BGIOSGA020258
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA020258 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA020258, complete gene. |
| LocusTag |
OJ1741_B01.2 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA020258-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA020258-PA |
| Length |
6919 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:27949764..27956682 |
| Sequence Coding Region |
27949764..27949818,27950303..27950409,27950490..27951323,27951457..27951615,27951746..27952086 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:27949764..27956682 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:27949764..27956682 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGGTCGGTGGAGCGGATCACGTCCATGCCTCGGCGGCAGGTCCAAGCCCGTGATGGGTCGGTTGCTTCATTGGCTAAACGAACGGGCTCACCCTGCCAACAGGAAGATGATTATGAAGGTGCCAAAACTATGACAAATCCATGGACCTTCCTTCCAGAGGACATCTGGTATCATATACACTCCTTATTGCCACTAAAAGATGCCGCTCGTACTGCATGCGTGTCTCGCACATTTCTACATTCATGGAGATACCGCCCCAACCTTGTCTTTAGTGATGCAAAACTGGGGCTGAGTGGCTTGTCGGAAAGTGATGAAGTAACCAAGGAACTCAACGAAAAAGTTGACCTCATTATGAAAAACCACTCAGGCATTGGCTTGAGGACATTCGGGCTTGAATATTATAATTTGGTCGATGCCTCTTATCTTGACCGTTGGCTCCAGATTGCTGTTACACCAGCAATAGAAGAGCTCATCCTTATGTTTTTTCCAGAGATCAAGGCAAAGTACTACGACTTCCCATTCTCACTTTTATTTGATAGGGGTGGAAACTCGATTAAGCATCTTCGCCTCAGCTACTGTGCCTTCCGTCCTACCACTAGTCTTAATTTCTTGCAAAGACTGCATCTGTTTGAAGTGCGTATTACTGGGGATGAATTGGGGTGCCTTCTTTCCAACTCTTTTGCTTTAGAGCAGTTGAAACTCACACATTGTAAAGAGCTCAATTACCTCAAGATACCTTGCGTGCTACAGAGGCTCAGCAAGCTGACAGTGTTTGGATGCACAACATTGCAAGTGATTGAAATTAAAGCTCCAAACCTTTCAACCTTTGATTATGATGGTAATTTAGCAGGACTATCAGATGGAGGTTTACTGCCAGTGAAGAACCTACACTTATCTTCCTTTTATCAGCATCATACTATTCAATACACATGTGCCAAGCTTCCATCTGTTGCGCCGACTATCGAAACTCTCACCATATTTTCAGAAAGCGAGAGGTTCAATACACAAATTTCACCATTCAGATTCCTTCATCTCAAGTGCTTGACGATTTCTCTTAGCATATACCGTGGGGGCTTTTCCCCATCAAATGATTATCTTTCTCTAGCTTATTTTCTTGATGCGTCTCCTGTCTTGGAGATTTTCACTTTGACCGTATCACAGACTCGTATGAAGCATCACGTGATTTCTGAAGATTCCTCATATCTGAGGCAGATGCCAGGACACCGCCATGTCAACCTCAAGAATGTGAAGATCATTGGGTTTTGCTCTGCAAAGAGCATGGTAGAGCTGACTTGCCATATTATTGAGAATGCAACATCACTAGAATGCCTTACTCTAGACACAATATGTGATGATTATGAAAATCCTGATAGGCTATCTGTTCACGAAATTGGTGAGTGCAGCCCCATATGTAGGCAAATGATCATGGAGGCCAAAAACGCGCTCTTGGCTATCGAAAGATACATTGTGGGGAAAGTCCCCTCTACAGTCAGCCCAAGCACACCAGTGAAGGCCTTCCTTGCCCTGCAGATGAGTCGGTTGCTTCACTGGCTAAACGAAATGGCTCACCCTGTCAACAAGGCGATGATTACCAAGATAGCTGTTACACCGGCAATCGAAGAACTCATCCTTTTGCTGTTTCCAGAGGACAAGGCAAACTACTACGACTTCCCATTCTCACTTTTATTCAATAGAGGTGGAAGCTCGATTAAGCATCTTCATCTCAGCTATTGTGTCTTCCGTCCTACTGGTGGACTTAATTGCTTGCGAAGTCTGTTTCTGTATGAGGTGCGCATTACTGGGCACGAATTAGGGTGCCTTTTTTCCAATTCCTTTGCGTTAGAGCAGTTGGAACTCACAGATTGCAAAGAGCTCAGTTACCTCAAGATACCTTGCCTGCTTCAACGGCTCAGCAAGCTGGCAATGTATGGATGGGAAGCATCACAAGTGATGGAAATTAAAGCTCCAAATCTTTTAACCTTCCATTATGAGGGTAATCTAGCACGACTATCAGATGGAGGTCTACCGTCTGTGAAGAACCTAACCATAGCTTCCATTCGTTGGCATAATGCTATTTATTATGCCTGTGCAAATCTTCCATCCATTGTGCCCACTATTGAAACTCTCACTGTATTTTCAGTTAGCGAGATTATCAATACGCCGATCGCACCTTTAAGATTTCTCCACCTCAAGCACCTTACTGTTTTTCTTCACACAGTCCCTAGGGTCGTTTCCCCAACATATGATTATCTTTCTTTAGCTTATTTTCTTGATGCATCTCCTGCCTTGGAGACTTTCACTTTGAAGGTATCACAGACTCGCATGGAGCATGACGTGATTTCTGAAGATTCATCACATCTAAGGCAGATGCCAGGACACCATCATGACACCATCAAGAATGTGAAGATCATGGTCGAGCTAACTTGTCATATTCTTGAGAATGCAACATCACTTGAAGGTCTTACACTAGACACAATATTTGATGGAAATAATAATCCTGCAGATAGGCTATCTGTTCACGAAGTTGGTCGTTGTGGCCGCATACATAGCCCTATGGTCATGGAAGCCAAAAACGCGCTCTTGGCTATCGAGAGATACATCGTCGGGAAAGTCCCCTCTACAGTGAAGCTGGATGTTCTAAAACCCTGCAGCTGGTGCCATACAAATTCAAGTGTTGAGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGSVERITSMPRRQVQARDGSVASLAKRTGSPCQQEDDYEGAKTMTNPWTFLPEDIWYHIHSLLPLKDAARTACVSRTFLHSWRYRPNLVFSDAKLGLSGLSESDEVTKELNEKVDLIMKNHSGIGLRTFGLEYYNLVDASYLDRWLQIAVTPAIEELILMFFPEIKAKYYDFPFSLLFDRGGNSIKHLRLSYCAFRPTTSLNFLQRLHLFEVRITGDELGCLLSNSFALEQLKLTHCKELNYLKIPCVLQRLSKLTVFGCTTLQVIEIKAPNLSTFDYDGNLAGLSDGGLLPVKNLHLSSFYQHHTIQYTCAKLPSVAPTIETLTIFSESERFNTQISPFRFLHLKCLTISLSIYRGGFSPSNDYLSLAYFLDASPVLEIFTLTVSQTRMKHHVISEDSSYLRQMPGHRHVNLKNVKIIGFCSAKSMVELTCHIIENATSLECLTLDTICDDYENPDRLSVHEIGECSPICRQMIMEAKNALLAIERYIVGKVPSTVSPSTPVKAFLALQMSRLLHWLNEMAHPVNKAMITKIAVTPAIEELILLLFPEDKANYYDFPFSLLFNRGGSSIKHLHLSYCVFRPTGGLNCLRSLFLYEVRITGHELGCLFSNSFALEQLELTDCKELSYLKIPCLLQRLSKLAMYGWEASQVMEIKAPNLLTFHYEGNLARLSDGGLPSVKNLTIASIRWHNAIYYACANLPSIVPTIETLTVFSVSEIINTPIAPLRFLHLKHLTVFLHTVPRVVSPTYDYLSLAYFLDASPALETFTLKVSQTRMEHDVISEDSSHLRQMPGHHHDTIKNVKIMVELTCHILENATSLEGLTLDTIFDGNNNPADRLSVHEVGRCGRIHSPMVMEAKNALLAIERYIVGKVPSTVKLDVLKPCSWCHTNSSVE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..55#540..646#727..1560#1694..1852#1983..2323#3285..3321#5158..5223#5629..6180#6280..6438#6545..6919#ATGGGGTCGGTGGAGCGGATCACGTCCATGCCTCGGCGGCAGGTCCAAGCCCGTGGTAAGCAGCTTCTTTGCTCCGTGCTTCCATGGCCCTCTTCGTTGCACTGTATTGTGTACATTGTCCTGACATATAGCTTGTTCAGTTAAATCAGTAATCAGGATACTGCTATCCTCTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTGAGGAAGATATCTTTTATTCTTTTGAGATGAAGTATACTGCATTATTCCTATTGTTCCGAGAGACTGAGACAGAAGAAAAAGTTTGGTTTTTCCTGACTGAGACAGTAGTAGCTAAGTGATTCGATTAGATTAGCTAGCTTAAAATCTGAGTACCTCGGAACGAATGTTGCTTTCTTTTTTCTGATTGCGCACTTCAATTTGCACTCTACCACAGAAGAATAACTTGGGAGGGTTCTTGCCCAAAATTTGCATAAGAGAAACAAATTTTATGTGTGCATTGTACTCTCAATTTTACGCTCCATTATCATCGGTACCTGCCATAACCATGATCACATGATGTATTGCAGATGGGTCGGTTGCTTCATTGGCTAAACGAACGGGCTCACCCTGCCAACAGGAAGATGATTATGAAGGTGCCAAAACTATGACAAATCCATGGACCTTCCTTCCAGAGGTATAAATTTTGCATGCATCATTGTTCACTTACCTTTACAAATGCGATGTTGAACTGTTCTCTGACTCTTGTGTTTTCAGGACATCTGGTATCATATACACTCCTTATTGCCACTAAAAGATGCCGCTCGTACTGCATGCGTGTCTCGCACATTTCTACATTCATGGAGATACCGCCCCAACCTTGTCTTTAGTGATGCAAAACTGGGGCTGAGTGGCTTGTCGGAAAGTGATGAAGTAACCAAGGAACTCAACGAAAAAGTTGACCTCATTATGAAAAACCACTCAGGCATTGGCTTGAGGACATTCGGGCTTGAATATTATAATTTGGTCGATGCCTCTTATCTTGACCGTTGGCTCCAGATTGCTGTTACACCAGCAATAGAAGAGCTCATCCTTATGTTTTTTCCAGAGATCAAGGCAAAGTACTACGACTTCCCATTCTCACTTTTATTTGATAGGGGTGGAAACTCGATTAAGCATCTTCGCCTCAGCTACTGTGCCTTCCGTCCTACCACTAGTCTTAATTTCTTGCAAAGACTGCATCTGTTTGAAGTGCGTATTACTGGGGATGAATTGGGGTGCCTTCTTTCCAACTCTTTTGCTTTAGAGCAGTTGAAACTCACACATTGTAAAGAGCTCAATTACCTCAAGATACCTTGCGTGCTACAGAGGCTCAGCAAGCTGACAGTGTTTGGATGCACAACATTGCAAGTGATTGAAATTAAAGCTCCAAACCTTTCAACCTTTGATTATGATGGTAATTTAGCAGGACTATCAGATGGAGGTTTACTGCCAGTGAAGAACCTACACTTATCTTCCTTTTATCAGCATCATACTATTCAATACACATGTGCCAAGCTTCCATCTGTTGCGCCGACTATCGAAACTCTCACCATATTTTCAGAAAGCGAGGTATGTTATGAAACTTAAGATTATATCATTAGATACCAGCATTATGCACATAGCAAGAGTTTTTTTTTTTTTTGGCTGGGCCGTGCACATAGCAAGAGTTCTGATTAATATGGAATTCTGAATATTATTGCAGAGGTTCAATACACAAATTTCACCATTCAGATTCCTTCATCTCAAGTGCTTGACGATTTCTCTTAGCATATACCGTGGGGGCTTTTCCCCATCAAATGATTATCTTTCTCTAGCTTATTTTCTTGATGCGTCTCCTGTCTTGGAGATTTTCACTTTGACCGTAAGCATTTCTTTTTTCATGTTTTTTCTCCTGTTTGATACAATTAAATTTTGATGTGGCAAAAAATACCTATTAATCCGTTGTCTATAATGGAATCATTTGTAAGTATTGTTTGCTTGTTCCTATGCAGGTATCACAGACTCGTATGAAGCATCACGTGATTTCTGAAGATTCCTCATATCTGAGGCAGATGCCAGGACACCGCCATGTCAACCTCAAGAATGTGAAGATCATTGGGTTTTGCTCTGCAAAGAGCATGGTAGAGCTGACTTGCCATATTATTGAGAATGCAACATCACTAGAATGCCTTACTCTAGACACAATATGTGATGATTATGAAAATCCTGATAGGCTATCTGTTCACGAAATTGGTGAGTGCAGCCCCATATGTAGGCAAATGATCATGGAGGCCAAAAACGCGCTCTTGGCTATCGAAAGATACATTGTGGGGAAAGTCCCCTCTACAGTCAGGTTAGATGTTCTGAAGCCCTGCAGCTGGTGCCATGCCATTGAAGTTTAGGTGTTAAATTGTGGCGATGTTGAATTATGTGGTGTTGCTTAAGCTAGGTGTGGCTTGTTTCTTTAGCTATAGGATGTACCTGCTGTTTTAGGTCCTGTGGTATTATTGCATGGGTTGTGCTTTGTCAGTGTTCTAATGTCATGTTACATGTTCAGTTATATTATAATCAAGAAGCATTCTTTCTTCTGGCTATCTCTGCTTTATCAATTGAAATCCACCTGAAGCTGGGATGCTACATATGATCTACGATTGTATTCATGCGACATGTACATGTTCTGTTCGCTCTTGTAATTTCATTGATATTTCTGTTACATGACAGCCCAATAATATCCTAATATTACTTCCTGCAAAAAGTATATCATGTTTAATAGTTTACTGCAAACACAGTACAAACGCTCGTATAAACACCTGCATACAAACCCATAAGCATCTTTGAAGACTAGACCAATATATATTGAGATTCACGAAGTCTACCTCATTATCGACGGGCATGTCATTTACCACTAATAGAATATTTAGCTATCAATGGGTATGACCTATTTTTCATGATGGGTTATGAATGCATTGCAACTTTTTTTTGGACGAAATGCATTGTATCTTACACTCGCACAAAGTGTATTATTTTGAAACTGCTTCTCTCTCTAGAGATCAACGCTATTATGTTTTGCTTATATTTTGGTTTGGCATTTTCATATTTGATCATCAGTGTCCTAGTGGAAGTCCACGAGACAATTTCCCTGGAAAAGATAATAGCTAATGCTCACCAGAGTTGAACAAGAAGAGAAGCAATCATTCATTCTGACGCACGTGTTTGGGCAACAAAATTGTCTGCTTTTCCGACTTATTTGTCACCTAAACTACCACAATCAAGAAGCATTTCAAACAACATAATCCGTACAAATTATCCTTCAGCCCAAGCACACCAGTGAAGGCCTTCCTTGCCCTGCAGGTGATGCCATGCTGCAGGTGTTAAAAGACCATTACTGTTCGACTTTATAGTGATTTAATGTTCCTTAAGTGAACTTTATAGTGATTTAATGTTCCAATGTTCCTTAAGTGAGGTGTTGGCTTGTTTTAAATCTTGTTTAACCTGGGATGGAGATTTGTCTCTGAAGTTGTCAGTGTTGTGTCATGTTCTCAGTTGGAGTATACTATAACCAATACCATTCTTAAATTGTCCAGCTGAAGCTGTGGCTTGTCTTGTCTTGCTTTCTTTAAAAACAAGGTCATTATGCAATATAATGATATTTCATCCAAAAAAAGTTAGATATTGGTTTGATTTTTCATGTACCTGATCATGTCTTGGTTGAAGACAGTAAGTCAATTTTTTTTTGGGGAAAAAAATAACATAATATGGCTCAATGGAGTCGAAGAACATGACAATTTTAACTGATTTGCCAAATATCCATTCGCCTAAATTATAGTTAGACCTATTTAAAATGGACTATCTAAAAATATGCCATAAGTTTTTGAGTGAAAAAAATTAGATGTAACTACAGTGTAATTAGAATATAATTACTCAGTAAAATACTATAACCATGGTTTCTTTCACAACCCTAACTACTCCCTTTGTTCCCACAATGTAAGACTTTCTAGCATTGCCTATATTCGTAAAGATGTGAATGAATCTAAATATTTACATGTGTCTAGATTCATTAACATCCATATGGATATATACAATGCTAGAAAGTCTTACATTGTGAAACGGAGGAAGTAGTTGTCAAATATTTATAGGTTAAAAATGTTTAAAAATTCAACCCACTCTATTTTAAACCTAAAAAATTGGGCCCATTACTACCCCTAGGTACAGCCCAAACATACCTACAAAAGCCCATTAAGGCCTCGTTTGGTGGGCTTCAAATATCGGCCCACAGCATGGACCAGCAGGTTTTCGTTTCCTAATTTTCTGCCGTATTTTTGGCCGTCACCTCTGCGGATTCCATTCCCCTCCCCTCCTCTCCTCGCGCAGCCGCGCCACGCCGCGCCTTGCCGCTGACACCGGAGCAAGATCGAGAGAGAGCGCGGCGTATCGGGGTGATCTGGTCTCCCCGCGCGCGCGCGCCGCCCTGCTGGTTTCGGAATCGAAGAGGAGCAGAGAGGGCGGCGGGGAAGAAGAGGGGAGGTGAAGCGGCGGCGGCGGCTCATGTCGATGCAGCAGGAGCAGACGCGGCCACGGCGGCTGGTCCAATCCTGTAGTGAGCTCGTCTCTTTGATCCATCGCCCCATCGGCCTCTTCGTCGCATTGCATCGTGTTTAGTGTTTCTGTGTTAATGCCCTGGCGTCCATAGCTTGTTTAGTATACCGCTATTCTTTTTTAGAGTATACTCCATTCGGTTCATATTATAGGTTTAGGTCGTTTCGACTAAATTTTAGAAAAATATAGCAATGTTTCCAACACAAAATAAACATATTATGAAAATATATTAAAATTTTAGTTTTAATGAAACGGAGTATTATACTGCTGCACCGAGACAAAAAGAGGAGGGTGTATTATACTGCTGCTTTGGGACTG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