BGIOSGA018959

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Structured Information

Gene Name	BGIOSGA018959
Description	Pxa 1 putative
Definition	Oryza sativa Indica Group BGIOSGA018959, complete gene.
LocusTag	OS05G0107600
Ensembl Transcript ID	BGIOSGA018959-TA
Ensembl Protein ID	BGIOSGA018959-PA
Length	10806
Source	Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome	Chromosome 5
Location	Chromosome 5:400373..411178
Sequence Coding Region	411117..411178,410714..410996),complement(410219..410443,408967..409164),complement(408322..408776 ,407194..407332),complement(407041..407119,406008..406246),complement(405595..405899 ,405406..405511),complement(405147..405311,404562..404661),complement(404368..404476 ,404010..404100),complement(403585..403709,403325..403474),complement(403157..403229 ,402300..402480),complement(402048..402206,401522..401662),complement(401220..401426 ,400955..401109),complement(400808..400860,400639..400717),complement(400373..400459
Genome Context	<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:400373..411178 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>
Gene Structure	<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:400373..411178 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>
Coding Sequence	<cdnaseq>ATGCCATCCCTGCAGCTGCTGCAGTTGACGGAGCGTGGCCGGGGACTCTTGGCCTCAAGGAGGAAAACTCTTGCGGTTGTTTCTGGCGCGCTGCTTGCCGGAGGAGCTTTGGCGTATGCACGCTCAAGCCAAGGCCAACGGAGAAGGCGTTCAGAGGGTGACGATGCCACCACTGCATTGGCCAGGAATGGGGACAGGATGGGCCAAAATGGTGTGGATGGTAGATTGGCCGGAACAAAGCGAAGAAAAGGTGGCCTCAGATCTCTTCATTTCCTTGCTGCCATCCTACTGAAGAAGATTGGACCAAATGGCACCCGCTACCTTCTTGGCTTGACGTTAACTGCGGTGTTACGTACTGCTGTGGGACATAGATTAGCAAGAGTCCAAGGCTATTTGTTTAGGGCAGCATTTCTTCGGCGTGTTCCAACCTTTACACGCCTAATCATCGAAAACCTAATCTTATGCTTTCTTCAATCCGCCGTATACCAGACCTCAAAATACTTAACAGGGTCTTTGAGTCTGCGCTTCAAGAAAATTTTGACAGATCTTGTCCATGCTGATTATTTTCAGAATATGGTTTACTACAAAATTTCACATGTGGATCATCGAATATCAAACCCAGAGCAAAGGATTGCTAGTGATATTCCAAAGTTCTGTTCTGAACTAAGTGAACTTGTACAGGATGATCTAGCTGCAGTTGCAGAAGGATTAATATACACCTGGCGTCTCTGTTCTTATGCAAGTCCAAAATACATGCTCTGGATTGTGGGATATATACTAGTTGCGGGTGGAGCAATTAGAAATTTCTCCCCTGCTTTCGGAAAGCTGAAATCCACAGAACAGCAACTCGAAGGAGATTATCGTCAGCTTCATTCACGATTAAGAACTCATGCTGAGAGTGTGGCATTTTATGGTGGTGAGAACAGAGAAGCATATTATATCATGCAGCGTTTCCAGGCTCTTATTGGGCACCTGAATCGTGTACTCCATGAAAACTGGTGGTTCGGCATGATTCAAGATTTCTTTCTGAAGTATTTTGGTGCAACTGTAGCAGTTGTCCTCATTATTGAACCTTTCTTCTCTGGCCACCTCAGACCTGATTCATCCACACTTGGAAGGGCTGAAATGTTAAGTAATCTTCGATACCACACAAGCGTAATCATATCACTGTTTCAGTCTCTTGGGATCCTATCTATAAGCACAAGACGTTTAAATATTCTAAGTGGCTATGCAGACCGCATTCGTGAGTTACTGGATGTTTCACGTGAACTGTCTGGGGTTCGTGATAAATCGTTAAATCATAATTCCTCTGCTGGAAATTATATCAGTGAAGCAAACCATATCGAATTCTCGGGTGTTAAGGTGGTGACGCCTGCTAGCAATGTCTTGGTTGATGATTTAACTCTCCGAGTAGAAAGGGGTTCTAATCTTTTGATCACTGGTCCGAATGGTAGCGGAAAAAGTTCTCTTTTTCGGGTCCTTGGAGGCTTATGGCCATTAGTTTCTGGTCATATTGTCAAACCGGGTGTTGGCTCTGATCTTAATAAGGAAATTTTCTATGTCCCGCAAAGACCATACACAGCTGTTGGTACACTTCGTGAACAGCTAATTTATCCTCTTACAGCAGATCAGGAGATTGAACCCCTTAGCTACGATGGCATGGTGGACCTTCTAAAGAATGTTGACTTGGAATACTTGCTAGAACGCTATCCTCTTGATAAGGAAGTTAACTGGGGTGATGAATTGTCCCTTGGTGAGCAACAAAGATTAGGAATGGCAAGGTTATTCTACCATAAACCAAAGTTCGCCATCCTTGATGAGTGTACTAGCGCTGTGACAATTGATATGGAAGAACGCTTTTGCAAAAAGGTTCGAGCAATGGGAACATCATGCATAACGATATCTCATCGCCCAGCTTTAGTTGCGTTTCATGACATTGTTTTGTCTTTGGATGGTGAAGGAGGGTGGGATGTCCAGCACAGAAGGGATGACTCATCCTTTTCTACTGAAGAGTCTGACTATACATTATTGGAAACTGATCGTAAATCTGATGCGCTTACTGTTCAAAGGGCATTTATGGGCAGGGCAAAGAGCAATGCTTCATCAAGGTCCAAAGAACATTGCTACACTACAAAGGTTATAGCAACTTCTCCCAAGTTGGAAATAGAACAAACAATACAAACACATAGAGTCCCGCATTTACGGTGCTTCCCAAGGCCTCTGCCTGCCAGAGTAGCTGCAATGGTCAAAATATTGGTTCCTAAGCTACTTGACAAACAAGGAGGGCAGTTGCTTGCTGTTGCACTACTTGTTTTCTCTCGAACTTGGATCTCAGACCGAATTGCTTCACTGAATGGGACAACTGTTAAGTTTGTCTTGGAGCAGGACAAAGCTGCATTTATTCGTCTGATTGGTATCAGTGTCCTGCAAAGTTCTGCAAATTCTTTTGTGGCCCCATCTTTGAGAACCCTTACTGGAAGACTTGCCCTTGGATGGCGGATTCGCCTGACCAATCATCTGCTTCAATATTATTTGAAAAGAAATGCATTCTACAAGGTATTCAACATGTCAGGTAAAAGTATTGATGCAGACCAAAGATTAACACTTGATGTGGATAAATTGACCACCGACCTTGCTGGCTTAGTTACTGGAATGGTAAAACCACTTGTCGACATTCTTTGGTTTACATGGAGAATGAAGCTTTTGTCTGGGCGAAGAGGAGTTGCTATATTGTATGCTTACATGCTGCTAGGTTTGGGCTTCCTGAGAGCTGTATCCCCAGACTTTGGTCATCTTGCTGGGCAAGAACAAGAGCTTGAAGGAACTTTCAGGTTCATGCACTCGAGACTGCGAACGCATGCTGAATCAATTGCTTTCTTTGGTGGTGGATCAAGAGAGAAAGCTATTGTTGAGGCTAAATTCATGAAATTGCTTGACCACTCAAAGATTCTGTTGAGAAAGCAGTGGCTTTATGGTATTGTTGATGATTTTGTAACAAAGCAACTCCCTCACAATGTAACATGGGGTCTTAGTTTGTTATATGCTCTAGAGCACAAGGGTGACAGAGCTTTGACTTCAACTCAAGGAGAGTTGGCACATGCTCTGCGGTTCTTGGCATCTGTTGTGTCACAAAGTTTCATAGCCTTTGGTGACATTCTTGACTTACACAAAAAGTTCCTTGAACTTTCTGGTGGGATTAACCGGATTTTTGAGCTTGAGGAGCTTCTTCGTGTATCTCAAAGGGATACTTTTGTGCCTTCCGATGCCACTAGTGCAGAAGAAACCATTTCATTTCACGAAGTGGATATTGTAACACCATCGCAGAAACTGTTGGCTAGCAAGCTGTCGTGCAATGTGGTACAAGGGAAAAGCCTTCTTCTGACTGGCCCCAACGGTAGTGGAAAGAGCTCTATTTTCAGAGTTCTGAGAGATTTATGGCCAGTGTGTTCCGGGAGAGTTACCAAACCTTCAGATGGGATGTTTCATGTTCCTCAGCGTCCATATACCAGCTTGGGTACTCTGAGAGATCAGATCATATACCCTCTCTCAAGGGAGGAAGCAGAGATGAAGATTTGTTCGTTATACAATGATGGTAACGGGTCTAGTGCTTCTAATCTGCTGGATGATCACCTGAAGACAATTCTAGTGAATGTTCGGTTGGTCTATCTTCTAGAAAGAGAAGGATGGGACTCAACTTCAAACTGGGAAGATGTTTTATCGTTGGGAGAACAGCAGAGGCTTGGGATGGCCCGTTTGTTTTTCCACCATCCTAAATTTGGTATTCTTGACGAATGCACGAATGCTACAAGCGTTGATGTTGAAGAGCATTTGTACAAGCTAGCAACTAGCATGGGCATCACTGTGATTACTTCCTCGCAAAGGCCAGCTTTGATCCCCTTCCATTCCTTGGAGCTGAAACTCATCGACGGAGAAGGAAACTGGGAGCTATGCGAGATCCACCAATGA</cdnaseq>
Protein Sequence	<aaseq>MPSLQLLQLTERGRGLLASRRKTLAVVSGALLAGGALAYARSSQGQRRRRSEGDDATTALARNGDRMGQNGVDGRLAGTKRRKGGLRSLHFLAAILLKKIGPNGTRYLLGLTLTAVLRTAVGHRLARVQGYLFRAAFLRRVPTFTRLIIENLILCFLQSAVYQTSKYLTGSLSLRFKKILTDLVHADYFQNMVYYKISHVDHRISNPEQRIASDIPKFCSELSELVQDDLAAVAEGLIYTWRLCSYASPKYMLWIVGYILVAGGAIRNFSPAFGKLKSTEQQLEGDYRQLHSRLRTHAESVAFYGGENREAYYIMQRFQALIGHLNRVLHENWWFGMIQDFFLKYFGATVAVVLIIEPFFSGHLRPDSSTLGRAEMLSNLRYHTSVIISLFQSLGILSISTRRLNILSGYADRIRELLDVSRELSGVRDKSLNHNSSAGNYISEANHIEFSGVKVVTPASNVLVDDLTLRVERGSNLLITGPNGSGKSSLFRVLGGLWPLVSGHIVKPGVGSDLNKEIFYVPQRPYTAVGTLREQLIYPLTADQEIEPLSYDGMVDLLKNVDLEYLLERYPLDKEVNWGDELSLGEQQRLGMARLFYHKPKFAILDECTSAVTIDMEERFCKKVRAMGTSCITISHRPALVAFHDIVLSLDGEGGWDVQHRRDDSSFSTEESDYTLLETDRKSDALTVQRAFMGRAKSNASSRSKEHCYTTKVIATSPKLEIEQTIQTHRVPHLRCFPRPLPARVAAMVKILVPKLLDKQGGQLLAVALLVFSRTWISDRIASLNGTTVKFVLEQDKAAFIRLIGISVLQSSANSFVAPSLRTLTGRLALGWRIRLTNHLLQYYLKRNAFYKVFNMSGKSIDADQRLTLDVDKLTTDLAGLVTGMVKPLVDILWFTWRMKLLSGRRGVAILYAYMLLGLGFLRAVSPDFGHLAGQEQELEGTFRFMHSRLRTHAESIAFFGGGSREKAIVEAKFMKLLDHSKILLRKQWLYGIVDDFVTKQLPHNVTWGLSLLYALEHKGDRALTSTQGELAHALRFLASVVSQSFIAFGDILDLHKKFLELSGGINRIFELEELLRVSQRDTFVPSDATSAEETISFHEVDIVTPSQKLLASKLSCNVVQGKSLLLTGPNGSGKSSIFRVLRDLWPVCSGRVTKPSDGMFHVPQRPYTSLGTLRDQIIYPLSREEAEMKICSLYNDGNGSSASNLLDDHLKTILVNVRLVYLLEREGWDSTSNWEDVLSLGEQQRLGMARLFFHHPKFGILDECTNATSVDVEEHLYKLATSMGITVITSSQRPALIPFHSLELKLIDGEGNWELCEIHQ</aaseq>
Gene Sequence	<dnaseqindica>1..62#183..465#736..960#2015..2212#2403..2857#3847..3985#4060..4138#4933..5171#5280..5584#5668..5773#5868..6032#6518..6617#6703..6811#7079..7169#7470..7594#7705..7854#7950..8022#8699..8879#8973..9131#9517..9657#9753..9959#10070..10224#10319..10371#10462..10540#10720..10806#ATGCCATCCCTGCAGCTGCTGCAGTTGACGGAGCGTGGCCGGGGACTCTTGGCCTCAAGGAGGTAACAAAAGTGCTTCGCCCAAAATACTTTCTTCTTCTTCTTCATCATCCTTTTGCTCCAACCTGGAATTTTATAAGAAGAACAAGGAAAAGAAACACATTCTTGTTTGTGTGGGAACAGGAAAACTCTTGCGGTTGTTTCTGGCGCGCTGCTTGCCGGAGGAGCTTTGGCGTATGCACGCTCAAGCCAAGGCCAACGGAGAAGGCGTTCAGAGGGTGACGATGCCACCACTGCATTGGCCAGGAATGGGGACAGGATGGGCCAAAATGGTGTGGATGGTAGATTGGCCGGAACAAAGCGAAGAAAAGGTGGCCTCAGATCTCTTCATTTCCTTGCTGCCATCCTACTGAAGAAGATTGGACCAAATGGCACCCGCTACCTTCTTGGCTTGACGTTAACTGCGGTAATTTCTGCCATTCTATGCTGCTGCTGCTGCACTCATTTCTCTATGTACATTCTTTTTTTTATAGAAAAAAAGAAGATCATGATAAGTTCGTATCAGTAGTTCCCACAAAATAATTTCAAGCATCGAACAATTTGTAGTGCATAGAGAAAACATTCTATGATATGTAATAGTACCTAACACTGGATTTTTCAAAAGCTATACATAACCTTATTAACTAAACAATAATATAAAATATTATTGTCAGCATTATAACAATTTCTTTTGCAGGTGTTACGTACTGCTGTGGGACATAGATTAGCAAGAGTCCAAGGCTATTTGTTTAGGGCAGCATTTCTTCGGCGTGTTCCAACCTTTACACGCCTAATCATCGAAAACCTAATCTTATGCTTTCTTCAATCCGCCGTATACCAGACCTCAAAATACTTAACAGGGTCTTTGAGTCTGCGCTTCAAGAAAATTTTGACAGATCTTGTCCATGCTGATTATTTTCAGGTACATTTTGGATCAATGTTGATTTTTTATTGGTTGAATTATTTGTTACTTCCCATTGCACACATACCTCACTTGCATTCATCCCCTGTAATATCCTAAGAGTACCTTCCTAGCTTCTGTCTATCAATGGAATTATTCCAGCTGGTATGCCTGGGAGGACTGTGTCGTACATTGTTATAATGGTTGAAGAACTAAACTAGTGACCACTGCAGCCAAGATAATAGCTGATAAAACCAGAGTTTTTCATGCAAAGCATAGCTTTGCTATAGAACATAAATTTAAAAAATATCCTAAAAGTGTAGTGAACTGGGGGTTCACCATGCTATATTTATGTGCCAACCCTTATTTATAAGAATGTGTAATTTCATTCAACAATTTCAATCATTCCGTAGTTGATAGCCAAGGGTGTATTATTAATACTCGGCGGATATCATCAACCGTGCTAATCTTGGTATGGAAGTAATGTACAAACATGATGCTCACAACTTCCTGATATGTCAAAAAGAGATGTCTTTTCCTCACTGAGAAATCCAAAGAACCGGAAAACTTTTAAATGATCCTGTTGAATTTGACTTCATATTTTAAAGTACTGACTCCTGAAACTGAAATTGTTGATTCATATGTTTCTCATACCCCATCGAGAAAATTGATTTTACCAGTTTCTGCCTGAGGTTATCTTCCCTGGATTGGTTAAGAAATAACTTTCTATTTGTTCTAGCTGGTTTCGGTATTGAATTATCATATTTCTCATTTGTCAGTGATTTTCCTATGCTATTGAATTTTGCAACAAATTATAGATATGTTACTAATTACATTGTCTTGTCATAATTAAGATTGCGAGGTTTCTTCATTTTTATATTTATGTAGTTCCAGATCAGATTAATTTATTTTTTTTTGTTAATTATTGTGGAATTACAGTTGACTAACTTGTGTGTGCATCTTTTAGGATAGAAATTAGCCCATCTTTTGATAATTTACTTAACACCTTCCATTATGATATACAACCTTAATAAGGTATATCACTGCTTCTTTTTTGCTGTATGGACAATTGCAGAATATGGTTTACTACAAAATTTCACATGTGGATCATCGAATATCAAACCCAGAGCAAAGGATTGCTAGTGATATTCCAAAGTTCTGTTCTGAACTAAGTGAACTTGTACAGGATGATCTAGCTGCAGTTGCAGAAGGATTAATATACACCTGGCGTCTCTGTTCTTATGCAAGTCCAAAATACATGCTCTGGATTGTGGTAATTTTCTAATTGAAAAGCTTGATTGCCATTTCATCTAGTAATGATACCCTTTAACAATTAGGATTAGTGATCAAATTATGCTACATTCCTCTTCTTTTCACTGATTCTGTAATGTAGATGGCCACTGCTTTCTCACCTTGTTATCTTATTAGAATATTAGATATTATTAAAAATAAATGCTTTTCAGGGATATATACTAGTTGCGGGTGGAGCAATTAGAAATTTCTCCCCTGCTTTCGGAAAGCTGAAATCCACAGAACAGCAACTCGAAGGAGATTATCGTCAGCTTCATTCACGATTAAGAACTCATGCTGAGAGTGTGGCATTTTATGGTGGTGAGAACAGAGAAGCATATTATATCATGCAGCGTTTCCAGGCTCTTATTGGGCACCTGAATCGTGTACTCCATGAAAACTGGTGGTTCGGCATGATTCAAGATTTCTTTCTGAAGTATTTTGGTGCAACTGTAGCAGTTGTCCTCATTATTGAACCTTTCTTCTCTGGCCACCTCAGACCTGATTCATCCACACTTGGAAGGGCTGAAATGTTAAGTAATCTTCGATACCACACAAGCGTAATCATATCACTGTTTCAGTCTCTTGGGATCCTATCTATAAGCACAAGACGTTTAAATATTCTAAGGTAAAGGCATATCTTCTGCACACTACTGATAACATATAGGTCCAGTTTTGTCATTGCAGGCGGCATTTTGCATGCAGAAATTAGTGGGTGCTGTGTGCGGCCTACCAATCTAATTATCTGAATCTGTTTTAATGTTTTCTGTAAATGCATTTTATCAATTGGCAAGTCTTATGCTGCTAACTAAATACCTATTTGTTGCAATGATTTCAGATAAACATGTTAGTTCCAAACTTGATAATTTGCAACTGCACATCAATGCAGAAATAATGGGCTTGTTCACTTTGTTGCCAAAATCAACATTACCAAAATCTGGTAATGCCAAATTTTAGCATTGGATGTGTTTGGTTTGATGCCTTTTCAAATTTGGATGGTGTTTTTGTGAGAGGAAGCTTTCGGAACTACCAAATTTTGGTAGGATGACATTGGTAAGCGCATGTTTAGTTTGTTCCCCTACCAAAATTTGGTAACACCAAAATTTTGTAGGGTTGAAAGTGGCGATATAGACATAAAGTGAACAAGCCCAATCTTATTACAAGCTGCATGCACAAATGAACTAGTTGTCCAGTGAAGATTCTACCAACTAAAGAGATGGTGGTGGGATGACAGAGTCACCACCATGACTAGGTTCTTTAGGCAGGAGAGATTTTGTCACAAACCATAAAGATCATAAACCAGTCGCCATTTCTCATGAAGAGCATTTCACTTCTTGGTTGCTATTCCAAGTATAACTCATATATTTGTCTGTGTGTATTGTTTCGGTGGAATATAAGTATACATGTTTCCTGTTCCTAATATATTTTACATATCTTTGCCCTTTTTAATATTTCATTGTTCTGTTGAAATCACACAATTTATGACATTGTATGCTGTTCATGGGGCAAACTTAATGGTGACCTTTACCACCATGGGTTGCATTTGCTATCTTTGAATTACTCATTTTCTTCCAACATGATTGTGACGCAAATGAACTTCCACTATTTTTTTTTCAGTGGCTATGCAGACCGCATTCGTGAGTTACTGGATGTTTCACGTGAACTGTCTGGGGTTCGTGATAAATCGTTAAATCATAATTCCTCTGCTGGAAATTATATCAGTGAAGCAAACCATATCGAATTCTCGGGTGTTAAGGTAATAACTGCATAAACTGAAGGAGGGTCATAGTCGCTATCTACTTCCAAAGTTCTCATATCAGGTCCTTGCAGGTGGTGACGCCTGCTAGCAATGTCTTGGTTGATGATTTAACTCTCCGAGTAGAAAGGGGTTCTAATCTTTTGATCACTGGTAATCCTCCCCTATCAAATGAATTTGGTTTAGCAACTTTTAACTTTTGTGATGTAAGCTGCACTTAACATTAAATTGATTGAAATTTGACCTTCTAAACAGGAGAAGATTGGGAATATATGTACCAGTGCATCTGTGCATGTATATTTCCTTTATATTTTGTATATCATCCTAAATCATCTGCTGTTATTTGATTACGTGGTTATGAAATAGTATGTGTCATGAGATGGTAGTTGCTATATCCACGTCTACTCTAGCCTCTGTTGATACCACTATGCAATTGTGAACTGTTCCCATGATTGCCTGTGCCTTCCCTCCCAACACATCAAATATGTAAAGTGATTCTGTTATTATTTCCATTCTTACTTTGTATTTGTCTATTCTATTTTCAATTCACTATCTGTGCTCTTAGGGCATAAACAATAGTTTCAAAATCGTAGGTTCTACAGTAGTAATTGAAAAGTCCTGTTGATGTCAGAAATTTTCTAAAAGAAAACCAATAAAAAAATACTGGCCCAAGGTTAACTACAGCATCATATTGCAAGTTCTGTGATTACATTAACAA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