BGIOSGA006445

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA006445

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA006445, complete gene.

LocusTag

OsI_07280

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA006445-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA006445-PA

Length

9563

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 2

Location

Chromosome 2:18542206..18551768

Sequence Coding Region

18551747..18551768,18551603..18551668,18551263..18551433,18550652..18550783,18549397..18549536
,18547676..18547762,18547403..18547525,18545987..18546130,18544347..18544448
,18542678..18542848,18542498..18542577,18542206..18542245

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:18542206..18551768 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:18542206..18551768 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGCCGCATTTCGTACTGGGCCCCGGCGTACCGCAGCAGCTGCTCATCCAGTCGGCGGCCGCCGGCGACCTCCCCGCCTTCAAGAAGTTTGCTCGTATGCTGGACGGCGGGAAGGGGCGGCTCAAGGAGGCGGTGGAGGCCGTGAAGAACCGCGGCGCTGGGGCTCTGCACCAAGCCGCCCGCTACGGGAGGACCGCGATGTGCGCGTACATGGTCGAGGAGCTCCAGGTGGACATCGACGCCGCCGATGAGTTAGGCGCTACGCCTCTTGGTTATGCAATTTATGGTGGGATTGTGGATACTGTGAGCTATCTTCTTGATCATGGTGCAAATCCAGATAAGCCAAATGAAAAAGGGTGTACCCCTCTCCATCTAGCAGTTGAACAAGGACATTGCGAGATAGTAAAGGTCTTACTGGTGAAAGGTGCTAATGTTGATTCGTCTTCTGACCATGGGACACCACTGCATGTTGCTGCCTCAAAAAGTCAGGATGGTTGTATGAAGATTTTGTTGGACCACCATGCAGATTGTAACAAGACATTCTCTACAGTTTGTACACCTCTCATTGCTGCGATGATGGGTCGCTCACTGAAATGTTGTAAGCTTTTGATTGAGGCTGGTGCTGATGTTAAGGGTGTTGGTACTTTTACCCCCTTAATAGTTGCTGCAACTGAAGGCTTAACTGATTTCTATAAGTGCTTACTGGAGGGTGGTGCTGATCCTGATGTGCCTGATAAATTTGGGTTTCTGCCCATAGAAATTGCTGCACGTCAGAACAGGAGGAAAGATGTGGAGATCCTACTTCCAGTAACTTCTCGTATTCCATCTGTGCATGATTGGAGTGTTGATGGGATGATTACTTATGTAAACAAACAGGTGGAGGTTGACCCTTTCTTCAAAATAAGACCAGCTGATCTGAAGTTGGAAGGAAATAGGGCATACATGAGAAAAGACTATCTTACTGCCGCAAAACTCTACAATATGGCGATCGAGCACGACCCTGAAGATATGACCTTGTACTCTAACACGAGCGTTTGCTGGCTTAAGATGGGTAAAGGAATGAATGCTTTGGAAACTGCTCAAGTTTGCAGGATATTGCGCCCTGATTGGCCCAAGGGCTGCTACAGGGAAGGGACCGCTCACATGTTCTTGAAGGACTATGAAAAGGCCTGCAATGCATTTCTTGATGGTTTCAAACTGGACCCAGCGAATATTGAGATTGAAAATGCGCTACGGGAGGCTTTGAAATCATTGAAGGCGTCTCGTGCTGCTTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAPHFVLGPGVPQQLLIQSAAAGDLPAFKKFARMLDGGKGRLKEAVEAVKNRGAGALHQAARYGRTAMCAYMVEELQVDIDAADELGATPLGYAIYGGIVDTVSYLLDHGANPDKPNEKGCTPLHLAVEQGHCEIVKVLLVKGANVDSSSDHGTPLHVAASKSQDGCMKILLDHHADCNKTFSTVCTPLIAAMMGRSLKCCKLLIEAGADVKGVGTFTPLIVAATEGLTDFYKCLLEGGADPDVPDKFGFLPIEIAARQNRRKDVEILLPVTSRIPSVHDWSVDGMITYVNKQVEVDPFFKIRPADLKLEGNRAYMRKDYLTAAKLYNMAIEHDPEDMTLYSNTSVCWLKMGKGMNALETAQVCRILRPDWPKGCYREGTAHMFLKDYEKACNAFLDGFKLDPANIEIENALREALKSLKASRAA</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..22#101..166#336..506#986..1117#2233..2372#4007..4093#4244..4366#5639..5782#7321..7422#8921..9091#9192..9271#9524..9563#ATGGCGCCGCATTTCGTACTGGGTGAGCAAGCAGCCCGAAACCCTAGCTTCACCTACCTGCCCGCGGGCTAACCATTCCTCCTTCTCCCTCCCCTTGCAGGCCCCGGCGTACCGCAGCAGCTGCTCATCCAGTCGGCGGCCGCCGGCGACCTCCCCGCCTTCAAGAGTGCGTGCTCGCTCCGCCGGCCGGGCCCCTTCCTCCGCTGCTTTTTCGCTGTTTTTTTTAATCCCTTTTTGGATTGCATGGTTTAGCTGCGTTTTGGTGCTCGATCGGGAGCTGATTTGGGGGTTGGGATGTGTGTTTTTTTTTTCCTTTATCCCCGATCCGCTCGCAGAGTTTGCTCGTATGCTGGACGGCGGGAAGGGGCGGCTCAAGGAGGCGGTGGAGGCCGTGAAGAACCGCGGCGCTGGGGCTCTGCACCAAGCCGCCCGCTACGGGAGGACCGCGATGTGCGCGTACATGGTCGAGGAGCTCCAGGTGGACATCGACGCCGCCGATGAGTTAGGTGATCTCTTCGCCTCCTCGTTTCGTGGAAGAGGAATCCCCGTTTTTTTCCCTTTTTTTTTAAATTTTTTTTATAGATTGAGGTCTTAGTTGCGCCTCCGTGAGTTGGAGGCTTTGCAAACACTACAGCCGTACAGTCGATTCTCGGAGTTTGGGGTTAGTTGGATTTACGTTACTTTGACGTGCTTAGTTCAACCGAAAGAGTTACTAGTACTGTTACAGGCATAACGCAACTCGATGAAGTAATTAAATTGAGCAGGTAATTTCTTAATTCTGATGAATCATCTTTAAAAACTTATTATTTTAGTTTTGTTCTTTTGGCGCTTATCAAGCTGAAATTAAAAGTATGCACTTTTGTTTTACCACATGTCAGGAAATCTACTATCCTATACTTTCACAAGGCAATCTGAAAAATGATCAGTGTGGATTTTCTTTTGCTTGTTACAAGAAATCTGATTTTTTTTTCAATGATTCCAATAGGCGCTACGCCTCTTGGTTATGCAATTTATGGTGGGATTGTGGATACTGTGAGCTATCTTCTTGATCATGGTGCAAATCCAGATAAGCCAAATGAAAAAGGGTGTACCCCTCTCCATCTAGCAGTTGAACAAGGTCCCTCTCAATGCATTTCCTTTATTTTATACGTGCATGGCTGCACAACACTGTTTTTTATATTATTTTTTATTGTTAGGAGAACTGCAAATAATGAAAGTTGCAAAAAATGTAGGTTATCCATTATAAATTCGGAATAGGAAATGACCCATGTAATATTGTTATAAATGGTTATGCTAATTATTATGCTACTAATATCACTCCCACTAGTATTTTAGCACTCTAGTGCTAAACTTCTTCTAATCTTTTATGGCCCTTTTGCATTTCTTCATCTTCCATTTTTAGCTGGGGATGCCATCATTTCCTTTCATATTCCCCTTCCCCCCTTGTCGCTAATGTGTTTTTGTGAGCCAAAGAAAAGGGAATAAGAGAATTGAAATAGATTAGAAAGAGTAGGAGGAGCATTGAAGTTGCTATCTTTTGTTTTTTGAAATGATCACGTATCCTTCACAAGTACCTGTTTAGCATTCATGTACACAGTTGTGTTCTATACAATGAGCATAATGATATGTGCTGGGCATGTTAGAGATGTAATAGATATGTTCTTGTTCTTTTTTTTTTTTCGAGTGGCAGCTATGTATGTCTAATCACAGAACAACTATTACCTGGATGAGGTGGCACCTAAGGTTGCCTGCTAACTGTCTTTCATTGTTGTCAACTCTAAATCTTTGACAGAATTTGTACTGTTACATACATTTTTACTATTTGATAAGTTGGGGAAGCTTATGCATGTTGTTAGAGAGTAACTAGTATTAGTTAGCTGAAGCTAAACAAAATGCATTTAACAACTTAACCAGTACTTGTTGGGTTATAGTTGATGGCAACTATTACTAATTCGGGGAGCTAACAACTTATATTAGTATTGTAACTGTTGCTCTCATCACTAGTTGTCAAAACATGTGAGCACGGGCCCATTTGTTATTTCTCCTGGCACAGAAGATATCAGTTAAAACACGGTTCAAAATGGACATTAGGTGGGAAAAAGGTATTGTCTCTGTATAGGTAATAAAGTTACTAGATTTCACCAATAAAACTGTTGCAGTGACAAATAGCTTGCTATATATTCTACATCGTTACACACTTACACTAATGGATACTCAATATTTCTAATTCAGGACATTGCGAGATAGTAAAGGTCTTACTGGTGAAAGGTGCTAATGTTGATTCGTCTTCTGACCATGGGACACCACTGCATGTTGCTGCCTCAAAAAGTCAGGATGGTTGTATGAAGATTTTGTTGGACCACCATGCAGATGTAAGCTTTGTTATATGCTTTTCTTCCCTTGCTTGCCGCTTACATTAAAATAGTTCATGCTACGAGATAATATATTTTAATTTCATCTACATTCATGTAAGATTGGTCTATACTCTATACTTGGTAGTGGTTTGCCAGGCTGTGTACAGACTGAAGTTGTTGGTTTGGTTTATTATATATTGCACACAGGCTTTTGGTTTGTTGTTTGATCTGATAGAAAATGTCTATGCTGTAAATGTCATAAGCAATCAATTTCTTACCCTGAAAGGAATGCCAGCGATGAAAAAATTCAGGTCATTTGGATGGAATGAGTATTTTCAACTCCAAACAAAACAATTATTTAGTTGTAAATATGGATGAACTAAAAAGAAACCTATTTATAGTGCAATGTCAAGGCCTTTGAGACTAGAGGAGGTACTCAACTGCTGCATAACATTGAGGTCTTTGTTGACGTTTACGACGGCCCTGCCCTCCATCTGATGGAAGGCTTGCTTATTAGCAATTGGTTGCATCAAGGAGTTGAGATGTTGGAAGACAGGATAATAAATTTTGGCTTAATAATGGGGACAGAGGAAGTGCAACTTCGGTGGAGTGACCTGGGTGAAGCATTTCTTGACTTGCTGCTACAGTTAGAAAATCCAGATCGGACCAGCAGTTTGACCAGAAAAAGCGGGACCAAGAGCCTTGGTGGGTCTGCTCCAGCCAATCGGATAGTTCAAGCAATCGGTCCATGTTGAATCAGTAAAATACTGGTTAAATTACTGTTTTTTATGTGAACCATCTATGATCAGACTGGCGCAAACTACCCTCTGTTGCGTAAAATTGCAAAAAAAATGCGTATAGATCGGTTTGAACGCATGCCCTGCTTGCATTCAGTTGCCTGCCTTGCCAACTGTGCCGCATGTGCTATTGTGACATAATAGTACTCCCTCTGTCCCACTCACTAAGGCGCGGTCAAACTTGGCATGGTCTTTAAGACTAATCTTTGACTTTAAATTTCTCATATACTATAATATTTGTAGCAACAAAATCATAATCATATGAAAGTAAATTTAAATGACAATCCAATGATATTATTTTCATCAAATAAAATTTAATTTACAATAAACTATTTGTTGTTCAAATATTTGAAGAGTTGAATTTTAAAATGCGTGCGCGCCTTAGTGAGTGGGACGGAGGGAGTAGTATTATAGTGAAAGAATAAGAGGAAACTGATTAATCTGCATTTATTGTACCTAAATACCAAGACAGTGATAAATTTAAAGGTTTTTTTATTGTTCTTATATGATAGGTTAGAGTAAATGTGATTTGTAAATCACATACCTGCACTGGAATTTAACTGTGTATAAATGTATGTGTTCTTTTGTCTGTCAGATATACAAAAAATATCTAAAACAAAACATGTGGTCCAACTGGTGACCCAGTGATTCAGGGCTGAGTATACGATCGTGTTGGGTCTGATAACTATGCTTTATATGATTTATGTGCTTTTGCATGGTACCTATATATCTGCAAACTTACTTGTGATTTTGGTGACATGGTTTGATATTCTTTTTATACCTCTTTCTTTGTCCGCAAACCATCTTCTACTTTTGACATGTATGGGCACTAATTTTTCTTAATTGTCTTATTAGTGTAACAAGACATTCTCTACAGTTTGTACACCTCTCATTGCTGCGATGATGGGTCGCTCACTGAAATGTTGTAAGCTTTTGATTGAGGTGATATACCTTGTTCTTCAAATCCAAACTGAAATTACATTATTGAACTCCTCTTTAGAAGGCAAAACTTGGTGGATATTTAAGTTTTAAATATTGTACAAATCATGACATGCTTATTTAGAGAAAGTATCTGCATTTGTTTTTTGTTAGGCTGGTGCTGATGTTAAGGGTGTTGGTACTTTTACCCCCTTAATAGTTGCTGCAACTGAAGGCTTAACTGATTTCTATAAGTGCTTACTGGAGGGTGGTGCTGATCCTGATGTGCCTGATAAAGTAACTCTTTTCCTTTTTCACTGAATTTTCTTCACTGCACATCGAGTGGTTGTTTTCACTCATGGAAATTATATTATTGATATTCATATCTATCAGATGGTCTATTTTATGATCTCATACTACTATTCGTCTAATGTTTTATTGATAGCTATGTAGATGCATTAATGACAGGACTGTAGTGTTGACACCTATTGAGGTTTTAGCACAATGCACTGTTCCTCGCGTTCTTTTTTCCCCTCTTAGAGAAACATACTGTTTTTTCTGTTAAGAATGATTTGTTAATTTTATGTTTGAATTCAAACTATCCTAGTTGCTCATGATACACAATAATTTGTCTATTAAGAATAATTTGCTCATGATGCCCATGCACATAATTTCTAGGTGCACAACCGAGCAATTACACTTGGATTAGTTTCAGATTTACAGTACACGTTTTTTAGATGGTTTATAACGACAAGCTGAGTTTATGCATGCAATATATATATTTTTATAATAATT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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA006445