BGIOSGA016807

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA016807

Description

cDNA clone:J023022A09, full insert sequencecDNA

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA016807, complete gene.

LocusTag

OSIGBA0155K17.3

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA016807-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA016807-PA

Length

10211

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:25225654..25235864

Sequence Coding Region

25225654..25225737,25226785..25227261,25227753..25227963,25228155..25228312,25228397..25228467
,25228643..25228748,25228816..25228902,25229527..25230084,25230181..25230244
,25231288..25231421,25231504..25231557,25232257..25232353,25233556..25233761
,25233837..25233920,25234201..25234266,25234819..25234892,25235600..25235687
,25235766..25235864

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGAGTCCAGGCCCACGGCCACCGCGGATGAGCCCCCGCCGCCGCTCGTCGCCATGCACGCCGCTTGCCTCAGGGACGGAAAGACTGCTGTTTTTCCTCTAGGAGCAGAAGAGATCCATTTAGTGGCAATGACTTCCAAGAGAAACTTGCCGAATCTTGCTTGTTTTTGGGGCTATAAGGTGCCATCGGGCTTGTATAATTCTTGCTTGAGCATGTTGAATCTTCGTTGCCTTGGTATTGTGTTTGACCTTGATGAAACATTGCTTGTCGCCAATACCACACGGTCCTTTGAAGACAGAATTGATGCACTTCAGAGAAAGTTGAGTAACGAGATTGATCCTCAACATATTAGTGGTATGTCGGCAGAGATCAAGAGGTACCAAGAAGACAAGTCTATCCTAAAGCAGTATATAGAAAATGATCAGGTTATTGATGGTGGCAAGGTTTATAAAGTACAGACTGAGGTTATCCCACCTTTACCTGATAATCATCAGCCTATGACACGTCCAATCATAAGATTACAAGAGAAAAATATTATCCTGACGCGTATAAATCCATTGATAAGAGATACCAGTGTTCTGGTACGGTTGAGGCCTGCATGGGAGGATCTTCGGAGCTACTTAATTGCAAGAGGTCGCAAACGTTTTGAGGTATATGTGTGCACAATGGCTGAGAGGGACTATGCTTTGGAAATGTGGAGGTTGCTCGATCCAGATTCAAGATTGATAAACTCTGTTCAACTTACTGACAGACTTGTCTGTGTTAAATCTGGCTCTCGAAAGTCTCTGCTGAATGTATTCCATGATGGGTCTTGCCACCCAGAAATGGCCCTAGTGATTGATGATCGCTTGAAAGTTTGGGATGAGAAAGACCAGTGTAGGGTTCACGTTGTTCCTGCCTTTTCTCCATATTACTCTCCCCAGGCAGAGGCAAACTTCTCTGTTCCAGTTCTCTGCTTTGCTAGAAATGTTGCATGCAATGTCAGGGGTGGTTTTTTCAAAGAATTTGATGAGGTCCTTCTGCCACGGATAAGCGAGATTCACTACGAGGACGAAATAAATGATTTTCCGTCCGCTCCTGATGTTGGCAATTATTTGATTACCGAGGACGAGAATGCTGCCATTTTGAATGTAAACAAAGATCCTCTTGCTTTTGATGGTATGGCAGATGCAGAAGTTGAGAGGAGATTGAAGGAAGTGTCTTGCAGTGTTCAAGCTGTGAATCCAATACCAACTAATGCTGATGTGATGCCTGTGGCCCCTAACCAGCAACTTATTACATCATCTGTTCCAGAAGCACCATCATTGGGCATGATTCCTTTGAATAATGATCAAGGTCCTCAGCCTCCTTCAAGCTGGCCGGTTGCTCAATCTGCTCCTGTGGATCCATCGCAAAGTTCTCCAGCTAGAGAAGAGGGTGAGGTTCCTGAATCTGAGTTGGATCCGGACACAAGGAGAAGGCTTCTCATATTACAGCATGGTCAAGACACGAGAGATCCTGCACCACCCTGTCCTGCAGGATCACCCGTACAGACCTCAGTATTGCCAGTGCAATCTCATGGGAATTGGTCACATGTAGAGGATGAGATGAATCCAAGAAGCCTAAATAGGACCTCAACAGGGTTCCATTTAGAATCTGATGATATAAATTATGATAAAAAGCAACCACATAATCCACCGTATTTTCCTGATGAGGATAATCTTATAACTTCTGATAGATATAACCGTCGGATCCATAGATACCCCTCACAGCTGCCTCACAGTGAGGATCATCATATGCTGAATCGTTCATCTATAGCCTACAGATCTTTTCCTGGAGAGGACATGGGAAACCGATTTGGTCCTTCGAATCATAGAAGCAGTAAAATAGAACCAGGACACCAGTTTGTACAAAACGCAGAGACCTCAGCTGGTGTGTTGGAGGAAATTGCAGTGGAATGTGGGTTTAAGGTGGAGTACCAATCAACTTTGTGTAGTACTGCAGAGTTGCAATTCTCCATTGAGGTTAGGATTTTAGGAGAAAAGGTAGGTGAAGGAATTGGAAAAACAAGAAAAGCAGCAAAACGCCAAGCTGTTAATATGTCCTTAAGAAATCTGGCAGAAAAATTTCTAACGTCTGATCCGGATAAGATGATGATTCTGAAGGAGAATGGTTTTAGTAGTAATTCAAACTCATTCAGATATTCGGGAGGTAGTAGAGATGACACATCACCAGTTGCAAGCACTTCAAACGAGTCTAGATACATGGGCGAGAGAGTTGATACTTTAAGAAAACCTGCTGGTTCTGTTGCTGCTCTCAAAGAGCTTTGTACGGTTGAGGGTTACAACTTAGTTTTCCAAGAGCAGCCATCACGTCCTCGTGGTTCATCAGGTAAAGAAGCTTATGCTCAGGTCGAAATAGGTGGTCAAATCCTGGGAAAAGGAGTTGGAGCAACATGGGAACAAGCTAAGCTGCAGGCTGCTGATGAGGCTCTAGGAAATTTGAAATCCATGCTTGGTATCTTTGCACATAAATCATCTGGATTTCAAAGTTTTACACTGCTTCCTGCTGCTCTTCATGGCCATGTTTGGTTCATACAGCAACCGGGTTCGGCTGGTGTTGGTCCAAGGCTTAAGGAGAGTATATACCTGCATTGGTTGAAGATCTTTATGAGAAGCTCGAATCTTGGTGGCTACGTGCACAATGTTGTCCCTCTTTCTGTTTATCTGTATGCTTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MESRPTATADEPPPPLVAMHAACLRDGKTAVFPLGAEEIHLVAMTSKRNLPNLACFWGYKVPSGLYNSCLSMLNLRCLGIVFDLDETLLVANTTRSFEDRIDALQRKLSNEIDPQHISGMSAEIKRYQEDKSILKQYIENDQVIDGGKVYKVQTEVIPPLPDNHQPMTRPIIRLQEKNIILTRINPLIRDTSVLVRLRPAWEDLRSYLIARGRKRFEVYVCTMAERDYALEMWRLLDPDSRLINSVQLTDRLVCVKSGSRKSLLNVFHDGSCHPEMALVIDDRLKVWDEKDQCRVHVVPAFSPYYSPQAEANFSVPVLCFARNVACNVRGGFFKEFDEVLLPRISEIHYEDEINDFPSAPDVGNYLITEDENAAILNVNKDPLAFDGMADAEVERRLKEVSCSVQAVNPIPTNADVMPVAPNQQLITSSVPEAPSLGMIPLNNDQGPQPPSSWPVAQSAPVDPSQSSPAREEGEVPESELDPDTRRRLLILQHGQDTRDPAPPCPAGSPVQTSVLPVQSHGNWSHVEDEMNPRSLNRTSTGFHLESDDINYDKKQPHNPPYFPDEDNLITSDRYNRRIHRYPSQLPHSEDHHMLNRSSIAYRSFPGEDMGNRFGPSNHRSSKIEPGHQFVQNAETSAGVLEEIAVECGFKVEYQSTLCSTAELQFSIEVRILGEKVGEGIGKTRKAAKRQAVNMSLRNLAEKFLTSDPDKMMILKENGFSSNSNSFRYSGGSRDDTSPVASTSNESRYMGERVDTLRKPAGSVAALKELCTVEGYNLVFQEQPSRPRGSSGKEAYAQVEIGGQILGKGVGATWEQAKLQAADEALGNLKSMLGIFAHKSSGFQSFTLLPAALHGHVWFIQQPGSAGVGPRLKESIYLHWLKIFMRSSNLGGYVHNVVPLSVYLYA</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..84#1132..1608#2100..2310#2502..2659#2744..2814#2990..3095#3163..3249#3874..4431#4528..4591#5635..5768#5851..5904#6604..6700#7903..8108#8184..8267#8548..8613#9166..9239#9947..10034#10113..10211#ATGGAGTCCAGGCCCACGGCCACCGCGGATGAGCCCCCGCCGCCGCTCGTCGCCATGCACGCCGCTTGCCTCAGGGACGGAAAGGTACATGAATTACTCCCAACAAGAAACCCACAGACAAATAATAAAAGAAGGGAATGAACGAACGAATGGAACATTTGATTTTACATGGTCAAGTTTACCCGAACAGCAAATAGTTTTTTAGCACATGAAAGAACTAGTCTATTTTTTTCCCTGAAACATTTATTGGTAATTTATCTCTGGACAAGTAATTTGACAACGATGGTGACATGACTAATGATACTGACTGGAACCTATTCCAGAATTCACTTTTCTTCATGATTATTGTGTGTACTGGACTTGATTTTATTCTATCTCAATTTTCAATAATTGAACTAATCGAAATACAGAATCTGGCCTGATGCTGTTGAATGACAGAGGTTTCAGGAACAGCATTTCATGTTTCAGAAATGGAGAAGTTTTGATTTTTGAGTGTGACACTTTTAATGGTTGTTGAAACATACCCAATGCAGCGAAGAATTTGCTTTTCTTCAATAGTTCTTGACTTTGGACTTGACACACTTGCTATCAGGAGTTCATTGCTGCAATTGATCATGAACCGTGAACTGCTGAACTCTGCGTATTGAAAGACATTGTTTGAGGGATGAGTGAAGGTTACTTGAATAATTTGAACGCATTAATCTAACTCATCTGCTAGCAACTTAATGTGTTTCTTGCTTCCACTTGAATTATTTGATAATTACATCTATATTAAGAAACACACTATTTTCGGCCTAATATTTCCTTTACATAGTTGGATTAAATAGCATTTAACTGTGGTCAGGACAGTGCTATAAATATTCCTGGTATTGATTTCGCTATTTTAAGATTTGGATGGATATAGAGTTTTTAATCCACACATGCCTTTTTTTTAACAAGTATCCCCTTTTTTGCATTTCTGTTGTACCTTTTATTTTCTGTACTACTTTGTGGATGTTACTCTGATATGCAGGTATGTGAACAAATGTACTAGATGCCATGCCTTTTACATGATTGCATTTTGTATTAGTGACGAACATTTCTCCTTTTTCTTAATCCTTTTCATTTCCTTTCATTCTCTCCTGCTTGCAGACTGCTGTTTTTCCTCTAGGAGCAGAAGAGATCCATTTAGTGGCAATGACTTCCAAGAGAAACTTGCCGAATCTTGCTTGTTTTTGGGGCTATAAGGTGCCATCGGGCTTGTATAATTCTTGCTTGAGCATGTTGAATCTTCGTTGCCTTGGTATTGTGTTTGACCTTGATGAAACATTGCTTGTCGCCAATACCACACGGTCCTTTGAAGACAGAATTGATGCACTTCAGAGAAAGTTGAGTAACGAGATTGATCCTCAACATATTAGTGGTATGTCGGCAGAGATCAAGAGGTACCAAGAAGACAAGTCTATCCTAAAGCAGTATATAGAAAATGATCAGGTTATTGATGGTGGCAAGGTTTATAAAGTACAGACTGAGGTTATCCCACCTTTACCTGATAATCATCAGCCTATGACACGTCCAATCATAAGATTACAAGAGAAAAATATTATCCTGACGCGTATAAATCCATTGGTATGTATTTCTTCAATCAACCTTTTTCTAGAGTCATGTGATGCCAGATGTCTGTTGTCTCTACATCTGTTACATTGATTAACATAAAAATGAAATACCACAATTCACTTTATTTTGCATCATGTGCTTTGATTGAGTTTACCATCATAACTCAATTAAATCTATTTTGTACTCTAATTTTACTAATTTTATTTGGCACTGCTTTTTAAAAGAAAAATATAGCAACCTTTTGGTTTTGGTGCTGTCAGTTCTTAATGTATTACAAATCATGTAATTAATGTGACTCAAATTGAATTGGCAAATAAGCCTTGCTTAGTGGTTGGTACTGTTGAGGGCAAGTTGCATTAGCTGGTGTGGCAACTGAAAATTTGATCTCCTATTGCGATATTTTGAGCGCTAAGCACTTCCCGTCTATTCAGCTTTGATACAACCATGTTCCATGTTTCCATGCTGTTATACTGCCTAGTTGATTTTCCCTTTTTCTTAATTAGATAAGAGATACCAGTGTTCTGGTACGGTTGAGGCCTGCATGGGAGGATCTTCGGAGCTACTTAATTGCAAGAGGTCGCAAACGTTTTGAGGTATATGTGTGCACAATGGCTGAGAGGGACTATGCTTTGGAAATGTGGAGGTTGCTCGATCCAGATTCAAGATTGATAAACTCTGTTCAACTTACTGACAGACTTGTCTGTGTTAAATCTGGTAGGTGTTAGCATTACTATTACTTTCAAACAACACAACTACCAAAGGAATATAGTGTCATTTGGTATATTTTGTACACCGCAATCAATGTTTTGTGTTGTCTAATTTCCTTCATACAAATTTCCATGTGCATGAACATAATGTCTTGGAATTTTCCATCTTTTGACGTTAATGCTACACCACTCTTATAGGCTCTCGAAAGTCTCTGCTGAATGTATTCCATGATGGGTCTTGCCACCCAGAAATGGCCCTAGTGATTGATGATCGCTTGAAAGTTTGGGATGAGAAAGACCAGTGTAGGGTTCACGTTGTTCCTGCCTTTTCTCCATATTACTCTCCCCAGGCAGAGGTAAGGTTTATCTGTACTTTACACCAACACAAATATATATTTTTTAGTATTGGTTATTGAGGGTACCTTGTCTTGAACTATCAGGCAAACTTCTCTGTTCCAGTTCTCTGCTTTGCTAGAAATGTTGCATGCAATGTCAGGGGTGGTTTTTTCAAGTAAGGATATCCATCTTTGCCTATGTGATCTAAGTAAATTCATTGCCATGACTCATTGTAGTCCCAGCTAAATTTAATATACTCCGTTCTGCCACACAATTTTTTTTCTTGTTATTGTGCCATAGACCAAGTGTGAATTATTTTGAGATACAGAAATTTACGATTTAATTGACAGAGAATTTGATGAGGTCCTTCTGCCACGGATAAGCGAGATTCACTACGAGGACGAAATAAATGATTTTCCGTCCGCTCCTGATGTTGGCAATTATTTGATTACCGAGGTAAACTTTGTAAAATGCATGTTCGATTCCCTAGTAACTGCCAACTTACACTCAGTCTCTTCAATAGGACGAGAATGCTGCCATTTTGAATGTAAACAAAGATCCTCTTGCTTTTGATGGTATGGCAGATGCAGAAGTTGAGAGGAGATTGAAGGTGTTCACTTCTACAAACCATTAGTTCACTACCCTGTTCTTCTTGGTTAATATTGATGTGAATAGAAACTGAATACCAAGATGTACTTTTCCTAAATTAGATGCTGCATATTAATAATATACTCTAGTTATTTTTTAGGTTTTGCACAATGCATTTTGGAACAAAAAAAATACACTGTTTAATATTTCATGTGTATTTTTTTGTTCATTAGGAATTATGCTAGGCACAAAATCTCATGGTCAACAGTATTATAAAATTTTGTTTGAATATGCAGTTGCAATAGACTATTGGGGCATTAGATCAATCTAATGTCTCATTCAATACTTTAATATATTATACTGTTCAGCATAGTGTTTCTCTATTTACATGATCTTAATCTGCATAAATCATTTATTTATTTGAAGTGAACAAGAGGGTGTATTAAGTTATCCTAATCCTTTTCGTTGGACCAGCCAATTGCGAATGCTATAGCTATGCCCCTATGACTATGTTGTTACTCCAATGGGTTGACTGGTCGTCTTGTGAGAAAAAAAATGCTGAGATCAATTACAAGCCTATATTATCATGTTTCTTAGCAATGACTACTGTTTTTACCTTTTACGTATGTATATGCACTATTTTCAGGAAGTGTCTTGCAGTGTTCAAGCTGTGAATCCAATACCAACTAATGCTGATGTGATGCCTGTGGCCCCTAACCAGCAACTTATTACATCATCTGTTCCAGAAGCACCATCATTGGGCATGATTCCTTTGAATAATGATCAAGGTCCTCAGCCTCCTTCAAGCTGGCCGGTTGCTCAATCTGCTCCTGTGGATCCATCGCAAAGTTCTCCAGCTAGAGAAGAGGGTGAGGTTCCTGAATCTGAGTTGGATCCGGACACAAGGAGAAGGCTTCTCATATTACAGCATGGTCAAGACACGAGAGATCCTGCACCACCCTGTCCTGCAGGATCACCCGTACAGACCTCAGTATTGCCAGTGCAATCTCATGGGAATTGGTCACATGTAGAGGATGAGATGAATCCAAGAAGCCTAAATAGGACCTCAACAGGGTTCCATTTAGAATCTGATGATATAAATTATGATAAAAAGCAACCACATAATCCACCGTATTTTCCTGATGAGGATAATCTTATAACTTCTGATAGATATAACCGTCGGATCCATAGATACCCCTCACAGGTCAGTGGTCATCCACCAGATCGATTATTCAATTAATATATGTTTGTTAATGAAGTATATCTGGACAATCTGTTGACAAATGCCTGATTTATTCAGCTGCCTCACAGTGAGGATCATCATATGCTGAATCGTTCATCTATAGCCTACAGATCTTTTCCTGGTATGTTTTGTTTTACCTCTGATGGTTCTAAAGTTCTTCTGAAGATTACTAGCTGCATAGGGTAGTGCATGATCTATGTCTTCCCGTTGAGCTCGCTGCATTAAGCTTAAGATGTTAGCATAAGCCAATCTACTAGTCTCTTGTCTTGCATATTTCTAGAGTTGAGTACTTGTGTACCTGTCTAAATGCAACCTTTCTG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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA016807