BGIOSGA012413
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA012413 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA012413, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_11142 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA012413-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA012413-PA |
| Length |
9702 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:11321742..11331443 |
| Sequence Coding Region |
11321742..11321852,11322471..11322514,11322628..11322691,11322765..11322879,11322991..11323058 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:11321742..11331443 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:11321742..11331443 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCTTCTACTTCCGCCGCCTCCTCCTCCTCCTCCAAGTACGCGAAGCACCGGCGGATCGGGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGCGGGGGAGGCCGAAGAGGAGCTAGAGCGGTTTGACGATTTCACTATTGCTTCATCATGGGAGAGGTTTATATCTGAGATAGAGGCAATTTGCCGTCAATGGCTTGCTGATGGCCCAAATATCTTGACGCAAAAAGGTGCAGAGAGTGTGCCTTCCTTCGATAACTTGTATGTGGTCAAACGTGAATTGAAGCATGGGAAAAGAGTTTATTGTATGGAATATCATTTCATGAAATCTGCAAAAGGGAAACATTCATACTGGGACGATGATACACATAGTATGCAGCTCTCTTTTGGAGTATATGAGTTTCTGATTATTGCTCCCTTGAGTGCCAGTGGTGTGGTGCTTGATGATCCTGAATCAACTAAGCTTTTGAGTTCAGTAGCAATTGCTCTGTCTAATTGTGGAAGCAATTGGCCAGCCTTTGTACCAGTGCATGACCCTTCACGTAAAGCATATATAGGAATCCAAAATTTGGGAACTGTATTTACTCGAAGATTTGAAGCTGATCGTATTGGTAGCCAGGTTCCGATACGACTCATGCATCTGGAGGGGTTACACGAGCTGTTTCTATCAAAATTTGTCCTATCCTCTACAGATTTTCCTGCAAGGGTAAAGGTAAACTTCTCCATGAAGCTTACCTACAGGACTCCTGAATATGATTACTATAACGAGGAAACTTTGGTGTCCGAAGCTAATGAGTCAATAGCAGAAAGCGAAGTTGCAAACCACCCAAAAAAACAATGGGATGATGATTGCTCTTGGGCAGAGTGGTATTCTGCTGAGGATCCAGTCAAAGGTTTTGAGTTGACTGCCATTTGGGGAGAGAGAGTGTTTGAAGAGACCCTTGAGATGGCTGAGGTGGAAAATGCTTCGTCATTTGATGCTGATCGTTGGCTTCTTCACCCAATTGTATCTCCATACATGGTTGATGATTCTATTGGAAAGTTTGTGGGGTTTGCATCGCAGCTGCAACTTCTGACAGCAGATACTTCAGGCCAGGAAAATTCAAAATCTACCGTCACTGTACCTCCACCATCTGTTGTTGATCGTGTTATGAAAGATCTTTTCAATGATGAGGTTGGGAACTCGAATTATGTGGAAGCAGAAAATAAGTATGGCCGCGCTATGAAAGGAGCACCTTCAGATTCACTCTTTGCCCAATTCTGTTTGCATGCTCTGTGGTTCGGCAACTGCCATATACGAGCAATAGCAGTCCTGTGGATTGACTTTGTTCGTGAAATTCGTTGGTGCTGGGAGGAATCAGAGCGATTGCCGAGGATGAAGAGCACTTCTAGTATCAACCTCTGTACTTGTCTGATACACCAAAAGTTGCATATGCTTGCAATATGCATTGAGAGAAAGAAATCATTGAGTCGCGAGAAGGGTACTGATCATGCACATGAAGATGGTATTTCAAATAGCGTGGCACAAAATAAGACTCGTAAAGGATCAGCAGGTGTTGTCCCCTCAATGATGCTTCTGAATACATTTCAAGAAATGCATGCACCATATACTCAGGATGCATTTTTGATGACTGAAGATATGCATGAAGAAAGGCTCCATGCTGCTGAAGCTTTTGGCAATGCTGTTGGATTATCTGGTCAATTGGAACGAGATGTATTATCTTCTGATATGTCTGCTTTTAAAGCTGCAAATCCAGATGCTGTTTTTGAAGATTTTATTCGGTGGCACTCTCCTGGTGACTGGGTGAGTGAGGACAGAGCAGAGGGTTCTTCAGGTTGGCCACCCAAAGGAAGGCTTTCTCAGCGTATGTCTGAACATGGGAATATGTGGCGTAAAATCTGGAATGACGCTCCTGCTTTACCTGTCTCTGAACAGAAATTTCTGCTTGATCCTATTCGAGAGGGAGAAAAGGTAATTCATTACCTTGAAACTTTAAGACCACAGCAGCTCCTTGAGCAAATGGTCTGCACTGCGTTCAAATCGTCAGCAGACATACTGAACAGAACCACATATGGTGGCTTTAAATTAATGAAGACTAAAATGGATCAGCTATATGCTACGTTGGCTTCAACATTGAAGTCTCTCCAAGGTAAATCTGACATCAGTGATTTGTCTGATGACTTGAAGCGGCTTTGTCAAGTTTTCGAGCACATTGAGAAGTTACTTATTCTTGCTGCTTCAGTCCACCGAAAACTTATTGATGCTCCACGTCTGTCTCAAGCAATTTTCGCTGACTACTTCAATTACTATCTCCCAAAAATGGGCACTAGCTTGGAAAGTGTTTGCTATGAGAAGGAATTCACTGCTAAGGAAAAGGTGGGGATGCATGAGAGAGATGCTGTATCAAATCTGTTTCCTCCTCCAACTGCTAACCAATCATGGAGGAAAGTTTTGAGCATGGGAAATCTTTTAAACGGTCATGAACCCATACAAAGAGAAATTGTATTCTCTGTCATTGAAAGAATTAGCAATGGCCATTATTCGAGCCCAACCCCATTAAGTACAGATGAACAGATTGAGACACATCGGATGTATATATCTGGGACGTCCAATGATCTTTGGGTTGCATTATCTGTGACATCCTGGGATTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASTSAASSSSSKYAKHRRIGEEEEEEEEEAGEAEEELERFDDFTIASSWERFISEIEAICRQWLADGPNILTQKGAESVPSFDNLYVVKRELKHGKRVYCMEYHFMKSAKGKHSYWDDDTHSMQLSFGVYEFLIIAPLSASGVVLDDPESTKLLSSVAIALSNCGSNWPAFVPVHDPSRKAYIGIQNLGTVFTRRFEADRIGSQVPIRLMHLEGLHELFLSKFVLSSTDFPARVKVNFSMKLTYRTPEYDYYNEETLVSEANESIAESEVANHPKKQWDDDCSWAEWYSAEDPVKGFELTAIWGERVFEETLEMAEVENASSFDADRWLLHPIVSPYMVDDSIGKFVGFASQLQLLTADTSGQENSKSTVTVPPPSVVDRVMKDLFNDEVGNSNYVEAENKYGRAMKGAPSDSLFAQFCLHALWFGNCHIRAIAVLWIDFVREIRWCWEESERLPRMKSTSSINLCTCLIHQKLHMLAICIERKKSLSREKGTDHAHEDGISNSVAQNKTRKGSAGVVPSMMLLNTFQEMHAPYTQDAFLMTEDMHEERLHAAEAFGNAVGLSGQLERDVLSSDMSAFKAANPDAVFEDFIRWHSPGDWVSEDRAEGSSGWPPKGRLSQRMSEHGNMWRKIWNDAPALPVSEQKFLLDPIREGEKVIHYLETLRPQQLLEQMVCTAFKSSADILNRTTYGGFKLMKTKMDQLYATLASTLKSLQGKSDISDLSDDLKRLCQVFEHIEKLLILAASVHRKLIDAPRLSQAIFADYFNYYLPKMGTSLESVCYEKEFTAKEKVGMHERDAVSNLFPPPTANQSWRKVLSMGNLLNGHEPIQREIVFSVIERISNGHYSSPTPLSTDEQIETHRMYISGTSNDLWVALSVTSWD</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..111#730..773#887..950#1024..1138#1250..1317#1663..1760#2289..2460#3172..3388#4297..4423#4557..4611#4753..4849#5504..5632#5720..5853#6417..6503#6583..6675#6755..6826#7080..7119#7295..7539#8345..8522#8657..8862#9406..9702#ATGGCTTCTACTTCCGCCGCCTCCTCCTCCTCCTCCAAGTACGCGAAGCACCGGCGGATCGGGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGCGGGGGAGGCCGAAGAGGAGGTACGTTCGTGTATGCTGGGTGCGATTGCTGCCTGGCACGGGCAGCGAGCTCGCCGTGATCGGGTAGTGCGGGTGCGGTTGTGGGGGTTGCTCTGGTCTGACATGAATTTTTCTAGTTTGTTCGGGACTTCGTGGAATTGGGGCTTCTCTTTGATTGCTTAAGGTTGTAACCAATGGGGTAACTCTCATTGGCCTGTTGGGTTACGGATTTGTTGTTATGGACTGAAGTCGATTTCTGAACTACCGGAATGCAATTTTACTCGAGTGGCAGTTAGGACGTTTCCTGCTGAAAATTGCTTGGAGAGTCAGAAAAGCTAAGTGGATTGTACTGGTCATAAGCTTGAATTTGTAATGCTAAATTACATCACAATATGTCTTTGCGTAGATGACAACTAGTACTCGGTAACTGTAGGTGGTAACCTTAGCCTCATCATTTTGTCGAGATAAACAGTGTACAATTGGTGGGCAGTGTTTAGTTTCTTCAGTTATGACTTCTTTTAACTTTAAAATCTGCAATGTGTAAGATTTATAGTTGTTGTAAATCAACATTCTGTTTCCGTCTAACCTATAGAAGTGGGCATTTGCCTGTTGATTTACCATGTAACTGCATTTTTTCAGCTAGAGCGGTTTGACGATTTCACTATTGCTTCATCATGGGAGAGGTACTGCATTGATACATTCCAAATTTGTTTATGTTATTTAGGCTATTTAAAACTTGATTCAAAGGGCCGGTTATGTATAACTGCACTTAAAGAGTTTTTTTGGGGGCATCTAGGTTTATATCTGAGATAGAGGCAATTTGCCGTCAATGGCTTGCTGATGGCCCAAATATCTTGACGGTATTTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCGATTTCATCCTCTGTATGATTGTTTTTTAATTGGATATGTTCCTGTAGCAAAAAGGTGCAGAGAGTGTGCCTTCCTTCGATAACTTGTATGTGGTCAAACGTGAATTGAAGCATGGGAAAAGAGTTTATTGTATGGAATATCATTTCATGAAATCTGCAAAAGGTGGGAGAAAATAAGTTGATAAAGTCTTCAACAAAATTATATATAATGTTATTCTTTCCTAACATTTTCTCGTTTAACAACTTCCTCACAGTCATAAATACCTTCCTGTAGGGAAACATTCATACTGGGACGATGATACACATAGTATGCAGCTCTCTTTTGGAGTATATGAGTTTCTGGTATATTTTCTGCTATGTGGTCTTGACAAGTTATCCCTGCTTCATTACTGTAATTGTAACACAAGAAAGTTAACCTGATGTGGCCTTGTTGCTTGCACGCAAGTATACTCCTCAGATGCCATGTGGCGCCTTTTTGGGTATATTGATACACTATATTGCATTATACTTTTTATTTAGCTAATGCATTGAGCTTTAGATAGAAACCATTGGAACTAGTACATAGATAGGCGGGGACTTTTTAAAAATCTGCACCAACCTCTAAGGCTCTAATGCATCATGGAGCCCAGTAAACATGCCTAAGCTAATAAACACAAATGAAGTCATTATGCTTTTATTTGATCGCAGATTATTGCTCCCTTGAGTGCCAGTGGTGTGGTGCTTGATGATCCTGAATCAACTAAGCTTTTGAGTTCAGTAGCAATTGCTCTGTCTAATTGTGGAAGGTAAGTTTTGACTAACATATAAATTTATAACAGTGAGCAGTTTGTTGAACTAGACATATTACAGATTGTGCATATTGTTCAGCAAGTTAGATAGTATAAGTTCATCAACGATCACAGTATTTCTGTTCGCGTCTTCACGAAGCAATTGATTAGATATCATTTTGTGTTGTCAATGCTAGTCCTCTCTGGTACACCCATATTCAATCTGAAATGTCCCTTTCAAATCTCTTTGCACTTCATAACTCATTCTGGCATAAATGTTTGTTCTGAATCTGGGACTGGGAGATTCAGTCCTGCACAATATGGTTGCCCTAAGCATATTATTATATGATATTGGTGTATTTAGTCTTCTTCAAGGAATAAGAAAATTCTGTCTATACGAGGGAATATTAATTCACACGCGTTGCATTTTTACATCTCATCAAGGCACGCTGCATGAATCTTAGTTAACAGTTAACAGGCCATTTCTTTATTTTCTAGTGAAACTATACCATTGTTTAATTTTACTGACATGAATTTTAATCTTAGCAATTGGCCAGCCTTTGTACCAGTGCATGACCCTTCACGTAAAGCATATATAGGAATCCAAAATTTGGGAACTGTATTTACTCGAAGATTTGAAGCTGATCGTATTGGTAGCCAGGTTCCGATACGACTCATGCATCTGGAGGGGTTACACGAGCTGTTTCTATCAAAATTTGTGAGTATTTTCTTATAACTTTTGGTGCTGTTTCTTCTCCCATAGAACTTTTTAAGACAGCAGATAAAATCTGTGTACAATGAATGGTTAATTACCTATGTTTCAATATATTCTGCTTATAGCTTTTATAATCTAGTTTGAAAATATAAGACGTGCATGGAATTTAGTTACCTATTCTCCCATTAACCCTCATTTACCATCCCCTCTTATCCCCTACATTAGTACTGGGACATGAGTCATTTCCTTTACCACTTTCTTGTTCTATAACCTCCTTAATCCGCAGGCATAGTTAAAATACTCCTTGTTAATCAAATGGAAGGAATATCGTGGAAACAAACTTTATTTACATTTGCTACCACATTATCTTTTGAACCTCACAATTGAGATACATAGTGTTTGAACTTCAAAATGGATCATGCACTAGATCTTTTGAAATCTGAAAGGTTTGCCTCATTTTTAATCAGCAGAAGTATTCAACCTTTTCAAAGAAAAAAATATCTGCATATGATGGACATACAAAAAAAGTAGAGGGGGGGGGGGGGGGGGCAGCTACCCGCCATTCAACAATCAGTCCATTACATTTGAACTATAGGAATGTACCATCTGTTTTTATTCAGCAATTCTGTTGTTCTGACTCTTGAGAGCCGCACTACTGATTTGGATTATTTTGCTACTTTGTTACATATGTGACCTGTATTTTTCTGTTTGGAGGTCCTATCCTCTACAGATTTTCCTGCAAGGGTAAAGGTAAACTTCTCCATGAAGCTTACCTACAGGACTCCTGAATATGATTACTATAACGAGGAAACTTTGGTGTCCGAAGCTAATGAGTCAATAGCAGAAAGCGAAGTTGCAAACCACCCAAAAAAACAATGGGATGATGATTGCTCTTGGGCAGAGTGGTATTCTGCTGAGGATCCAGTCAAAGGTAACTGCAACCTTATTCCATATTTCTAGTAGCAACTTTTCTACTCGCTTATTTTTTGAATAACGGGTTTTGACAAAAAAAAGGTATTAAAATGGTCTTCAACAATATTTCTAGCACAAAGAATGAGGTAATGAAGTTGTGGGGAAATGTAGAGTTAACAGGGGAAATTTTTTGAAAACAGGCATTGTTTGTGATGCCAAGTGTTTGTGTGATATGATATTGTTCAAAAGCAACAACTGTTAAAAATTGGAAGGAGTAATAATTACTCCCAAAAATAAGACAAATGAAAAAATAGCAATTTAGACATAGATTTGATCTAATTGGATCAATCGTCAAGAGCAACCAAGAACCAATAGTTTCAAAATTGCGAACAATGCCACTTAATGGTATCGAAAATTGATCTAGCAGCTTATATTATAATTCTTGTATTACCATTAAAGGATAGTTTCTATTATATGTGCCTCTCTTTTATCTGTCATCAGTTTCTCTGTATGGTTCTAAACTTCAATGCATATTATTGTCATTGATACTGGGACTTTACTTTGTTTTTTTACATTGTAAGTGCGAAGGGATCATGTTGTCATCTCAACGTAGAAACCTCATTTTCCATGCCAGAGGAAATATGGAGGCTGAATAATTCTTCTTCACATTTTCCTTTATGCTAGTGGTATCCTAACAAGGGTTGATATGCTATTATGATATGATATGAGAGGCTTGGTTTTCCATGAAGGCAAGGACTATTACAGTATATTAACTCCAATTTTTAAGCAGTAGTTGTCATGTTTGGAAGCGTGTTTTACCTCATGTATTTAGTATTTATAATATGTGTGACTCATATTTTTCCAGCTGAGATTTTTTTAATTAACATATGTTAAAAAACAATAGACTTAGTGGCTAAATTGTTTTAGGTTTTGAGTTGACTGCCATTTGGGGAGAGAGAGTGTTTGAAGAGACCCTTGAGATGGCTGAGGTGGAAAATGCTTCGTCATTTGATGCTGATCGTTGGCTTCTTCACCCAATTGTATCTCCATACATGTAAATTCCTTGTGACATTATTACCTTCACACTTTTTACATCAATTGTACGTAAACCTGCTGTATGTATTCTCTTTTTTTTTTACCTTCACTGGATGTATTCTTTTTTTATCTATGTCTGTACTTTGCACCAGGGTTGATGATTCTATTGGAAAGTTTGTGGGGTTTGCATCGCAGCTGCAACTTCTGGTAAAAGCATTTGAATCATCAGCAGAGGCACAGTTTTTGGAAGATTTTGTTGCAGGTTAAGAGCTTCGTGCATGCCTGAAATCCTTCAAAGCACTATTTATTCAGCTTTTCTTTTTTTCTGATTTTTATCTGTCATGTTAGACAGCAGATAC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|
| External Link(s) |
