BGIOSGA004139

From RiceWiki
Revision as of 18:28, 20 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

BGIOSGA004139

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA004139, complete gene.

LocusTag

OS01G0655800

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA004139-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA004139-PA

Length

7682

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:29815015..29822696

Sequence Coding Region

29815015..29815163,29815886..29815949,29816040..29816129,29816318..29816374,29816562..29816610
,29817050..29817126,29817648..29817687,29817767..29817861,29818255..29818419
,29818507..29818617,29818701..29818788,29819445..29819511,29819718..29819793
,29819885..29820002,29821075..29821320,29821686..29821825,29821991..29822173
,29822289..29822408,29822661..29822696

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:29815015..29822696 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:29815015..29822696 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGAGATGCAGCACGTGGTGGAGGTCGAGCAGGGCCGCGCGGCCGCCGACGGCCGGCCCTCCGTGGGCCCCGCCTACCGGAGCGCCTTCGCCCGCGGCGGCTTCCCGCCGCCCGTCGCCGGCCTGGACTGCTGCTACGACATCTTCCGAATGGCCGTGGAGAAGTTCCCAGACAACAGAATGCTTGGTCACCGTGAGATTGTTGACGGGAAGGCTGGTGCATACGTTTGGAAGACATACAAGGAGGTGTTTGACCTTTCGACTAAGATTGGTAACTCTATTAGGAGCCGTGGACTTGCAAAGGGAAGCCGTTGTGGTATCTATGGTGCTAATTGTCCTGAATGGATTATCACGATGGAGGCCTGCAATGCTCATGGAATCTACTGCGTTCCATTATATGACACTCTTGGAGCTGGTGCTGTAGAGTTTATTTTGTGCCATGCAGAAGTTGAGATTGCTTTCACAGAGGAGAAAAAAATTGAGCAGATCTTCAAGACTTTCCCCAAGTCAGCTGAATTCTTGAAAACAATCGTTAGTTTTGGGAAGGTAACTCAGGAACAAAAGGAAAATGCCTCCAAATATGGGCTGGAGATCTATTCATGGGATGAATTTCTTTCTTTGGCAGACCAAGAATTCGATCTTCCAGTGAAAGCAAAGACTGACATATGTACTATAATGTATACCAGTGGAACTACTGGTGACCCCAAAGGTGTACTGATCTCCAATGCAAGCATTATTTGCCTAGTCGCAGGTGTAGATCGGCTGCTTAACTGTGTAAATGAGCAGCTGGAGCAAACCGATGTTTACATGTCTTATCTTCCACTTGCTCATATCTTTGATCGTGTTGTGGAAGAGCTATTTATGTTCCATGGTGCTTCCATTGGATTTTGGCGTGGGGATGTTAAGCTGCTTGTTGAAGATATTGGGACACTGAAACCAACTATCTTGTGTGCTGTTCCACGTGTGCTTGACCGGATATTTTCTGGACTCCAAGCTAAAATTGCATCTGGGGGTTTCATAAAGAGTACATTGTTCAATCTTGCTTACAAATTCAAGCAATTTAGAATGATGAAAGGAGCTAAGCACAATGAAGCTGCCGCAATATGTGACAAAGTAGTTTTCAGTAAGGTGAAAGAAGGTCTTGGGGGAAATGTTCGTGTTATTTTGTCCGGAGCTGCTCCACTTGCTACTCATGTTGAAGAATACCTGAGAGTGGTGACTTGTGCACATGTCTTACAAGGATATGGTCTCACGGAGACTTGTGCTGGATCTTTCGTCTCCCTACCAAATCAGATGTGCATGATAGGGACTGTTGGTCCTCCAGTGCCAAATATTGATGTCTGCCTGGAATCAGTGCCTGAAATGAATTATGATGCACTTGCAACTAGACCGCGTGGCGAAATCTGCATCAGGGGAGAAACAGTATTCTCAGGATACTACAAGCGTGAAGACCTTACAAAGGATGTTTTGATTGATGGATGGTTCCATACTGGAGACATTGGTGAGTGGCAACCTGATGGAAGTATGAAAATCATAGATCGCAAAAAGAATATCTTCAAGCTTTCACAAGGAGAATATGTAGCAGTAGAAAATTTGGAGAACATTTATGGTCTTGTTTCTGCTATAGATTCGATATGGGTATATGGGAATAGCTTTGAGTCATTCCTTGTTGCTGTGGTCAATCCAAACAAGGAAGCATTGGAGAGCTGGGCTGCAGCAAATGGAATCAGTGGTGATTTGGAGGCATTGTGTGAGAACCCCAAAGCAAAAGAATACATTTTGGGAGAACTGTCAAAAGTAGGAAAAGAGAAGAAGCTCAAAGGTTTTGAATTCATAAAGGCTGTACATCTTGAACCAGTGCCATTTGACATGGACCGTGATTTGATTACTCCAACATATAAAAAGAAGCGCCCTCAATTGCTCAAGTACTACCAGGGAACAATTGACAACATGTACAGAAGTGCCAAATGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MEMQHVVEVEQGRAAADGRPSVGPAYRSAFARGGFPPPVAGLDCCYDIFRMAVEKFPDNRMLGHREIVDGKAGAYVWKTYKEVFDLSTKIGNSIRSRGLAKGSRCGIYGANCPEWIITMEACNAHGIYCVPLYDTLGAGAVEFILCHAEVEIAFTEEKKIEQIFKTFPKSAEFLKTIVSFGKVTQEQKENASKYGLEIYSWDEFLSLADQEFDLPVKAKTDICTIMYTSGTTGDPKGVLISNASIICLVAGVDRLLNCVNEQLEQTDVYMSYLPLAHIFDRVVEELFMFHGASIGFWRGDVKLLVEDIGTLKPTILCAVPRVLDRIFSGLQAKIASGGFIKSTLFNLAYKFKQFRMMKGAKHNEAAAICDKVVFSKVKEGLGGNVRVILSGAAPLATHVEEYLRVVTCAHVLQGYGLTETCAGSFVSLPNQMCMIGTVGPPVPNIDVCLESVPEMNYDALATRPRGEICIRGETVFSGYYKREDLTKDVLIDGWFHTGDIGEWQPDGSMKIIDRKKNIFKLSQGEYVAVENLENIYGLVSAIDSIWVYGNSFESFLVAVVNPNKEALESWAAANGISGDLEALCENPKAKEYILGELSKVGKEKKLKGFEFIKAVHLEPVPFDMDRDLITPTYKKKRPQLLKYYQGTIDNMYRSAK</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..149#872..935#1026..1115#1304..1360#1548..1596#2036..2112#2634..2673#2753..2847#3241..3405#3493..3603#3687..3774#4431..4497#4704..4779#4871..4988#6061..6306#6672..6811#6977..7159#7275..7394#7647..7682#ATGGAGATGCAGCACGTGGTGGAGGTCGAGCAGGGCCGCGCGGCCGCCGACGGCCGGCCCTCCGTGGGCCCCGCCTACCGGAGCGCCTTCGCCCGCGGCGGCTTCCCGCCGCCCGTCGCCGGCCTGGACTGCTGCTACGACATCTTCCGGTGAGTGGCTGCTGCTGCTGTGACGACGATGACGAGGGGTTCCTCGCCTGACCTCCGGTGGGAGGCGGGGCGGGCGGGGCGTGGGCGAGGCGCCAAGCATCGGTTTGCTTGAATTCGTGTATGGGTTGGTTGGTTGGGGGGAACATTAATTGATGCGTGGATTCTGTTCTGGCACTGAGATTCAGAGGATTGTTTCCAGTGGCCGTATGCTATTTATTTCTGGTTTGCACATGGAGGTTGGGATTTGGTGTCCTTTGGTTCAGTTTCGATCTTATCTCTCATTAATGGGTGACAAATTCTGTGCTTAGATTTGGTATGCTTGCTTATGTTCATATGCTTCACCAGGGGACAGTTAGCTTAGATTTTAAAAAAAGCCTTGCCAATTAGTTAATCTTTGTCTGTCCCATAATTTTCAGACCTCCTATTCCTTATGGATCTGTAGAATTCCGCGGGAGTGATTTGTAACTGGAAAATCACTTTCAGCCTAGCCATGCACCGTTGTTGTTCGATCTGTGGGTCGTAATGGTGATGTCAGACTGGTCCATGTTGTCTGGTCTCTTTCTGGATATGGATAGGAAAGTACAGAGGGAATTAACAGGATTGGTTTGTCCTTTGCATTCTAGTTGCTGGCCTGAATTCTGTCAATTCTTCAATTTAATGACCCTTTTCTCCTACTGAGCTTCTCTAATTTCTTGATTTCGACAATGTCTGTTCTTGTGCAGAATGGCCGTGGAGAAGTTCCCAGACAACAGAATGCTTGGTCACCGTGAGATTGTTGACGGGAAGGTACCTCAATCACTCCATGTACTCGTTTATTCCCTTGAAATGTTATACCAGAAAGAAAAAAAACTAAATAGGATTTTTGTGCTATTATAGGCTGGTGCATACGTTTGGAAGACATACAAGGAGGTGTTTGACCTTTCGACTAAGATTGGTAACTCTATTAGGAGCCGTGGACTTGCAAAGGTTTGGTCAATAATTTATTATATTTTCTATATATATGTCATGAGATGGGATGCTAATTTCTTTGAACATTGTTAATTGAATTAAACATTGTATGAACTTTTTGTTCAGCTTGGAAGCAACACTTTGATGTATTCTTATATCTTGATTAAAGAATCATACCATCTCATTTTAATTTGATAATTTTGCAGGGAAGCCGTTGTGGTATCTATGGTGCTAATTGTCCTGAATGGATTATCACGATGGAGGTAATGTTTTCAATCTTGTTCTGTAGCCAGCTTTTGTCTGGATGCACTCTCATCATTTCGCAGCAAGTAAACTGTCAATTTTCACCCATTATTTAGTCATTTTTGTCTTTTGGGGCACTTATGTTGCTGAAACAATTGTAACGCTTGGTACTTATGTCTCGCCAATTTATGTTTCTGTCCTTTTCAGGCCTGCAATGCTCATGGAATCTACTGCGTTCCATTATATGACACTCTTGGTATATATCCTAACATTTTCTTAAGAGCATTATACACACATTGACGAGTTTATTGTTTTCTTCTATGATACTTCTTGCTTGGGGGCGGTGGTAGGTCATTTAGTTGTGCACCTGTTAACATTATGCTTCTTTCTCTGAGGAAGGTAGCCTTGATACTGTTAAGCATGTGCTCAAGAACTATTTATGGTCTCCTCTTATGGCAACTATGATTATGTTTCCAGAAGAATGAAAAAGCTTTGTCACATCATTAGAACATATTGCAAATAAGTTTCCTATGATGATCTTGTTGTTTTCTTATAAGCAAACTAAGAGCTAAATGTCATTCAATAAGTAAAGGATCTTTTTCCTAGTTGACACATTTAGATGCATAAAATGAAACGACATAGTAACACATGCAACTGCAGCTTATACCTTTGTATTAAATATGCTCTTGATGCAGGAGCTGGTGCTGTAGAGTTTATTTTGTGCCATGCAGAAGTTGAGATTGCTTTCACAGAGGAGAAAAAAATTGAGCAGGTATAGTTTGTTACTTTGTTTCATTGTCTCATACCAGTATGTAGAACTTCGATGATTGCATTGCAGTGCATCCTGAATCGAGAATACTTGCACTGTTGTTGACCTTCTACATAATTGTCTTTATCTGTATGATGAATATGTAAAATTAATCTTTATTTTGGTGAGCATCTTTGGAAATATATCTGTAAACTGTCCATTGGGGAAAAGCTAGCAGTACACCAATTGTTCTTCTGTATTCCTTAAGTTCATTTTTGTTTTTAGTTATGCTTTGTAAAGCTCCATCACCCGTTTAGATCCATGGAAACCTTGCTTCATTCTACTTAAAAAAAATGCATGTTTCCAAGACAGTTTTCTATAGTTACACAATTATCTTGTTTCAACTGTATTACATTGTGTTATTTATATTTTGGACGACACTTCGATGGTTGTTTTGCGACTGTGTCAATGGGTTGTGGGTATCTCATCATATCAAAGCATGCTTTATCTCTCCGGATGCATATTGAGTAATTTCAACTTGGCAGATCTTCAAGACTTTCCCCAAGTCAGCTGAATTCTTGAAAAGTAGGTTTCACTCATCCATACCATCATCAAGAAATAACATGCTTCTACCATGAAATTAAAGATGTAATACTATTTGCAGCAATCGTTAGTTTTGGGAAGGTAACTCAGGAACAAAAGGAAAATGCCTCCAAATATGGGCTGGAGATCTATTCATGGGATGAATTTCTTTCTTTGGTAAGACATGCTGCCAGCAATTTTATATGCAGTTCGTTTTGACATTATCATTTCTTAAACATAAATGCCTCATAATGATGTGGCAATGTGCACATTAGTATTTGTCTATCCACAGATCCTTCAATACCTGTATAGGCAAAGATTTTGATGTAACTTCATTTGTATAACATGGAAGTTGAAAACGCTAATTTTTAATGTTGTTTGCCTACAAACTTTTGTCAAGTTTGCTAACTTTTTGTTGTCACCAGTTACTACAGTCTACCTATGGTCCTAAACCTCTCGTAGTTTTGTTTCTTTCTAATTTGGAAAGTTGTTTCAAGAGTTCATTTTACACCTATTTTATTAGGATAGCTTTTCAGATATTCTATTTTTCACATGACATTGTATCTTCAGGCAGACCAAGAATTCGATCTTCCAGTGAAAGCAAAGACTGACATATGTACTATAATGTATACCAGTGGAACTACTGGTGACCCCAAAGGTGTACTGATCTCCAATGCAAGCATTATTTGCCTAGTCGCAGGTGTAGATCGGCTGCTTAACTGTGTAAATGAGCAGGTAAGATATGCCAGCAGCCCTTTCATTATGCATCCATATATAATCACTGATCAATCTTTAATTGCTTTAACTATGCGGGAATCTCAGCTGGAGCAAACCGATGTTTACATGTCTTATCTTCCACTTGCTCATATCTTTGATCGTGTTGTGGAAGAGCTATTTATGTTCCATGGTGCTTCCATTGGATTTTGGCGTGGGGTAAGCACCGTTACATGTTTACTGATCCCTCTTGGATTTTGATTTTTTGAACCTGTGATGACTATCTTAAAAATTTGGTTCAGGATGTTAAGCTGCTTGTTGAAGATATTGGGACACTGAAACCAACTATCTTGTGTGCTGTTCCACGTGTGCTTGACCGGATATTTTCTGGTAAGGAGCTCTTGAAGTGTATGGAAAATTATTAACAGTCGTCATACTTTTTCATAGGCATCCAGTGAGATATTTTTGTGATTAAGTGAGGCAAGACAGTAGATATTTATCATTTGATCATATTGTTCAATAGCAATTATTCTTAGATGATATTGTTTTAATATATACACTAATTAATATAGATTGAATCTGTCATTTTCCTTTGGTGAAATACTTCTTATTGGTCTTAATGGTGTGGTTTGCTCTTTTGTTTGGTAAATTCTTAGATGGCTGGCTGTCTGATCCACTGATACTCTTGACATGTCATGGCAAGGTGTTTATACTAATTTACTCAAGAAACTACCTAATAACTTGGCTATATTGTTATTGGTGTTTCTTACTTCACCAAGGAATTCTCCTGTGTCTAACAATAGTTGAATGTTGAGTACTTCATATCTTATTCTAATGCAAACTTGAACCATATTTGTGCTTTTGGTATATGAGGATCTTCTGTTTGTTTATATATGCTCATGCATGAACCTGGTGATAGTTTTGTTCTGTCGACTTGAAGTTTGCTTGTACTTTTTAAAAGGATTTGATATTGTCACTGTGAGTGTGATCTTGCTAGAGTTTGCTCGTGCTCATGGAACTTTCCCTTATTTTTACCCTTTATTCAGGACTCCAAGCTAAAATTGCATCTGGGGGTTTCATAAAGAGTACATTGTTCAATCTTGCTTACAAATTGTAAGTTTACTACTCTTTGTACTCTGAATGTTTGCCTTTTGGGGAATAGAAAATGTGGAATAGTTGTTTGCACTTTTAATATTATAGGTCCAATGTTTCTTCTGAAGTTCACTTTATGCTAGTATTAGTTAATAATCTGTAACTATCAAATTGAAGTATTTCACCTGTCACAGAATCGAGTATGACCTAGGTATTATATTTTGCAGCAAGCAATTTAGAATGATGAAAGGAGCTAAGCACAATGAAGCTGCCGCAATATGTGACAAAGTAGTTTTCAGTAAGGTAGTTGAACTTTGCAGTCGCTACTTCTTCACTCTTATGTGTTCTTAAACTTGCCATTCTTATTTTAGAAATTTAATTTATCATGCTTCAGGTGAAAGAAGGTCTTGGGGGAAATGTTCGTGTTATTTTGTCCGGAGCTGCTCCACTTGCTACTCATGTTGAAGAATACCTGAGAGTGGTGACTTGTGCACATGTCTTACAAGGATATGGTATATCTTTGTTTGTTATCTTTGTAGAGAAAGTAGGATAGATGCCTCACCTAAGAGGGGAGGTGATCTCTTATATATATAGCTGAATTACAATGAATGCTAGTGCTGAGATACAATCAATACAAGTGAATTACATAAGACCAAAGGTCTAGGAGAGTAAAGGTCTAGGAGTTGAACAGCCTATAGATTAATAAATAATCCTAATACCCGCCCGCAGTCATAGCGGGAGGAGTACGAACGCAAAGACTGGACCGAAAATCTTGTGATAAAAGAACACTTGCAACTCTCTTGATCTATCATGTCTTTTCTAGTCCATTTGATCAGTACAATCATTTTTATTTAGTTGTATGCATTAGACATACCATCCAATTAATTATTAAAGCATTATAAATTGATGTAACTGAGTAGGTAAAGTTATTTTCTACGATGCTATATATACTTGATGGGATAACTCAATTGTTTTGATGACAACATCACTGATGTTATTGGTCTATTCAATCTATGCTCTTACTAGCAAAAGATAAACTCTGAAAATATTAATAGAAGGCAAATGTGTTGATGGAAATCTCTGTTTTTTGAATGGAAGTTTTGATTTGATTTTGTTGTGCAACATGCAAAGTTTTAAAATTGGTGGAAAAAAATACTAATCTCCTGGGCTGGACTGGTAACCAGTAGGTTAACGGAATTTACCAGACAAACATTCAAATATTGGAATTCAAACAATGGTTACTGGTTGTTAACAAGTAGCATTGTACCAGCCCGAAGCAGAAGGTAACTGGTCAGCAAAAAAGTGCTTCTGTTAGTAAATATCAAAATTATTAAATTACGAATTTCAAATCTAAATTAAAGTATTGCAGCTGGTTTGTTCTGGCACTATTCACCACCTTCTAACCAGTTATGGGCTGGTTACCAGTTGTTTTCCAAACGCTGTCAACATGCACTAGTTCTTAAATTGGTTTCCTCCATAAAAACAAACAAAAGTTTCCTAAATTGTAGGTCATTATCATTGATCCATGTAACCTGAATTTTTTTTCCAACAGAACTTTGTTTTGAATCATTTGGTCTCTTTTAGGTCTCACGGAGACTTGTGCTGGATCTTTCGTCTCCCTACCAAATCAGATGTGCATGATAGGGACTGTTGGTCCTCCAGTGCCAAATATTGATGTCTGCCTGGAATCAGTGCCTGAAATGAATTATGATGCACTTGCAACTAGACCGCGTGGCGAAATCTGCATCAGGGGAGAAACAGTATTCTCAGGATACTACAAGCGTGAAGACCTTACAAAGGATGTTTTGATTGATGGATGGTTCCATACTGGTATGTCTTGCTTTTTCATAGTTTTTTTTTTCTCTCCTTATGGGGGCTTTTTGTAGATTTTAGTGGCTGCAGCAGTAAAAAGAATGTCAGATACCATTTCCACAATTGCAATAATTTCATTTCTGGAGTAGGATTCATGTTTTAATATTTTAGGCCTTGTAATATCAATAGTAGGTCCACACTGTGATACTGAGAATGGGCTAACTAGCTAAGCTTAAGCAGCAATTAATCAGAGTATACATCCGCTTTAGATTGCAAGGCATTCTACTCTCTTTTACTAAACTGTGCCTGGATGACAGTACTAATATGATCAGCTAGTTGCAAAGAGAGGTTTGAAAATTGAAACATCTGTTCTCTGCTTGCAGGAGACATTGGTGAGTGGCAACCTGATGGAAGTATGAAAATCATAGATCGCAAAAAGAATATCTTCAAGCTTTCACAAGGAGAATATGTAGCAGTAGAAAATTTGGAGAACATTTATGGTCTTGTTTCTGCTATAGATTCGGTATATGGCTATCTGCTTTAAAGTTCTCTGCTCCTTAAATTTATTCTGCGACATTGTTTTTGCCTTTTTGGTATCATAAATGACTGATGGGTCATTACCTTCTGTTTCTGCTAAAACAATTTGAAAAACTTTCCTCTGTTTTTTTTTTTTTGAACATCTGTTCAGATATGGGTATATGGGAATAGCTTTGAGTCATTCCTTGTTGCTGTGGTCAATCCAAACAAGGAAGCATTGGAGAGCTGGGCTGCAGCAAATGGAATCAGTGGTGATTTGGAGGCATTGTGTGAGAACCCCAAAGCAAAAGAATACATTTTGGGAGAACTGTCAAAAGTAGGAAAAGAGAAGAAGGTAATATTTTGATTATTGCTTACTTTTTTTTCCTGAAAGGAAATTAATCTCTTCTATATATCACGTTTGTCCGCTTGCTCCTATTAACTCCTTAACTTTCTACGTACTTTTGCAGCTCAAAGGTTTTGAATTCATAAAGGCTGTACATCTTGAACCAGTGCCATTTGACATGGACCGTGATTTGATTACTCCAACATATAAAAAGAAGCGCCCTCAATTGCTCAAGTACTACCAGGTATTGCTCATTCAAATTCTCGTCATACTGATGGCATATGTTGTTTACATACTTCACGCGTGTAGAACGTTCTCATTTTGCTTACTTGGTCCTTTGAATCAGTTTTAGATCTCGATAATTCTGAAGCTATTGTCCCTTTATTTCAGCAGAATTCCACTATTTGTTTTTTGTACTAAGAACCAAAAAAAAGGGTTTTCGGACGCCTTACATTCAGAGGTTAACTAGCAGCTCTAAATTTACTTCGATTTGCAGGGAACAATTGACAACATGTACAGAAGTGCCAAATGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA004139