BGIOSGA025837
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA025837 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA025837, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_26259 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA025837-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA025837-PA |
| Length |
5562 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:18459187..18464748 |
| Sequence Coding Region |
18459187..18459227,18459586..18459676,18460287..18460381,18461016..18461073,18461464..18461648 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:18459187..18464748 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:18459187..18464748 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGATCTCCTCCAGCAAGCTCAAGTCCGTCGACTTCTACAGGAAAATTCCTAGGGATTTGACCGAGGCATCACTATCTGGGGCTGGATTGTCCATTGTGGCAGCACTAGCTATGGTGTTTTTGTTTGGAATGGAACTGAGTAATTACTTAGCAGTCAATACTAGCACATCTGTGATTGTTGATAGGAGTTCAGATGGGGAGTTCTTACGGATAGATTTTAACTTAAGCTTTCCTGCACTTTCATGCGAATTTGCATCAGTTGATGTCAGTGATGTTCTGGGAACAAACAGATTGAACATAACGAAAACTGTTCGCAAATATTCAATTGATCGGAATTTAGTGCCTACTGGATCCGAGTTCCACCCAGGACCTATTCCTACGGTCAGCAAACATGGAGATGATGTTGAAGAAAACCATGATGATGGTTCAGTTCCCTTGTCCTCTCGCAATTTTGATAGCTATTCACACCAGTATCCTGTTTTGGTTGTTAATTTTTATGCCCCCTGGTGCTACTGGAGCAATCGATTGAAACCTTCGTGGGAGAAGACAGCAAAAATAATGAGGGAGAGATATGATCCTGAAATGGATGGCAGAATCATTCTTGCCAAGGTTGACTGCACTGAAGAAATTGACTTGTGTAGGAGGCACCATATACAAGGTTATCCATCGATTCGCATTTTCCGTAAAGGGAGTGATCTTAAGGAAAACCAGGGTCACCATGATCATGAATCATACTACGGCGATCGTGATACTGAGAGTTTAGTAGCGGCAATGGAAACTTATGTTGCAAACATCCCAAAAGATGCCCATGTTCTAGCTTTGGAGGACAAATCCAATAAGACTGTTGATCCTGCAAAACGCCCTGCTCCATTGACCAGTGGATGCAGAATAGAAGGTTTTGTGCGGGTAAAAAAGGTCCCTGGGAGTGTTGTAATCTCAGCTCGATCTGGTTCCCACTCCTTTGATCCATCCCAGATAAATGTTTCCCACTACGTAACACAGTTCTCTTTTGGCAAAAGGCTATCGGCAAAGATGTTTAATGAACTGAAAAGACTAACTCCCTATGTTGGTGGCCACCATGATAGATTAGCTGGTCAATCCTACATTGTTAAGCATGGTGATGTCAATGCCAACGTTACTATTGAGCATTACCTGCAAATTGTGAAAACTGAGCTTGTTACACTGAGATCATCAAAGGAATTGAAACTGGTTGAGGAGTATGAATACACAGCGCACAGCAGCTTGGTGCACAGCTTCTATGTTCCTGTTGTGAAATTCCATTTTGAACCTTCTCCCATGCAGGTCTTGGTAACTGAACTTCCAAAATCCTTCTCTCATTTCATCACAAATGTTTGTGCTATCATTGGAGGAGTTTTCACGGTTGCTGGAATACTGGATTCCATCTTCCACAACACCTTGCGGCTGGTTAAGAAGGTCGAGCTTGGGAAGAACATTTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MISSSKLKSVDFYRKIPRDLTEASLSGAGLSIVAALAMVFLFGMELSNYLAVNTSTSVIVDRSSDGEFLRIDFNLSFPALSCEFASVDVSDVLGTNRLNITKTVRKYSIDRNLVPTGSEFHPGPIPTVSKHGDDVEENHDDGSVPLSSRNFDSYSHQYPVLVVNFYAPWCYWSNRLKPSWEKTAKIMRERYDPEMDGRIILAKVDCTEEIDLCRRHHIQGYPSIRIFRKGSDLKENQGHHDHESYYGDRDTESLVAAMETYVANIPKDAHVLALEDKSNKTVDPAKRPAPLTSGCRIEGFVRVKKVPGSVVISARSGSHSFDPSQINVSHYVTQFSFGKRLSAKMFNELKRLTPYVGGHHDRLAGQSYIVKHGDVNANVTIEHYLQIVKTELVTLRSSKELKLVEEYEYTAHSSLVHSFYVPVVKFHFEPSPMQVLVTELPKSFSHFITNVCAIIGGVFTVAGILDSIFHNTLRLVKKVELGKNI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..41#400..490#1101..1195#1830..1887#2278..2462#2802..2859#3024..3064#3150..3224#4049..4105#4228..4294#4504..4650#4736..4960#5082..5243#5320..5397#5485..5562#ATGATCTCCTCCAGCAAGCTCAAGTCCGTCGACTTCTACAGGTCCCCTCCACTCCCGATCTATATCTCTCTCTCCCTCCATTGCTTGGTATGGTACACTCTGTGTGCGCGCGCGCGCGGGGGGGATTTCGACGCGGTCCGCGGCTGGGGGTGCAGGTCCTCGTTGTGGCTTTGCTTCGAATCTGGGTTCGGATTGGGCGAATTCTCTTGCCTGGCTGTTCTGGCGATTGCAGTAGATGGTTTGTGATGGTTCGTTGATGCACTGAGAAAATCGGGGTTGCGTGGGCGTATGTGGTGGTATTGACCATTCGTGCGGTCGTTGCGAGTAGTGTAATGTCTGGTGTATTTTCTACTGAGATGGGTAATTTGGTTGATGCGCTTTTTCTTTTCGTGCTTGCAGGAAAATTCCTAGGGATTTGACCGAGGCATCACTATCTGGGGCTGGATTGTCCATTGTGGCAGCACTAGCTATGGTGTTTTTGTTTGGAATGGTCAGTTTTCGTTGGATTAGCGATTGCACTGTTATTTTTAGATTTCATTTTATCACACTGGTTCCAGTCTTTAGGGAAACAAACAAAAAATGGTTGGACTGTTCTTCTGTTACATTTGGTGATTGTAGACTGAAATTTGGTACAGAGCCAAACTAAAATGACAGAGCATGTATATGTTTATGCAGATTAGTTGTCTTCTACCATTCCAACTGCTGTAGTTTAGCTAATCACTATCGCCGGATCAATGTAGAGTCTCGATTTGCTTGTTTCATTTGATGATTGAGAATAGCTCGTTTTTCCTGATATCTGTTTCAATTGACTATTAGAGCTTCATGATAGGCTAGATTCTTAACTGAACCTATTTTGGTTGAATATTTTTGACCGAATTATCAATTGGTCCATCCAACCTTGAAAATGGCAGTTAAGTAATGTATATGCCCAAGTATATTGTAATTACTCCGGAACCTATGCATAATTTTGGCTGTTGCTTGTTAAGGCTTGCAATGTGCTATAGTTTTCACTATGCTGAGCTGATTCCTTAATCAAGCTTTAGACTAGTTTAAAGGTTCATTTCAACTGAAAAGCTAAATCTGTTCAATTGTTTTTGCAGGAACTGAGTAATTACTTAGCAGTCAATACTAGCACATCTGTGATTGTTGATAGGAGTTCAGATGGGGAGTTCTTACGGATAGATTTTAACTTAAGGTAAATTCTATGGCACATGCTGCACATCTCAACAAGTAATAAGGTTAGAATACAAAATAAGAACCTTCATGATCACATAGATAATACTGCTATCATTATGGTTCATAGAACTAATGTCTTCCTAATTCTCTGATCTGCTGATAGTAATTTTATCCCTATTGTGATTAATTTTAATGGAATACTATATATGCAACAGCAAAACATAGCGTTAATTAATGTCAGGCACTCAGTACATTCTTTTCAATGTATTTGTACTCATTTGGTGCATTGTGGAAAAAAACATATGATTCTCAGTTAATTCATTTATCTTCAAAGGTCACCTAATTACCAGATCCAACCATTTGTAGTAATATGTTTGTAGAATAATTCTGATGTTGTTCTTTTACTCAACACTGTCAACCCTTGGTCTATATGAACCTGAGAGCCATTGTTTATACTTGAAATTGATGCTTTCCAGCAAACAAGGACTAGTCAGGCACTGCTCATTTATTTGTATGTGATAATGCATAGGAGGGTATCTACATTAGTCTAGCTGGTTGCCCATTGTTTTCTATGGAATGACATCAGCAAAGCTGGACTCAACTTTTCCTTGTTTTTCCAGTAGATGCTCACGATCTGGTTCTGTGATTTTCAGCTTTCCTGCACTTTCATGCGAATTTGCATCAGTTGATGTCAGTGATGTTCTGGGAACAGTAAGATTCTAACTTGACCTCATGTACTCTGTTTTTGTTCATCTGCCGTCTAGAATGAGGATATCATTGAAGGACATGAAGCTCGTCTTGCGCGTTCCATAAAAACTATTGTTGACTTTCATTTCTTGTTAACTTGCCATTACAAATAACTTTCCACTAGCTTTTAAAAGTAAGCTCTACATGTATATTTTACACCAATGTTAAAAGTACGAAATATGACAATTTATCAGTTTTTGTAAAGTTCTGTGCATGTCAAAAGAATGAAACCTATCCTAAATTCCTAACTAACTTTCTATCTATAAGCATTTCTTGATCATATCTTGCCTTTTGTAGCTCGAGTTTTTCTCCATGCTGGTTTAACCTTAAAGTTTCTGTTCAAAACACATGCAGAACAGATTGAACATAACGAAAACTGTTCGCAAATATTCAATTGATCGGAATTTAGTGCCTACTGGATCCGAGTTCCACCCAGGACCTATTCCTACGGTCAGCAAACATGGAGATGATGTTGAAGAAAACCATGATGATGGTTCAGTTCCCTTGTCCTCTCGCAATTTTGATAGCTATTCACACCAGTAAGTATTCAAATATGTATTTCAATATCCACCTATCCGTAACACATAACATATAGCATTTTAGCAATTGTGCGTTTCAATACCATATCAACGGTCAACCTATTATTCATGTATGCTGTCTTCTTTCTCCTTCACATTCATGGAGAAATGTACTTTATATTCATAGCTCCAATCACTTCAACCAGATTGTCTATGGCAAATTGGTGATAATCTTCACTTTTACCTGCCTCAAATATTTTTCCTTGAAGTGCCGTTCGGTAGATCTAGTTAATCCCTCTTGTATTGTTTCGGAGCCCAAATATTGTTTCCACTGATAATTATCATGCACTTCCTTTTCAGGTATCCTGTTTTGGTTGTTAATTTTTATGCCCCCTGGTGCTACTGGAGCAATCGATTGGTTAGAATTCATCTTGTTCCCTTGCATTTAGTAATTTTCTAGTATATGCTACTCTATCTGTAAGGAAATGATTAGTAAATTATTGCTGGTAAAGTAATGTAAGTATGGCACGACTTATTGAACTAACAAATGGAGACATTTCTAATTACTTGATCTTCCTCCAGAAACCTTCGTGGGAGAAGACAGCAAAAATAATGAGGGAGAGGTACATACTGTTTCTCTTTGTTTGTGTTTTGTGGTTTTAATGTGCTGTTTAATCTATACCATGTTGGTTTTTTTTTTTTCTGCAGATATGATCCTGAAATGGATGGCAGAATCATTCTTGCCAAGGTTGACTGCACTGAAGAAATTGACTTGTGTAGGAGGTTCGTCTATACTTAATTATTATTCATATCCAAAACAAGGACAAAGCATATTTAGGCTGCAACATGAACTTTACAAATACTTTTTTGATCCATGTACCAAGAGAAATTTAGTTAATTACTCCCTCCATCTACTTTTGATAGTCATATTTCCAAATAAAAAAAAAATTTTTGATAGACATATTTCAATTCAACAACCTATCCTCTTAATGACTTTCTCGGATTTAATGCGTGACTCTCCATTCTTCCACACAAGATTAGCTACATGGACATCGAGAAATGTAAATATTAATGAATCGCTTGTTTACGAGGAATGACTAGTAGCATGTTTAAATGGATGATAAGTAGAATTACTTATCCTTGGTCTATGTGCCAAGATGAAATATGACTATCAAAAATAGATGGAGGGAGTAGTTTTTAATATCCCCAACAAAGTGTCATTATTATGCCACATCTTTCATGAGCTATTCGTGTTTGTGTCCTCTTATCCTGGTTCAGTGGATGCTTATGCCTTCTGGACTTGTTTGCATTTGGAATGATTCAAAAGCCTTTATTCCATAGATCACAACCCTAATTGTTACTGACCATGTTTTTATAAGAAAATGAGCCATTGCTTCTGATGACACTGGTTTCTGTGTGATAGTGCCATTGCCATTGATGCACATAGTAACATTTCAAGCTATGCGCATTGGATGTGAACCACAACTCCTCAATAGAAGCCTTAAATTGTTCTCCCACTAGTTTTACCTAATTATATGTGCTCTTGTTATGCTTGTTCGTCATTAAATTAAGGACTACAGTTCATTGTTTTAATTTATTAAATGCAGGCACCATATACAAGGTTATCCATCGATTCGCATTTTCCGTAAAGGGAGTGATCTTAAGTAAGTTCAAGTAAATCTTACAGTCTTCCGGATACTCTACTGAGAGTTAACCTGTGGCGCAAGACTTGTATTATTATTTTTTTGCTCATGTTCCATAAACAAACAAATTGACATTTGTGCAGGGAAAACCAGGGTCACCATGATCATGAATCATACTACGGCGATCGTGATACTGAGAGTTTAGTAGCGGTATGTATATTCTGTTACCCACTTATTTTTCTTGATGTACTGCATGATATATTCTTCACCCTAAGCTTTAGCTTACCTGTAAAAGGTATTGTCCCCATTTTCCTAGGGAGAACAAAGGGCTAACTATCCTTTGCTTGTAAATCACTGACTTTGTTCATGGTCTTGTCAAATTGTGGATAAAATTCCTGACATATTTTTTTGGGCCTCAGGCAATGGAAACTTATGTTGCAAACATCCCAAAAGATGCCCATGTTCTAGCTTTGGAGGACAAATCCAATAAGACTGTTGATCCTGCAAAACGCCCTGCTCCATTGACCAGTGGATGCAGAATAGAAGGTTTTGTGCGGGTAAAAAAGGTAAATGAACTTCTGAGGTGTAATCGTTGTAGTGTTGATGATGATCTCTATCTGTGGTATTTGATTTCTGGTTCCTCTTTATCAGGTCCCTGGGAGTGTTGTAATCTCAGCTCGATCTGGTTCCCACTCCTTTGATCCATCCCAGATAAATGTTTCCCACTACGTAACACAGTTCTCT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