BGIOSGA008467
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA008467 |
|---|---|
| Description |
Japonica Group Os02g0570400 (Os02g0570400) mRNA, |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA008467, complete gene. |
| LocusTag |
NM_001053721.1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA008467-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA008467-PA |
| Length |
7750 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:23483014..23490763 |
| Sequence Coding Region |
23483014..23483071,23483164..23483273,23485844..23486129,23486650..23486830,23487337..23487554 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome02:23483014..23490763 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome02:23483014..23490763 source=RiceIndica02 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGCCGTCAGCAAAGCAGCCGAGCAGCAGAGCTCCTCCTCCTGGGATCACTGGAGGGCGCAATGACCTGCGAATTCTTTCGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCTGTTGGAGGTCTTGAGATGAAGAAGCCGGAAGCAGAGGGGATTGCAGAGAGCCTGCAAGCGACGCACAGGAAAGAACTCGAGGCAAGTATAAGGAAGCAGCTCCAAGGAGTGGAATTATCACCATCCCCATATGACACTGCATGGGTGGCTATGGTGCCACTCCGGGGTTCGTCTCACAATCCAAGCTTCCCTCAATGCGTCGACTGGATACTAGAGAATCAATGGGACGATGGATCATGGAGTATTGACGGGTCCATATCCACAGCCAACAAAGATGTCCTATCATCTACGCTAGCATGTGTTCTGGCACTCAACAAATGGAATGTTGGTAGGGAGCACATCAGGAGAGGACTAAGTTTCATTGGAAGAAATTTCTCGATTGCGATGGATGATCAAGCAGTTGCTCCTATAGGTTTCGGCATCACTTTCCCAGCTATGCTAACCCTTGCCAATGGGTCCGGCTTGGAAGTCCCCGTCAGACAAAACGATATTGATAGTCTTAATCACCTTCGGGAGATGAAAATACAAAGAGAGGCCGGGAACCATTCTCGTGGAAGAAAGGCCTATATGGCCTATCTGGCAGAAGGATTTGGGAACCTTCTGGAGTGGGATGAAATCATGATGTTCCAGAGGAAGAACGGGTCATTGTTCAACTGTCCTTCTTCAACTGCTGGCGCATTAGCCAATTACCACGACGATAAAGCTCTCCAATACTTGCAATCTCTAGTCAATAAATTTGACGGTGTAGTGCCAACACTGTATCCACTAAACATATATTGTCAGCTTTCAATGGTGGATGCGCTTGAAAACATGGGAATATCTCAGTATTTTGCCAGTGAAATAAAGAGCATCCTTGACATGACATACAGTTCCTGGTTAGGGAGAGATGAGGAAATCATGTTAGACGTAACAACGTGCGCAATGGCATTTCGCCTTTTAAGAATGAACGGTTACGATGTTTCCTCAGATGAGCTATCTCATGTTGCTGGAGCTTCAGGCTTCCGTGATTCGCTTCAAGGGTATCTAAACGATAGAAAATCTGTACTGGAAGTATACAAGACCTCGAAACACAGTATATCAGAAAATGATTTGATCTTAGATAGCATAGGCTCTTGGTCAGGCAGCCTATTGAAGGAAATGCTGTGCTCTAATGGGATCCAAGGAACTCCAGGCCGTGAAGAGATCGAGTTTGCTCTGAAGTATCCCTTCTACAGCACATTGGAACGTCTAGTCCACAGGAAGAACATTGTGCTTTTCGACGCTAAGGGCTCCCAGATGCTGAAAACAGAGTGCATGCCTGTTCATGACAGTCAAGATTTTCTAGCTTTGGCTGTCGATGATTTCTGCATCTCTCAATCTAATTACCAGAATGAACTGAATTATCTCGAAAGTTGGGTGAAAGACAACAGACTCGACCAGCTACATTTCGCACGGCAGAAGATAACATATTGCTATCTCTCTGGTGCTGCCACCACATTCCGTCCTGAAATGGGCTACGCTCGCACCTCGTGGGCAAGAACCGCTTGGTTGACGGCTGTTATCGACGATCTTTTCGATGTTGGTGGATTAGAACAAGAACAAGAAAACCTCCTAGCATTAATGGAGAAGTGGGAAGAGCCTGGTGAAGATGAGTACTACTCTGAGGATGTAAAGATCGTGTTCCAGGCTCTTTATAATACGGTGAACGAGATTGGCGCAAAGGCTTCCGCGTTACAAGGCCATGATGTTACCAAGTACCTAGTAGACGTATGGCTACATGTGGTGAGGTGTATGAAGGTTGAGGCAGAATGGCAGAGGAGCCAGCATCTGCCAACGTTCGAAGAATACATGGAAAGTGGTATGGTGTCACTTGGACAGGGCGCTACGGTGATGTCGGCATTGTTTCTGATCGGAGAAAAGCTCCCGGAGGGTGTTGTCGAACTTGAAGAATACGATGAGATGTTCAGGCTGATGGGCACTTGCGGCCGTCTCCTGAATGACATTCGAGGCATTGAGAGGGAGGAGTCGGACGGCAAAATGACGAACGGCGTCTCGCTGCTCGTCCACGCTAGCGGCGGCTCCATGTCCGTAGACGAGGCCAAAACCGAAGTGATGAAGCGCATCGACGCCTCACGGAGGAAGCTGCTGAGCTTGGTCGTCGGCGAGCAGGAAGGCCCTATCCCGAGGCCGTGCAAGCAGCTGTTCTGGAAGATGTGCAAGATTCTTCACCTGTTCTACTACCAGACCGACGGATTCAGTTCTCCCAAAGAGATGGTCAGCGCGGTGGATGCGGTCATCAAGGAGCCACTTCAACTCAGATCATTGTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAPSAKQPSSRAPPPGITGGRNDLRILSPAAAAAAVGGLEMKKPEAEGIAESLQATHRKELEASIRKQLQGVELSPSPYDTAWVAMVPLRGSSHNPSFPQCVDWILENQWDDGSWSIDGSISTANKDVLSSTLACVLALNKWNVGREHIRRGLSFIGRNFSIAMDDQAVAPIGFGITFPAMLTLANGSGLEVPVRQNDIDSLNHLREMKIQREAGNHSRGRKAYMAYLAEGFGNLLEWDEIMMFQRKNGSLFNCPSSTAGALANYHDDKALQYLQSLVNKFDGVVPTLYPLNIYCQLSMVDALENMGISQYFASEIKSILDMTYSSWLGRDEEIMLDVTTCAMAFRLLRMNGYDVSSDELSHVAGASGFRDSLQGYLNDRKSVLEVYKTSKHSISENDLILDSIGSWSGSLLKEMLCSNGIQGTPGREEIEFALKYPFYSTLERLVHRKNIVLFDAKGSQMLKTECMPVHDSQDFLALAVDDFCISQSNYQNELNYLESWVKDNRLDQLHFARQKITYCYLSGAATTFRPEMGYARTSWARTAWLTAVIDDLFDVGGLEQEQENLLALMEKWEEPGEDEYYSEDVKIVFQALYNTVNEIGAKASALQGHDVTKYLVDVWLHVVRCMKVEAEWQRSQHLPTFEEYMESGMVSLGQGATVMSALFLIGEKLPEGVVELEEYDEMFRLMGTCGRLLNDIRGIEREESDGKMTNGVSLLVHASGGSMSVDEAKTEVMKRIDASRRKLLSLVVGEQEGPIPRPCKQLFWKMCKILHLFYYQTDGFSSPKEMVSAVDAVIKEPLQLRSL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..58#151..260#2831..3116#3637..3817#4324..4541#4857..4977#5049..5146#5240..5454#5548..5660#5757..5852#5979..6194#6311..6452#6633..6878#7439..7750#ATGGCGCCGTCAGCAAAGCAGCCGAGCAGCAGAGCTCCTCCTCCTGGGATCACTGGAGGTAGTAGCTAGCTAGATCTCGATAGAGCTAGTATTATTACTGTAATAATTTCGTATCTTTCTCACGTTCATAAAAACATATATATGTCGAAGGGCGCAATGACCTGCGAATTCTTTCGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCTGTTGGAGGTCTTGAGATGAAGAAGCCGGAAGCAGAGGGGATTGCAGAGAGCCTGCAAGCGACGGTAAGACTAATTGCAGAAATTTTGATGGAAGATCTGTTAAATTTTTGTCCACTAGAGACGTAGTTAATTTGAGATGGGATGAGTAAAAAGTTAACATATTTTGTGACTTCCATGCCACTCACATCCTATATACATTATAATTAATTACATGCTAATCTCTACTATTATAAAAATTAAAGATGTTTTTGCCAGTATTTTGATACATCATCTGTGTATGAGTCAGTTTTTAAGTTCAATTACTTTTGAAAATACATATCCGTATTTGAGTTGGTTTTTAAGATCGTTCACTTTTGGTAATCATATAAGAAATCTGTTTAAAAAAACTCGCATGCTAACCTGAGACGATCGGATTCCTAACTGCAGCTCAGGATTTTCTAAAAATATATATATCTAACCGAAACCCCACAGTGAATTTCATCTTAACTAAACCATATAACAACAATAAGATTAAAATAAACTTCACCCATTGCAACACAATGGCATTTTTTCTAGTCCTATAATAATTATAATATAATTATACTATAATTATATTTGACAGATTTTGTAAGGTTTTCTGTTGAATGATGGATATATAGTCCCTTATTTTTTAAGTTAGGGTGACAATACTATAGTTTAATTTGGTGGGGTCTCAAATTTTTAAATTTGGAAACCATTGTAAGGAAAAGTATTGATTCAAACCATAAGCGCAAGTATTGATCCCTTGCTATTTGTTTGCTTAGCATGCATGACAGGGACAGTCTTGTAGGCGCCATGGTCCATGGAAGTTTTGCACCTTGCATGACTTGTTCTGGACACGTACGCATGCATATCAAAGACTGGTATAACAGTGTTCTAAAAAAAGGCTGGTGTAACAGGACTAATTAGCATGAGTCTTCTTTGACACCGACTTGTGTTTGTCTTATATACAATATTAGATACGCATATATTTCATCCGTTTCACAATATAAGTCATTCTAGCATTTTTCACATTCATATTGATGTTAATGAATCTAGACATATATATCTATCTAGATTCATTAATATTAATATGAATATGTGAAATGCTTGAATGACTTACATTGTGAAACGGAGGAAGTATATCGCAATCAACGAGGTACACGCAGTAAATATTATGACCCTTTATATATATATATATATATATATATATATATATGACACAGGTGATTTTTTTTAATGTTTGATAATATTTAGTGCAAATATGTAAAAGTATATGTTAAGGTTAGAGTTAATTTCATGGATGATAAAATAAATCATAACAAAAATAAACTATATAATTTTTTGAATAATTAATATGAATAGTCAAATGTTGAACTAAAAGATAACAGCGTCAAATATTAAAAAAAATGAAGATGCATAGTAGATTGGATGTCCAACTTCTTTTCTTCGTTCGATTCCTTAATTTGTTGGAGAACTTTTAACCATTTAGGATTAATGAAAGACTGTTTAGGATTTTAACTACGCAGGATTAATATATATGGAGGATAATAAGAGGGTCTCCAATTAATTAGTATGAAAAACTGCCCAAACCCATGAATCCGTACATGCTACGTTTTCGTCCTATCTTACGATAAAGATAGAACCCACTAAATCCTAAAGTTCAATATGCAAATATATCATATTATCATCTTCTAACAACTATTATATCTTAAACATCATACAAGCATGCTATATTATCTATAATTTTATTCTATAATTTATTAAATTTTAGAGCTTTAAAATGCAAGCATGTTAAACCACCATCCTACATAATTTATATAATATTTTAATATATCATCTCTCCATCATTTATTATAATATCCTATATACATATATATTTTATCCTCACATAATTAGTATTATTTCTCTCTTCTATAATTAAGCCATATCATACAATTATTTCTAGCTCTTAGATGATTAATTTATGGTCCAAATTATCCTGCTCTTTTTCTTCTCACTATACCACCTTAATTATTTTTAACCCTTAAATGACTAACCTATTGTCCAAATTATTCCCCTTCTTTTCTTCTCTCTTAAAACCCCATCACTTTATTTTTACATTTAAATCATCATTCTATGTGCTATTTAAATCATCATAAACCACATCAACTTATGTAAACTTATATTATCTAGCTATCTTACACATTATTTTTATCTATTGTTATCATACTAAACTCCCGTAGCAATGCGCGGGGTTTCACATAGTGGATTGAACAACTAATACCGTCTCATTATTTACTAATACAGATTTTTAGAGTATTACCCGCTCTTTAAAATATTACAATTTAGATTCTAAACTAAGCACATCACTATATGTTATTTTCGAATTTTTGAAATGACTAAATTATAAAAAGAACTAGTCGAGAATTTAGGTCAGGTACATCTCAATATTTGTATTTCTTGATAGTTAAATTTATTAGTAGTTCCGAATTTTCAAATCAATAAAATAAAATAATATATTGAGACAATAAGCCTAACACAATGCAACTTGATATTTTCAATACACAATTGTTATTGTATATAGAAAAAATATATGGATCTTGCACTATATCCTTTGTTGAGTTCATTATATATTGTTGTGATGAACGCTGCAGCACAGGAAAGAACTCGAGGCAAGTATAAGGAAGCAGCTCCAAGGAGTGGAATTATCACCATCCCCATATGACACTGCATGGGTGGCTATGGTGCCACTCCGGGGTTCGTCTCACAATCCAAGCTTCCCTCAATGCGTCGACTGGATACTAGAGAATCAATGGGACGATGGATCATGGAGTATTGACGGGTCCATATCCACAGCCAACAAAGATGTCCTATCATCTACGCTAGCATGTGTTCTGGCACTCAACAAATGGAATGTTGGTAGGGAGCACATCAGGAGAGGTAACATATATCAATATTTATATATAGATACACTTAACAAGTTAATGTTCATTTCTATTTTCTTTAAACATTTTTATACTCATTGAAATTTGGGTTATACTCAATTTAAAACTTAGAGCCCAAACACCATAGTTCCTCAGTTAATTTCTCTCAGTTTGGTGTGATATGGTAATTTAAAACTTAGAGCCCAAACAAACCATATCACACCATGCATGGTTGGTTATGTTAACCAAACAAACACCATGCATGGTTATGTTATAGCTAAAACAAGCTTGGGTAATAAAATCTTTACTGTAAGAGAAATCATTGTCAAATACTTCTATTAAGTCTATTAGTATTTTTTTTTACTACGGGATACCTACATATTATTGAAATTTTCATGATGAGATATATTTTAGGACTATATGTCGCAGTAAAGATTTAACTATACGAGGGTACCTTTCAACCTTTCCACATTAATTGCTTTAATCATATCTTACTCTTAAACGTCTTAATTAATCCTATGGTACGACGGCTGCAGGACTAAGTTTCATTGGAAGAAATTTCTCGATTGCGATGGATGATCAAGCAGTTGCTCCTATAGGTTTCGGCATCACTTTCCCAGCTATGCTAACCCTTGCCAATGGGTCCGGCTTGGAAGTCCCCGTCAGACAAAACGATATTGATAGTCTTAATCACCTTCGGGAGATGAAAATACAAAGGTTTAATTGCCAATATCAAAGTTTATCCTAGAATGGATATTTATATTGTTTCCGAATAAGTTTATAACAATTTCCAAGCACATCAACTTTTTAAAACTAGATAAAACTGATCATCCGCCAACTTTTTTTTAAAAAATGAACCTTTTCAGCTAAAATTGTAAAACTAATCATCTCTGAAACTATTTTTTTTACACATAATTTAGCCACGATGGGCTACGGGTGCGTGGCAACATTGTTTGCCACCAATCCAAGGCAGAATGATCAAACAACTGCTACGCCATGGAAAAATATGAATAAACCTAGCCCATGCATTAAATTGCGTTAGCTCAAAGTAAAAGAAAAGACCTGAACATTTATTAGCTAGCCAACTGAGTAATTATTAATTTCAATTTTACAATATATTTTTTTGACAAAATAAATAATACAAACGAGATTGCAAACGATTGATTTGACGTATATCTGAGTTACAAGTAAATTATCCTGAATGTTTTGATTCATTAATTTAGAGAGGCCGGGAACCATTCTCGTGGAAGAAAGGCCTATATGGCCTATCTGGCAGAAGGATTTGGGAACCTTCTGGAGTGGGATGAAATCATGATGTTCCAGAGGAAGAACGGGTCATTGTTCAACTGTCCTTCTTCAACTGCTGGCGCATTAGCCAATTACCACGACGATAAAGCTCTCCAATACTTGCAATCTCTAGTCAATAAATTTGACGGTGTAGGTGAGTTTGTATATATACTTCTCCTTCCGATTCTTTTATTTAAAAAAATTACTCTATTAATTCACTTTTAACGTATGTTTGACCATTTGATTTATCCAAAAAATACATAATTATTATTTATTTTGTTGTGAATTAGTTTATTATTAAACATATTTTGAGCATGTGATTTTTTTTATATTTGCATAAAATTAATGTTTTGAAAAAACGAACGATCAAACGCATGTTTATCCAATGAATAACAGGGGGCAGTATCAAGAACTTGCTACATTCTGTTATTAATTAAGTACTTACTAATACA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