BGIOSGA003554
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA003554 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA003554, complete gene. |
| LocusTag |
OS01G0375500 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA003554-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA003554-PA |
| Length |
9553 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:17249991..17259543 |
| Sequence Coding Region |
17249991..17250001,17250134..17250239,17251635..17251853,17255129..17255475,17256772..17256835 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:17249991..17259543 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:17249991..17259543 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCAATGCAGACCCAATTGGGAAGGAGGCCAATATGAAGGTGATGATGCTACAAGATTTGAAGCACTCCGTTTAGCAATGGAGCTAGGAGTAAATTATGTCGATATTGAATTGAAGGTTGCTGACAAATTTATCAGCTTTATTTATGGGAGTAAGCCAGAGAAGTGCAAACTTATTGTCTCGGCACATAATTATGAAAGTACTCCATCCTGTGAGGAGCTTGCAGATCTTGTGGCTAGAATACAAGCAGTTGGAGCTGATATAGTGAAAATCGCAACAACAGCTAATGACATTGTTGATGTGTCACAGATGTTCCAAGTGATGGTGCACTGCCAAGTGCCTATGATTGGACTAGTTATGGGCGAAAAAGGTTTAATGTCAAGGGTGTTATCCCCCAAGTTTGGGGGATATCTAACCTTTGGGAGTCTTGATGCTACAAAGGTATCAGCACCTGGGCAGCCAACCGTCGAAGAGCTGCTAGACATTTATAATATAAGGCGCATAGGACCTGATACAAAGGTTCTCGGTGTTATAGCCAACCCAGTAAAACAGAGCAAGAGCCCAGTTTTGCACAATACATGTCTTCAATCTGTTGGATACAATGCTGTTTATCTTCCACTTTTGGCAGACAACATTGCTAGATTTCTTAGCACATATTCGTCTCCGGATTTTTCAGGATTCAGTTGTTCTCTTCCTTTTAAAGTTGATGCCGTACAGTGTTGTCATAAACATGATCCAGTTGCTAAGTCAATAGGTGCCATAAGCACTATAATTAGGAGGCCAGATGGCAAACTAGTGGGCTACAATAATGACTACATTGGAGCAATTTCTGCCATTGAGGATGGCATAGGAGGTCCAGGATCAAAGAATGCTGCCGTCACACCTTTGGCTGGCAGGCTTCTTGTTGTTGTAGGCGCTGGTGGAGCTGGCAAGGCAATTGCTTACGGGGCAAAGGAGAAGGGTGCAAGAATTGTAGTAGCAAATCGTACCTACGAAAAAGCAGTAAGTCTTGCTGCCGCGGTTGGTGGTCATGCCCTGAGATTAGCCGAGCTTGAAACTTTCAGGCCTGAAGAAGGGATGATCCTTGCTAATGCAACATCGTTGGGAATGTACCCCAATGTGGATGGCACCCCTATTCCAAAGCAAGCACTAAGCTTCTACGATGTTGTGTTCGATGCGGTATATGCTCCGAAAGTCACCCGGCTTCTACGAGAAGCAGAAGAATGTGGGGTTAAAGTTGTCAGCGGTGTGGAGATGTTTCTCAGACAAGCCTTGGGTCCGCTCGAGCGTTTCACAAATGGTATTGAAGCTCCTGAAAGCCTGATGCGTGAGGGCTGTAGGCGAATGGGGAAGCGGGAACGGTTGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MQCRPNWEGGQYEGDDATRFEALRLAMELGVNYVDIELKVADKFISFIYGSKPEKCKLIVSAHNYESTPSCEELADLVARIQAVGADIVKIATTANDIVDVSQMFQVMVHCQVPMIGLVMGEKGLMSRVLSPKFGGYLTFGSLDATKVSAPGQPTVEELLDIYNIRRIGPDTKVLGVIANPVKQSKSPVLHNTCLQSVGYNAVYLPLLADNIARFLSTYSSPDFSGFSCSLPFKVDAVQCCHKHDPVAKSIGAISTIIRRPDGKLVGYNNDYIGAISAIEDGIGGPGSKNAAVTPLAGRLLVVVGAGGAGKAIAYGAKEKGARIVVANRTYEKAVSLAAAVGGHALRLAELETFRPEEGMILANATSLGMYPNVDGTPIPKQALSFYDVVFDAVYAPKVTRLLREAEECGVKVVSGVEMFLRQALGPLERFTNGIEAPESLMREGCRRMGKRERL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..11#144..249#1645..1863#5139..5485#6782..6845#6946..7051#7140..7280#7584..7732#8093..8258#8346..8368#9518..9553#ATGCAATGCAGGTACATTTGTTTTACTTCACAATGTTGCTCCCCACTTTGTAGTTGTTGGTCATATTTATATAACTACTGCATATTAGATTCACCGTTATGCTTTGCATAAATGACATTTGTATGTGCATATTTCTTTTGCAGACCCAATTGGGAAGGAGGCCAATATGAAGGTGATGATGCTACAAGATTTGAAGCACTCCGTTTAGCAATGGAGCTAGGAGTAAATTATGTCGATATTGAATTGAAGGTTTGTTACCTCAAATAAGTTAAACTGTTACGCTGTTCCCAGTTAATATGTAATATTGTAAGCATCCTTAGATTTCAAATTGATTAGTGCCCACTATTTTTCAAAATGCATAACACATTGTATTAAAAACGATTCTGAAAAATGCCTTCTTTTCATGGTTAAACCCCACCACTACTTTTTCCTTTTATTTGTGGAACACAAGTGCATCCACATTGCCTCCATTTTTCATTCTACCACAATATGACTAATTTGAGCATGAAAATGTGGCCTGTACATAACTTTGAAAATGAGTTTTGAGTAAATTTGGAATATCATGTTGTAGCTTCATAGCTGGAGGTACAAATATGACACTCATTCATGCATTATGGATGGTGCAATTTTAATATTTTTATGTATTTTAATATTCAGTTCAATTGCTCATGACAAGATAGATCATTCCTCTTAAGTTCAAATTGAATCCATTTGTCAATCATACTATTTTATTCTTTAGTGTCTAGCTGCCATTTGGCCATCGCATTAGGAAGGTTAACTAAAATATAACACTGAAGGGGGAAATCTATTTTAAAAACGTCCAATGAATACTCAATACATCGTTCTCATGCTCATGTGGTTTCTTTTAAGATGCTCTGGAATGAAATTGTAAAAAGTTCCTTTTGTAATTACTTAATAAACTTGAAGTCAAAAAATTCATGTTTTCCATTTGTTCCTTTAGGGAACACACCAAATATATATTTTTTTGCATCTTTATGTTAAGTAAGGAGAGCAAACAAACAATAAAAAATTTGGAAAAAAAAGTAACATGTAACTGTTCAAGACAAAAATGCCAACCTAAAAAAAGAAAAAAAACACAAGGTAGCTCTAGCCAATAGTTTTTCGGGACGATTCTTCAGTTTTTATTCTTGTATCTCTTATCTCATACTCTATATGTTTCATATTATAAGATGTTTTAACTTTTTCCTAAGTCAAACCTTTTTAAGTTTATAGAGAAATATTGCAACATTTATAACAAAATATTAACACTATCAAATATATTCATTGTTAGATTTAATGAAACTAATTTGGTGTTGTAAATATTGCTAATTTTTCAATAAGCTTGATCAAACTTAAATATGTTTGACTCGGAAAAAAAGATCAAAACTCTTATAATATGAAACAGAAGGAGTATATGTTTTGGAACACAATGCAAACCTAGTTTTAAGCAATTTAAAAAGCCAAATGCTTTAATATAATTTAATTTTCACCAATCATCTAGCCATGTAGGCTCTATGCCTCATTTATCTAAGTACATGATTAGGACTGTATGGGGGCACATTTGTATCTTCATTAGCCACTAGGCATTTACATACATAACGGCATGCATACTATATGTACTAACCAAGTTTATTTTTCTTGTAGGTTGCTGACAAATTTATCAGCTTTATTTATGGGAGTAAGCCAGAGAAGTGCAAACTTATTGTCTCGGCACATAATTATGAAAGTACTCCATCCTGTGAGGAGCTTGCAGATCTTGTGGCTAGAATACAAGCAGTTGGAGCTGATATAGTGAAAATCGCAACAACAGCTAATGACATTGTTGATGTGTCACAGATGTTCCAAGTGATGGTGCACTGCCAAGTAAGTGTCATTTTATAAAATCCAAGAAATGCTTTCACTTTTCTACATGGAAACTTGCGTGTCACCTATCTTGTATAGTTGTCCCAGTACATCTTGCCTCTAGCCCACTACTACTGCATGCCCCCTTTAGATTCTTTTTTTAAAAAAATAAAGGAAGCTATTCAGATCCATGATGTTTTTGAATTATTGCACATGTCAAAACTTTGTGTAATGGTCCCTAAGGCCTGTAAACATCACTCGGCATGGGGGATTTTCTATGGTTTGGAAGTATTCTGAAAGTGAAAAGCATTAGGATTTGTAATTTAATTTCAGCATGTTGGCTTTCAGAAAATTGTATTTCACAAATTGCACTTCAGCTAAGCTACATGAGAACTACACCAATCTAACCCCCCCTTTTTTATAAATAGGTCCTTTCAAAAACTTATTTCAAAGCTAGACCGTGCAAAAAAAACTTACCAAAAATAGACCGTCGGCTCAACGCCAACCGCCTTTGCGCTGAGGTTACACTGATCAGCGCCGACTCCCCTGCCAATGTGGCAGCCGAGCCAATCCCCTCGTCTACATGGCGCTCAACACCAACCGCATTGGCGCTAAGCCACTAATCTCAGTGCCAATTACTCTGGTGCTGAGCTTTGAGACTTAGCCGCTCGCAGTCGGGCCACCCAACACAACTCATATGTTGGGCGACCCAGAGGCGCTGAGCCGGAAAATCTCAGTGCCAACGTAATTGGCAATGACCCTAAAGATCTCAGTGCCAACTAATTGGGCGCTAAGTTTTGTGACTTAGTCGCTTACCACAAGCCCGCTCAACACAGCTCCTGTGTTGGGCTCTACCCTGACGCGAGGGTTCAACGCCAATACCTGAGGCAAGCCATGGTGTACTTGATAGATGCATTGGACTCCTTCACATGAAACATGGATGCACCTGGATAGAGTAGCTCTGCAGCCATATTTTCAAGTCTTCCATAGATTGAAATTCTAACCCCGTTCTCGATTCCTCCCCCATGGCATCGATGGTTCCATCTTATTGTGGATCCCCATCGGCAACTGCGAGCCCATCATTGCTAAGATCCTTGAATTGAGTGATTTCCGGATTGCGACCAACTATTTTCTCAAACACTCTCCTCTCTTCCTCTGACATCTTGCCCATTGGACGATCGTCATTGGAGTTAGAAGCATACTCATCCACATCATTATCTGAATGCACATTCAACAAATCCATGTTCAATCCATTAAATATCATAGCCTCCTCACACTCCTGTCGGGTGTAAATTTTTCTTCAAAGCAATTCTCTGATGTATGAATCCATCTGCCTATCATCAAGTTCAACTTTCATCTCATTCTCAACTTGATTCACATCTAGGCCAACATCTAACAAATCCTCCCCTACCTCCACTTCATCCTCAACGGGTACTTCCCCCTACCTCCATATCCTCCTCAACCTGTACTTCCTGCACAAACATATTAATTGAGGTCTAAAAATTCATTCTTCGATTTGCCGCGCTCTTTCTTCCAAGCAAACACCTCAAGCGATTTGAACTGTGACCCCAGTACTATATCTACATATGTTTCCCATTCCACCTCTCCATTCAAGTCTAATATAAAATTATGTGATATGGGATCAGCGCCCACATCGTATCTTCCTTTCATACCAACCGACTCATCATTCCAATCCAATTCATCTTTCGTGCGGGACTTTAACTCCTCAAATGTGGATTTGGCACGAAATACTTACTATCTAACAGTCTCCCCCGCAAATTGGCTTCCACCAGTACTTTCATCTACCACACAGCTACCAATCTATTTATCTACAATGTGTAATCAATAAATAAAAATAAAGTATTTCAGAATAACCGATAAATGCCACGCCAATCCCAAAACTATCAAACCTAAGAATGTTCAAATGTTTCAAAAAAAAAACCCCTAACAACGTATACTAATCTATCCATCCAATATGTAACCAATAAATAAAAATAAAGTATTTCAAAATAACCGATAAATGCCACGCCAATCCCAGAACTAACAAACCTAAGAACGTTAAAATGTTTTAAACAAAATCTAACTACGTACAAATTATAAATTACCACTAACCCCACCACTAAGTCCTAATGTTTTAAAAAAAACACATGAATCATAGTACAACTTAACTTTCCAACTCCTACAAATTGCCTAAAACAAATCATTTATCTCGGGTTACAACCACACATCTAACCCTAGCCATCACCACACATTCAAAATATAGGTTCAGAAATTTACAAATCAACATTAATCAACCGAAGCAACATCAATATGGAACTTCCACACTAATCACGACCCACACTACCCAACTAACAATAGATCACGAGCCACATTCCTCAAATCATGGTTAGAACCAAAACAACCAAAATACATAATAAAATGTTCAAGAAATTAGGGTTTTCGAGGGAGTTTACCTTTCAACTCGACCCCGCACTCAATCCTCACGAAATTCCATTCGATTTTGTGTTGATTTGGAGAGATTTGGGGAGGGGAGGAGAGAGAACTTGGCGTCATAGCACGAGCACTAGGGGAGAGGAAAGGAGAGGAGAGGAAGAAGAGAGGCTGGGTTGTTGCGGCCTCGTGTCGCCCTTAGTAACCTAGCTCAACGCCAACACGGCCGGCGCTGAGGTTAGACGGTTCAGCGCCAAGGCGGTTGGCACTGAGACCCTGCCACGTAGACGAGGGGATTGGCTCGACTGTCACATTGGCAGGGGGTTCAGCGCCAACAACACTGGCACTGAGCCGTCTAGCCTTAGCGCCAAGGCAGTTGGTGCCGAGCCAACGACCTATTTTTTTGTTGAAGTTTTTTGCACGGTCTAATTTCAAAATAACTTTTCGAAAAACCAATTGGTTAGAAAAAATGGAATCGAACCTGTTAAACGAAAGAAAAAAATATATAACCCCTTTTGTTCTCATGTTCTTTCCATATTCGAGTCTCCGTAATCCCTATTTTCCTAGTGAAAGCAACTAAAACAATGTGAATTTACGATG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|
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