Os08g0100200

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os08g0100200

Description

Zinc/iron permease family protein

Version

NM_001067286.2 GI:297607855 GeneID:4344407

Length

5775 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os08g0100200, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:17289..23063

Sequence Coding Region

17289..17376,19820..19937,20290..20357,20451..20491,20752..20808
,21327..21388,22180..22276,22363..22449,22518..22610
,22741..22799,23000..23063

Expression

GEO Profiles:Os08g0100200

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008401:17289..23063 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggatcccaaagttgttgttgctctcgctctgtcccttattggtggccttagcacctctcttggtgcattgctggctatactaaactgtgccccaaacaacaaaacactcgggatgttacagggttttgctactgggctcatgttaagcatgtctttctttgacttggcttatgatgctgtcaacgcgattggttttctaaaaggaaacctttggttttttgctggggcactcctgttttccactattgctgaggttttccctgaaccagattgcaatttagcagatgagaatgacaaacatttggaaaataagactggtaataacaacatagcagggaaggaacttatgatgagacaccgccgaagagtaatctttagtgtcgttgtcacagcaatagttgctggtgtgagtttgcaaaacttccctgtgggtactgcggcatttcttggaaccacaaagggcttccgtgttggccttaacttgtctcttgctatagctctacactacatcccagagggtatttcagtagctctccctgcgtactttgccacttgcagcaaatggcaagccttcaaactagcgacgctatctggttttgcagagccactaggtgtaattatcgtagtgggaggggtcatggcgtttctaacgttatatgaaatgctaccaatagcatttgaatacgcaggacgcaaggatgctgtgaaggctgtatttgttggcatggcttttatgtccatgagagaggttctcagagaaaaagaaagacctccagagaataatgtggctatgccaagccagtctaaccaaagtggcccttttgggctataa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDPKVVVALALSLIGGLSTSLGALLAILNCAPNNKTLGMLQGFA TGLMLSMSFFDLAYDAVNAIGFLKGNLWFFAGALLFSTIAEVFPEPDCNLADENDKHL ENKTGNNNIAGKELMMRHRRRVIFSVVVTAIVAGVSLQNFPVGTAAFLGTTKGFRVGL NLSLAIALHYIPEGISVALPAYFATCSKWQAFKLATLSGFAEPLGVIIVVGGVMAFLT LYEMLPIAFEYAGRKDAVKAVFVGMAFMSMREVLREKERPPENNVAMPSQSNQSGPFG L</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>5688..5775#3127..3244#2707..2774#2573..2613#2256..2312#1676..1737#788..884#615..701#454..546#265..323#1..64#atggatcccaaagttgttgttgctctcgctctgtcccttattggtggccttagcacctctcttggtatgcatatatgcacttcccatcactcatttttcttagctgtatgcacagccatgcaattttgtacctcaattggacttttatggtattttctcttgaattattttgggatcaattttgtagtaattgaatgagtatgttatacctctcgatagccatcaccttcctactcccgtaatagctgtgtactatttcatcaggtgcattgctggctatactaaactgtgccccaaacaacaaaacactcgggatgttacaggtagagtacagctatgtattatgtattacggtcaaacaacaccagttcatatttgcactatgggcaagctcataaaacaacataagctcatctttgcacaaatctaacatttttacatactgttttttagggttttgctactgggctcatgttaagcatgtctttctttgacttggcttatgatgctgtcaacgcgattggttttctaaaaggaaacctttgggtgagagtaaccaataaaaagtcaaggaactgtaacctcttcttgtctaattagcttatgcattgcagttttttgctggggcactcctgttttccactattgctgaggttttccctgaaccagattgcaatttagcagatgagaatgacaaacatgtataacctctcaacttagttcgctagccaatttcagttagccttggctcagaaactaatataggattcaccattctattttttagttggaaaataagactggtaataacaacatagcagggaaggaacttatgatgagacaccgccgaagagtaatctttagtgtcgttgtcacagcaataggtaagtccaaaatgtaccttatgtattttaatagcttgataaagaatatgctataataaactaattgtacatttattgttgatgccatcctagcaaactatgaattgattgcatcaacactttgacacatttatatacagccaaccttgtgagtcacaacaatttatagcatgaaagcaaataaaattttaatgttgaacctaaattaagatgtatacttattgaaccaagattaagatgtacttattcaataaaattataatatttaacctacattaagatatacttaataatgatgaatatatcataacattttccagttttctaacaacacacagatgacatatttctggattgcattatatatataactaacattttagttctgaactccaacatattgactcttaattattcataagagtatgattgctaatattcagcataaaaaaatctgtagcttattggataagaaaaagaaaaaagagtaacatgtagctttatataaacaacagctcagattgaagtattgaacatctagaggcaactcaaaattagtagtttgtttagccgttaatacagaaaatgatatttcacaacttgttcagtacaacaattgatttctatttaaatagcttggattcaagtacacataattttacacagtgaaagaaatgacatataagtaaaatatatgcatacacaactaactgtatgcccttttcctgcatgtttgtttggttttaatggttgcacttatgaacaaaatgttcaattgttcatatcaacagttgctggtgtgagtttgcaaaacttccctgtgggtactgcggcatttcttggaaccacaaaggtatttttttcttactgttttcaatatttataataacttattcagtgttgtcactatgcccaacaaagtttctcaatgatggccaaaggcttttgaggcatggaagaaaatatataaccaagtacaacataattaaacaaacaagctgtatatattcatctttgtgttaagttgaacaaacattcaacaattaaatagtaaatatggtacaaaaactattcatgtatgtacctttacaattatatgcattgtagtagatattattttccatgtacctttctcatattatccatattgactacagcccactctattttattgataagtatttttagtctctctagtattttcataaatggatagtgtgtaaaggataccttgcatgctaatgttgacatgcattttatccagacacatgttcatttagtgtataacatcaccaatatatttgaatatgtaaccagaaattgaatagtaaaggcttatgataaagttaattaatcttatctgcttttcagggcttccgtgttggccttaacttgtctcttgctatagctctacactacatcccagaggtaattgactttgtggcgccttttgggtggaagtgggacttgagaataggtgttgaaattgggaagtgtcttctcacccatccgcccatcccctcttttttgcccatggccactgtaattttgcattgaagatacacaatattatactttcatgaatttgtagagctaattgcaaatggagtgtaattatattttctcccaccaccctgttaagaccaattgaatactctaatagttatcgatattttgttcacgtgcagggtatttcagtagctctccctgcgtactttgccacttgcaggtactagttaatatatttaagtagacctgttgtacttctgaaaaaaatagccctgcagttctagtaaaattatgtttgtcacgtctgatgcagcaaatggcaagccttcaaactagcgacgctatctggttttgcagagccactaggtgtaattatcgtaggtaggttcactgatttaaattattgcacaataatacgtgatttgtgcacatagatgttaccaattaccaaaactagatgtgttcttaaattttaacacttccatattaactataaccagaaatactaacattgacaggctgagttcatacacttcattctattgccatcattctatgtattcaaataatgcatatgaaatgtaagtttcttgcagcatacctattcccaagcaacttgaatcctgaaatattggaaggcctacttggattaggtaaccaaattaacagaaatttattttgaaaaatagctcaacttaagtgtttaatagtttcataaattttctttgcacagtgggaggggtcatggcgtttctaacgttatatgaaatgctaccaatagcatttgaatacgcaggacgcaaggatgctgtgaaggctgtatttgttggcatggcttttatgtccatgaggtgtgttacagtcttactactgcggtgaacaattaattttacataagacactaccagtaccggtttataatttttctgttcaataatatgaccgcgatacttatttcggccacccaagatacctaccgcaccttggacagaaaaaaaataatttgatagatgttggtcaatgtggctgatttagcaagaaatatttagcagagattggttataacaaaatattgcgttcaaaatttgggttatggcatagggggtgcacattcgctaaggcaggcatgagcgcatgaggatggacacatatggattagttccacatcacttagcagcactgcagcagtgaccaacatataagcccaagagtaccataccccagagttaacaattttaacaagtgaaacaaggatgaaaatactaagcaaagttggtgtaagtgcatggcttatttgacacggaccctaggtgtcacagtaggccaatatggtatgtatgtatatatggatcaggagttattaacacaaaatttccagtcaaaatcagcaaagtatttagaaatacatggtgtataagatcttaaattcaatgaactgtttttggaagattgtaatataatgtaatgaatgttattatatcatgagcctacttcaagaatgggcaacaactatcagaagaggacatgcaacatggcttgagggagaaagatcaaagagaacaaagggacggggcttagtggagaggaataagctagattatgaactttttaattcattattattacttgcacactcagagggagatgataaacctcctttatatagagcatatcaatgacaaatcaaagctggagatagggagtctccattgatagactttattgttatcccccaagcataactttataaggaaacagctaattttcaaataatttaaaccctcagcttaggcagccatggaagctagctgcctagctcagcattcttgcttggccctctgctgtctccttgcattgcatctagatgattggaaagcttcatgggcatggctacatctgctatgagcctcaaggtctcatggattcgtccatgaatttccctgcagctttgtgacaattatatcagctgtatttccttaatgtgattacagcatataaatattgataaatgtctacatttccaatttatagctcacttgtattttgcagcttgcacttcctagatattagtcttccaaaggagatgggtgcataacatttgagttgaattctgatgtggacaagagtatttcatcatggactttgcgctaaggtatctcaccttttcttggaattactattgctgcagaggatgtatatttaagtttcattggtccttttttaaaaaaatgatttcaaatttactagaaagaaacaagtatattttgacctgacagtgactgccatttaaacttaacttctttcatttataaagcatcagtaaggttctgcattaattattttatgcatcttcttgccaatcaagacaataggaggggaagacaaattaatcattttgcctctatattccatcacagaattgccaagccaacataaccaaactggagcatcgcatttaatgatgttggttggaaagacatacctactgaaggttttaacttttaagcagtagtagacagtagaaatttgaacaaggaacctcatcaatgttctccccaggtgcatgtttctaggaaatttactatcagaaaacaagataagtaggtgaccaacacatctgtaaatagtggatgagactgtaattcattgaaaaaggagaaaaatactactcaatgatgtaaataaattaattgtcatgtgatgaatcatatgattctatcctttacaaaaatatatttgtgcctcatggcacttcggcagtcggcagcctatacattgaagtttatttaacgaaaaacggaaatctaatgtcttgctattgagtattaatttagcaacataaactgtatggatttaggccatactcacgagaaatagagtaatatttagaaggccgaaatttcaagattagatgacagctgaatctatactaaaaggttattagacaaacttacagcaccactaaagaacctgtttaggtcatgttagttctagaacccatcctagggtgatacataatggacctagaaaatattcataagcaaaatacagtacgaagaattgttttcactcaatttcagaggtgcaagcagggatctggctgattcaggctttttgttgatttctcttttcttcctttttttttctttctttaagcttttttccccttaaattcttttgttaccttatcttggataaacattactactaatattactatatgaataaaatttagacattttccttagattgtaactgtaagttcatctgattatgggccgtttgcatctgcagagaggttctcagagaaaaagaaagacctccagagaataatgtggctatgccaagccagtctaaccaaagtggcccttttgggctataa</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os08g0100200, RefSeq:Os08g0100200