BGIOSGA023128
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA023128 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:J023136C13, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA023128, complete gene. |
| LocusTag |
' |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA023128-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA023128-PA |
| Length |
5635 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:23053099..23058733 |
| Sequence Coding Region |
23053099..23053351,23054297..23054411,23056379..23056487,23056591..23056668,23057765..23057956 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:23053099..23058733 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:23053099..23058733 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCCGTCGCACGCGGATCTGGACCGGCAGATCTCGCAGCTGCGGGAGTGCAAGTTCCTGGGGGAGGCGGAGGTGAGGGCGCTGTGCGAGCAGGCGAAGGCGATCCTCATGGAGGAGTGGAACGTGCAGCCGGTGCGGTGCCCCGTCACCGTCTGCGGCGACATCCACGGCCAGTTCTACGACCTCATCGAGCTCTTCCGCATCGGCGGGGACTCCCCCGACACCAACTACCTCTTCATGGGTGACTACGTCGACCGTGGTTACTATTCAGTGGAGACTGTTACATTACTAGTGGCTCTTAAAGTCCGTTATAGAGACAGAATCACAATATTGAGAGGAAATCACGAGAGCAGACAAATCACCCAAGTGTATGGCTTCTATGACGAATGCTTACGGAAGTATGGAAATGCAAATGTTTGGAAGTACTTCACGGACTTGTTTGATTATTTGCCTCTCACAGCTCTTGTAGAAAACCAGGTCTTTTGCCTCCATGGCGGTCTCTCGCCGTCATTGGATACATTGGATAACATTCGTGCCCTCGATCGCATACAGGAGGTCCCTCATGAAGGGCCCATGTGTGATCTTTTGTGGTCTGACCCGGACGATCGATGTGGGTGGGGAATTTCTCCAAGAGGGGCAGGATACACGTTTGGGCAAGATATTGCACAACAATTCAACCATACTAATGGCCTTACCCTTATTTCAAGGGCCCATCAACTTGTGATGGAAGGCTTCAATTGGTGCCAGGACAAGAACGTTGTCACGGTGTTCAGCGCCCCAAACTACTGTTACCGCTGTGGTAACATGGCAGCAATTCTAGAAATCGGGGAGAACATGGATCAGAACTTCCTACAGTTCGATCCAGCCCCACGACAAATAGAGCCGGACACAACGCGCAAGACCCCCGACTACTTTTTGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPSHADLDRQISQLRECKFLGEAEVRALCEQAKAILMEEWNVQPVRCPVTVCGDIHGQFYDLIELFRIGGDSPDTNYLFMGDYVDRGYYSVETVTLLVALKVRYRDRITILRGNHESRQITQVYGFYDECLRKYGNANVWKYFTDLFDYLPLTALVENQVFCLHGGLSPSLDTLDNIRALDRIQEVPHEGPMCDLLWSDPDDRCGWGISPRGAGYTFGQDIAQQFNHTNGLTLISRAHQLVMEGFNWCQDKNVVTVFSAPNYCYRCGNMAAILEIGENMDQNFLQFDPAPRQIEPDTTRKTPDYFL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..253#1199..1313#3281..3389#3493..3570#4667..4858#5462..5635#ATGCCGTCGCACGCGGATCTGGACCGGCAGATCTCGCAGCTGCGGGAGTGCAAGTTCCTGGGGGAGGCGGAGGTGAGGGCGCTGTGCGAGCAGGCGAAGGCGATCCTCATGGAGGAGTGGAACGTGCAGCCGGTGCGGTGCCCCGTCACCGTCTGCGGCGACATCCACGGCCAGTTCTACGACCTCATCGAGCTCTTCCGCATCGGCGGGGACTCCCCCGACACCAACTACCTCTTCATGGGTGACTACGTCGGTAAGTTTCTAGCTCGCTACCCCTCTCTCTCTCTCTTCTCCTCCGGCCTCGGACGCGTGTGTTCCCCTTTTGGGCCGATCTGCGGGTTTGGTGTGGTGGTTCGACCAATCGATCTGGTATAAATGGGGCGTGTGAGGTAGGGGATGAATTCGTTAGATCCTGATGCAGTGTTGAGGTGCTGAGGTGTTCGGATTTGGGAGCTTTGAGGCAGTGCTTTGGTCTGATTAATGTGCTGAATTGATGATCATGTTCTTGTTATGTTGTCCCATGGATCGCTAGAATTTTGATGCTAGCCTTTCTTATGTTGTTCGTCTGGATTAGGTATATTAATCAAGTAGAAATTTATGTGAGTATTTATTGCTATTGGACATATTAGGCATGTTGGATTTTTTTTTCTTGATGGGATGAACGTCCTTGGGCTTTGGAGTGTTTATTCCTTGGATTATATGGAGTCTTACTGTCTTAGGGAACTGATGAGATGTCTGTTAGCCAAGGTTTTGGTTTGCTTCATTTTAAATGTTTCAAGGTTGCATGGAAACGGAGAGCTTGCATGTACTTTTAACATAAATGGCATGTATAGCTTGTTGCCACCGGTACACTAACATACAAGGATCTTGTCGCTTGGTTCCGCTACACTGCTGCCGTGTTGGTTTTGGTAATCGTACATGTCAAGCATTCTTAAACTTGAGGTCATCATGACTATGGTTGTCTATGTGTATTCATTGCATGCTCATGATGTGTATTGATCTGAAATCTGTATGCAATACAACATGTCGGACAAACAGGGCACCATTCAGTTAAGGATTAGACAATTTGTACGGAATGCCTTTTCAGATAAGCAGTTGAATGATATGCCTTTTTTCTATCACAATTACTTTTTCCTGTATTGTGTTTATTTGTTTCTTCTATTTGTAGTTGAATTGATTTTGTTGTCGCTTGCTGCAGACCGTGGTTACTATTCAGTGGAGACTGTTACATTACTAGTGGCTCTTAAAGTCCGTTATAGAGACAGAATCACAATATTGAGAGGAAATCACGAGAGCAGACAAATCACCCAAGTGTGAGTTTCTATTCCTCTGATATGAAAAAAACTCTGAACTGTCTTCAATAGTTGCCAATTGCCAATTTTCAGCACAGTATCTCTATATTGCAATTTTTTGCAAAACATATATGACCATGCTGCAAATCTTACCAAATGATTATGCTTGAAATTGATCTTTTCTGCCTCCTTAGACAAAGAATATATTTTTGTTGGGCATGAATTAGAGTGACAGTTTATTTTTCTGTTGGAAGATCACGATTACATTGTCTCGATATCTTTTGGTTTGTGCGCTTTTTTATTTGCAATACTAGTTAACATGCAAGAAAAACATTGTGACCTTAGTAGCTTTAACTTCCTTGATTAGTTGTATTCAAAAGCTTGTCTTATATAAATACATTGTTTTGATATTGAGCATAGCAATATCCTTGCAAAGGTGAACTAGCATATTAGTTGAACTAGATTCTGTGGCCACATAATATCTGTAAGATGCAAATTCTGGCACAGGCATTATAATATTTGGTTATTCAATTGTTTCCTTGGTACCCCATGGCCTATCCCCTGGGTATTTTGTTAGTCAACTTGTTCGATTTTAGAATCAGGAGGATTGCATCCTGTTTCTAGTTTTCATAGATGATACTCCACTTCCATATGGTTGAATACCCTCTAATAGGGGTAACATAATGGCTGTATGGTGTCATGCCAAACGTCAGAAATCCTATAAGCTGAATAAGGAATCTGTCTCTTGTCTTGGTATGGAAATTCATGCCATGTAATTCAACACTCTATTCTCAGTCTACATCTTATTAGATATGGAATTGTGGATTGAGTTAAAATAGTAATCTGGAGTTGATTATAAAGAGGAATTCAAACATTGATGAATTGTTAAAATTATGCAGTGGCAGAGTCACGGATCGCCTATTTTAGTGGTTATGTGTGCAGATGACTATGAAAACGTTATACTTTGTAGGAGCCTGACAACCCTCAACAGCAAAAACTTTTAGAAAGACTTACAAAGTTAAAATAATTTCTTGCAACGTAACACCCGTAAAAAACAACCTGGTTGCTTATTATGCAGGCAGTCTATTTAAACAACGATTTGCATTTCAACAGATATATCAATGACAATAAACAATCATTTAAGAAACAAATTCCTTGTTCTTAAAAGGCATGGAAAGTAATCACCAATTGCTGGCTTATTTGGTTGACTCGGGCTCCAGGCTACGACACCAACTGAACTCTGAATATTCCATTTCATGGAGAAAACAACAAAAGGTGATTTGTTATCTGAACTGGTGATCCAAAATGGCCAAAGGCATCCCTGCTAACCACTCTTGATTAAGAGGTCATGGAACAAAACACATTTATTTTTCTTGGACTCAGCACGGTATCTGGTACTGTAGTTTTTAGCTAGCATGATATCATAAGAATTAGATCATGTAATGTTGATGTCGCTTTATAAATCATAAAGTTTGGTAAATTACATGACTTTTTTTGGTTAGAAACCTAAAGAAAGAAATAATGCAAATTAGCAATAAAGATCATCAATTTATATTTTGAAATAATTAGCTGCGTAAGTATGTTTTGGGACTTTGTAAGTTGGGTTATGCGTTGCATGAGATTTGAGTTGCAGAGTTATTTAGAAATAATTTACAAGGGCTCCCAGCTTCTGACTCCCTAATCTGATCTAACAACCCCATATAGAAGTTTAGGTATTGGCAGCCAATGATCTACTGGAGGTTTAAGCCAAATTCCTAGAATATGATGAATAGATCTCAACTTTATGCTGACTTGCTGCCATGAACTTTCTTAAAGTAAAAAAGTTATGATTGCTCTGGGTCTGAAGATTGATGTAGCAAGAATCCTACTTTATAATGTTCTTGTCATGACATGAACTTTTGCCAATTTCTTCTGCTGCATTCTACTTTGTAAAATGCAAGCACACCCACTGTGCTAGGGTGTTCTTGACATGCAGTGTTTGGATACAGGTATGGCTTCTATGACGAATGCTTACGGAAGTATGGAAATGCAAATGTTTGGAAGTACTTCACGGACTTGTTTGATTATTTGCCTCTCACAGCTCTTGTAGAAAACCAGGTTAGCTCTTTTTGCCAAATGTTTGTTCTATTAATATGGACATTGAACTCAGCTTGTCCATGTATATGGCATACCTGACAAGAGGAAAAATTTCATTTTGTAGGTCTTTTGCCTCCATGGCGGTCTCTCGCCGTCATTGGATACATTGGATAACATTCGTGCCCTCGATCGCATACAGGAGGTATGCAACACTTCACCCATACCTTTGAGCTAGTGATCTAATTATGCATCATTTTGCACCATCGTCTTTACTTGCCATGTCTCCATAGTCCATAGGCACCCTCCTTTTGAACTGGAGGTAATGCTCATTCATGATAGCTTGAGAACAGGTCCAGGAGTGTTAAATAATTGAACCTATATTAGAGGATAGCATATACCATTCTTTGCCATTGGATGATTCGGTGTGCTCTAATAATTTATCTGCATCGTTTCACGTGCATGGCTCGAATGGCATTCTTCTCATATATGTTGATCTCACACAATAACTTTATATTAATATACATAAAATGTTCTGGGTGAGGATCAAATGATATACAAAGGTTGATATACCCCCTCCAGGTTGATAATACTTGTAGTTTTGGACGAGTACATGGTCTCGAAAAAACAACTTTGACCACTATTTTCTATTATAATATATATAGAAATATCAACAAATATATGATTCTATTGAAGTACTTTTTAAGACTAATCTATACATATGGTCTGCATATTTCTGAGACAGATATTTTGGAAATTATTCATAGTCAGATTTTAAAGTTTGACATCAGCCTTGTCTAGAACGACAACTATTATCAACCTGGAGGGAGTAATAGGTTCCAGTTACGCGATTTTCTGATGTACCATAGTGTGTTCTTTTTTACAAGATGCAATGGGATATGGGAGAAGAGCTCAGAAATTAAACAAACTAAAAGATCAATATTCCTGTACAATTTGCTTAAGTAGTTACAGATATTTCTTACTTTATTGTTGGCCAAGCATTTGGTAAGACTAAACAGGACCTCACTCGCCATGACCATTCACAAATAATATTATGCTTGCTGGTTTAGTGTTAGTACCTGCTATGCCTATATATCAAATTTGTTGGTTCGTGCCATTGTTCGTACATAGCTTAAAACTAGTAACTAAAGGTGGCCCTCATTGAGCAATTGTGCGTAATAGTGACCGTCTTTGTGTAGAACATATGTGCTGTATTTGCACACTTTTTTGTCTTGATAATTTATAGTTTATGGAAATCATATGTTTTGACTTATGCACCCTGTTCTCTTTAATGGTTATAGGTCCCTCATGAAGGGCCCATGTGTGATCTTTTGTGGTCTGACCCGGACGATCGATGTGGGTGGGGAATTTCTCCAAGAGGGGCAGGATACACGTTTGGGCAAGATATTGCACAACAATTCAACCATACTAATGGCCTTACCCTTATTTCAAGGGCCCATCAACTTGTGATGGAAGGCTTCAATTGGTGCCAGGTTGGTATAAAATGTTCCATTTGCTTGTTTTCATTCGTCCCACTCTGAGAGCCCTGTTCACATAATTATTATTGGTCTTACTATGTTAGGCTAATCCATTTTGGTATTCATAATAATTTCTGGTGCTTTAGCTAAGTTATAGACTCATAGTTGCATGCTGATGCTGATTGCTGAATCTAGTAATCATTATGATGTTATGGTACCTGAACTTCGCATTATATAAGTTTTAGTAGCTTGTTCAACCCTTCAGTGATCTGTTAAACAATGACAACCCCTTCGGCCCTTCCCCCACATAGTTTATGCTGTATAGTGATTGCTGATTATTATCTAGGAGGCATAACATATTTACAATCTATGGCGGACATAAAGAATGCAACGCTTGATACAGTTCTATAAGATGAGCAGAACTTTTCTTGGTTTGGATGTATGGTATGTGGTTTGTTGTTGATCCTAGTATTATTACTATATGTTTGGTTTTCATGTATCATCACATAGGAGCATGTACATAGAACCTTACCTTACCATCAGTGACCTGCACTTGAGCACCAAATTGGAAAATTCTAACAAAAAGCTTGATACTTAATGACAATGATTGTTATGCAGGACAAGAACGTTGTCACGGTGTTCAGCGCCCCAAACTACTGTTACCGCTGTGGTAACATGGCAGCAATTCTAGAAATCGGGGAGAACATGGATCAGAACTTCCTACAGTTCGATCCAGCCCCACGACAAATAGAGCCGGACACAACGCGCAAGACCCCCGACTACTTTTTGTAA</dnaseqindica> 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