BGIOSGA021229

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA021229

Description

cDNA clone:J013002B12, full insert sequence

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA021229, complete gene.

LocusTag

'

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA021229-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA021229-PA

Length

12501

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:17263254..17275754

Sequence Coding Region

17275620..17275754,17273717..17273905,17273194..17273307,17269480..17269602,17269277..17269396
,17268138..17268236,17266358..17266414,17265710..17265756,17265213..17265390
,17263446..17263520,17263254..17263349

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGCCAATGGCTTATCTTTATGGTAAGAAGTTTGTTGGGGCAATTACACCAACGATATTGGAAATAAGAGAGGAGCTCTACAGTGTACCATATAATGAGATTAACTGGAAAAATGCTCGGAACAATTGTGCCAAGGAAGACCTTCGTTATCCGCGATCATTTGTACAAAATGTTATTTGGACTGGTCTTAACAAAGTTGTGGAACCAATATTGATCCTTTGGCCATTTAATACCTTAAGACACGCTGCACTGAATAATCTCTTGAAGCATATTCGCTATGAAGATGAATCTACAAAATATATTGGCATATGTCCAATCAACAAGGCACTCGACATGATTTGTTGTTGGATAGATAATCCAAATTCTGATGCATTCAAGTTGCATCTTCCAAGAATATACGATTATTTATGGCTTGCAGAAGATGGCATGAAGGCACAGGTGTATGGTGGTTGTCAAAGCTGGGAAACAGCATTTATTGTTCAAGCTTATTGTTCAACAGACCTTGTTAATGAGTTTAGTCAAACACTTACAAAAGCACACGAGTTCATAAAAAAGTCACAGGTCCTTGAAAACCATCCAGACTATGAAGCTTATTACCGCCATAGATCAAAAGGCTCATGGACGCTTTCAACAGCAGATAATGGATGGTGTGTATCTGATTGTACAGCTGAAGCACTTAAGGCATTACTTATGCTATCAAAGATCTCTCAAGATCTAGTGGGAGATCCGATAGACGGAGAAAGGTTGTATGATGCAGTGGATGGCATGCTCTCTTTCATGAATGAAGATGGCACCTTTTCTACATATGAGTGCAAGAGAAGTACACCTTGGTTAGAGGTTCTCAACCCGTCAGAGAGTTTTCTGAACATTGTAGTTGATTATCTGTTTGGTACTTGGGGTATATGTTTCACTTATGGGACATTCTTTGCTGTAAAAGGATTAGCTGCTACTGGAAGAACATACGAAAATAGCTCTTCCATTAGAAAAGCATGCAACTTTATTTTGTCAAAGCAACTTAGTACAGGTGGATGGGGAGAGACTTATCTTTCTAGTGAAACTGAGGTTTATGTGGAGGCTAGTAGACCTCATGCAGTGAACACTGCTTGGGCAATGTTAGCTTTAATATATGCTGGGCAGGTTGAAATAGATCCAACACCACTATATCATGCAGCACAAGAATTGATCAATATGCAACTAGAAACAGGCGAGTTTCCACAACAAGTAAGTATTTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

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Gene Sequence

<dnaseqindica>1..135#1850..2038#2448..2561#6153..6275#6359..6478#7519..7617#9341..9397#9999..10045#10365..10542#12235..12309#12406..12501#ATGCCAATGGCTTATCTTTATGGTAAGAAGTTTGTTGGGGCAATTACACCAACGATATTGGAAATAAGAGAGGAGCTCTACAGTGTACCATATAATGAGATTAACTGGAAAAATGCTCGGAACAATTGTGCCAAGGTTTATTTACATAAGATTTTGCTTCCTCCAAATATCATCACCATTTCCTATAATAAAGCATTTTGAATAACTGGTTGTTCTTAAATAAGTGTCGTACTGAAAACTACATTTTGTTTATTACATGCCTCCTCTGAGAATTGTATTAATAATACTAAATTCATGTGACTCAACCTTATATGGCGTAGTCTGTTTCAGTTTTGTGTAAGCTAGTACATACACATTTTATAATAGAGCTGCTTGAAAGTGCAGGGTTTTGAGTAGTTCGTTCTTGAATGTTGTATAGTTTTTATGTTTAGGATTGATTTTCAGTCTTTCATGGATGGTCAAACTTGTGAACTAGTCCTTTTCCGATTACAATTAACAGCATCAACGTCTACTCATCCTAGAAAATCTTATTCCTTTCAAAATGATTGGGGCGTATATTTCGATATTATGGAATGTATAAATATTTAATTCATTAAATAGTTTTAAAAATTATATGGACAAATTAAGTTCCACCTAAACTAGAACCGTTCACATGGCTGCCTGTATGTTAAAACCATTCAAGAACCATTGTATTGTTGAATACAAATGGCTTTGATAGCTGAAGGGTGAAAAGTGAAAGATTTGTCTCTTAATGCAATGATATGCAAGTATTTTTTGTATTCCCCGAAAAAATTGGAAGAAAGGAAGTTCAAGGATGGAATTCGCTCTAGCAAAGAGAAGATGGATTTGTGACATTATTGGAAGCCTCTTTGTACAAGTGTTAGTAGAGTACCTGCAACTATAGGACTTGGTTGATGGATTGATCCTACAACAGGATGTCCCTGACCAACACACTTGGAAGTTTTCGGAGACAGGAAATTACACAAGCAAGTCTGCTTACCACACCTATTTCATTTGGTCGATAAAATTTGCCCCATGAAAGAGAATATGGATGACTTGGGCGCCCATTAAGTGTAAGTTCTTTTTGTGGTTGGTGGTGAATAACCAATGTTGGACATCGGATCGCCTTGAGAAGTTTGGTATGTCACACCTAGACGTTTGCCCTCTCTGTGATCAACAGGAGGAGATAATACAGGCATCCATGTATCTTGTGTCTTCGCTCGTCAAGTATGGTATCTAATTATGAAAAAGAAAGGCATGGCGGTTTGAGCACGTCAACCCTCCTCAAGACGATTCTCTAGCTAGTGGCCCCAAGTGGTCAGAGTTGTCTCTAAGGAAACTAAGAAAGGGATGGAATCTCTGATTATCTTAGTGGTTGGCAAATTTGGAAATACTGGGATGGCCGCGTCTTCAACAATGCCACACCTAGTACTAATGTCATATTGGATGCCGTGGCAAGGGAGAATTTATTATGGTGTACTGCTAAAGCAAGAGCTCTTCATGAACTCTTGGCCTGATTGATTCTCACTAAGGAGCTTAGCTCCTCTGGGAGTTGTTGCGCATCGCTTCGGCGACTCATTTTTTTCAGAGTGTTCCTTTGTGAAGAGCTCTGTTATGCATGCTTTTTCTTCTCTTTAATGAAATGAAACGCATGGCTGTTGTGTTTGGGAGAAAAAAAGGATGGAATTCAGATTAGCAATTAATTTGGTATCTTAGGATGTAAAGTATATTTCTTCTTGTCCTTCCTTTTTGATTCTGTCTAAGAAGTTAGCTTTTGTTGTGCTTTCTATGTGTAGAATGAAAAGTAATGTACATGACCTTTATATGCTGTCCTTGTTTCTGCTTGCAGGAAGACCTTCGTTATCCGCGATCATTTGTACAAAATGTTATTTGGACTGGTCTTAACAAAGTTGTGGAACCAATATTGATCCTTTGGCCATTTAATACCTTAAGACACGCTGCACTGAATAATCTCTTGAAGCATATTCGCTATGAAGATGAATCTACAAAATATATTGGCATATGTCCAATCAACAAGGTAATGTATGCAATATTTATGGTTTGCTTGCTTTAATTTCAGAGAGGGAGAGTGAATGCCTTCTCATTTAGTGCTATACTCAAGTGGCATGTGAAACTCTAGCCACTTGCTAAATTATTCCATCCATATACATTGTGGGCTTATTATTGCTCCTCCACCCTCCACACGCTCTTTATCTCCTTCCAAAACTACCCAGCTTTCCAGCAAGTTAAGTCCATCTTTTTTCTGCTAACGTTACTCTTGTCATATTATCTTTACTGCCCACCAACACATATCAGTTGCTACCAACACACTTCTCATCTGTGTGCTATTTATATGCCAACTCCTTTTTGGAAGTAAAATTTTGATATCTTACATCGCACCTACCTGGTTTGTAAGCAGCTCGTTAACAACCTTTAATGTTCTTTAGGCACTCGACATGATTTGTTGTTGGATAGATAATCCAAATTCTGATGCATTCAAGTTGCATCTTCCAAGAATATACGATTATTTATGGCTTGCAGAAGATGGCATGAAGGCACAGGTACTACCGATGTTGCTATTTCTCTGCAAATGTTCTAGTTTTTTCTTATGGTTACTTGGCTAAAAAAAATACTTGACTTATACAAACTTTGATAAAAGCCACATGCTTTTTCATAATAAAGGATGAGTGGCCAATAAAGATAACTGCTTAGTTTACTTCAATCACAGCTATGTGGCTCCTGGTGGTGCTTGTGCACATGTACTTGCCTAGACTCTTGACACATTAACATAGCTGTTCCCAAAATACATCCACAACATATCTGAAAGAAATTGGTTCATCACACTGAATTACAGTAGTCTGAGCGCCATATAGGACACTATCCATCATGAGTCCATACTTTTCTACCATAGGCAACTAGCATGGGGAATGCAACGTAGGTCCACCTTTCTTGACATAAACATTGGCAAGTTGACACTATTACAGTAGAATTAGATTGTCAAACTCGGTGTCATGATGTTATATCATAATTATATGTGACATCTGTACTTGACGTTAATGTGCTGTAACAAAATATTTCAGTGCTTTGTATTCTCAACTTCACTTTGTATCTTTAGCATATACTTCCTTCACTTCAAAATGTAAGTGATGCAGTTGTTTTCATCTTATTTCAAAGTAAATTTGTATGATTAAAAAGTGTATATGCAATACGATTTGCATAGATCGGACTTTGGTAAAGGCCCATGTCCAAGTACCGTTGAGATAAGCCCCTTATGAAGATTTTAGAAAGGTTGGGGCAACCTGTAAACCTGCAAATTCCAACCAAAAAACATTAATTGCTAAAACAGAGTTTATAGCATTAACAGACGACAATTGTGGCCTGTTTTGAGTTAACGTGGTTGTTTTCATACTTATCCATACATCTGGTTATTAATCCGCTGGTATGGCCATTGTCCACAACATTGGTGCCAACATATAAATCTTAATGTTCCAACCACATCATGTTCTAGTGAACCCAGGGGTGTTGTGCATATGTAGGCTCATTCCATGGAAGAGCTTTGTCCTTATTCTCTTGATCTTTTGTCTCTTCAACTCTTGTTTCCAATGTATTTAAGTAGGATAACGTAATTAATTTTTTAGGATGAGTCTAAAATGTACCCCTACTCTAAAACTGGGTATTCAACACCCTTCAACTCCTAAAACCAGTGTTACTGGGACACGCGTGTCCAAAAATTTTTTGGCACGTCGACTCGTGTCTGACAAGGGGAGACACGCATCTGACCCCTCGATGCGTGTACTTTCTTGCTTTGTGGTGGCTTCTTGGGAGCAGCAAAAGGATATAGAGAAGCATCAGAGAGTGAGAGAGCTCAGCTGCAGCCTGCAGCCTGCATCACTACCCTTTAGCCTAGCACACTGTTGGCCAGTGCTACCGGGACACGCGTGTCCAAAAATTTTTTGGCGCGTCAACTCGAGTCCGCGCGTCGACTCGTGTGTGACGTGGGGAGACACGCATCTGACCCCTCTATGCATGTCCAAACTCAAAACTGACATGCTAGTAGTACTTTCTTGCTTTGTGGTGGCTTCTTGGGAGCAGCAAAAGGAGAGAGAGAAGCATCAGGGCGTTCACAGTGCGTCACCGATTTTTGTTGTTCCTCATATGCCACGTAGACGAAGAACCTCATAAGCTTCATACTCCACAGTGCAAGTACTAGTAGTGGGTCCCACCGGTAGCAAACTTTTCACTTTTCATCTCTCTCCTTTTTCTTCTCACCCAAATGAATATTAGTACTAGTAGTTTCTCTCCACGCCGGGGCTGAGTAGCTTCTCCCCAAGAACCGGTGGCAAACTTTGGACACAAAAACTTCATTTTGGTGGACCCAGAAGCAAATGTGGCGTGTGGCTTTCTCCTTTGCAGACGTGGGAGGGTGAGGCTGAACACCACGCAAGCCCACTGTGAACGCCCTCAGAGAGTGAGAGAGCTCAGCTGCAGCCTGCACCCCTACCCTTTAGCCTAGCACACTGTTGGCCTGTTAGGTAGTACTACTAGTGTACTAAAGTATTAATGTGTGGCTGTGAAAGCTCCTCTACTCACGAGAGTAGTAGTTGGTAAGGATTATCTGTGCATAAAGGATCCTCTACTGGCCTGTTAGGTAGTACTACTAGTGTACTAAAGTATTAATGTGTGGCTGTGAAAGCTCCTCTACTCACGAGAGTAGTAGTTGGTAAGGATTATCTGTGCATAAAGGATCCTCTACTGGCCTGTTAGGTAGTACTACTAGTGTACTAAAGTATTAATGTGTGGCTGTGAAAGCTTCTCTACTCACGAGAGTAGTAGTTGGTAAGGATTATCTGTGCATAAAGGAT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External Link(s)

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