BGIOSGA006432
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA006432 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA006432, complete gene. |
| LocusTag |
RAD50 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA006432-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA006432-PA |
| Length |
15612 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:18772936..18788547 |
| Sequence Coding Region |
18788425..18788547,18788232..18788318,18787702..18787869,18786364..18786539,18786068..18786182 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:18772936..18788547 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:18772936..18788547 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGAGCACGGTGGACAAGATGCTGATCAAGGGGATCCGGAGCTTTGACCCGGAGAACAAGAACGTCATCACCTTCTTCAAGCCCCTCACCCTCATCGTCGGCCCCAACGGCGCCGGCAAAACCACGATCATCGAGTGCCTGAAGCTCTCCTGCACCGGCGAGCTGCCCCCGAACTCCCGCTCCGGCCACACCTTCGTGCACGACCCCAAGGTGGCAGGTGAGACGGAAACAAAAGGGCAGATTAAGCTGCGGTTTAAGACAGCAGCAGGAAAGGATGTGGTGTGCATCCGCTCCTTCCAGCTTACCCAGAAGGCATCAAAAATGGAGTTTAAAGCAATTGAGAGCGTCCTCCAGACTATAAATCCACACACGGGCGAGAAAGTCTGCCTCAGCTACAGATGTGCTGATATGGATAGGGAGATTCCAGCTTTAATGGGTGTATCAAAGGCTATACTGGAGAATGTTATATTTGTGCACCAAGACGAGTCCAATTGGCCTTTGCAGGATCCATCGACACTCAAGAAGAAGTTTGATGATATCTTTTCTGCGACCCGCTATACCAAAGCTCTCGAAGTCATAAAAAAACTTCACAAGGATCAAGCACAGGAAATCAAGACTTTTAGGTTAAAGTTGGAGAACCTTCAGACTCTAAAAGACCAAGCATATAGGCTCCGTGACAATATTGCTCAAGATCAAGAGAAGTCAGATGCCTTAAAAATTCAAATGGAGGAACTGAGAACAAATGTTCAAGGTGTTGAAGACAAAATTCGTCGTACTGAAAAAAGTTTAGCTGACTTGAGGAGGCTTCAACAGGAAATTAACTCCAGTACATCTGCTAGAACTACATATTTTACACTTCAGCAGCAACAGTATGCTGCTCTTTCTGAGGAAAATGAAGATACCGATGATGAACTAAAGGAGTGGCAAACGAAATTTGAAGAAAGAATGGCATTGCTGCAAAATAAGATCAGTAAACTAGAAAGAGATGTGGATGATGAAAATACAACAAGCTCCTTCCTTTCCAAGGCCATAAATGATTTGATGCGAGAAACAGGAAGGCTCCAGGCAGAAGCCGACGCTCACATGTCAGTGAAACACGAACGGGATTCAGCAATCAGAAAGATCTTCACCAAACATAATCTTGGGCCAATACCTGATGCTCCTTTAACTGATGCTGCTGCCATGCACCTTACAAACATAACTAAAGCAAAACTGTCAAATCTTAATGATGATTTGCAGGATAAGAAGAAATCTAATGAGGCACAGAAACAGTTTCTGTGGGGACGCTATCTTGAAGTAAATACTCGCTACTCTGAAGTTGTTGGCCAGATAGAATCTAAGGTTGCCTCCAAGAAAGGTATTTCAAGGCGCATGAAAGATAAAGAGAGTGAACGCGATGCCGCGGAAATGGACCTCTCAAAGTACAATCTTCCCCGTATTGATGAAAAGGAGAAACATCTGCAAATTGAAGTTGAAAGGAAAGCACTTGCGCTGGGAGAAAGGAACTATGATTCAATTATAAATCAGAAGCGCACAGAGATATTTAGCTTGGACCAGAAGATAAAAACACTTCAGTGGGAAAAAGACAGCATTATTAGTGATTCCAATGACAGGGTACTACTAGACGTGAAGAAGGATGAATTGGAAGAAACCAAGAAGAAACTTAACAAGATATATGATGAGCATAAGGACAAAATCAGAAGTGTGTTTAAAGGGAGGATTCCTTCTGAGAAGGAAGTCAAGAAGGAACTTAGTCAAGCCTTTGGGTCTGTAGACAGAGAATACAATGATCTGAACTCAAAATCCCAGGAAGCAGCGCAAGAGCTGAAACTGGTACAGATGAAAATACTTGATGCTAGGAGCCACTTGTCAAAGCTTCAAAAGGAATTGGATGCAAAGAGAAGCTATGTGGAGTCCAAACTTCAATCCATTACGAAGATGTCTGCTGACATTAACATGTTTCCCAAACATCTGAAAGATGCCATGGATGAAAGAGAGAAACACAAAAACAATTTAAGTTACGCGAAGGGAATGCGGCAAATGTATGAGCCTTTTGAAAATTTGGCTCGTGAGCTCCACATGTGCCCTTGCTGTCAACGTGCTTTCACACCTGATGAAGAGGATGAATTTGTAAAGAAGCAAAGGACAACGTGTGAAAGTACTGCAGAGCGCATGAACAAGATCTCATTTGAATGCTCAAATGCTGAAGACTTTTTCCAGCAATTGAATAAACTCAATGCAACTTATGAGGAATTTGTGAAGCTGGGAAAAGATGCTATACCTCTAGCAGAGAAGAACTTGAAACAACTTTTGGCGGATGAAAGTGAGAAGGCACAAACATTTGATGATTTTGTCAGTGTTCTTGCTCAAGTTAAAATGGACAAGGATGCAGTGCAGGTATTGCTACAGCCAGTTGAAGTGATTGATAGGCACGTACAAGAAATACAGCAGTTAGGACCACAAGTTGAAAATCTTGAATATAAGCTTGATGTTCGTGGCCAAGGTGTTAAATCTTTGGAGCAAATCCAGTTGGAGTTGAACTCTCTGCAGAGGACAAGGGACACATTGAACAATGAAGTGGATGATCTAAGGGATCAACAAAGAACACTTACCGATGGTCTGACTAATGCTCAGATGCGATGGCATGATATTAGGGAAGAGAAGCTAAAAGCTTCAGGTGCAGTGCACAAATTTCAAAAAGCTGAAGAGGATTTGGGACATCTAGCTGAGGAGAAAGAAAAACTAACATTAGAAGAGAAGCATTTAGAGGAGTCTCTTGGTCCGTTGTCAAAAGAGAGAGAAAGCTTGTTGCAAGAGCATGAAGCTTTGAAGGAAAAGCTTGACCAGGAGTATCATCAGCTGGCAGAAAGAAAAAGGGAATTCCAGCAGGAAATTGATGCACTCGAGACACACAATGAGCGTATCAAAGGGTACCTGAATTCAAAGAAGGGCGAGAAGCTTAATGAACTACAGGAAAAACATACTCAATTGCAGTCTGATCTACATAAAAGTAAGGAAAGAAAAGAAGAAAAATCGGCGGAGTTAAGCAAGAACAAAGAGCTATTGAAGAGCCAAGATCAGTTGAAAAGAAACATTGATGACAACCTTAACTACAGGAGAACAAAGGCTGAAGTGGAACGACTTACTCATGAAATAGAATTACTTGAGGACAAAGTACTTTCCATTGGCAGCCTGTCTACTATAGAAGCGGATCTTAAGCAATATTCACAAGAAAAAGATAGGCTTCTTTCAGAGTATAATAGGTGTCAAGGAACGCAGTCCGTTTATCAAAGTAATATTTCAAAACACAAGCTTGAACTTAAACAGACGCAGTACAAGGATATTGAGAAGCGATACTTTAACCAACTTCTTCAACTAAAGGTTGATGGCATGAATGCCCAGACAACTGAGATGGCAAACAAGGACTTGGACCGATACTATGCTGCTTTGGATAAGGCTCTTATGCGGTTCCACACCATGAAAATGGAGGAGATAAACAAAATAATCAAGGAACTGTGGCAACAGACATATAGGGGCCAAGATATCGACTATATAAGCATTAATTCTGACTCTGAGGGTGCTGGCACGCGATCATACAGCTATCGTGTTGTCATGCAAACAGGTGATGCTGAGCTGGAAATGCGAGGGCGCTGCAGTGCCGGCCAGAAGGTGCTTGCGTCGCTTATAATCAGACTGGCACTGGCAGAAACATTCTGTCTGAACTGTGGCATATTAGCTCTAGATGAGCCGACCACTAATCTAGATGGGCCTAATGCAGAGAGCCTTGCTGGTGCCCTTTTGAGAATAATGGAGAGCAGGAAAGGGCAGGAGAACTTCCAGTTGATTGTGATCACCCATGACGAGAGGTTTGCTCAGCTTATTGGTCAGAGGCAGCTCGCCGAGAAATACTACCGAGTCTCCAAGGATGAACACCAGCACAGCAAAATCGAAGCCCAGGAGATCTTTGACTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSTVDKMLIKGIRSFDPENKNVITFFKPLTLIVGPNGAGKTTIIECLKLSCTGELPPNSRSGHTFVHDPKVAGETETKGQIKLRFKTAAGKDVVCIRSFQLTQKASKMEFKAIESVLQTINPHTGEKVCLSYRCADMDREIPALMGVSKAILENVIFVHQDESNWPLQDPSTLKKKFDDIFSATRYTKALEVIKKLHKDQAQEIKTFRLKLENLQTLKDQAYRLRDNIAQDQEKSDALKIQMEELRTNVQGVEDKIRRTEKSLADLRRLQQEINSSTSARTTYFTLQQQQYAALSEENEDTDDELKEWQTKFEERMALLQNKISKLERDVDDENTTSSFLSKAINDLMRETGRLQAEADAHMSVKHERDSAIRKIFTKHNLGPIPDAPLTDAAAMHLTNITKAKLSNLNDDLQDKKKSNEAQKQFLWGRYLEVNTRYSEVVGQIESKVASKKGISRRMKDKESERDAAEMDLSKYNLPRIDEKEKHLQIEVERKALALGERNYDSIINQKRTEIFSLDQKIKTLQWEKDSIISDSNDRVLLDVKKDELEETKKKLNKIYDEHKDKIRSVFKGRIPSEKEVKKELSQAFGSVDREYNDLNSKSQEAAQELKLVQMKILDARSHLSKLQKELDAKRSYVESKLQSITKMSADINMFPKHLKDAMDEREKHKNNLSYAKGMRQMYEPFENLARELHMCPCCQRAFTPDEEDEFVKKQRTTCESTAERMNKISFECSNAEDFFQQLNKLNATYEEFVKLGKDAIPLAEKNLKQLLADESEKAQTFDDFVSVLAQVKMDKDAVQVLLQPVEVIDRHVQEIQQLGPQVENLEYKLDVRGQGVKSLEQIQLELNSLQRTRDTLNNEVDDLRDQQRTLTDGLTNAQMRWHDIREEKLKASGAVHKFQKAEEDLGHLAEEKEKLTLEEKHLEESLGPLSKERESLLQEHEALKEKLDQEYHQLAERKREFQQEIDALETHNERIKGYLNSKKGEKLNELQEKHTQLQSDLHKSKERKEEKSAELSKNKELLKSQDQLKRNIDDNLNYRRTKAEVERLTHEIELLEDKVLSIGSLSTIEADLKQYSQEKDRLLSEYNRCQGTQSVYQSNISKHKLELKQTQYKDIEKRYFNQLLQLKVDGMNAQTTEMANKDLDRYYAALDKALMRFHTMKMEEINKIIKELWQQTYRGQDIDYISINSDSEGAGTRSYSYRVVMQTGDAELEMRGRCSAGQKVLASLIIRLALAETFCLNCGILALDEPTTNLDGPNAESLAGALLRIMESRKGQENFQLIVITHDERFAQLIGQRQLAEKYYRVSKDEHQHSKIEAQEIFD</aaseq> |
| Gene Sequence |
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