BGIOSGA012647

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA012647

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA012647, complete gene.

LocusTag

OsJ_10899

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA012647-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA012647-PA

Length

10383

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:15243192..15253574

Sequence Coding Region

15243192..15243294,15243936..15243997,15244125..15244196,15244282..15244518,15244597..15244774
,15244855..15244987,15245813..15245972,15246052..15246205,15246286..15246389
,15246481..15246639,15247527..15247595,15247671..15247739,15247900..15248037
,15248172..15248252,15248935..15249063,15249851..15249995,15250228..15250370
,15250450..15250575,15251300..15251356,15251491..15251589,15251676..15251898
,15252372..15252616,15253461..15253574

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:15243192..15253574 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:15243192..15253574 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGGCGCATTTGGGTCTCAGTCCTCTGATGGGTACATCTCCATTAGCAAATATAATGGGTACTCTACGTTACAGTGTCTTTCAAATGTAGATGGGGGCTCAGTGGCACAGAAATATGGAGGATTCAAGATTTTAAGCCAGTTCCTTTGCCAAAAGCAGATTACGACGACTTGCAGCAAAGGTGGTGGCGCCTATCTTTTTGACATCCACTTTTGGATTGGGAAAGATTCTAGTCAAGATGAAGCTGGGACTGCAGCAATTAAGACAGTTGAACTTGACACCATGCTCGGAGGTCGTGCAGTGCAGCACAGAGAACTTCAAGGCTATGAATCTGATAAGTTCCTATCGTACTTTAAACCATGCATTATACCCTTGGAGGGAGGTTTCGCCTCTGGGTTTAAAACACCTGAAGAGGATAAGTTTGAAACAAGGCTATATATTTGCAAAGGGAAGAGAGCTATCAGAGTTAAAGAGGTTCCATTTGCTCGCTCGTCATTGAATCATGATGATGTATTTATCTTGGATACGGAAAAGAAAATATATCAATTCAATGGTGCAAACTCCAATATTCAAGAGAGAGCGAAAGCTTTGGAAGCGATTCAACATTTAAAGGAGACATACCACAATGGAGTGTGTGATGTTGCGATTGTTGATGATGGAAAATTGCAAGCAGAATCAGATTCTGGTGAATTCTGGGTTCTTTTTGGAGGTTTTGCACCAATAGGGAAGAAAGCTATATGTGACGATGATGTTGTTCTTGAAACCACAGCCCCCAAGCTTTACAGCATCAATAATGGTCAATTAAAGTTAGAAGACACAGTTCTGACAAAATCAATTCTTGAGAACAATAAGTGCTTTTTGGTCGACTGTGGGTCTGATTTATTTATATGGGTTGGTCGACTAACACAAGTGGAGGAGAGAAAAGCTGCAAGTGCAGCAGTTGAGGAATTCATTGCTACTCAAAATAGGCCAAAGACAACAAGAGTAACCCGAGTGATTCAAGGGTACGAGAATCATACATTCAAGTCTAAGTTTGAATCATGGCCAGTAAATAGTGCAGGAAGTGCTGGCGCTGAGGAAGGCCGAGGGAAAGTTGCAGCTCTGTTGAAGCAACAAGGAGTTGATATCAAGGGAGCCTCAAAAAGCAGCGCTCCAGTAGACGAGGAAGTTCCTCCTTTGCTAGAAGGCGATGGAAAACTTGAGGTTTATTGTGTCAATGGCAGTGCTAAGACTGCTCTTCCAAAGGAGGAGCTTGGAAAGTTTTACAGCGGAGATTGCTATATTGTTCTCTATACATATCATTCTGGTGACAAGAGAGAAGAATTTTATTTGACTTATTGGATTGGCAAGGACAGCATACCGGAAGATCAAGAGATGGCTTTCCAAACAGCTAATTCAATTTGGAATTCACTGAAAGGAAGGCCTATTCTGGGTCGTATTTATCAAGGGAAAGAACCACCACAATTTATTGCCCTTTTCCAGCCCATGGTCATTCTAAAGGGTGGAATCAGCTCTGGATACCAGAAATGTGTAGAAGAAAAGGGCTTGAAGGATGAAACATATTCTGGCGATGGCATTGCTCTTTTTCGAATTTCTGGAACATCAATTCACAACAATAAAGTGCTTCAAGTTGATGCGAGACATGACAGAGTAGACCTAGGGCTGCCACTGGGTATCCGATGCCCACACCCATACCCTTACCCACACTATTTGGGAAGGGTGTCATCAAACTTGAGTCCCACAGATTGTTTTGTCCTGCAATCTGGAAATTCAATGTTTACATGGATTGGCAATGCCAGTTCGTATGAACAGCAACAATGGGCTGCAAAAGTTGCTGAATTCTTGAAGCCTGGTGTTGCTGTCAAACATTGCAAGGAGGGAACTGAGAGCTCTGCCTTTTGGTTTGCTCTTGGTGGAAAGCAGAATTACACAAGCAGAAATGCCACACATGATGTTGTTAGAGAGCCTCACTTGTATACATTCTCATTGAGGAAGGTCACTGAAATTTTCAACTTTTCACAAGATGATTTGCTGACTGAAGACATGATGGTTCTTGATACACATGGGGAAGTCTTTGTTTGGATGGGTCAGTGTGTGGATGCTAAAGAGAAGCAGAAGGCATTTGAAATTGGCCAGAAATATGCAGAACATGCGGCGGCCTTCGAATCTCTTTCTCCTGATGTGCCTCTGTACAAAGTCGTTGAAGGGAATGAACCATGCTTCTTCAGAACTTACTTCTCCTGGGATAACACAAGATCTGTGATTCATGGAAATTCATTTCAGAAGAAGCTTTCACTTCTTTTCGGAATGCGCTCAGAGAGTGGATCTAAGAGTTCAGGTGATGGTGGACCAACTCAGAGGGCATCAGCATTGGCTGCTCTTTCATCTGCATTCAACCCATCTTCCCAAAAGAATAAGGGTAATGATAGGCCTAAAAGCTCTGATGGTGGACCCACTCAGCGCGCTTCAGCAATGGCTGCCTTAACATCAGCGTTCAATCCATCAGCAAAACCCAAAAGCCCACCACAACGTGCAGGTCAAGGTTCTCAGCGAGCAGCTGCTGTTGCTGCGCTGTCTAATGTTTTGACTGCTGAGGGTTCATCTCAAAGCCCACGCATAGGTAGGTCTTCCCCAATGGCAGGTGATGCAGATACAGCTGAACTAACTCCGTCTGCTGCATCCCCTCTGTCTGAAGGAGCATCAGAATTTTCCGCTGATAAAGATGCCCCAGGAGATGGGGCATTATCTGAGGGAGGGCGAACTGAGCCTGACGTATCAGTGGAACAGACTGCTAATGAAAATGGAGGTGAAACAACCTTCAGCTATGATCGGCTGATATCAAAATCTACCAACCCTGTTCGTGGGATAGATTACAAACGCAGAGAGACATATTTGTCGGACAGCGAATTCCAGACTGTATTTGGTATAACGAAGGAAGAGTTCTACCAGCAGCCAGGGTGGAAACAAGAACTACAGAAAAGGAAGCATGATCTTTTCTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MGAFGSQSSDGYISISKYNGYSTLQCLSNVDGGSVAQKYGGFKILSQFLCQKQITTTCSKGGGAYLFDIHFWIGKDSSQDEAGTAAIKTVELDTMLGGRAVQHRELQGYESDKFLSYFKPCIIPLEGGFASGFKTPEEDKFETRLYICKGKRAIRVKEVPFARSSLNHDDVFILDTEKKIYQFNGANSNIQERAKALEAIQHLKETYHNGVCDVAIVDDGKLQAESDSGEFWVLFGGFAPIGKKAICDDDVVLETTAPKLYSINNGQLKLEDTVLTKSILENNKCFLVDCGSDLFIWVGRLTQVEERKAASAAVEEFIATQNRPKTTRVTRVIQGYENHTFKSKFESWPVNSAGSAGAEEGRGKVAALLKQQGVDIKGASKSSAPVDEEVPPLLEGDGKLEVYCVNGSAKTALPKEELGKFYSGDCYIVLYTYHSGDKREEFYLTYWIGKDSIPEDQEMAFQTANSIWNSLKGRPILGRIYQGKEPPQFIALFQPMVILKGGISSGYQKCVEEKGLKDETYSGDGIALFRISGTSIHNNKVLQVDARHDRVDLGLPLGIRCPHPYPYPHYLGRVSSNLSPTDCFVLQSGNSMFTWIGNASSYEQQQWAAKVAEFLKPGVAVKHCKEGTESSAFWFALGGKQNYTSRNATHDVVREPHLYTFSLRKVTEIFNFSQDDLLTEDMMVLDTHGEVFVWMGQCVDAKEKQKAFEIGQKYAEHAAAFESLSPDVPLYKVVEGNEPCFFRTYFSWDNTRSVIHGNSFQKKLSLLFGMRSESGSKSSGDGGPTQRASALAALSSAFNPSSQKNKGNDRPKSSDGGPTQRASAMAALTSAFNPSAKPKSPPQRAGQGSQRAAAVAALSNVLTAEGSSQSPRIGRSSPMAGDADTAELTPSAASPLSEGASEFSADKDAPGDGALSEGGRTEPDVSVEQTANENGGETTFSYDRLISKSTNPVRGIDYKRRETYLSDSEFQTVFGITKEEFYQQPGWKQELQKRKHDLF</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..103#745..806#934..1005#1091..1327#1406..1583#1664..1796#2622..2781#2861..3014#3095..3198#3290..3448#4336..4404#4480..4548#4709..4846#4981..5061#5744..5872#6660..6804#7037..7179#7259..7384#8109..8165#8300..8398#8485..8707#9181..9425#10270..10383#ATGGGCGCATTTGGGTCTCAGTCCTCTGATGGGTACATCTCCATTAGCAAATATAATGGGTACTCTACGTTACAGTGTCTTTCAAATGTAGATGGGGGCTCAGGTAGATGTAATCAGCACGTCGTGTATGGTTTATTCCGGCTTACCTGTTTTGATCTGACTTACTGATTCGTTTATAAGAGTGAAATTGTGCGATTCTGGTGAGTCATTACTGGGCTGCATGCAATTGATGATGCTTTCCTTCATGATATACCCCTTTTACGATGGTTTCATTCAGGATATGTTCGTTTTGATCATTCACTTGTGTGTTCCATTCATTCATATTTCCCAACAGCTAAGTACTCTATTTGTTGTCTTGATTCGAGTTGATTGTTTGTTTGAATATCATTGCTCTCTTTTAACATCTGGTCTTTCGATCCATGTATAGAAGTCCAAATTAGCTTGGCTATTTTTTCTTTCTAATCTTGTTGACATATAATTTTTTCTTCCCCTTTTCAGTGTGCAAGTTCCTATTATTCTGTGGTGGAGCCATCTTCCACTACCCTGTTTTCAATTAAACCTTTGTAAAGTTGCTGCTCAATGTCAAGTGCAAAACCAGTGCTTGATCCTGCATTTCAAGGAGTTGGCCAAAAACCGTATCCTTCTTTAAATGCCTTTATGGTTTGTTTTAGTTGTCTTCTTTTAGAAATCTACGTACAAGAGTTTCTATCCTTTTATGCTGTTAGCCCCTTAATTAAAATATAGTGGCACAGAAATATGGAGGATTCAAGATTTTAAGCCAGTTCCTTTGCCAAAAGCAGATTACGGTAAATTTTACAATGGAGATTCATATATAGTTCTCCAGGTGATTTTTTTTATATTTACATTTTAGAAGAATCTTTCTGTTATCTCCACTATGGAAAGTTTCAATGATCTGTTCATTTTGTTTTGTAGACGACTTGCAGCAAAGGTGGTGGCGCCTATCTTTTTGACATCCACTTTTGGATTGGGAAAGATTCTAGTCAAGTACATTTTCTCTAACATCTCAAGTTTCATGTACTGATAAATGGCATTTCCAGCCCACTTCTTGATTTGATGTGTTCTCATTCAGGATGAAGCTGGGACTGCAGCAATTAAGACAGTTGAACTTGACACCATGCTCGGAGGTCGTGCAGTGCAGCACAGAGAACTTCAAGGCTATGAATCTGATAAGTTCCTATCGTACTTTAAACCATGCATTATACCCTTGGAGGGAGGTTTCGCCTCTGGGTTTAAAACACCTGAAGAGGATAAGTTTGAAACAAGGCTATATATTTGCAAAGGGAAGAGAGCTATCAGAGTTAAAGAGGTGACTACTATTTCACCTCCCTGTTTCTTAGACTACTTTATCTCCTCATGTTATATACACTAAATGTCCTATATTCAGGTTCCATTTGCTCGCTCGTCATTGAATCATGATGATGTATTTATCTTGGATACGGAAAAGAAAATATATCAATTCAATGGTGCAAACTCCAATATTCAAGAGAGAGCGAAAGCTTTGGAAGCGATTCAACATTTAAAGGAGACATACCACAATGGAGTGTGTGATGTTGCGATTGTTGGTATGCTCGACAACCAAATCTCAATTCATGTAACTTTCTGGCACAAATCTACACATTTTCATACAAAATTTTTGTGATAGATGATGGAAAATTGCAAGCAGAATCAGATTCTGGTGAATTCTGGGTTCTTTTTGGAGGTTTTGCACCAATAGGGAAGAAAGCTATATGTGACGATGATGTTGTTCTTGAAACCACAGCCCCCAAGCTTTACAGGTATGATTTTTTTTAAATTGCGCTTACAGAATTGTGAATCCAGATAGGACCCTTGTCTTTTAGTAATCAGATGCTCCAAACAACTTCATATTCTTGCCTTCCCTATGTATGGTACGCACTTCACGGTGAAGTTATTTTAGGGTGCGCTCATTGAAGAATTTCTGTGCCGAAAAGCATTGTTCTAACACATGATATGGCACGGACTAACTTCCTCCCTGATCATACACAGGCTGCTAAACTTCATATAAAACTCCAAAAATTTATCCATCAGTTGTGTGCAAGGCATGTGTATATTTATGTATTAAGATGATGCTATTTGAAAAGTGTCGATGCTAATTACATACATCCATTTTTAGGACTTCTTACTTCAACTTTATTACTTTTGGATTTCTGACAGTACATTAAGCAACTTCTGACATAATTTCAACGAATGTTCAGTATGCAGATACAACCATTTTAGCTGTATGTATTTGCAGCTTAATGTTACTGTAAATAGCTTCCTGTTTAGGTAGATACATTTTTACCAATAAATTGATTTGTCTTTTTCTGGTTGATGAAGGGTTTCATACCTTTTCAAAGGCTTCTCATAAGTTTAATAGTTTTCCCATGTTTTATATAGGTTTTCTCAGGTTTTTGGTAGTGTTGTATTGTAGCATAGACTAAATGGGTATCACAGTTTTAGTTGGTTTGCTATGCTTACTATATCCTTAGGTCTGAGACTATATATATATATATATATCGCTATGTTTATCTTACTTTTTTTTCCCAGTGGCTTAACTTTATTTTTGTATCCTGATTTTTTTCCATGCCATCAACTGCTTGCAGCATCAATAATGGTCAATTAAAGTTAGAAGACACAGTTCTGACAAAATCAATTCTTGAGAACAATAAGTGCTTTTTGGTCGACTGTGGGTCTGATTTATTTATATGGGTTGGTCGACTAACACAAGTGGAGGAGAGAAAAGCTGCAAGTGCAGCAGTTGAGGTAAGTCTCAAGCCATTGTTTTCTTCTTTTTTTTTTCTTGCCTATTCAAATTTGTTAGGATCTAAATTTGCCTTTGTAGGAATTCATTGCTACTCAAAATAGGCCAAAGACAACAAGAGTAACCCGAGTGATTCAAGGGTACGAGAATCATACATTCAAGTCTAAGTTTGAATCATGGCCAGTAAATAGTGCAGGAAGTGCTGGCGCTGAGGAAGGCCGAGGGAAAGTTGCAGGTTGTGTATATTGTTCATGTTCTCTGAGATAAAATAATTGACCCTTAGATCATTCTTGATAATATTTGCTTTTCCTATAGCTCTGTTGAAGCAACAAGGAGTTGATATCAAGGGAGCCTCAAAAAGCAGCGCTCCAGTAGACGAGGAAGTTCCTCCTTTGCTAGAAGGCGATGGAAAACTTGAGGTATATTTTATAAGCTTTCAGCAACTATAAAGGAAGACTGGGAAAATGCAATAATAGGAATGTAACCATAAGAAACATGTGGATATTTCAGGTTTATTGTGTCAATGGCAGTGCTAAGACTGCTCTTCCAAAGGAGGAGCTTGGAAAGTTTTACAGCGGAGATTGCTATATTGTTCTCTATACATATCATTCTGGTGACAAGAGAGAAGAATTTTATTTGACTTATTGGATTGGCAAGGACAGCATACCGGTAATGTACCTTCCAGTGCTCCCAAGCTTTAGAATGTACATCCTCCGTTTCACAATATAAGTCATTCTAGCATTTCCCACATTCGTATTGATGTTAATGAATATAGATACATATGTCTAGATTCATTAACATTAATATGAATGTGGGAAATGCTAGAATGACTTACATTGTGAAACGGAGGGAGTAGTTGGCAATATTATTCTTGAACTTCTATACTATAGTGCTTTCTTCTTACTTTGTCTGTGATCAACACAAAGTCCTGTCAATGCCATGTTATGTGTGTTCTCATCAAGAGCTTGACTTTTATGTCAAATAATCACCAGTTCTCATGTGCAATTAAATATTACTAGTCATCTCAGGTGAAAATAAATATTCCCTCTGTTTATTTATTTACAGAAGACGCCGTTGACTTTTGGACATTAATTTGACCATTGTCTTATTAAAAAATTACATAATTATCATTTATTTTGTTGTAACTTGTTTATCATTAAAAGTACTTAAGCATGACTTATATTTTTGCATATTGCACCTTTTTTTTTTTTTGAAAAAGATGAATAGTCAAATGTATGTCCAAAAGTTGACAACGTCATCTATTATAAAACGGAGGGAGTATCATCTTATGGGTGACAATTATCTCTTATACCATGTTGAATAGTATAGGGAGAGAGAAATACTGCAAATATTGGACAGATTGTATTGAGCCTTGGGGGGCGGTATATATAGGAGTACATGTAGAGGAGATAAGGAAGGATTTAGAGATAAGGAAGGAGTCCATACAAATCAATCCTATCCTATTATGACTCTAAGTACCATATACTCAACATTTTTGTCGCCTCATACCACTGTTGTGTGATCTGTGAACTTACTCTTTGGTTGATTTCATACAGGAAGATCAAGAGATGGCTTTCCAAACAGCTAATTCAATTTGGAATTCACTGAAAGGAAGGCCTATTCTGGTACTGTATTCCTACTATGACAATGTGGACAGATTTTCTGGAAAGGAGTTTGATACATTATATCTGGTGTTGTAGGGTCGTATTTATCAAGGGAAAGAACCACCACAATTTATTGCCCTTTTCCAGCCCATGGTCATTCTAAAGGTATGGTACTTGATCCTTACCATATTCATGTTAAATAGAATCAGTTGGTAATAGTGGGTGTTCTCTAAGGAACTAGGTGCGCACTGTCTATATAGCTGAACTGTAATGTCCAATCTCAATTCAAACAATATCAGTTAAGTGTATTTGGCATATTGTGCAGGGTGGAATCAGCTCTGGATACCAGAAATGT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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA012647