BGIOSGA013689

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA013689

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA013689, complete gene.

LocusTag

OsI_13807

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA013689-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA013689-PA

Length

10665

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:36911617..36922281

Sequence Coding Region

36911617..36911814,36911885..36911980,36912090..36912189,36912684..36912788,36912868..36913030
,36913236..36913356,36913866..36913946,36914048..36914094,36914222..36914372
,36914712..36914798,36915525..36915644,36915749..36915880,36915978..36916075
,36916154..36916277,36916361..36916468,36917057..36917192,36917986..36918096
,36918198..36918261,36918368..36918440,36918997..36919173,36919247..36919357
,36920050..36920220,36920312..36920467,36920829..36921062,36921176..36921343
,36921556..36921665,36921753..36922281

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:36911617..36922281 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:36911617..36922281 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGATCCGCTCAGGAGCTACCTCGGGAGGCTCCTCCTCGAGGAGATCACCCCGGTGGTGATGGTGCTCACCACCCCGCTCGCCGAGGCCGCCTGCCGCAAGAGCGGCCTCAGCGTCGTCGACATGCTCTCGCCGTTCTCCCTCTTCAAAAAAATCGACGGTGATTCACCTCCCCGATGCTCTCCGCTTCCGATAATTTGCCCGTGCGGACGGCGAGTGACCAGCCCTTACAGGCTGCAGATGTTTAAGATTCGGATGGTCTACGCTTCCGACGTCCGGAAGCAGGACTACGAGGTGGCGGATCAGAGGATCAAGCCAGTAGTTTCTGAGGCGAATGAGAGTGCTCTTCCAGATCTGCTTTCAGACCCACCACAGCTAGAAGATGTACTTAGCAAGCCTGAAGCTGAACTGTGCCCTTTGTGGATTAAGAAATTCAACAGAGCTCTGATGCGTACACTCTCATTTTCAGAGCATGAAACATTCGACCACCCTGTGGCATGTCTGTTAGTTGTATCATCAAAGGACAATGAACCAATCAGCAAGTTTGTTGATCTCTTCAACACAAATCAGTTACCTTCTCTTTTAAATGAAGGCATAATGGATCCCCAGATTCTTAAGCACTATCTTATACTTCATGATCAACAAGATGGACCACAAGAGATAGCTATGAACATTTTAGCGGAAATGAAGAGCACTCTTGGTTTGAATGATTGTAAATTGTTGTGTATTAATTCTTCTACAGAAGCAGATGGTGCAGATGCTGAGAATTCATGGTTACCTTATATAAAGGACTTCATGCAAGATTTGGCTTCTAATCATATAATTCCCTACATGGAGCAAAAGATCCGTGTCCTCAATCAGCAGGTAGCCACAACAAGGAAGGGCTTTAGGAATCAAATAAAGAACTTGTGGTATACGTTCACCTCCATAGAGTCACAGATTAGAGTTCTAGGTGACTATGCTTTCATGTTACGGGACTATGAGCTTGCTTTGTCCAATTATAGATTACTCTCAACAGATTATAAGCTTGACAAAGCTTGGAAGCGCTTTGCTGGTGTGCAGGAAATGAGTGGACTGTGCTATTTCATGTTGGACCAGTCAAGGAAGGATGCTGAATATTGCATGGACAGTGCCTTTAGTACATATCTGAGAATTGGATCTTCTGGGAAGAGAAATGCTACTAGATGTGGCATTTGGTGGGCAGAAATGCTTAAAACAAGAGGACAGTATAGGGAGGCATCAAGTGTATACTACCGCGTTTCTAATGAGGAACCTTCATTGCATTCTGCTGTACTGCTTGAGCAAGCCGCTTGTTGCTATGTGTTATCTAAACCACCTATGCTTCGGAAGTATGGATTTCACCTAGTGTTAGCTGGAAATAGTTATTACATATCCGATCAGAAGCAACATGCTGTTCGGGCATACAGAAATGCTCTGTTTGTTTACAAACAACATCCTTGGAGTTATATCAATGATCATGTACATTTTAATGTTGGAAGGTGGTATGGAGTCCTTGGGATATTTGATGTAGCCATAAAGCACTTGCTGGAGGTCATTGCTTGCAGCCATCAGTCCCTGACAACGCAAAGCATGTTCCTCAATGATTTTTTCCATTTTGTTCAGAGTATGGGGAAGAAATTTGATGTCTACAAGCTTCAACTTCCTGTTATCAACATGCCATCACTCAGAGTTATATATGAAGATCATCGTACTTATGCATCAGATGCAGATGTTAATGTTAGTGAAAGCATTTGGCAGGAGCTGGAGGAAGAAATGATCCCATCATCATCTATTGTTAGAACTAACTGGCTTGAAAAATCTCCTGACTTGAGAAAATACAAGGATTCCTGTGTTTGTGTTGTGGGAGAAGCAGTAAAAGTGAGGATTGAGCTTAGGAACCCTCTACAAATTCCTGTTGCTGTTTCTTGCATCTCTCTAATATGTCAGCTTTCCACCAGTTTGGACGCTTCAAGTGCTGTCAATAGTGTGCTGACCACAGGTGCTGGGGAAGATATAGCTAACACAAAGCCTGCGATATCAATATTTGAGGATGATGGAAATAATTTCACAGTTTCAAAGCTGGACATTGTGTTAGGAGGAAGTGAAACTAAAAGTGTACAACTTGAAGTTACTCCAAAAGTTGAAGGTATTCTGAAGTTACATGGGATAAGGTGGACGCTCTCAGATTTATTAGTTGGCTATCAATACTTTGAATTTGACACAAAAAGGAAAACTAAGAAAGGGAAAAAGGGACCTCGTCGTACTTTGAGCAACACCCTGATTGTAATCAAGGGTTTACCTAAACTTACGGGGTGTATTGATCACTTGCCAACAAATGCGTTTGCTGGAGATTTACGGCTACTCAAGCTGAATCTGAGGAACCAGTCAGAATATGCTGTGAAGAATATTAAGATGAAGCTTAGCCATCCAAGATTTGTAATTCCTGGTGATTTATCAGAAGTTGATTTCGAGTTTCCCCAATGCTTAAGAAAGCATGTACAATCAGAAATTAGTACTGTATCGACAAAACGTACTCAGGGAGATGCCAAGGGTTTGCTCTTTACATTTTCTCAAGATATTAAAATTCAAGAAGGAGCCACGTTCTCCTGGCCTATTTGGTTCCATGCTGCAACTCCTGGGAACTTTTCTCTTTATATATCTCTGTATTATGAAATGGAGAGCCCAAGTGAGATAACTTATAGAACATTGCGCATGCACTACAATATTGAGGTTTTTTCATCACTTAATGTGTCCTTTGCTATAAGAATGTGCTCATCAAGATTGAAAGAGTATATTGTGCGCATGGACATCCTGAACAGGACTCCCTCAGAGTCATTTATTCTTCATCAGTTGTCATGCAATGACAGTAAATGGGCAATTTCATCGTTGCCTTTGTGCGATTCTATCCGCTCTATTGAAACAGTATCAGCAAATCAGTCTGTGTCGTGCTTCTTCAAGATAAAGGATTTAGGTACAAATTCTTGTAAAGAAGCTGAAAACAGTTCTTGTAGAAGTGATATGCTTTTTTTATCTCGTGAGGGCAACAGCAATACTGAGGAGTTTGATGTTTCCCAATCTCCTATTACCAATTTCCACTATCAAGAGAGATACCAACAGGGAAGGTTGGCTAAGGGACCACGGGACCTTCTTGATTTTATTCTGATCTCGAAAGCAGTAGGTGGTAACTATTCCAAGTCAGATCCAGACGTTCAACTACTCTCTCATCATGTGTGCCATTGCAGTGCTATCGACCAGAGTCCTATATGGTGGTTTATGGAAGGGCCTAGAACAGTTACTCATGATTTCTCAAAGTCTTACTGTGAAGCAAACATCCAGTTGGTAATTCATAATTCTGTGCAACATAATATTTCAGCGAGAGTAGTTACCTATGACAGCGTGCCAGATAAAAGCCAAACTGTCAATTTGCAAGATTCTAATAGTAATCAGGGTGGATGGTATGATGTATCGCTGGAAAATGACATTAAAGCTATCTCTACTGCCAAGGGGACACATTATCAGAAACAGCCATCAGAGAGCATTTCACCTTTTGTTTGGTGTTCATTGAGTTCTGCTCAAGTTGACCTGAAACCTGACACTTCCACTAAAGTTCCTCTAAAAGTGTGCATATTTATGCCTGGAACATACAATCTTTCGAATTATCAGCTACAATGGAAAGTGCATTCATCCGAGGTAGGACAGGTGGATGAAAATCAAAGATCCGGTGGTGGCCAAGGGCATCCTTTTTATGTCACTGTTCTTCAGGATGCTTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDPLRSYLGRLLLEEITPVVMVLTTPLAEAACRKSGLSVVDMLSPFSLFKKIDGDSPPRCSPLPIICPCGRRVTSPYRLQMFKIRMVYASDVRKQDYEVADQRIKPVVSEANESALPDLLSDPPQLEDVLSKPEAELCPLWIKKFNRALMRTLSFSEHETFDHPVACLLVVSSKDNEPISKFVDLFNTNQLPSLLNEGIMDPQILKHYLILHDQQDGPQEIAMNILAEMKSTLGLNDCKLLCINSSTEADGADAENSWLPYIKDFMQDLASNHIIPYMEQKIRVLNQQVATTRKGFRNQIKNLWYTFTSIESQIRVLGDYAFMLRDYELALSNYRLLSTDYKLDKAWKRFAGVQEMSGLCYFMLDQSRKDAEYCMDSAFSTYLRIGSSGKRNATRCGIWWAEMLKTRGQYREASSVYYRVSNEEPSLHSAVLLEQAACCYVLSKPPMLRKYGFHLVLAGNSYYISDQKQHAVRAYRNALFVYKQHPWSYINDHVHFNVGRWYGVLGIFDVAIKHLLEVIACSHQSLTTQSMFLNDFFHFVQSMGKKFDVYKLQLPVINMPSLRVIYEDHRTYASDADVNVSESIWQELEEEMIPSSSIVRTNWLEKSPDLRKYKDSCVCVVGEAVKVRIELRNPLQIPVAVSCISLICQLSTSLDASSAVNSVLTTGAGEDIANTKPAISIFEDDGNNFTVSKLDIVLGGSETKSVQLEVTPKVEGILKLHGIRWTLSDLLVGYQYFEFDTKRKTKKGKKGPRRTLSNTLIVIKGLPKLTGCIDHLPTNAFAGDLRLLKLNLRNQSEYAVKNIKMKLSHPRFVIPGDLSEVDFEFPQCLRKHVQSEISTVSTKRTQGDAKGLLFTFSQDIKIQEGATFSWPIWFHAATPGNFSLYISLYYEMESPSEITYRTLRMHYNIEVFSSLNVSFAIRMCSSRLKEYIVRMDILNRTPSESFILHQLSCNDSKWAISSLPLCDSIRSIETVSANQSVSCFFKIKDLGTNSCKEAENSSCRSDMLFLSREGNSNTEEFDVSQSPITNFHYQERYQQGRLAKGPRDLLDFILISKAVGGNYSKSDPDVQLLSHHVCHCSAIDQSPIWWFMEGPRTVTHDFSKSYCEANIQLVIHNSVQHNISARVVTYDSVPDKSQTVNLQDSNSNQGGWYDVSLENDIKAISTAKGTHYQKQPSESISPFVWCSLSSAQVDLKPDTSTKVPLKVCIFMPGTYNLSNYQLQWKVHSSEVGQVDENQRSGGGQGHPFYVTVLQDA</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..198#269..364#474..573#1068..1172#1252..1414#1620..1740#2250..2330#2432..2478#2606..2756#3096..3182#3909..4028#4133..4264#4362..4459#4538..4661#4745..4852#5441..5576#6370..6480#6582..6645#6752..6824#7381..7557#7631..7741#8434..8604#8696..8851#9213..9446#9560..9727#9940..10049#10137..10665#ATGGATCCGCTCAGGAGCTACCTCGGGAGGCTCCTCCTCGAGGAGATCACCCCGGTGGTGATGGTGCTCACCACCCCGCTCGCCGAGGCCGCCTGCCGCAAGAGCGGCCTCAGCGTCGTCGACATGCTCTCGCCGTTCTCCCTCTTCAAAAAAATCGACGGTGATTCACCTCCCCGATGCTCTCCGCTTCCGATAATTGTGTGTGTGACGCTTGTCGCATTTCATTCGATTGGGTTCTGTGACCTCATGGGGAATCCCCTGTATGCAGTGCCCGTGCGGACGGCGAGTGACCAGCCCTTACAGGCTGCAGATGTTTAAGATTCGGATGGTCTACGCTTCCGACGTCCGGAAGCAGGACTACGAGGTGATTCTCGAACTTTCTGGAAGCTTCTGGGTTGTGCTGTTGGCTTGGTCAGTATGGATGCCTATAGGTTTATAGAATCTCTTGATGGACATTGGCTGTTTTGGAGCAGGTGGCGGATCAGAGGATCAAGCCAGTAGTTTCTGAGGCGAATGAGAGTGCTCTTCCAGATCTGCTTTCAGACCCACCACAGCTAGAAGATGTACTTAGCAGTGAGATCCCTTACTGCTTCATTTTGTTATGTTCTCACCTGTGGGCATATTTACTTTGAGCAAAATTATGGAGCCGTAGTTGGAATTCTATGGATCACTTAAAGTAGCGTAATCCGATCACCTTGACATTAGAAGCAAACTGTGACTTACTATGAGCAGCAATAATCTTCTATTCAGATTGTTTAATTTGCAGAATAATTTTAGGTTATAATTTTGCGCTGGTAGTGGAAGTATCTTTACAAAGTGATCATACCAAACGAGCGTGTGCATTATATTTTGGATAGCTCAAAGTTCCTGTAAATGGTGTGAATATGCGATGTGTTTCTCAGTGGCTGTGAGTGTAAATAACAAGGGATATTTGGGTGGTTACAAACATAGTGTTTCTTTGCCTTCGTCATGTCTTAGAGTTGATATGAAACTGAAATAATAGTATTATTGTTTGCTGTTTGTTCGGTGCATCTTACATATGGTTCTTTCTTTGCTCTTGATTCCAGAGCCTGAAGCTGAACTGTGCCCTTTGTGGATTAAGAAATTCAACAGAGCTCTGATGCGTACACTCTCATTTTCAGAGCATGAAACATTCGACCACCCTGTGGCATGTGAGATTTGGAACTTTCGTCTTATTTGGTGTTTTTTTTAAGGATATGTTCTTGCTCATGCTTTGACTATTGTTAACAGGTCTGTTAGTTGTATCATCAAAGGACAATGAACCAATCAGCAAGTTTGTTGATCTCTTCAACACAAATCAGTTACCTTCTCTTTTAAATGAAGGCATAATGGATCCCCAGATTCTTAAGCACTATCTTATACTTCATGATCAACAAGATGGACCACAAGAGATGTATATTCTTCACTCAGTTATTATGTTTACATTAGTTCTTGCATAGCCTAGCAACCTGTTACTAATGAACATGTTCTCTCAGTTTTATAGTGTTCTCTAGCCAAACAATGATATAATGTCATATGCCAAATGCCAACATTTTACAGTGTCATGTATGCAATTTTCCCCTTCTTTTTTGCTGACCTTCTTTTTTCTTTTGGTGAAGAGCTATGAACATTTTAGCGGAAATGAAGAGCACTCTTGGTTTGAATGATTGTAAATTGTTGTGTATTAATTCTTCTACAGAAGCAGATGGTGCAGATGCTGAGAATTCATGGTTACCTTATGTAAGTACAGAGAACTACTTCAGATTAAATTGCATTAGTGTTTACGTAGTGCAGCCGATATGCAATCTAGTTACAGTATTTTCTTGACTAAACTACAGAAATCTCATGGTTTGCACAACCAAGACGGAGCTTGTTGGCTTAACACGGATGATTTGAATGAGGTATTGCCCCATTTGATGAATATCATGTCATCTGCTTATCCGTCTTCTTGGGCATATTGAATGTCATGAAACCATTGTCCAACATTTTGTAGCACCTAATGATTCATCTGTTCCCTGGTAGGTATTGTTGGGAAGATTAGTAGCCTACTTGGTAGTTATTACTCAGTGTATGCAAGGTTTTCATGGGTATCGATGCTAAGAATACAAAATGAATATTTCTCGCAGATGTATGGTATTAGATCAATGAACTTTAGTTATTCCTCTGTAGTATCCAGTGTCACATGCAATTATTGATTTCTGAGAGCCAACCCATACAAGATACTTACTAGATAAGCCGTTTTTTTTCAGATAAAGGACTTCATGCAAGATTTGGCTTCTAATCATATAATTCCCTACATGGAGCAAAAGATCCGTGTCCTCAATCAGCAGGTATTTTCTTTATTCCATTACTTTTTTTTTACCTCTCTCAACAAGATTAACCATTCTGTTTTTGAAAATAATAATAATAATAATATTAAGCATTTTTCTAGGTAGCCACAACAAGGAAGGGCTTTAGGAATCAAATAAAGAACTTGTGGTGGAGAAAAAGAGATGATGTTCCAGAAGCTGCAAATGGCCCAATGCAAGTGGTTACTTACATCTTGCCCTTTTCCCTATATAAAAATTCTGTAGTTTGCTGTAACACTTTTTTTTTTCTTCAACAGGTATACGTTCACCTCCATAGAGTCACAGATTAGAGTTCTAGGTGACTATGCTTTCATGTTACGGGACTATGAGCTTGCTTTGTCCAATTATAGATTACTCTCAACAGATTATAAGCTTGACAAAGCTTGGAAGCGCTTTGCTGGTGTGCAGGTGCTTTATACTTGTTTTAACTTCTTGCCTTGATTTACATATGACATTACTTATGTAGTGTTGTTGAGTTTGAAATAAAGTAGCAATCAAGGTGGCGATTCTTAAGGAATATCCTGGGACCAGCTACGTTAACAGCCTAACATACTTTTCACCTCAAACACGAGTTTAGACCTTCTTACTTGTACACCATATCAGAATCATACTGTATGCTTCCAAATTTAAAGCACATGGTTCCTGAATTTGTTTTGATGATTGATTGAGTACTGAATCAAGCTTGAGTGCAGTGGCCAAATATTCAAGTAGGTAGTCACTTCATGATAATGTCTGTGTCTTTTGCAGGAAATGAGTGGACTGTGCTATTTCATGTTGGACCAGTCAAGGAAGGATGCTGAATATTGCATGGACAGTGCCTTTAGTACATATCTGGTATTCATCTCTATGTCCACTTCTAGTTTCTCAGACTAAATTAAATGGTTCTCTTTCTAAATTGTAACCTAACATGCTAGCTCCATCGATATAAATTTGTGTTCTGTGTACTGTCCAATATGTCATACACAAAGAGAAAAGGAGTTCCTATTTAGTTTTGTATGAAGCAGTTTTCCATGTCTATTAAATACAGTTGCATCTGATTTTCAGGACTATTGATATTAACATTGACTTAGCAAGGAGTGATCATATGTCATTGATCTTACTGCGCAAATGCTAGTCTGTTGCATTGTTTTATAGTCATTCATATGATATCAACAGTAGACTCAGTTAATTTTATGGAGTTCCCCAGTCATTAAATTCCTGTGTGCTCTGTTCTTACCCGAATTAGTGCCATGCTTCACCTAGCACTGTTCTAATCCAAGTTGTCATTGGTGGCATCTCTAGGATAGATGACTTCCTTTATTCCCATTATTTTTGGGAGCTGATAGTTGGGTGTGCTTTGTGGCATATAATCAAGAATGCGTGAAACTAGATATCAAGAATTGAAGAATTCATAATTTGCGATTAAGGGCTATAAAGGGGCAGGATGATTCCAAATAATTAATGCTACTCTTATGTGTAATTTCAACTTTTGAAGTTAATTAAATTTGGAATGATTGATATCCTTCGTGCTTCTCTGTTCTCTCTTGATATTGCTCTCGTTTATTCTATTCATATTTGTAGAGAATTGGATCTTCTGGGAAGAGAAATGCTACTAGATGTGGCATTTGGTGGGCAGAAATGCTTAAAACAAGAGGACAGTATAGGGAGGCATCAAGTGTATACTACCGCGTTTCTAATGAGGTAGATCTAGCATCAAGCATACATTGATAAAATTTTACTCATATTTTTTGCAGGAAGAATTTTTAGTTTATTACACAACATTGATGGAATTTTCTAATGTTCAGGAACCTTCATTGCATTCTGCTGTACTGCTTGAGCAAGCCGCTTGTTGCTATGTGTTATCTAAACCACCTATGCTTCGGAAGTATGGATTTCACCTAGTGTTAGCTGGAAATAGTTATTACATATCCGATCAGGTGTACTATAATTATATTTACTGCTGTGATATTTAATTAATGCTTTAGAAGTATATTATATCTTTGTTGAGTCTGAAAATTCAATCTTTGAGTGCAGAAGCAACATGCTGTTCGGGCATACAGAAATGCTCTGTTTGTTTACAAACAACATCCTTGGAGTTATATCAATGATCATGTACATTTTAATGTTGGAAGGTAGTTGTGTGTTTTAGCTCCTATCCATATATTTTTCTTGTCTATAAACTATTATTAACTCTGGTGACTGTAAACTAGGTGGTATGGAGTCCTTGGGATATTTGATGTAGCCATAAAGCACTTGCTGGAGGTCATTGCTTGCAGCCATCAGTCCCTGACAACGCAAAGCATGTTCCTCAATGATTTTTTCCATTTTGTTCAGGTTCTTGACCAGCTCCATTTGTGCTCTCATTTT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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA013689