BGIOSGA020852
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA020852 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:J013073O18, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA020852, complete gene. |
| LocusTag |
OS06G0625400 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA020852-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA020852-PA |
| Length |
8502 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:26407920..26416421 |
| Sequence Coding Region |
26416174..26416421,26415545..26415743,26415254..26415301,26414654..26414842,26414261..26414557 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:26407920..26416421 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:26407920..26416421 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTTTGATGATTTTCAGATCAGGCGTCGCCATGTATTACATGCTGCTGGACCTGATGAACCACATGTTGCAAGTCCAACTTGGTCTGAAACTGCTCTGGATAAACATTATGTAGATCAGCCAATTGGGAAGGAGGAACTTGAAGGTTTTCTTAACACACCGCTTCCTTCTCATCCAAAGCTAGTCCGAGGACAATTGAAGAATGGCCTCCGATATCTTATTCTACCAAACAAAGTTCCAGCAAACAGGTTTGAGGCTCACATGGAAGTTCATGTTGGATCAATTGATGAGGAAGAGGATGAGCAGGGAATTGCACATATGATTGAGCATGTTGCATTTCTTGGCAGTAAAAAGCGTGAAAAACTTTTGGGGACAGGTGCAAGGTCTAATGCATATACAGATTTCCACCATACCGTGTTCCATATACATTCTCCAACTAAAACAAAGGAATATGGTGAAGACTTGCTCCCTTCTGTGTTGGATGCATTGAATGAGTTATTGCAACATTTGCACTCAGAAAACAAACTGAGCGAAAGATTCCCTATTGGACTTGAAGAGCAGATACATAAATGGGATCCTGATAAGATCCGCAGATTTCATGAGCGTTGGTATTACCCTGCTAATGCTACTTTATATCTGGTAGGAGAGATCAATGATATTCCCAGAGCAATACGAGAAATAGAGGCTGTGTTTGAACATACACTTCCAGAAGGTGAAGCAGCCCCTATGTCAACTGCAAGTCCATTTGGTGCTATGGCAAGCCTTTTTGCACCAAAGCTACCTGGTGGCTTGGCTGCAAGCCTAACTGGTGAAAGATCACCTGCTGCGGATAAAATAAAGCCTGTGAAAAGGGAAAGACAGGCAATTAGGCCACCTGTAGAACATAAGTGGTCTCTTCCTGGAGTTGCCCAGGATGCCAAGCCTCCAGCAATTTTTCAACATGAATTGATCCAGAGTTTCTCAATCAACATGTTCTGTAAGATACCTGTTAACCAAGTTCAGACATATAAAGACCTGCGAAGTGTCCTGATGAAGCGGATATTTTTATCTGCTCTGCATTTTCGAATCAATACAAGATATAAGAGCTCAAATCCTCCTTTTACATCCGTCGAGCTGGATCATAGTGACTCTGGAAGGGAAGGTTGCACTGTCACTACTCTTACAGTAACAGCTGAACCCCAGAATTGGAGGAGTGCCATCAAAGTTGCCGTTCATGAGGTTAGGAGACTCAAAGAGTTTGGTGTCACAATGGGGGAAATGACCCGCTACATGGATGCACTGATAAAAGATAGCGAGCAACTGGCTATGATGATTGATAGTGTTCCCTCAGTTGACAACTTGGACTTCATTATGGAGAGTGATGCACTTCGCCATACTGTTATGGATCAATTGCAGGGGCATGAAAGTTTGCTTGCTGTTGCTGAAACCGTCACCCTTGAGGAGGTCAACACTGTTGGTGCAGAAGTTCTGGAATTTATTTCAGATTATGGAAAGCCTGATGCACCGCTTCCTGCTGCTATTGTGGCCTGTGTACCCAAAAAGGTCCACATGGATGGAGTAGGTGAAACTGATTTTGAGATACATCCGGAAGAAATAACTGATTCCATCAAGGCGGGTCTTGAGGAACCTATTTACCCAGAGCCTGAGCTCGAGGTGCCAAAAGAACTGATTACTCAGTCTGAGCTTGAGGACTTGAAATTGCAACGCAAACCATCATTTGCTTCTCTGAGTAAAGAGGAGAATGTTGTGAAAATATTTGACGATGAAACTGGTATAGCACAGCGCCGCCTTTCTAATGGAATTTCCATCAATTATAAGATCACACAAAATGAGGCAAGGGTTGGTGTTATGCGACTGATAGTAGGTGGTGGGAGGGCAACAGAAGATTCTGAATCTAAGGGATCTGTTATTGTTGGTGTTCGTACTTTGAGTGAAGGTGGCTGTGTTGGCAACTTTTCAAGGGAACAGGTTGAACTTTTCTGTGTGAATAATCTCATAAACTGCTCATTAGAATCCAATGAGGAGTTCATTTTTATGGAGTTCAGATTTGCTTTAAGAGACAATGGCATGCGCGCTGCTTTCCAACTCCTCCATATGGTCCTTGAGCATAATGTGTGGCTAGAAGATGCATTTGATAGAGCAACTCAGCTATACCTGTCTTACTATCGCTCCATTCCCAAAAGTTTGGAGCGCTCTACAGCCCACAAGCTTATGTTAGCCATGTTGAACCATGATGAAAGGTTTGTAGAGCCATCACCACATTCATTGCAGAAATTGACTCTCCAATCAGTCAAAGATGCTGTTATGAACCAGTTTGTTGGTGACAACATGGAGGTCAGTATTGTTGGTGATTTCACTGAAGAAGAGGTCGAATCTTGTGTTCTTGACTATCTTGGGACTGTGAGTGCTCCAAAATCTTCAAAAACACAGGAGCATATTGAGAAGATTTCCTTCCTGCCGTTTCCTTCGGACTTGCATTTTCAGCAAGTATACATAAAGGATACTGATGAGAGAGCTTGTGCCTACATTGCTGGCCCTGCACCTAATCGCTGGGGGTTTGCAACTGAAGGGAATGATCTATTCAATGTCATCCGGAGTTCTAGTGGAGATGCTCAAGTTTCTGAATCAGCAAACACAGATCTTACGGAGAGGAAACATAATGACGTTCGCAGCCATTCTCTGTTCTTTGGCATCACTTTGAGTTTGTTGGCTGAAATTATTAATTCTAGGCTATTCACAACAGTTCGAGATTCCATGGGATTAACCTACGATGTTTCTTTTGAACTAAACCTTTTTGACAAATTGGACCTTGGTTGGTATGTGATTGCAGTAACATCAACCCCGAGCAAGGTTCATAAAGCTGTTGATGCATGCAAAGGTGTTCTCAGAGGATTACATAGTAACAAAATCGTTGAAAGGGAGCTGGACCGGGCAAAGAGGACGTTATTGATGAAACATGAGGCTGAGACAAAGACAAATGCCTATTGGCTTGGTTTACTAGCCCATCTGCAGTCTTCATCTGTGCCTAGAAAGGAAATATCCTGCATCAAGGAATTGACGATGTTGTATGAAAGTGCCACGATTGAGGACTTGTATCTTGCATATGAGCACCTAAAAGTTGATGAATCTTCTTTGTTTGCTTGCATTGGGATTGCTGGTGCTGAATCTGGCGAAGAGACGACTGATGATGAGCTCGATATGGGCCTGCATGGCATGGGTCCTATTGGAGGCCGTGGTCTATCAACAATGACCAGACCAACCACATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MFDDFQIRRRHVLHAAGPDEPHVASPTWSETALDKHYVDQPIGKEELEGFLNTPLPSHPKLVRGQLKNGLRYLILPNKVPANRFEAHMEVHVGSIDEEEDEQGIAHMIEHVAFLGSKKREKLLGTGARSNAYTDFHHTVFHIHSPTKTKEYGEDLLPSVLDALNELLQHLHSENKLSERFPIGLEEQIHKWDPDKIRRFHERWYYPANATLYLVGEINDIPRAIREIEAVFEHTLPEGEAAPMSTASPFGAMASLFAPKLPGGLAASLTGERSPAADKIKPVKRERQAIRPPVEHKWSLPGVAQDAKPPAIFQHELIQSFSINMFCKIPVNQVQTYKDLRSVLMKRIFLSALHFRINTRYKSSNPPFTSVELDHSDSGREGCTVTTLTVTAEPQNWRSAIKVAVHEVRRLKEFGVTMGEMTRYMDALIKDSEQLAMMIDSVPSVDNLDFIMESDALRHTVMDQLQGHESLLAVAETVTLEEVNTVGAEVLEFISDYGKPDAPLPAAIVACVPKKVHMDGVGETDFEIHPEEITDSIKAGLEEPIYPEPELEVPKELITQSELEDLKLQRKPSFASLSKEENVVKIFDDETGIAQRRLSNGISINYKITQNEARVGVMRLIVGGGRATEDSESKGSVIVGVRTLSEGGCVGNFSREQVELFCVNNLINCSLESNEEFIFMEFRFALRDNGMRAAFQLLHMVLEHNVWLEDAFDRATQLYLSYYRSIPKSLERSTAHKLMLAMLNHDERFVEPSPHSLQKLTLQSVKDAVMNQFVGDNMEVSIVGDFTEEEVESCVLDYLGTVSAPKSSKTQEHIEKISFLPFPSDLHFQQVYIKDTDERACAYIAGPAPNRWGFATEGNDLFNVIRSSSGDAQVSESANTDLTERKHNDVRSHSLFFGITLSLLAEIINSRLFTTVRDSMGLTYDVSFELNLFDKLDLGWYVIAVTSTPSKVHKAVDACKGVLRGLHSNKIVERELDRAKRTLLMKHEAETKTNAYWLGLLAHLQSSSVPRKEISCIKELTMLYESATIEDLYLAYEHLKVDESSLFACIGIAGAESGEETTDDELDMGLHGMGPIGGRGLSTMTRPTT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..248#679..877#1121..1168#1580..1768#1865..2161#2651..2752#3154..3288#3645..3869#4003..4206#4339..4509#4633..4782#5159..5296#5407..5634#5788..5940#6133..6256#6369..6486#6750..6870#6968..7048#7228..7329#8073..8223#8420..8502#ATGTTTGATGATTTTCAGATCAGGCGTCGCCATGTATTACATGCTGCTGGACCTGATGAACCACATGTTGCAAGTCCAACTTGGTCTGAAACTGCTCTGGATAAACATTATGTAGATCAGCCAATTGGGAAGGAGGAACTTGAAGGTTTTCTTAACACACCGCTTCCTTCTCATCCAAAGCTAGTCCGAGGACAATTGAAGAATGGCCTCCGATATCTTATTCTACCAAACAAAGTTCCAGCAAACAGGTGAAGAAACTTGTTTCATTTCCACCTATAAACCCTTCTTTTGCAGCAGTACCAACATAACCTTCAGCTGCTATAACAAAAGTATTTACATGATTTGGGATGCCGTGAGTTGTATTTCCTAGCAGTGTGGGGGCCTACAGTTTTGACTTTTGACAAGTTGTTATGTTAATTTCGTTGCAACATAACTATTTGGATTTTGGACCCTTTAAACATTCAATATACTTTAGTGTTGATTCCTGGACATCAAAATTGTTTCAGTATATTGATATATTGACAAATATTATACGGTGGCTTGGGGCCTAGTTCATGCCAGTAAATTACACTACAAACTTGTGCTAAATGTAGAGCATATACACAATGTTCTAATATGCTTGTCAACCGGTGATTAGGTGCAATGCTGATGCAAGATTCTAACTAATCTTTTTTGCAGGTTTGAGGCTCACATGGAAGTTCATGTTGGATCAATTGATGAGGAAGAGGATGAGCAGGGAATTGCACATATGATTGAGCATGTTGCATTTCTTGGCAGTAAAAAGCGTGAAAAACTTTTGGGGACAGGTGCAAGGTCTAATGCATATACAGATTTCCACCATACCGTGTTCCATATACATTCTCCAACTAAAACAAAGGTATGTACTTTTGCAGTCATCGGTTGTTTCTTTAAGTCTATCTCTGTTTTCTATTGCTTTGAATATTTTCTTTGACAAGAATATATATGAAAATCAACTGGGAAACTGTTGACTGCCATATTATGTGCATAACATGTCTTCAACGCTTAACATATGTAGGTATTTCAATCTGGTGGTCTAAATTTGATGTCTTCTCTTGTTTATTTAAGGGTTTAACATATTAGCTTGTCTTTTATGTGGCAGGAATATGGTGAAGACTTGCTCCCTTCTGTGTTGGATGCATTGAATGAGGTGGGATGTTACGTATAGGCTATATGCGCAGCTTTTGCTACCATTTTATTTCTTTTTGGTTAAGGGCCTTTAATAACAATTATCTTTCATTTGGTGATAAAAGTTTTACATGCATTTGGGTAGCCTGTTTAACAAATTCTCTTTCTGCCAAATTTTTGTTCTCCCAGATAGCTTTTCATCCAAAATTTTCTTCTTCTCGTGTTGAGAAAGAGAGAAGAGCAATTCTTTCAGAGCTCCAGATGATGAACACAATCGAGTATCGTGTTGATTGTCAGGCAAGTAATTATTTTACTCTGTACCACTTTTTAGGGCATCCTCTGAGAAGGGATTGTTCCTCTTGGGACACATGCTAAATCAATTCATATTTAAGGGTACTATCTTTCTATACTAATTGCAATTCATTTGGTGTAGTTATTGCAACATTTGCACTCAGAAAACAAACTGAGCGAAAGATTCCCTATTGGACTTGAAGAGCAGATACATAAATGGGATCCTGATAAGATCCGCAGATTTCATGAGCGTTGGTATTACCCTGCTAATGCTACTTTATATCTGGTAGGAGAGATCAATGATATTCCCAGAGCAATACGAGAAATAGAGGTAACTAGAATTACAACCTCCTAACTGTTGTTTTTTCTTATATTTCTGCTGATCTGTTTTTTGGATTAATCGTAAACTGACTCATATGCAATGCAGGCTGTGTTTGAACATACACTTCCAGAAGGTGAAGCAGCCCCTATGTCAACTGCAAGTCCATTTGGTGCTATGGCAAGCCTTTTTGCACCAAAGCTACCTGGTGGCTTGGCTGCAAGCCTAACTGGTGAAAGATCACCTGCTGCGGATAAAATAAAGCCTGTGAAAAGGGAAAGACAGGCAATTAGGCCACCTGTAGAACATAAGTGGTCTCTTCCTGGAGTTGCCCAGGATGCCAAGCCTCCAGCAATTTTTCAACATGAATTGATCCAGAGTTTCTCAATCAACATGTTCTGTAAGGTATGATTGTTTGCTATCTGCTGAATTTTACTCTTTAGGGCTTGTTCTGTTAATCCTCATGAGGAAGGGGTTGAGAGGGATTAATTCCACACCTCAATCGATGTGGAATAAATCCCCCTCAATCCCTTTGGGGGAGGGATTAACTGAACAATGCATTTGGGTTGCGCTTTGTGCCTCTACAGCTTAGTGTTAGCTTAGTTTAACACCAGATGTTTCCATAGTGGTTTCTGTTATAATATATAGTAGATGGGAACCAGTATTTTGTTGTAATCAGCGAAAAGTTTGATAGCCCTTTCTTCCCTCCCTCTCTGTGCACATGCACACATATTCCGCCTGTGCCTAACTATTCATTTTCTCTTCTCAGATATGATTCTATTTTATGATTCAAATGAGAACAGTCTTTAGCTTTAAGCTTACTCTTCTCTTTGAACTTTCTTAAAAATGCATCATTTGTATATGCCTAACTAATTGATTTCTTTTTGTGGACAGATACCTGTTAACCAAGTTCAGACATATAAAGACCTGCGAAGTGTCCTGATGAAGCGGATATTTTTATCTGCTCTGCATTTTCGAATCAATACAAGATATAAGGTTCGTGATATTTAATCAACGTGAATTTTGAATCACTCTAATTTTTTCACTTATGCCGAGACTTTCTTTGGTTTATCTCTCTAAAGAATGCAGATAAGTTCATATGATTTGCATTCTTTTATATCTATATCTAGCACATGTTTTTTTCTTTTTGTAGATTGTTTGTACATGTTTAACAGATAGACATAAGACATGCATTTTACTGGACATTAGACTTGCTGCATAAGTCTGTAGGAGGCCTGAGGTCTTTCCAGTGAAGTATTTACATTTGTTTGGAATCATCTCTTTTTTTTTTTTGCTTGGAATTAGGTTTAAGTAATTAGTAGTTCCATGTTTCTTGTTTCTAGTTTTTAGTGATAAAAACATCTTTCCTGTATATGAATGCTGTATTTTTTATACAGAGCTCAAATCCTCCTTTTACATCCGTCGAGCTGGATCATAGTGACTCTGGAAGGGAAGGTTGCACTGTCACTACTCTTACAGTAACAGCTGAACCCCAGAATTGGAGGAGTGCCATCAAAGTTGCCGTTCATGAGGTTTGTATAGTATACTCATGACCAGTTTATCTGTTTTACATGACTTGTTCTAGCTCACACTCAATTTAATCAATGGAATTATATATAGACAGTCATAGATAATTTCAGGAAATGTAATTGTTGGAAGGAACAAATAGAAAAAAGAAACAGTTCAATGGAAGTTATTGAAGCAAGATTTTATTAGCACAAGACCCGCATAAAGCAAAACTTGCCTATGTCCTGTGTAACGCTGCTAGCCAAAGCCTAATCTGACCTGATCTTCATCCAACCTGGTCCCAACACAACCCAAGCATTCTTTAAAGGGAAGCTCAAGCGTTCCCTTACTTTTACTAACTTATCTTTACCTGCTGTTTCAGGTTAGGAGACTCAAAGAGTTTGGTGTCACAATGGGGGAAATGACCCGCTACATGGATGCACTGATAAAAGATAGCGAGCAACTGGCTATGATGATTGATAGTGTTCCCTCAGTTGACAACTTGGACTTCATTATGGAGAGTGATGCACTTCGCCATACTGTTATGGATCAATTGCAGGGGCATGAAAGTTTGCTTGCTGTTGCTGAAACCGTCACCCTTGAGGAGGTATGGCGATTTTCTTTTATACAAGTCACAGAGGAAAAAAATAAATATATGGCATGGCATCAGTTCATTTTGCCTTGTTTTTAGTTCTACTACTTCATATTATACATAATGAATTATGTTTTACCATATGTAGGTCAACACTGTTGGTGCAGAAGTTCTGGAATTTATTTCAGATTATGGAAAGCCTGATGCACCGCTTCCTGCTGCTATTGTGGCCTGTGTACCCAAAAAGGTCCACATGGATGGAGTAGGTGAAACTGATTTTGAGATACATCCGGAAGAAATAACTGATTCCATCAAGGCGGGTCTTGAGGAACCTATTTACCCAGAGCCTGAGGTACGTTGGTTACTTATGGTATCTCTTGCTTGTTGTGAGCTATCTACCTGGTGTAGAGCAGTATGTTTGGGATCTTGTTTGGTTCTGGTGTCTTGATTGGTTGCTAAATGATTATTGTTATTGTGGCTACAGCTCGAGGTGCCAAAAGAACTGATTACTCAGTCTGAGCTTGAGGACTTGAAATTGCAACGCAAACCATCATTTGCTTCTCTGAGTAAAGAGGAGAATGTTGTGAAAATATTTGACGATGAAACTGGTATAGCACAGCGCCGCCTTTCTAATGGAATTTCCATCAATTATAAGGTAATACTAATAAATTGGAAACCTCTGGCTATTGTTATCAGGATTGAACAGTGTCTTGTTCCAGTTTTGTTGTAGTTCACTTTGTTATTCCATTGTAAAAATTGTGTGGTAAATTGATGACAGATCACACAAAATGAGGCAAGGGTTGGTGTTATGCGACTGATAGTAGGTGGTGGGAGGGCAACAGAAGATTCTGAATCTAAGGGATCTGTTATTGTTGGTGTTCGTACTTTGAGTGAAGGTGGCTGTGTT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