Os12g0112300
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Structured Information
| Gene Name |
Os12g0112300 |
|---|---|
| Description |
Conserved hypothetical protein |
| Version |
NM_001072505.1 GI:115486971 GeneID:4351303 |
| Length |
5577 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0112300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:631454..637030 |
| Sequence Coding Region |
631489..631605,631700..631864,632636..632734,632941..633027,633114..633182 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:631454..637030 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008405:631454..637030 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgacgacgacgacgacgactcggcaccgcctccgggatgcggcggtggcgtcagtggtggccgtcctcccccacgagatctccccgctcatcagcgccgcctccaccttcttcttcatcctcagcgcctactttgccgtgctgccgctgcgggacgagggggccatctccctgggcctctcctccctcccgggtctcttcgccggctccctcctcctcacccttgtcgccgcccccgtcgcctccctcgccttctccctcccatccatccccaaacccagggctttggttttcatacacagattcttcagtttatcccttcttgtcttttttgttctttggtttgcctctacccctgggcattccccttctatctcccagtcaagcgaagatgcttcaaataaacctcctggatggggaaaccacagttggttctacatattagtgagaataagcttgtttctttgggtttccttgcttaatctcattgcaatatcatcaacatgggcaagagtaattgatatcatggatagtgagtcaggttcaagattgtttggttttattggggccggtgctacgctcgggcaactttttggttcattatttgctgcaactatggcattgctagggccctttctgctcctgttttcatccctattgatggaacttgctgcattgtcatcgaaaggaatctgcactgatgatactcacggctcaatggaattgtcttctacaatagccgaacaaagccaaaatacagaggctgatgatgaaatgtcttcactggtcacttcacaaggattaccgtcccaagtctccgaatctcagaaaaccaaacctgagatttttgtgatgtttgaaggtttctggctgattgcacgctctccctatctgatgtatatatctctatttttgtggctgagcgctgttgtgtcgtccttcttttacttccagaaagtgacgatagttgctacaacaatatcaagcccaactgccagaagaagaacctttgcactcataaacagctttattgccgtctttattcttgcagggcaactcactttgacgggtcgtatccttaccatagctggtgtaacagttgctatctgtgcatccccattcattgccacattgaatatggttgcccttgctctatggccaacttgggttgctgttgctgtcactgaaacaattcgaaaggtaactacttatgttttgacaagacctggaagggaattgctattcacagttgtctcacaggatgagaagtacaaagccaaggtttgtatagatgttgttgttcaaaggcttggtgatgcaacagctgccggaatatacagtttgttgttcagcagccttgagaagaaggcatccatggtcaccctctacgcgttgccgctctgcttcgtgtggcttctaacggcatttcatttgggccggctccagacaaaccttgtcaaggttcaggttgcttcttttgcatcttcgattcctagatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MTTTTTTRHRLRDAAVASVVAVLPHEISPLISAASTFFFILSAY FAVLPLRDEGAISLGLSSLPGLFAGSLLLTLVAAPVASLAFSLPSIPKPRALVFIHRF FSLSLLVFFVLWFASTPGHSPSISQSSEDASNKPPGWGNHSWFYILVRISLFLWVSLL NLIAISSTWARVIDIMDSESGSRLFGFIGAGATLGQLFGSLFAATMALLGPFLLLFSS LLMELAALSSKGICTDDTHGSMELSSTIAEQSQNTEADDEMSSLVTSQGLPSQVSESQ KTKPEIFVMFEGFWLIARSPYLMYISLFLWLSAVVSSFFYFQKVTIVATTISSPTARR RTFALINSFIAVFILAGQLTLTGRILTIAGVTVAICASPFIATLNMVALALWPTWVAV AVTETIRKVTTYVLTRPGRELLFTVVSQDEKYKAKVCIDVVVQRLGDATAAGIYSLLF SSLEKKASMVTLYALPLCFVWLLTAFHLGRLQTNLVKVQVASFASSIPR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>36..152#247..411#1183..1281#1488..1574#1661..1729#1821..1917#2003..2105#2416..2632#2762..2875#3568..3699#3993..4073#4831..4947#5044..5145#agagtagacgacggagtttggattggaaatttggaatgacgacgacgacgacgactcggcaccgcctccgggatgcggcggtggcgtcagtggtggccgtcctcccccacgagatctccccgctcatcagcgccgcctccaccttcttcttcgtacgtatcgtatcgtatgcttccctctctctcttgcttcttgcttcttctcatttcatttccttgattcatctatggctttatggctgtgcagatcctcagcgcctactttgccgtgctgccgctgcgggacgagggggccatctccctgggcctctcctccctcccgggtctcttcgccggctccctcctcctcacccttgtcgccgcccccgtcgcctccctcgccttctccctcccatccatccccaaacccagggtccgtattcttcctcacttacattatctatttttattagcttgctttttatgccacaagccaaccggttagatttcttagatgcaaacttcggtaatgctttgtacctttacggacgcaatttttacacacttattgtagtcaatcacgcaaaaacaactgcattacattctcacaatcatgaaaactctttttaacgaatatgaaaacttgaattggttcagatgaaaacttgctatttgctctaagttcagatgtaggcacacttcttaaacctgaaggaatgcaattcttaactcaactcaattatttcaatgattgtattgttcttgctttagtgtttcactagttaaaagtagtatacctttattttgtttcatttgatcaagatgctagctttgccttctgtatgactggaacagttgatgaattactttagagtaccatgttaatcattgaatttgtgttcttttgtctgttgagaagaaaaaaataattctggtctgtgttgtgcgagcttctgtatatttaccacaggaatgcaataatttgggtatttcttcagtaaacccctttaatttaagatggttcagctagcttttccttgactaaataccagattcttgtcctcagctttcttccgtttgtttatcgatgatgaggtctacattttaagaatttgaaatattctgaagaacaatacaggctacaaatatccttgcagttatttcttattcactgacatcagctaattttatcatctatattcaggctttggttttcatacacagattcttcagtttatcccttcttgtcttttttgttctttggtttgcctctacccctgggcattccccttctatctcccaggtaatatacattgctattaatcttggtttttgcaattatgtacaatatagttattaaatttcaatgaaattgtgaagggaaaaaattaccgtaccatgaattttcactcagctgcttcgtctgtccccctgaatttcctaatctaagaatcattcctcacacaaaaaaaaacttatttttctctgtttcttggtgtacaaatcaagtcaagcgaagatgcttcaaataaacctcctggatggggaaaccacagttggttctacatattagtgagaataagcttgtttctttgggtacgacttttcatgctacatgggcatgttcatttattctaattctcaaactgattattgatttgagtaattatgtctatttgaaggtttccttgcttaatctcattgcaatatcatcaacatgggcaagagtaattgatatcatggatagtgaggtatcatttacagctgctctaaaacttattggcaaattacctacaactgattacttttgcttctgatattcttattactcttttaattcagtcaggttcaagattgtttggttttattggggccggtgctacgctcgggcaactttttggttcattatttgctgcaactatggcattgctagggccctgtacgtatgattttctgaacaagaaaacaaattcctgatttaaaatttctagaatgcattttcacatctccgaaatgtgcctcagttctgctcctgttttcatccctattgatggaacttgctgcattgtcatcgaaaggaatctgcactgatgatactcacggctcaatggaattgtcttctacaatgtatgtatccttctggacatggtttgcaatatcctgacttatctatgactgttaactatgacacgggcaaaacatatcattgatacggactaatgtccagttttactttcatttttaattcttaaacttaagtcacattatagtttgtaaattctttcttttataatcaacctcaaaacccttgaatggattttgttagtttgaacgtctcatagcaatacagatagattgcctgctgattatttgatttgatattttggtgattccttgttttgcttatgattgcatcccaatctattaccaactgcagagccgaacaaagccaaaatacagaggctgatgatgaaatgtcttcactggtcacttcacaaggattaccgtcccaagtctccgaatctcagaaaaccaaacctgagatttttgtgatgtttgaaggtttctggctgattgcacgctctccctatctgatgtatatatctctatttttgtggctgagcgctgttgtgtcgtccttcttttacttccaggtatggttcttctatatatgtctattgacatgaataagttccacatcactgtgaccatgttgtttccttagttacatcgttggaaggatccaccatttaccatccatttgaattctacctgatttccagaaagtgacgatagttgctacaacaatatcaagcccaactgccagaagaagaacctttgcactcataaacagctttattgccgtctttattcttgcagggcaactcactttgacggtatttatccatctccagattgtccttggttttattattaatagtacccctttttgcagtatgaataaatcttaacctgacaaattgtcctgcacaggaccactatgacatgcgtcatggtgaagtagctttatatgttgcaaactgaacattttgactcattaggctctccctcctttttgttttggtggggaaggctcaattagaaagctcagcttcatttctaacatctatttgatcatgcatgcgtatccccaaagtgcttatttttctcatacaacattgaacttattatttagtgatatcttcctttgttcttttgaagacaagaatgtgtcaaaatttcaatagattttccttctgaattctgatgtaattctgatacacgcatatgttcctcagtttgacaattaagagataattcgcatctcatatcgtcaaaagaagggaagagttcattacgatgtagtcaaaatgatgtattgcatgtctacatcactacattccaagtactgagcaacttattagcattggcaaaaacaatataatttaaaaatgtcctaaccaacaagttgttagaaaactgcaatgactgaggaagttttgctaattttgtttcttctttcatttcgaaaaaaaaaatctcgaaatttcgttactgattcctgttatgaattaaacaactatttcagggtcgtatccttaccatagctggtgtaacagttgctatctgtgcatccccattcattgccacattgaatatggttgcccttgctctatggccaacttgggttgctgttgctgtcactgaaacaattcgaaaggtacatatagaacagggagctatgattgaacttttggtgtaataaccgttttttaccattaaatgatactttccaaaagtcacatacaaataaatatgcatatctagatgtgagcattcattaccacctggatattcatatttgagagctgagacacattaatttgaatttaatctggaattttcgcatgtcaaggatatctaatcactcataatccatttttgtgcaatttagggttttcgatgttagctctaaattgctgctttcccaatctcatcttttattctctgtaggtaactacttatgttttgacaagacctggaagggaattgctattcacagttgtctcacaggatgagaagtacaaagccaaggtaaaagatatgtcattacctgtttgagtttagtgaccaataagaaacgaaataatacatttgcttgaatgcaatagatgagttgtgtcagtagtacacattatcatgcaccacagagaactaacaaaatttctaatccctggattgctcatcaattttcatcaatttgcattgtgttatagatgtctccggtagatatcaagcatatacacatcaacatatgtgatgtgtttttgttctcaaccctggttcaaggtggtcgtaggcatggcgcaagaggccgccctttggcatcttgcccatcctctgtcgccaacgcttccttcttagcgtgctaggtcatttggtcgtcccattgtaatcgcgagaataggattaagtccttgttttcctctccccccccccccttttcttcccaaaccccccttcttttctttgttttgccttttgtgtaaattttattcctcttaatacagaagtccgcaatccttttgcgtattccccaaaaaataaaatggctctgttttgaattcacctaggcacatcagagttagccttgtctcttaaaatggagagtgggtgattagcagcgaaatttgaagttgaatttccagattaagtaggctattgtagaaaaatagtcagtttttcagttgccttcttagtcttatatttaaaatcatcttaaatacgtgttcacaaatgtatgacccatttcagttttgactatttaactaatgaatatgaattctaataggtttgtatagatgttgtt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|
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