BGIOSGA022142
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA022142 |
|---|---|
| Description |
BGIOSGA022142 |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA022142, complete gene. |
| LocusTag |
' |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA022142-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA022142-PA |
| Length |
6656 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:409565..416220 |
| Sequence Coding Region |
409565..409869,410648..410873,411539..411664,411759..411923,412000..412118 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:409565..416220 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:409565..416220 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCCTAGCTGCTGCTGCCTCCTCGGCCTCGGCTTCCCCTCGCCGCCCTCCGCCCTCCGCATCCTGCGCCGCCGCATGGCCTCTCGCGCCTTCCAGCTCCGCCTCAACCCGCTCACCGGCGACTCCGAATGGCTCGTCGTTGAGGAGGAGGAGGAGGAGGACCACCACCCGACACCGCCACCCAAGCAGCTTCTCGCCACCACCTCCTACCTCGACATGCTCAACGACTCCGCCCGGAACCGCGCATACCGCCGCGCCATCGAAGCCGCCGTCACCGACCCTTCCTCGCGCGTCCTCGACATTGGAGCTGGGACTGGGTTGCTATCCATGATGGCCGCCCGAGCTTTGGCAGCTGTTGGGGGTGAAACTAGAGGAGGAAGTGTTTCAGCATGTGAATCTTACCTCCCAATGGGAAAATTGATGCGAAGGGTACTGAGAGCCAATGGGATGGAAAACAGGGTCAAAGTCTTTCACAAGCGTTCGGATGAGCTCAAAGTCGGAGATGACCTGGATTCACCAGCTGATATATTGGTAAGTGAAATTCTTGATTCTGAGCTGTTGGGCGAGGGTCTGATACCTACTTTACAGCAAGCATATGACATGTTATTGGCAAAAAATCCAAAGATAGTTCCTTATCGAGCCACTACATATGGGCAGCTAGTTGAAAGTACATTCTTGTGGAAGCTACATGATTTGCACAACAATGAAGCAAATGCTGCAGACGGTGTATGGCTGACTCCTGGTGAGATGGAGAGGATTGTGTCTGTGAAGCCACAACAACATGCAATGCAATGTGATGCACTAGAAGATGAGATACGATTGCTGTCAGAACCCTTCAAAGTTTTTGAATTTGACTTTTGGAAACGGCCAGATAGTCATCGTGAGGCCAATATCAAGATACAAACAACACGAGATGGATATGTTCATGCTATTATTTCATGGTGGGTACTTCAATTGGATTCTGCTGGGTCAATCTTCTACTCAACTGCTCCTAGATGGGCGAGACAATCAAGTAGTGAGGGGCCGCAACGCGACATGAAGGATTGGTGTGATCACTGGAAGCAGTGTGTATGGTTCATGCAAGGCAAGGGGATCCCTGCTACGGAAGACCAAGTTCTTTCGTTACGAGCTAGACATAACCAAACCAGCATCTCCTATCAGCTGAACATCAATGATGAAGCATGTGATAGAAGTTCCAAAGGTGACCATCTAACGTTGTTGCCAGAACGGATTGCACTTTATGGTGATAAAGATTGGAGATCAGCTCTGATAAATACCATTAAAAATGCTTTAACTGTGAAATCTTCCCCAACTTGTGTTGTGGCTGACGACAGCATGTTCTTGGCTCTCTTAATTTCCTCCATGTCACCCACTTCAAAAGTCATCGCGATGTACCCTGGTCTACGGGACAAGGGTGCAGCCTATCTTCGATCTGTTGCAGATGCAAATAATTTTTCCATAGACCAGATTCAAGTGATTGGTAAAAGAGCCTCATCTATTACAGCTGATGACCTGAAACATAAAAAGGTTAATTTATTAGTGGGGGAGCCATTTTATCTTGGAAGTGAAGGAATGCTTCCGTGGCAAAATCTACGTTTCTGGTTCGACTTATGGAGGAGCCGTAGCAGCCTTAAAGATGTAGAGGGTTTTGATCACTCAGTTGTCAATGAGACTTTAGGAGCCTGTGGTTACCTGCCTGGAGACCAGCAAGGTCCTTGTCTGCCGTATTATGTATGGCAATGTGGTTATACCAAGAAATTAAGTAAAGTGTACTCTCTGATGGATTTCAACTTTTCTGAGCCAATCCACTCCTGTTTTGGGAAAACAAAGATCGAGTTTTCTCATGATGGAACATGCCATGGTTTTGCGGTTTGGATTGATTGGGTTCTTGATGAGAGAAAATCCGTTGTGTTAACAACCGGACCAGATAACCGATACTGGAAACAAGGAGTACAGCTCTTTGGCAAGCCTGTAGAAGTAAATCCAGGCAAGTCGGTGATGCATGTAGAGGCGTCCTTCGATCCTTCCACGGGTGAGATAACGTTCAGCAGTTCATCAACAACCTGCTCCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPSCCCLLGLGFPSPPSALRILRRRMASRAFQLRLNPLTGDSEWLVVEEEEEEDHHPTPPPKQLLATTSYLDMLNDSARNRAYRRAIEAAVTDPSSRVLDIGAGTGLLSMMAARALAAVGGETRGGSVSACESYLPMGKLMRRVLRANGMENRVKVFHKRSDELKVGDDLDSPADILVSEILDSELLGEGLIPTLQQAYDMLLAKNPKIVPYRATTYGQLVESTFLWKLHDLHNNEANAADGVWLTPGEMERIVSVKPQQHAMQCDALEDEIRLLSEPFKVFEFDFWKRPDSHREANIKIQTTRDGYVHAIISWWVLQLDSAGSIFYSTAPRWARQSSSEGPQRDMKDWCDHWKQCVWFMQGKGIPATEDQVLSLRARHNQTSISYQLNINDEACDRSSKGDHLTLLPERIALYGDKDWRSALINTIKNALTVKSSPTCVVADDSMFLALLISSMSPTSKVIAMYPGLRDKGAAYLRSVADANNFSIDQIQVIGKRASSITADDLKHKKVNLLVGEPFYLGSEGMLPWQNLRFWFDLWRSRSSLKDVEGFDHSVVNETLGACGYLPGDQQGPCLPYYVWQCGYTKKLSKVYSLMDFNFSEPIHSCFGKTKIEFSHDGTCHGFAVWIDWVLDERKSVVLTTGPDNRYWKQGVQLFGKPVEVNPGKSVMHVEASFDPSTGEITFSSSSTTCS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..305#1084..1309#1975..2100#2195..2359#2436..2554#2628..2719#3183..3439#3827..4063#4203..4280#5639..5788#5863..5937#6326..6422#6511..6656#ATGCCTAGCTGCTGCTGCCTCCTCGGCCTCGGCTTCCCCTCGCCGCCCTCCGCCCTCCGCATCCTGCGCCGCCGCATGGCCTCTCGCGCCTTCCAGCTCCGCCTCAACCCGCTCACCGGCGACTCCGAATGGCTCGTCGTTGAGGAGGAGGAGGAGGAGGACCACCACCCGACACCGCCACCCAAGCAGCTTCTCGCCACCACCTCCTACCTCGACATGCTCAACGACTCCGCCCGGAACCGCGCATACCGCCGCGCCATCGAAGCCGCCGTCACCGACCCTTCCTCGCGCGTCCTCGACATTGGGTCAGCTAACCCAACCCAATTCAAATACCTCCTCAATTTTGGTTTATGCTCTAAATACCTGAATTTTTCTTTTTAAGCCAGTCCGGCCCAAGTAGGCTAACCAATTTCATTAACATTGGGGAAACAGTACAAGTTACAAACTCATTTACACCAACAGCAGGCACTTCCAGCATCTAAATTTTTTCTTTCTAAAACACTCAGGTTCCTTCCAAATGGACATCATCTCTTTGATGTCTACATACCTCAAATTGTAGGCCATAATTCAACTGCCTGTCGAATTTAGGTTCACTTACTAGCATTACTGGATTATTAGCTAATGTGATCTCATCTCATCTCATGACTCATGGATACTGCATAGGGCACCGATATCATGCTCACTGTTATCTTTAATAGCACCATAAAGCTAAGCATCCAAACTCATGTTAGGTGTTAATTCTCGGGGAAAATATTGCTTTACAGGGTTATAGTTGGGGCTTTTTGTGAAGTTTTTAGATTAGGATTCAGTGAATATCAAGCCATCAGGTTGCATTGGATTGGATAAATATAAACAGATAGTGGGCTCTCTTTTCTAAATTATCTTTTATCAATCATTGAATATAAGTTTTGACCAAGTTATCTATCTCTGGCTATAGGTTTCCTAAGGCTATATTACAAAGCAAATATTACTTTCAGCCTTTTATGTGCAAGTGTCTCATTGCCTTGCTTAAGTTGTCCTGGTTACTGCATGATTATTTCTAGCAAAAGGTGGAATGGATGCTTATGTCTTTAATGATTTCAGAGCTGGGACTGGGTTGCTATCCATGATGGCCGCCCGAGCTTTGGCAGCTGTTGGGGGTGAAACTAGAGGAGGAAGTGTTTCAGCATGTGAATCTTACCTCCCAATGGGAAAATTGATGCGAAGGGTACTGAGAGCCAATGGGATGGAAAACAGGGTCAAAGTCTTTCACAAGCGTTCGGATGAGCTCAAAGTCGGAGATGACCTGGATTCACCAGCTGATATATTGGTATGCTCTTGTTTTAGGCCAGCACTATTGACCATAAGATGCTGCTCATATATATAGCAAATTTGGCAGGGGAAAAATGATCATTTTCCAATCTAAAGAGTAGCACTTGATCATTTGCTACCCCTTGTCTCTCAGACATGTTGCCTCAGGACCCATGGTCAGAGTCTACACATTGTGTGGGAAATGATTGATTTTGCCACCCCAAATGTTCAGTCCCCCATTATATTCTGAATTAAAATTGCTAATCTCATCTATACTTGATTATCCAACCAAAAGTTTCCCAAAAGAAAACCATTCTACTGATCTCACTTATTGTCAATGTGATAGACTATCTGTATCAGGCAAACTGCTGTAGATGTATTGATTGTTTTGTTTTTTTTTCTTGAATACGCAAGAGAGTTGCGTATCATTTCACTAAGAAGAAGAGAAAAACAGGAGAATTGGGAGGGGAGCCCCTCCCCTCACCAAGACCCCACAGGCCAAGACCTTTACAAACAGGGGATTGTTTTGTTATTTTGACTACTGCCATTCAGAGGCACGGCCAACTCAATATTGCTTACTTTCCCTTCTATTTGTGTTTTAGGATATAAGAGGGTTTAACACTTTTCTTGCTATTGTGTATTATGTGTAACTAATACTCGTGCTAACAAAGACATGTTCTGCAGGTAAGTGAAATTCTTGATTCTGAGCTGTTGGGCGAGGGTCTGATACCTACTTTACAGCAAGCATATGACATGTTATTGGCAAAAAATCCAAAGATAGTTCCTTATCGAGCCACTACATATGGGCAGGTCAGTTCCCAGTGCCTTCTAATATGCGTTTGTCCCAATTTTAACAATGTGAGATAAATTTATACTGAATTTGTTGATTTCCTTGATGTCCTAGCTAGTTGAAAGTACATTCTTGTGGAAGCTACATGATTTGCACAACAATGAAGCAAATGCTGCAGACGGTGTATGGCTGACTCCTGGTGAGATGGAGAGGATTGTGTCTGTGAAGCCACAACAACATGCAATGCAATGTGATGCACTAGAAGATGAGATACGATTGGTATGGACTTTAGTTTTGCAAAATCTGGTAGAAAAGTACTGTCCCAACTCCCAAGTCCTAATTTGTCTTAATGTAGCTGTCAGAACCCTTCAAAGTTTTTGAATTTGACTTTTGGAAACGGCCAGATAGTCATCGTGAGGCCAATATCAAGATACAAACAACACGAGATGGATATGTTCATGCTATTATTTCATGGTAGTGCAGCCTCTTGAAGAATCTCTAGTCTTCTGAAATTTCTCTGAATAAATGCATTTATCTGTGACTGCAGGTGGGTACTTCAATTGGATTCTGCTGGGTCAATCTTCTACTCAACTGCTCCTAGATGGGCGAGACAATCAAGTAGTGAGGGGCCGCAACGCGGTTGGTTAAATAATTAGAATTTTGTCCACCTTTTTTTGCATTTAGTCAGTACCTTTTCCTATATTTATGTGATCATAGAGTTGTGCACAACATGTAGAACAGTTGATATGTGCATGCCAATTCCTGATAAGTAGAACAGTCATTCTAGAGTCTGACTTCTACCAAGCCATAGAAAACTATTTATTAGGTCACATGCATATGTGTATACGATCATATGCTTCACAAAAGATCATCCAAGGCAGACACATATGCATACACAGATCCATTCATAGAAGATCATCACAATGAAAAACCATAATCGCTACTAACTTGAATATTTACTGTAGTCGCTAATAAAGATTTGAAACCACTCAGTCAGACTAGCATGCTATTGATGTGGGCCTTTTAGGACTAGCATTACTTCTGAAATACTGAAACTACTTGAAACTATAGAATTTATTCATATTGCTTTCTGCTTTTATAGACATGAAGGATTGGTGTGATCACTGGAAGCAGTGTGTATGGTTCATGCAAGGCAAGGGGATCCCTGCTACGGAAGACCAAGTTCTTTCGTTACGAGCTAGACATAACCAAACCAGCATCTCCTATCAGCTGAACATCAATGATGAAGCATGTGATAGAAGTTCCAAAGGTGACCATCTAACGTTGTTGCCAGAACGGATTGCACTTTATGGTGATAAAGATTGGAGATCAGCTCTGATAAATACCATTAAAAATGCTGTGAGTTTCCCCAATTCATTTGCCTATAAATATTATGATATTTAAGCTATAACTTCTCTGTGGCCTTCCACTTTGCACTACTGGGAAGGAACCACTTATGTTGGTTATGTGTAACTTCCGTAGAATCCAAACGTCTGTTACTTTTGGGAAGGAGGGAGGGAATTCTATGCTTGCCTACTGACATTCAAGTTTCTAATTGATAACCTCTGTTGGCCCCCTTCATGCATATATGAAGCATATTGTTCGACGTTATCAGCAGCTCTGAGATGATTTTGCTTCTGTTCTTAAAATTGATCACTTTTTTTAGTGGGAATACACGATTAATTCTATATTTTTATGCTATGTATAACAACTTGAGCTTATTGATGTTTAATTTTGCCTTGCCAGTTAACTGTGAAATCTTCCCCAACTTGTGTTGTGGCTGACGACAGCATGTTCTTGGCTCTCTTAATTTCCTCCATGTCACCCACTTCAAAAGTCATCGCGATGTACCCTGGTCTACGGGACAAGGGTGCAGCCTATCTTCGATCTGTTGCAGATGCAAATAATTTTTCCATAGACCAGATTCAAGTGATTGGTAAAAGAGCCTCATCTATTACAGCTGATGACCTGAAACATAAAAAGGTAAATGCTGTAAATGCCATTAGTGGGTGATTTTGAATATTCGTCGATTCCCTCATTCTTGTTTAAATTCAGAGTTTCATATGCTGCCGTGTTATATGAATGCATCTTGATATTATTAATTATCTGTTCATCTCCATAGGTTAATTTATTAGTGGGGGAGCCATTTTATCTTGGAAGTGAAGGAATGCTTCCGTGGCAAAATCTACGTTTCTGGTTCGTAAGATACCAACTCACATTACCAATTGCCCCTTTAAAATAAGGCTTTCTACTCCCTAATGTCACAATCTTTGTTCATTATCTTGGGAAATGTTGTGCCACACAGTCTGTCCTTTTAAGAAACTGGGTGTGTATTCTGCATTGTTCCGTTCTCTGGTCCTTGTGAGAAATGGTTGTAATTTATCTTTTAAGGGGGTACACATGATGATTTCTGGTTAGCTGCATTGTTAAATTAGCGCTTTCTTATTCTCTTGCATGGTGAGCTTCGACATGTTTTGAAACGAAGGAAATACAGTTAGTTACTTATCAATATGTTGATTAATTTGCACTTTAAATCATTCACTGTGTAAAAAACTTGATTCTTTAGAGTTGTCCTTTTGTTTTTGGCATATTTCTGTACAAGGGGAAAACTACCCCCAGTTTGATAAGATGAAGCCATTGCTGATTGATGTTAGAGATTTCTACACTCTGCTAGTGCATGCTGCTTTTCAAAGATTTCCTAACAATGAAGCCAATAATTTTCGATATTGTATGGTACTCCGTAGCCTGCAGTATGTCCATCACAGAT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