATGCTAACAGGTTTAACTGGTCCATTTGTTCGGTAATTTATGTAGTTAGTGCGTTCCAGGTCAGTTAACAAGTTTGTGGCACAAAAAACTTGCAATCAACTTTTGTCAGGTTTTGATCTGTCTTGCTGATTTCTGATCACACATTCTGATTTAACATGTCGTTATGAACTGATGATGCAAACTAGTCCTATTTCTACTCGCTGATTTAGAATTACATGATTGACTCCTATTATTCATGTCGTTATTGTCGTGATTCCCCCTTTTGATCATTCTACCTGGCAGCTTGCGTTTTTTTACTATGGATAGCTTTTGAAGCCTACATAAATAGAAAAGATGCAACATTTTTTTTTTGTTCTGATACCATATAAACATCATGTATAAATTCGAACTTTAAATTGAAAATTGAGTATAATGCCAAGTACAAGGCTGGTTCCTGTATATGCATTCCACAGTGAGGTGATTGAATGAATACTAGCTGCTGAGTTTTAGAACCTTGAAAATGACTGCCTATCGTGTTATCATAATCCAATTCTTTTTTTTTCCATATTTTTCCTTTATGTACTATCCTAGTTTCCATACATTGTAAAAGCAATACTATAATGATAAACTCGTGGAGAATTTAATACTGGTGCAATATAATGTGCACCAGCTGAGTTCATTAGTTGTCAACTTTAGATGTTTTTTTGCAGATATATTATTTTATTCATAGTAAGTGGGTTAATTTGACATTAGGACTTTAAATATTCCCTTCATATCTGTTGAGTTGTTATATAAAAATGTTCCTTTTAACGATGTTTATGACCTGCCAATTGAAGTGTTACACCAACTATAAAGAAGTATCATCCTCGTAGCAAGCTTGATGGTAACATTTGGTCAGACTAGGGGCACAAAGGGGGATGATCAGCCTGTTGAGGTTCCCCACAAAGTAAAGGGCCAAATACAAGCTAACCAAGGCCATAACCTAGCTGAGCAATCCAAAAGCTTGCATTGCATGGGCTAACCACTGTATATCACAGACCAACCCACCTACAGGGATTTTGCATAAACACAACACTATTGTTTGCTCTATAGACGACTATTTAGTCCTCCAACTACTGTATCAGAGACCTTGGCCATTTTGATGGATCTATGACTCCAATAGTTGTCAATGACATGGTTGCCATGCAATCATGGCACATGGGGGGCACCAGGACGCCACGATGTCTAGGCTGGTCCCTAGGTGTCCTCAAGGTGAGATATGTCGAGCTAAAGGGGTTGACTACGGCTCATTGAATACACGGACAGCAAACTGAACACATGATCATAGATGAGAAGACGTACATGCTAAAAGGACATCTCAAAAAAGAATGGAGGGAGTACATGTATAGAGCGTGTTAATTCACTATACATGTAAATCTATATTTTCTGGAATTCTCTTACAAGTGCTAATTCCACAAGTTTTTCCATATTGTCTTGCTACATGGCATTTTGATCTGCATTAAACCAGCAAATTGATGCATGATCCACTAGAGAGGAGATAAGGAAAAGAGACAAAAGAGAGGGCAAGAATCAGAGAAATGCCTTTTGATTTCAGTTAACTTGTTGATTCATGGCATGATTTGGCTTACTCATATGGCTCAATACTTTGATGACTCGGAAAGTTAAGTTAAGGGTTTAAATAACCGGTTTTAGAGCAGAGGGTCCAATCTGGATATTTATGAATGTAAACTGGGCAAACTGGACGTATCCCATAGCAAACATATAATAGTGAAGCACACATATCTCTTAATCTCATGCTGAGCTAGTCAATATCTCGAGGAATTGAATGGAATGCTGCCCACCTTTTCAGTTAGCATGTCATTGCTGGAATGCTGCTGGGTTCACACTGCATCGATACCCTGGTGCCTCATGGCAACAACCTGGTGAAAAGTTAACTCTATTAAATCTAGAAAACTATTTGGAGAAAGTTTAGATCCATGTGTTTTGTTTTTTGGATTATGGAGCTATTATGAATTTGTGATAACACATCCTTAAATTTTGTGGAAGGTTAAAACTAGCAAAAGTATAAACCTAAATTCATTCCTGCATAATATTGTACCCAAAATTGAGACACATCTTTCGCCATATTGTCTGACTCAGTTTGTAGATTTGTAAATACTTTATTCAAGTATGACCATAACGTAAGAAAAGAGTCCATCCAAGGCTCAGTTCGAAACAGATTATTGAGCAGATTGTTGCTGCGGATAATCTACTTGATGATAGGGAGAAATAAAGTATTTTGATAAATTTACTTAACAAATAACTTAAAACAAGTGGTCTAAGCAATACATCAGGAGTATTTTTTTTTTTTGGAGAAAATGTATTTTTTGAAGTGTTGAGCAAATTATCCATTTCAACAATCTGGTAAATAATCTGAAAAGAACTAAACCCAAGAACCTAAAAGCTTTTTTATCTGTTCATTCACTTCTGATTGAGACGTGGCACAATCATTTCTTATTTTCGTAAAAGCCGGCGTTTGGTTAAACACTTAAACTGATTGAGCGTATCTGTGGCCATTAATTAGCTTTCTATACTTGTAGAAATGAATATTTATATTATAGGATCTGTAAAAAAAAATACATAAAAGGTATATGCTTCTCCCATCCTTATATTTATCTTTTCATTTTGTGAGCTTTAGTTGATTTATTTTGTAGCTTTTTCCAACGTGAGTA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