BGIOSGA019594

From RiceWiki
Revision as of 16:26, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

BGIOSGA019594

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA019594, complete gene.

LocusTag

OsI_19411

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA019594-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA019594-PA

Length

6562

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:15146409..15152970

Sequence Coding Region

15146409..15146530,15147913..15148045,15148105..15148144,15148526..15148749,15149725..15149967
,15150245..15150410,15150660..15150964,15151376..15151562,15151664..15151817
,15152539..15152601,15152689..15152785,15152881..15152970

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:15146409..15152970 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:15146409..15152970 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGACGGCAACTGAGCAGAGGCTAGCAACGGCGGCGGCGGCTCTCGACGACCGAGGTGCAGAGGCGGAGGTCGTGCGGTCGGCTGAATTCGGCGGGGGCGGCAAGGCTCGGCGAAGCTGGTGCATAATTCTTGAATCCATTTTAAGTGCAGCAATTCTGAGTACCAAAAAATCCATTCAAAATGGTATGCCTAATGGTTTATTATTCTTTGTAATATTAAGAAGGGACATTCTGACATTTGCTCTTTTGCTGGTGGTTCTTGCTGCTTCCATCATTTCAAAGTCCGGGAAAGCGCTTGTTTCAAGACAGTTTGTTGACATGTCTCGCATAAGGATTGAAGGATTACTTGCAGCTTTCCCCAAACTGGTTGGAACTGGGAAGCAGCACACTTATGTTGAGACTGAAAATGTTCGCTATGTTTATCAGCCAATAGAAGGCCTGTACTTGCTACTTATCACTAACAAGCAGAGCAATATTCTTGAAGATCTGGACACCTTGAGGCTGCTCTCTAAGCTTGTGCCTGAATATTCTCCCTCTCTTGATGAGGAGGGTGTTTGTAAAACAGCATTTGAGCTTATATTTGCCTTCGATGAGGCCATCTGTCTTGGAAATAAGGAAAACGTAACAGTCCAACAAGTCAAACAATATTGTGAGATGGAGAGCCATGAAGAGAAGGCGCACAAGCTGATGATGCAAAGCAAAATCAATGAAACAAGGGATGTGATGAAGAAGAAAGCCAGTGAGCTTGATAAGATGAAGATGGAAAGAGGAAAACTTGACAAAGGAGGATACTCGGCAATATCAGGTCCCAGGGTAGTTGAAAAAGCATTTGGTGACATGAGCATTACTGGTAGTGGATTTGGAAGTGGTTCTGGATTAGGTGGACTGAGCATGGATATGGACTCATTTGCTAGCAAGCCTAAAGGCCGTCCATCTGCAGCTGCTACTGCTCCTGGTAAAGGTCTTGGAATGAAATTAGGGAAAACACAGAAGACGAATCAGTTCCTGGAATCTTTGAAAGCTGAAGGAGAAGTCATTCTGGAGGATGTACAACCCAGTTCAGTTCAGTCAAGGGTGTCGCCTCTTCCACCAAGTGATCCTGTCACAGTGACAATTGAAGAAAAACTCAATGTTACAGTTAAAAGAGATGGAGGTGTTAATAATTTTGATGTGCAAGGAACCCTTGCTCTTCAGGTCCTTAATGATACTGATGGGTTTATCCAGTTGCAGATTGAAAACCAGGATGTACCTGGACTTAGCTTCAAAACACACCCCAATATCAACAAAGATTTGTTTAACAGTCAACAAGTTGTGGGGGCAAAAGATCCAAACAGGCCATTCCCAAGTGGTCAAAATGAAACTCCTCTGGTTAAGTGGAGAATTCATGGGATGGATGAGTCATCGTTACCTCTATCAGTCAACTGCTGGCCATCGGTATCTGGAAATGAAACTTATGTCAACATTGAATATGAGGCTGCTGAGATGTTTGACCTGCACAATGTTGTCATATCTATACCATTGCCTGCACTTCGGGAGGCTCCGAGTGTTAGACAGATTGATGGAGAGTGGAGGTATGATTCGAGAAACTCCGTGTTGGAATGGTCCATTCTTCTTATCGATCAGTCAAACCGCAGTGGCTCCATGGAATTTGTTGTCCCCCCAGCTGATCCATCAACATTTTTCCCCATATCAATTGGATTTTCCGCATCTAGTACATTCAGCGATTTGAAGGTTACTGGAATTCGTCCTCTAAAGGATGGTAACCCACCAAAGTATTCGCAGAGGGCTCGTTTGGTAACAGCCAATTATCAAGTGGTTTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MATATEQRLATAAAALDDRGAEAEVVRSAEFGGGGKARRSWCIILESILSAAILSTKKSIQNGMPNGLLFFVILRRDILTFALLLVVLAASIISKSGKALVSRQFVDMSRIRIEGLLAAFPKLVGTGKQHTYVETENVRYVYQPIEGLYLLLITNKQSNILEDLDTLRLLSKLVPEYSPSLDEEGVCKTAFELIFAFDEAICLGNKENVTVQQVKQYCEMESHEEKAHKLMMQSKINETRDVMKKKASELDKMKMERGKLDKGGYSAISGPRVVEKAFGDMSITGSGFGSGSGLGGLSMDMDSFASKPKGRPSAAATAPGKGLGMKLGKTQKTNQFLESLKAEGEVILEDVQPSSVQSRVSPLPPSDPVTVTIEEKLNVTVKRDGGVNNFDVQGTLALQVLNDTDGFIQLQIENQDVPGLSFKTHPNINKDLFNSQQVVGAKDPNRPFPSGQNETPLVKWRIHGMDESSLPLSVNCWPSVSGNETYVNIEYEAAEMFDLHNVVISIPLPALREAPSVRQIDGEWRYDSRNSVLEWSILLIDQSNRSGSMEFVVPPADPSTFFPISIGFSASSTFSDLKVTGIRPLKDGNPPKYSQRARLVTANYQVV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..122#1505..1637#1697..1736#2118..2341#3317..3559#3837..4002#4252..4556#4968..5154#5256..5409#6131..6193#6281..6377#6473..6562#ATGGCGACGGCAACTGAGCAGAGGCTAGCAACGGCGGCGGCGGCTCTCGACGACCGAGGTGCAGAGGCGGAGGTCGTGCGGTCGGCTGAATTCGGCGGGGGCGGCAAGGCTCGGCGAAGCTGGTAGCGGTGAGGAGTACACCAGCCGCCATGCCGACCGGTCGTTGCTGCGGGCCACCGTTTGGCGAGGCGTTTTGGTTGGCCAACTCTAGCCAGCCAGTGAGCAAGTTTGACCAACTGGATGGCTTGGCCATCCGGTTGGTCAGTCTGTTGGACCTCCTTTTTGTGCTTGAATGACGAAAATTTGGCTTGGAGAGGTTGATAGAGAGGCTGCATTCAGAAGCCTCTGTTCCTATCCCAGGCTGTGCGCACGGAAAACGAAGCGGTCCATTAGCGTGTGATTAATTAAATATTTTCTTTTTTTTTAAAAAAATGGACCAATATAATTTTTTTAAGCAACATTCATATAAAAACTTTTTTTAAAAATGTACAATTTAGCAGTTTAAAAAGCGTGCGTGTGGAAAAGGAGAGGAGAGAGTTGGGAGAACCTAGATACGGGCCTTGTTTGGATCCTCCGAGCTATTAAATAGCCCTCCGGAATCTTGCTATTTAGAAGTATTAAACGTAGATTACCGACAAAACCGATTCCATAACCCCTAGGCTATTTTGCGAGACGAATCTAATGATGTATATTAATCCATGATTAGCGGCTGATTACTGTAGCATCACTGTGGCAAATCATGGATTAACATACCTCGTTAGATTCGTCTTGCAAAATAGCCTAGCGGCTATGGAATAGGTTTTATCAGTAATCTACCTAAATAATAAAATTCCGGAGGGCTTAAATAGCCCTCCGGATCGAAACAGGCCACGAACGTAGAGCATCTAGTAACTGAGCGGTTTGCTATCGACACAGTACCTAATAACTGAGCTAGTTCCATTTTTTTTTTCAAGTACCGTTGACATATGGCCCACCAGTCATAGTAAATTTGAGATAAAAGGAGTCCTCGACTATCTTCTCCTTCCTTTCGCCTAAAGGAAAATCTCGCGTCTCGTCTCCCCTCCTTGCGCCATCTCGCGGCTGACAGGGTAGGGGCGCCGATCTCCATCTGGCGAGCAGAGCAGAGCAGGCGAGGGGAGGGGATCCTGGTGAGCATCCACATCCTCTTTCCGATTCATCTCTCTCTCTCTCCCCCCACCGGGAGTACTTTTGTCTGGAATTTTGCTTGCGTTGCGTTAACCCCAGCTTCTCTTGTAGATCTGGAAGAAGCTCTTCTCTTAATTTCAGAGCCTTAACCTTAGTAGAACTAACAGTTTGTTTGTTCTCCCAAAAGTTTGCCGGTTCAACTCAACCCCCATTTCCCAAGTTGGATCCGCCCCTGCTAGTAGTAAGATCTGGAAGCAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGTTGGATCTAGTTCGCAGGAGATCTCTGATTATGTTGCACTGATTGAATAACCTCTTCTTTTTTTTCCACTTCTGGCAGGTGCATAATTCTTGAATCCATTTTAAGTGCAGCAATTCTGAGTACCAAAAAATCCATTCAAAATGGTATGCCTAATGGTTTATTATTCTTTGTAATATTAAGAAGGGACATTCTGACATTTGCTCTTTTGCTGGTATAAGCAACTAGTTGATTCGTTTAGGAGAGCTTATTATTGTTTTTTGTGTACCGCAGGTGGTTCTTGCTGCTTCCATCATTTCAAAGTCCGGGAAAGGTTAGCTGGCTTGAAATATTCTGTTGTTAATATATTGTATTGCATTATTCTCAGTGAAAAAAAGAAGTCTTTTTAAATTTATATTCTTATGTTGTAATCAAAACAAATTCTTTTGTGCATAGAAAAAGAAAGAAACTGTTGTATTTGTATAAGTTTTTACCTGTCACCTGTGCTAATAAGATTGTTAGCTCATATGCAAATTTGTGGAACCCAAATACTAATCTAGCCGTTGTCGTGTTGCCTCAGTAGATTCTTAACTCCTATGACCCTAAAATCCTATGTAGTGAGCACCTCTTGGTTACCAATTTGCTGATGCTTCCTTCCAGAAAGCTAATGTGATTAGACTGAATGCTGTTTCTTCTCTGCGCTTTTCAACTGCAGCGCTTGTTTCAAGACAGTTTGTTGACATGTCTCGCATAAGGATTGAAGGATTACTTGCAGCTTTCCCCAAACTGGTTGGAACTGGGAAGCAGCACACTTATGTTGAGACTGAAAATGTTCGCTATGTTTATCAGCCAATAGAAGGCCTGTACTTGCTACTTATCACTAACAAGCAGAGCAATATTCTTGAAGATCTGGACACCTTGAGGCTGCTCTCTAAGCTTGTATCCTTTTTTCCCATATGTTCATTGTTCCAGTTTTTTGACCTAACTAACCTATACAATCCTATCCTATGAAACATATGAAACATGGTTTTTTAACCTACACATATATTGCTCTGTAGTGAATAAATGTATATCAGATAATGTTACCAACGTTTGTTTTGTGGGATAAAATGAAGATTATAATGTCTCGGTATAGTTGAGCTTGTCACTATATACCACCAAGGGGACAAAATATCAGATAATGCTATAATATGAAACATATAAAAAATTTTTCTTTTAACCTACCCATATATTGCAATGTACAGACTAAATATCAGATAATGCTATTAATGTTTGTTTTGTACGACAAAATGAAGATTATAATGTCTTTGTTTAGTTGAGCTTATCATTATATGTTACCAAGGAGACAAAAGAAAAGTAATTATTGTTTATCATAGTTGCTTGGGAAATTTGGAAACACTATAATGACTGTGTATTCAATTGAGCGAATCCAAACGTTATGTAGGCGTTGCGGGCAGTGTCAACAGAAGCTACGTTTTGGTGCCTGGCTGGAGCTCTTGTGCTCCAAGTTTTCCTTTGTAGGTCGTTATCTTAAGGGCACTAGGCTGTCGTAGGGTGGTTTTTTGGTCATGTGTCACCTTGTGTGATGCTATTTGTGGATGTGTTTTGGATGAAGGGCTTGTTAGCGCTTGGTTGTATGGGTGGTTTGTTTTTCCTTCTTAATGAAATGAAGTGCAGCTCTCCTTTGTTTTCTAAAAAAAAAACAAAGAAAATAAAGTCACTACATTAACACAATTCAATTTTGATAAAAAACAACATGCAAGCTATACAATCATGAACCTATCATATTTTTTTAATGGAATCTGTTATGTTTTGGGGCTTTATGGATATCCACCGTTAGAGATGCTACTACACTGCATTGGTTTTCTTTGTTGGCAATAATCAAGTACTGTGATCTCCTTAACAGTTCCACAGGTGCCTGAATATTCTCCCTCTCTTGATGAGGAGGGTGTTTGTAAAACAGCATTTGAGCTTATATTTGCCTTCGATGAGGCCATCTGTCTTGGAAATAAGGAAAACGTAACAGTCCAACAAGTCAAACAATATTGTGAGATGGAGAGCCATGAAGAGAAGGCGCACAAGCTGATGATGCAAAGCAAAATCAATGAAACAAGGGATGTGATGAAGAAGAAAGCCAGTGAGCTTGATAAGATGAAGGTCTGCACTGCACCTTTCTTCAGATTAAAAATACATATTATATCTTCAGAGAAAATAAATGACAGTTAATGTAGTTGACTTTGACCATTAGGAAAATCGATATTACATTATTATTGCTAGTTTGACCTTATGACTCTGTGCTGTTTTACTGCCAGCTTGTCATTTCTTTGGTTACAATTGATATCAGTTCGCGCAAACTTTAGTGTTTAAAATACAATTGCATTGCCGTTATTTCTTAATGTCTAAGAGGTGAATTTTGTGTTCGGTGTTCATGCAGATGGAAAGAGGAAAACTTGACAAAGGAGGATACTCGGCAATATCAGGTCCCAGGGTAGTTGAAAAAGCATTTGGTGACATGAGCATTACTGGTAGTGGATTTGGAAGTGGTTCTGGATTAGGTGGACTGAGCATGGATATGGACTCATTTGCTAGCAAGCCTAAAGGTGGTAATTTAAAAACTCTTTGCATTTCTCTTGGCAGATATTAACTCTTTGCATTAGGGGAAAATTTACTACGTAAAGCTCTGGGTTTTCTTCTTGCAGTACTTGATATTCAGATCTTCATTCCCATGCCAGTAGTCTCCTGATTATGTCTATGTTTGTCTATATAATTCCTACTTTCCATTTTAACTGCTCGACAAAGTTCAATCAGCTATAATATATTGCTTATGTTTGCTAGCAATGTTTATACAGGCCGTCCATCTGCAGCTGCTACTGCTCCTGGTAAAGGTCTTGGAATGAAATTAGGGAAAACACAGAAGACGAATCAGTTCCTGGAATCTTTGAAAGCTGAAGGAGAAGTCATTCTGGAGGATGTACAACCCAGTTCAGTTCAGTCAAGGGTGTCGCCTCTTCCACCAAGTGATCCTGTCACAGTGACAATTGAAGAAAAACTCAATGTTACAGTTAAAAGAGATGGAGGTGTTAATAATTTTGATGTGCAAGGAACCCTTGCTCTTCAGGTCCTTAATGATACTGATGGGTTTATCCAGTTGCAGGTAACATTCTTTCTGAACCTCTAGCATCCTGCTTGATTTTTTTCTACAGAAATTTTCACAAGCAGATCAAAGAACATAGCACGACAATTTTTGTTTGAACCTATACGATATTTCTACTAAGTAAATGTAATGCATGTGTTATATTGGGTGACCTTCCTGCTAAGATAATCCATGTACTGTTTTTTTTGTAGTCCATGTCATATGATATCCAATTTTGCTATCACATTTGTGCTTGTGACTTTGTTTATGCTTATCATGCCATGTTTTTGTTGCTGAGGAATATTATTTCTTTTTATTACGTTCAGTTACATCTATGATTCTTGCACCATATTTTGCATTGCGGACAAGAAACATTGTTTGGTCCATGATACTGTTTGTCGGAGCTGATTATTTGATACTTGTGTCTTATAGATTGAAAACCAGGATGTACCTGGACTTAGCTTCAAAACACACCCCAATATCAACAAAGATTTGTTTAACAGTCAACAAGTTGTGGGGGCAAAAGATCCAAACAGGCCATTCCCAAGTGGTCAAAATGAAACTCCTCTGGTTAAGTGGAGAATTCATGGGATGGATGAGTCATCGTTACCTCTATCAGGTGCACAATCACTTTACTTTCTTCTATATCACATTGAAGATCATGCCTTTTCTTTTCTTGGTTGCCTCCTACTTTTATTAACTTGTGTTTTTTTCGCTCAGTCAACTGCTGGCCATCGGTATCTGGAAATGAAACTTATGTCAACATTGAATATGAGGCTGCTGAGATGTTTGACCTGCACAATGTTGTCATATCTATACCATTGCCTGCACTTCGGGAGGCTCCGAGTGTTAGACAGATTGATGGAGAGTGGAGGTAATGTTTCAAATTCATCTCTATCTGTACTGAACTTGGCTGTTATATTATACTAAAATAATCGTCCAACTAATTGTTAGATGACAATTATCTCCTTAGTATTGATGCTAATATTAGAAAAATAACAAGTGATAGCTATGCTTTCTAGCTATTGTTCCTGGCACTGTCATATTGGCATTCAAACTGTTAAGGGCCCCTTTGATTTGTAGGAAAAGTGTAGGAAATTTGAAGGATTTCAATCCTATGGAAAAAATTCCTATGGAAGCCTTTGAAATTAAGGATTGAATCCTATACTATCCTTTAAAATTCCTATGAAATGGCTAATCCTATAGAGATTTTGGAGGAAAGTTAGCAAGAGGTCCAACCTCTTGGAAAAATTCCTTTGAGTCTATCTCTCTCATCCGATTCTTGCGTTTTTCGTGTGGTCCAATCAAACGGTCATTCCTGTGTTTTTCCTGTATTTTCCAATCCTCTGTTTTACACCTGCATTCCTGTCAGAATCCTACGTTTTTCCTATTCCTCCGTTTTTCCATTCCTGCGATTCAAAGGGGGATGTGTTTTGGATTTATCGGGATTTAGTCCAATTCCCTTGGATGAACTGGTCCTAAATGACACTTTGTGTAGATAGAGCTAAACTTTTATTTCCTTGATGCTAATAAGGTAGAACGCACAGCGAAAGCTGATTGTTATAATGCCTATTTCACTTTCATTTTGCATACAGGTATGATTCGAGAAACTCCGTGTTGGAATGGTCCATTCTTCTTATCGATCAGTCAAACCGCAGGTCAGTGAAATACGAGTTCATATAACCATGTTTTATTTTGTTTTTTTTTCCTGTGGCTCTAACTCTTATTTTTTCCCCTGTTTGCAGTGGCTCCATGGAATTTGTTGTCCCCCCAGCTGATCCATCAACATTTTTCCCCATATCAATTGGATTTTCCGCATCTAGTACATTCAGCGATTTGAAGGTTGGTTTTCCCTTATTAGATGAGACTCGTGGTTCTATGTTTGTGTTCCTTCTCATTTTATTGTATGGTAATGTTATTTTCTGCATACCTTGCAGGTTACTGGAATTCGTCCTCTAAAGGATGGTAACCCACCAAAGTATTCGCAGAGGGCTCGTTTGGTAACAGCCAATTATCAAGTGGTTTAA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA019594