BGIOSGA014567
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA014567 |
|---|---|
| Description |
Os04g0557200 proteincDNA clone:J023013E24, full |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA014567, complete gene. |
| LocusTag |
OS04G0557200 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA014567-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA014567-PA |
| Length |
8324 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:26714482..26722805 |
| Sequence Coding Region |
26722669..26722805,26719843..26720097,26719494..26719590,26718883..26718939,26715109..26715765 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:26714482..26722805 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome04:26714482..26722805 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCATCTGCTCCTCCAGTTCAGGAAGAAGCCCTACAGCCAGGGACGAACCACTTCAGGAGCCTGCTTGCTGCTGCTGTGAGGAGCATCAGTTGGAGTTATGCGATCTTTTGGTCCATTTCAAACAGTTGCCCAGGAGTTTTGACTTGGAATGATGGGTTCTACAACGGCGTGGTAAAGACGAGGAAGATATCCAACTCAGCAGACCTCACGGCTGGTCAGCTCGTCGTGCAGAGAAGCGAGCAACTGAGGGAGCTTTACTACTCTCTCCTGTCCGGCGAGTGCGACCACCGGGCGAGGAGGCCCATTGCCGCGCTATCGCCGGAAGATCTCGCAGACACAGAATGGTACTACGTCGTCTGCATGACCTACTCCTTCCAACCCGGCCAAGGGCTGCCAGGCAAAAGCTATGCAAGCAATGCATCTGTTTGGCTGCGCAATGCTCAGTCTGCAGATAGCAAAACATTTCTACGCTCGCTATTAGCGAAGACAATCATCTGCATCCCCTTCACGAGTGGCGTGCTTGAGCTGGGGACCACTGATCCGGTTTTGGAGGACCCAAACTTGGTAAACCGAATCGTTGCATATTTCCAGGAGCTTCAGTTTCCGATATGCTTAGAGGTACTAATGAGCACTAGCCCTTCTCCGAACGAAACGGAAGATGCCGACATCGTGTCCGAAGGCCTCATCACTCACAACGCCATCGAAGAGGGGCAGATGGTTGTCTCTGATGAGTGCGTGTCCAACGCCAACCGCGATCCAATCACCATGGAGATCGACGAGCTCTACAGCATCTACGAGGACCTGGACCTGGACACCGTGCGCTTTCTCGAGGATAATGGCTGGCCTGTGAACCCCAGCTCTTTTCAACTGGTCTCGGCGTCGTCAACGGAGGCGGTGGCGGCGGCGGCGGCGGCTAATGATGTCGACGGTGTTGCGAATTCTCAAGTGTCGTGCTTCATGGCTTGGAAGAGCGCGAAGTCAAACGAGATGGCTGTGCCGGTCGTCACCGGTATAGAGTCACAGAAGTTGCTGAAGAAAGTTGTGGACTGTGGTGCACGGATGAGCACTGGTCGTGGTAGTAGAGCAGCGCTAACTCAAGAGAGTGGCATCAAGAACCATGTCATATCAGAGAGAAGGCGCCGAGAGAAGCTCAATGAGATGTTCCTGATTCTGAAGTCAATAGTCCCCTCCATCCACAAGGTGGACAAAGCATCCATCCTTGAAGAAACGATTGCCTACCTCAAAGTGTTGGAGAAAAGGGTGAAAGAGTTGGAGTCCAGCAGCGAGCCATCACATCAGCGCGCAACCGAAACAGGACAGCAAAGGCGCTGTGAGATCACCGGGAAGGAGCTGGTCTCTGAGATCGGTGTCAGTGGCGGCGGCGATGCAGGGAGAGAACACCACCACGTGAATGTCACCGTCACGGACAAGGTGGTTCTCCTGGAGGTGCAGTGCCGATGGAAGGAGTTGGTGATGACACGAGTGTTCGACGCGATCAAGAGCCTCTGTCTTGACGTTCTCTCCGTGCAGGCGTCGGCACCGGATGGTCTTCTTGGACTGAAGATACAAGCTAAGTTTGCTTGTTCTGGTTCAGTGGCACCTGGGATGATCAGCGAAGCTCTCCAGAAAGCTATCGGTGGCTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASAPPVQEEALQPGTNHFRSLLAAAVRSISWSYAIFWSISNSCPGVLTWNDGFYNGVVKTRKISNSADLTAGQLVVQRSEQLRELYYSLLSGECDHRARRPIAALSPEDLADTEWYYVVCMTYSFQPGQGLPGKSYASNASVWLRNAQSADSKTFLRSLLAKTIICIPFTSGVLELGTTDPVLEDPNLVNRIVAYFQELQFPICLEVLMSTSPSPNETEDADIVSEGLITHNAIEEGQMVVSDECVSNANRDPITMEIDELYSIYEDLDLDTVRFLEDNGWPVNPSSFQLVSASSTEAVAAAAAANDVDGVANSQVSCFMAWKSAKSNEMAVPVVTGIESQKLLKKVVDCGARMSTGRGSRAALTQESGIKNHVISERRRREKLNEMFLILKSIVPSIHKVDKASILEETIAYLKVLEKRVKELESSSEPSHQRATETGQQRRCEITGKELVSEIGVSGGGDAGREHHHVNVTVTDKVVLLEVQCRWKELVMTRVFDAIKSLCLDVLSVQASAPDGLLGLKIQAKFACSGSVAPGMISEALQKAIGG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..137#2709..2963#3216..3312#3867..3923#7041..7697#7784..8158#8256..8324#ATGGCATCTGCTCCTCCAGTTCAGGAAGAAGCCCTACAGCCAGGGACGAACCACTTCAGGAGCCTGCTTGCTGCTGCTGTGAGGAGCATCAGTTGGAGTTATGCGATCTTTTGGTCCATTTCAAACAGTTGCCCAGGGTAATAATTAGTTCAATACGAATGCAGTTGCTTGGTGATATTGTTCACAAATATAAAAGATTATGGTATTTTAATTTATCCATAAATATAAAAGATTTGTTATCCTGAGACATAATTTTGTACTATTTTATTTCATACCTATCAACTTTTGCACTAATTTGTTCCTCACCTACCATAGTTTATATGTACTCCCTCAATCCCAATTTAATCATTCCCTAAGCAAAAAGCACCAAAACTAAGGACATCAAAATATTCATCATTCTCAAATTAATCATTACCGGTTAAGGTGTTTCATCGCTTCGTGTCCCTTGGATTCCCATGTTTTAAATATTACATGTTATTGCACCAATATAAATTAATCTTGGTTGGTTGCATACAACACATTTAATGATGTGCATTTACTGTTTGCATAAGTTCATTTCATAAAAAACTATTTGCATAAATAAATGAAAAGACACTTGTTAGATGATGATCATTTTGGGAAGACCTCAAAAATTTTAAGAGATGATCAAGCTGGGATGGAAGGAGTACTACTTTATTTTCCCGTATATCACTATGAAGTGACATTTTGTTATTTCCTTAATTCTTTACTTAAAAATATTATAATCCCTTATATTTATGAAGGAAGGTAGTAACTAGTTGTAGACCAGTGGCGCAGGTAAGAAGAAAAAAAGTACGGACCATAGACAAGTGCTAGAGTGATTACTCAAGAAGAACAAAGAGAAAAACAACATATTCTCAATTGCATGATATTATTGGAACACAAGAAGGTCAAAATTCGACAGGGCAACAACCACGATTCATTGGCAAAAGCACATAAAAGTACGAATGAAAAAATAATTCAACAAAACAGGAAGCAATGACGAATGTTGATCAATTATTCAATTTGATGCTAAATCGACAAAATTCCCAATGTCCTTGAGCCTTTCCCTTTCCTCTTCTATCAGCTTCTCAGTATCAAATCTCGAAATAAAAAACGGCAAAGGATCACAAATTCACAATTACAAATGAGAGAAGTGTAGGATCGAGTCACAACAACTAAGCCAACCAGAGGGGGGTGAATGATTGGTATACCCAAAAACCGAAAACCGATCGGTCTTACCGGAGTAGACTAGCCGGTCTGACCGAAGCGTAGCCGCCGGTCTGACCAGTGTTGATATTCCGGTCTAACCGCCGAAACTTGTCGCTGCCTCCTGTTGCCGACGCTGGTTTGACCGCCGTGTGCCCACCGGTATGACCGCCGCGATGCCGCCGATCTGACCGCCGTGTTTTTGATTTTACAAGAAGCACCCAACCTTCAACTGAAGTCCGCCTGCCTCCGATGGTCCAATCTACAACCTGCATGCCTTGTCAGCACTTTGCCTCCCTGGCTGGCACTGCCCAACAGGGGACCCTAATCGGTGACTAGGCATGCGCCCCTCCCCTTGCGTGACGCTCCCCCCTCTAGTCCATTACTGTTCCTTCATTTGTTTACTGCTAGCTAAATGGCCAAATGTTCCTTGTAATAAATGGGTGGTGCTAGAGCCTTAACACCCAGAGCCTTGCATGCTAATGTATGGAAGTGGATGCTCATTCTAAAGCAACATAACAACAATACCTTATCATAGGCATCTGTCTTCACAATGGACTCATGAAAGAAATCTGGCAATCCTAGAATTGGTGCTTGTACCAAAGCCAACTTAACGTAATTAAAAGTTTGTTGCAATGATTCAATCCATTTATACTTAACATATTTTTTGACCAACTCTGTCAAGGGTTTGATGACCACTCCGTAGTTTTTCATGAACTTTATGTAGTAAGCAACCAACCCTTAGAATCCACTTAGTTGTTTGAGGTTGTTGGCACTGACGAATTTTGCACAACCTTGATTTTCTATGGATCTATAGCCACTGCATTGACACCAATTATATGCCTTGTTAAACAGTTTGTACTGCTATAAGATAGCAAAAACTTCCTTTAGGTGTTGCACGTGCTCCTCAAGGTTTTCGCTGTAATTGAATATGTCATCCACAAATAGATAGAAGCACACATTTTCTTATTAGGGTAGTAAAGATAATATTCATGAGGCCCTGCAAAGTGGTTGAAGCATTAGTCAGGCCAAATGGCTTCACCCTAAATTCATAAAGGCCTTGGCGTCTTTTAAAAGTTGCTTTGTGCTCATCTTGGTTTAACAACCTGATCTGGTGATAACCATACCTGGGATCAAGCTTAGTAAACCATTGTGCACTAGCCAGCTCATCAAGGACTTCATCTATTACCTATATGGGGAAATATCCAATGGAAACCATCAAATAAATAAAAACCGATAAAAACTAGACCTATGAGCTTTCTAAATTCATTTAAAAAAAAATAGAGACGGATGTAGGCATGAACTATATTAATTGCCACTGAATTTTTAAGTAATTTGTTTTATGAATTTAGAAAACTTTTAATCCGATTTTTACCCTTTTTTCACTTATTTGATTTTATTTACCTGATATTCCCTTACTTACATAATATACGTTCCGTTAGATATTATCTCCCAGTATTTATATACTAAATTATATAATACCTAAAAAATATTACCTGTAGAGTTTTGACTTGGAATGATGGGTTCTACAACGGCGTGGTAAAGACGAGGAAGATATCCAACTCAGCAGACCTCACGGCTGGTCAGCTCGTCGTGCAGAGAAGCGAGCAACTGAGGGAGCTTTACTACTCTCTCCTGTCCGGCGAGTGCGACCACCGGGCGAGGAGGCCCATTGCCGCGCTATCGCCGGAAGATCTCGCAGACACAGAATGGTACTACGTCGTCTGCATGACCTACTCCTTCCAACCCGGCCAAGGGTGAGTATTTCATCTGCTAGCTTGATGCCAATACACACATACGAGATGATCTGTTGATCGATCTGTGCCTATACACATGACTGATCAAACTTGTCGGTTGATCTGCTAGCTTGATAGCAACTCCAATAATAGGAGAAAACAAAAGCTGGGTAAACCAGCCTGGAAATGTCTCTCATGACATCTTAATAACAAGATATACATTGCTGTACTGTAGTGTTGTTATTGATCTGCTGGGGTACATTCTGTCTGCAGGCTGCCAGGCAAAAGCTATGCAAGCAATGCATCTGTTTGGCTGCGCAATGCTCAGTCTGCAGATAGCAAAACATTTCTACGCTCGCTATTAGCGAAGGTACCTATATATTTCCATGCTGTGCTGCTCGATCATGGCATGTCAACCATGATGCCTTCAAACAAAGATAATGTTCATGCATTATATATCCTCCATATAATCATCATATTTAATTATTTACTCCATATGTAATGTCATGATCTGACTCGATCGCACGCTCTCCATGCATGCACCAATATAATGTCGTCGAATGCTGCAGAGCGCGTCTATTCAGGTATATATGTAGGTAGAGTTGTACATAGTACTCTCTCCTTCCAAAAGTCTAAGTCATATTTCATTCTTTGGTTTTTTTTCAAAAGTCTAAGTTCTATTTGTAGTCACTATGTGCTATATTAATTTTTTTATCGAAACCTAAAAAATCATTTTAGTACTTATTGGTTGCATGTTTATTAGTTTTATCACATAGTGAAAGAGTTAACTATACATTAGTCTTAATAAAAAAGAAATAGGATTTAAACTTTTAGGAGGAGGAAGTATTTTAGCTTTCAAATTGATATGTACGTGTACGTCGATCGATATCTCTGACTCCATCTAAATATCTATACATCTTACAGACAATCATCTGCATCCCCTTCACGAGTGGCGTGCTTGAGCTGGGGACCACTGATCCGGTAAGCTCATCGATTGTTCAGCACGAACAACTATGCATGGAGCTATAGCTAGCTCAATCGTCCAGTGATATAGAACAACATAATTCCTCCATCTAAAAAACACTTTTGAGAATGAATCTTAACACATTTTAAAAATATATATAATATATATATCTTAACAAACACTTATCCATATTCATCCTTAGAATTCATCCTTAGAAGGGCATTTTTTCTGGAATGCGTTTACGATATTTTTTCTAGGATAGAGGAAGTATGTATTACTCCATTTGATTATTCATCTTATAAAAAAATTATATAACGATTATTTATTTTTGCTATAACATGTTTAATCATTAAAGAATTTTTAAGTATGATATATACTTTAAGCATATTTACATTAATCTTTTAAATAAAATAAATGATCAAACATTATTTTAAAAATCAACAATATCCTATATATTAATAAACTAAGGTGTATATATGAGAGAATATCACGTGCTCAATATGTTATAGCATGTCCGGGGTTCGTTTTGCTCAACTGGCAAGGAGCGACAAAGCCATTGGGCGCCAGGGTGTGATTCTTCGTACTCACCAAGTCACCATTTCCTAAAATTATAAATATGATATAGTTGCGTCTTTCCTAAATATTATTGATGCTAAGCTTCCTTTTATATCCCACATTCTTTTTATGTTATTACCATCTCACATTTTGAGTCTAGCACAGTAAAGCACTATTCTGTAACACCCGAGATTCCATGGAAAATGCTTCAAATCAGCCGTCCGGGCGGAAGGCAAAAATTGGACGTTCACATCACTTGGGATAGGTGCATACGGTCAAATTTAGGAAAACTGTTCATAATGATTGAGAATTCAAACATTTTTTTCCTCCAACTATTTATCCAAACTATGAATAAATTATATAATTTGATTCATTATAATTAAATCTTCGGAACAAGATCTCACATCATTGTATTCCAATGACTTTTTTTCTGACTCTTTTTAGTGTTGCAC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