BGIOSGA021944
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA021944 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA021944, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0007O20.8-2 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA021944-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA021944-PA |
| Length |
8152 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:2521441..2529592 |
| Sequence Coding Region |
2529590..2529592,2529366..2529433),complement(2529050..2529104,2528291..2528327),complement(2527880..2528205 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:2521441..2529592 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:2521441..2529592 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCCGCTCAGGTTGGAGATCAAGGTGCGCCACTGGCTCGGGCTCGGCGAGCCCGATTCCGCTAGATCTCGGATCCTGTCGAGTCTTTACTCCGGGAGCGTGTGCATCTGGGACTATCAGTCGCAGACAATGGTGAAGTCATTTGAAGTTTCAGAATTGCCAGTGCGGTCAGCAAAATTTATTTCACGGAAACAATGGGTTGTAGCTGGTGCAGACGATATGTTCATTCGTGTCTACAACTACAACACGATGGACAAAGTTAAGGTTTTTGAGGCTCATACTGATTATATTAGATGTGTTGCAGTCCATCCAACACTTCCATATGTGCTTTCATCATCTGATGACATGTTGATAAAATTGTGGGACTGGGATAAAGGGTGGATGTGCACTCAAATCTTTGAGGGACATTCACACTACGTGATGCAAGTTACTTTCAATCCAAAGGATACTAACACTTTTGCAAGTGCATCTCTTGACCGAACTACAAAGATATGGAGTTTGGGTTCTCCGGATCCAAATTTCACACTCGATGGACATCAAAAGGGTGTGAACTGTGTTGACTACTTCACTGGTGGTGACAGGCCCTATTTGATCACTGGTTCTGATGACTCCACTGCAAAGGTCTGGGATTACCAAACGAAGAGCTGTGTTCAGACACTTGAAGGACATACACACAACATTTCTGCTGTTTGTTTCCATCCTGAGCTTCCTATAATCATTACTGGATCTGAAGATGGCACAGTTCGCATATGGCATTCGACAACTTACAGACTTGAGAACACGCTAAACTATGGTCTTGAACGAGTCTGGGCTGTTGGATACATGAAGGGTTCAAGAAGGATGGTAATTGGTTATGATGAGGGAACTATAATGATAAAAATGGGACGTGAAGTACCTGTGGCAAGCATGGATACCAGTGGAAAAATCATTTGGGCAAAACATAACGAGATACAGACTGTGAACATCAAAACTGTTGGTGCAGGCTTTGAGGTTACAGATGGGGAAAGATTGCCATTGGCTGTTAAAGAATTAGGAAGTTGTGATCTTTACCCACAGAGCTTAAAGCATAACCCCAATGGAAGATTTGTCGTAGTTTGTGGAGATGGTGAATTCATAATTTATACTGCATTGGCTTGGAGGAATAGGTCATTTGGATCTGCATTGGAGTTTGTTTGGTCATCAGAAGGAGAGTATGCTATCAGGGAAAGTACATCAAGAATAAAGATTTTCAGTAAATCATTTCAGGAGAAGAAAACTATTCGCCCTACATTTTCAGCTGAACGTATTTTTGGTGGAATATTATTGGCGATGTGTTCCAGTGATTTCATTTGCTTTTATGACTGGGCTGACTGTAGACTAATACGCCGCATTGATGTGAATGTCAAAAACCTTTATTGGGCTGATAGCGGTGACCTAGTTGCAATAGCAAGTGATACATCATTCTACATACTGAAGTACAACAGAGATGTCGTTGCGTCTTATCTAGAATCTGGAAAACCTGTGGATGAGGAAGGCGTTGAAGATGCTTTTGAGCTGCTTCATGAGGTTAATGAGCGAGTGCGGACAGGGATCTGGGTTGGAGACTGCTTTATTTATAACAATTCATCATGGCGCCTGAACTATTGTGTTGGTGGCGAGGTCACCACGATGTATCACTTGGATCGCCCTATGTACTTGTTGGGATATCTAGCGAATCAAAGCCGAGTTTATCTTATTGACAAGGAATTCAATGTCATGGGGTACACATTACTTCTTAGTTTGATTGAGTACAAGACACTTGTGATGCGTGGGGATATTGAACGTGCAAATGATATTTTACCATCCATACCAAAGGCGCAATATAATAATGTTGCTCATTTCTTGGAGTCAAGAGGTATGCTGGAGGAAGCACTTGAGATAGCTACTGATGCTGATTACAGGTTTGACCTAGCTGTGCAACTTGGAAAATTAGAAGTTGCAAAGGCTATCGCGATGGAAGCGCAAAGTGAATCTAAGTGGAAGCAGTTGGGTGAACTGGCTATGTCCACAGGCAAGCTAGATATGGCGGAAGAGTGCCTTGTGCAAGCGAAGGACTTAAGTGGCCTGTTGCTACTATATTCATCTCTTGGAGATGCTGAGGGAATCGAGAAGCTTGCTTCTCAAGCAAAGGAGCATGGCAAAAACAATGTTGCTTTCCTCTGTCTCTTTATGCTTGGTAAATTGGAAGATTGCATACAATTGCTGATAGACAGCAATCGTATACCTGAAGCTGCGTTAATGGCACGTTCTTATCTTCCCAGCAAAGTTTCTGAGATAGTAGCAATATGGAGAAATGACCTCAGTAAAGTTAATCCAAAAGCTGCAGAGTCTCTGGCAGATCCTTCTGAGTATCCAAATTTATTTGAAGACTGGCAGGTTGCACTTACTGTAGAAAAGAATGTTGCTTCTCGGAGGGTCCATTATCCTCCTGCTGATGAGTACTTGAACCATGCTGAAAAGTCAGACATGACTCTTGTGGAAGCTTTCAAAAGGATGCAGGTCATTGAAGATGAGGAAACAGAAGATGCACTAGATGAAAATGGAGAGCCCGATGAAGAGGTTTTGGAAGAGAACAAAGTGGAGGAGAGCACAGATGAAGCTGTCGAAGTTGATGCTGATGAGCCTGAAGAGACCGTTCTTGTAAATGGGAAAGAGGGTGAGGAACAGTGGGTGCTAACTGAACATGAGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPLRLEIKVRHWLGLGEPDSARSRILSSLYSGSVCIWDYQSQTMVKSFEVSELPVRSAKFISRKQWVVAGADDMFIRVYNYNTMDKVKVFEAHTDYIRCVAVHPTLPYVLSSSDDMLIKLWDWDKGWMCTQIFEGHSHYVMQVTFNPKDTNTFASASLDRTTKIWSLGSPDPNFTLDGHQKGVNCVDYFTGGDRPYLITGSDDSTAKVWDYQTKSCVQTLEGHTHNISAVCFHPELPIIITGSEDGTVRIWHSTTYRLENTLNYGLERVWAVGYMKGSRRMVIGYDEGTIMIKMGREVPVASMDTSGKIIWAKHNEIQTVNIKTVGAGFEVTDGERLPLAVKELGSCDLYPQSLKHNPNGRFVVVCGDGEFIIYTALAWRNRSFGSALEFVWSSEGEYAIRESTSRIKIFSKSFQEKKTIRPTFSAERIFGGILLAMCSSDFICFYDWADCRLIRRIDVNVKNLYWADSGDLVAIASDTSFYILKYNRDVVASYLESGKPVDEEGVEDAFELLHEVNERVRTGIWVGDCFIYNNSSWRLNYCVGGEVTTMYHLDRPMYLLGYLANQSRVYLIDKEFNVMGYTLLLSLIEYKTLVMRGDIERANDILPSIPKAQYNNVAHFLESRGMLEEALEIATDADYRFDLAVQLGKLEVAKAIAMEAQSESKWKQLGELAMSTGKLDMAEECLVQAKDLSGLLLLYSSLGDAEGIEKLASQAKEHGKNNVAFLCLFMLGKLEDCIQLLIDSNRIPEAALMARSYLPSKVSEIVAIWRNDLSKVNPKAAESLADPSEYPNLFEDWQVALTVEKNVASRRVHYPPADEYLNHAEKSDMTLVEAFKRMQVIEDEETEDALDENGEPDEEVLEENKVEESTDEAVEVDADEPEETVLVNGKEGEEQWVLTEHE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..3#160..227#489..543#1266..1302#1388..1713#1812..1943#2029..2177#2684..2752#2875..3025#3107..3172#3611..3799#4419..4559#4650..4724#4849..5025#5126..5217#5294..5410#5851..5965#6087..6158#6521..6717#6804..6897#7010..7116#7233..7377#7567..7678#8133..8152#ATGGTACGTACGCGGATCTGAGCTTTGGCCAGCGCGCTCTCGCTGTTCCGATCAATCCGCTCGCCCGTTTTTTTTTTTTTTGTGTGTGTTGGGAAGTAATTGGGTGTGGTTTGGGGAGAGATCTGATCAAATGTTGTTTTCTGCTTGTGCTTCCTGCAGCCGCTCAGGTTGGAGATCAAGGTGCGCCACTGGCTCGGGCTCGGCGAGCCCGATTCCGCTAGATCTCGGTTTGTTGCTGTTTCAGTTGGTGGTTAGTTTTGTGCTGATTTTGTGGTTGTTTTGTCTTTGGGATGGTGTGATTAGAGGAAGTTTGCGCAACGGTCGGAGAGGGTCAAGTCGGTGGATCTGCACCCCACGGAGCCATGGCAAGTGACCTGCATTTCTGAGGGTTTTAGCACATTTTAGCCTGATTTGAGCCGTTCGTACTACCATTTTGATGTGCTTTTGCTTCATTATTTGATTATTAAGCTGTTTTTGCATTGGTGTAGGATCCTGTCGAGTCTTTACTCCGGGAGCGTGTGCATCTGGGACTATCAGTCGCAGGTAAGAGTTCTAGTTGCATTTTAGGTTCATTGTTTCCCCATTAAGCAAGACTAAGACTCAACTACTTTTGAAGTAAATATGAATATTCAAAACTGTACTCATGCTAATTGACCGAAGCATGATTGTGCATAAAATTAGGGCTTCTGTTTCTATAATCTATATGGTTTCTTATTAGTTTTGCATGTCTTGAGCTCAAATTTTGCTTTACAACTTAATCACATGACGGATGAAGGGGTATATGCTAAGTAGTTTTGTCATTCATCCTTAAATCATGCTTTCCAGTTAGTACAAATCACTATGGGAGGAACATAGAAGCATTTCTCACCACATTATTACATCTTCACACTTATGTTATACTCCCACTGAAGTTTAATGCCATCTGTGGCTAACTGATCCATTATATGTAATATATATTATTTTTGGTGGCTGCAAAGCCTCAGTGCCTTATTCCAATGTAATATGTTATTTTTGGTGGCCGTCAAAGCTTTGGTGCCTTACTCCAATGTAACATGTAAGCCTTTTACAATTTTGCATTGACCTATAGGATGATCGGTTGATGCCTAGTCTTATATCATGACCATCATTGTTTGGATTTGAACCACATAGAATTGACTCTGCATTTCAAATCAGCGTATTCCATCACATGCTCCTGCAATCCTGCATAATCTATACTTAGCGTTCCATTTGATTATTAACATGTTTTCCTTGGTGTATGTTTGCAGACAATGGTGAAGTCATTTGAAGTTTCAGAATTGCCAGGTACTCATCTGCTTATGTTCACATGAAATGAAAATCTGTCATAGAGGTTGAATTGATGCTAACTTGTATCTGATCTTAATTTCAGTGCGGTCAGCAAAATTTATTTCACGGAAACAATGGGTTGTAGCTGGTGCAGACGATATGTTCATTCGTGTCTACAACTACAACACGATGGACAAAGTTAAGGTTTTTGAGGCTCATACTGATTATATTAGATGTGTTGCAGTCCATCCAACACTTCCATATGTGCTTTCATCATCTGATGACATGTTGATAAAATTGTGGGACTGGGATAAAGGGTGGATGTGCACTCAAATCTTTGAGGGACATTCACACTACGTGATGCAAGTTACTTTCAATCCAAAGGATACTAACACTTTTGCAAGTGCATCTCTTGACCGAACTACAAAGGTCTGTTTCACAATCTCTTATGCAGTGGATGTTATTCACAATATATGGCTTTTTATGAGGTGATTTGTGCACTAATGGTTCTAAAACTGAAACAACAGATATGGAGTTTGGGTTCTCCGGATCCAAATTTCACACTCGATGGACATCAAAAGGGTGTGAACTGTGTTGACTACTTCACTGGTGGTGACAGGCCCTATTTGATCACTGGTTCTGATGACTCCACTGCAAAGGTTTTTTTTTTTCTATCCACTTTTGAGTGTTCCAAGTATCCACGATTCTGTGCAGTCCTAAGATGGTGTGGTCATGGTGAACCAGGTCTGGGATTACCAAACGAAGAGCTGTGTTCAGACACTTGAAGGACATACACACAACATTTCTGCTGTTTGTTTCCATCCTGAGCTTCCTATAATCATTACTGGATCTGAAGATGGCACAGTTCGCATATGGCATTCGACAACTTACAGGTCGCTTTCACAGTTTCACTTGTGTTTTTGCTTGTTGATGTGGACTGTTTCCTAGTTCTCATTGTTTGCTATTCAAGTGCTCTCTACGAAAGAAACAACTTGTAATTTCCTGGTTCTCATTTCTGGATTCTGGATATTTTGCTTTTTCTCTTGGCAACCTCTCAAGTCCTGGGTTCAAAATTTGATCCAAAAGTTTTTACATATTTTCTTAGAGGAAATTTTCCCCAATATAGCTTTTTGGTATAATTATCTCATAACTCATAAACATATTATGCATGGGCTATTCTTACATAGAAAAGCTCCAAATCTATGTTAGACATTGGAAAAGAGGGTAGCTGACAGTGTAATCTATGTACCAATCGGTCTGTTTTTGTCATTAATTTATCTGTTCCTTTTTCTTATGGTCTGGAATATTTGTTAGTTGTTGGCAGCTCACTACTTAATACTTATGTCAGTTATGATTGCCACAATGTTGAGGTGTTCTTATTTTTTAATTTATTTTGTAGACTTGAGAACACGCTAAACTATGGTCTTGAACGAGTCTGGGCTGTTGGATACATGAAGGGTTCAAGAAGGTAAACAGAAGATCCTTTGCATTCTGCTTTTGTGTTGCATTGTAATCAATTGCTTTTACTACTGTTCTGCGTCACTCCTCCTTTCAATTTTTTAACACCATTCGACATTTTATGATATGTAGGATGGTAATTGGTTATGATGAGGGAACTATAATGATAAAAATGGGACGTGAAGTACCTGTGGCAAGCATGGATACCAGTGGAAAAATCATTTGGGCAAAACATAACGAGATACAGACTGTGAACATCAAAACTGTTGGTGCAGGCTTTGAGGTCAGTTGGCCTGTTTGCAAACAGAGTCGATCAATCAAACAGAGAAGCTGATCTCATGCCCTACTATGTTTTCTTATTCAGGTTACAGATGGGGAAAGATTGCCATTGGCTGTTAAAGAATTAGGAAGTTGTGATCTTTACCCACAGGTATTTTTGAATGTCACAACTCACAACGCTCTTTATATTTTACTCCTGATACTGTTAGCAGTGCTGCAGTAACCTATGTGTTTGAACTTCTGCATAAATAGCATCCATTAATCTCACATCAGCATATATAGTGGTTATCATCCATGCCTGCAGCTTGTGAATTGTGATGACTTGTAAATGGTTATGCTAATAAGCTTAGTGAAAGAACATATGGAACTTGTAGTTCAATAGGTGACATTGTCCAATTAGTGTTAATTGCTTTGATTGATAGTTTTCACACAACCACTACCTCTATTTTGTGTTCCTTGTGATTCCTTGATGTGATATTAGACTGAGATGGCTACAACATTTCTTTTCTTTCTACTAGGTAATGTTAGTTGTTTGTCATATCTTGAATAGTATTCAATCTTACTATGTGTCATCATTTTGTTTGGTCAGAGCTTAAAGCATAACCCCAATGGAAGATTTGTCGTAGTTTGTGGAGATGGTGAATTCATAATTTATACTGCATTGGCTTGGAGGAATAGGTCATTTGGATCTGCATTGGAGTTTGTTTGGTCATCAGAAGGAGAGTATGCTATCAGGGAAAGTACATCAAGAATAAAGATTTTCAGTAAATCATTTCAGGTTTGGCCCACATTGATTGTAGCCTTTCCTTTTATGAATTTGATCAGTAAAACTGTAGTGTTTCATTTCTTCAATCACCACTCTGGAGAATGCACCATCTTCACCTGTTTATCACTTTGCCTTTAACCGTGAATTTACACCTTGCAATATTCAATTGAGATGTCTAATGTACTATTGTTTGGCTAACTATTGAGTTAACTTTTATTTAATCAATAAAGGTTTCTGGTTAACACGAGCGTTCATTCAATCAAAAGTTTTATGTTGTGCATTTTAATGTCTGTTCATGATTCATCAATCATCATGTTTGGTGAAAGGAAATTACATACCGATTTAGGTTTGCATCTCATTGGACCTAGTCACCTAGATGACAGTTTCTTTTTCTTACACTATATATCTTACTTCCTGACAATCTGTTGTCATTCAGCCAATCAGCCTACATGAATACTCCATTTATGTTTAGCTATAACATTGATCTAGAAACAATTTAAGCGTAGGTTGATTTAATTAGTTACTATGTTCTAAGGACCTTTTATTAATGAATTTGGCAAAGAATTGCACATCATATTCTGTTGGCATTTATCAATATTGTATCTTCTGGTTTGAATGATCCAATATGCAGGAGAAGAAAACTATTCGCCCTACATTTTCAGCTGAACGTATTTTTGGTGGAATATTATTGGCGATGTGTTCCAGTGATTTCATTTGCTTTTATGACTGGGCTGACTGTAGACTAATACGCCGCATTGATGTGAATGTCAAAGTGAGTCAAATATTATCTATTGATATTTATAGATTGATACTTTTAACGAATTTCATACTGAAATAACTAGTTTTGTCACTGTATTTTTAGAACCTTTATTGGGCTGATAGCGGTGACCTAGTTGCAATAGCAAGTGATACATCATTCTACATACTGAAGTACAACGTAAGTTA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|
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