Os08g0245400

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os08g0245400

Description

Aminotransferase class-III family protein

Version

NM_001067889.1 GI:115475514 GeneID:4345056

Length

8189 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os08g0245400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:8878957..8887145

Sequence Coding Region

8879252..8879423,8880021..8880133,8880735..8880869,8881008..8881139,8881483..8881616
,8881945..8882091,8882168..8882283,8882501..8882595,8884330..8884478
,8884630..8884750,8884903..8884980,8885077..8885338,8885543..8885713
,8886417..8887057

Expression

GEO Profiles:Os08g0245400

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MLRLLRHARRHSTSSSSSAAAAAVPLTSPAFAVFGANTGVGKTL VSAGLVASLLASPSPSPSTVAYLKPLQTGFPDDSDARFVFDRAPALLRRLRLAGGGAS TRLVASNHTLFPSPAVDPLPERQDTVVNYGGEEGVEEKALVCRTVYAWREPVSPHLAA EREGMPVEDEEVRWLVDRWLAEEDGGGEVWKVLETAGGVASPGPSGTLQCDLYRSSRL PAVLVGDGRLGGISSTLSAYETLLLRGYDVGSVILEDRGLSNDRFLLSYLRKRVPVHV LPPIPEDPKDDLTDWFSESSSAFSSLKDSLQSFHSRRVQRLNSMQRKSKYLLWWPFTQ HDLVPVDSVTVIDSRFGENFSAYKVKDKTIVPQFDACASWWTQGPDSNLQIELARDMG YAAARYGHVMFPENVHEPALRCAELLLGGVGKDWASRVYFSDNGSTAIEIALKMAFRK YACDHGIIVDSEKDIRSEGSVHFKVLALNGSYHGDTLGAMEAQAPSAYTSFLQQPWYS GRGLFLDPPTVYIKNKSANLSLPPSIMHDQLSSCDTCFSSLTEVFCKTRDTSSAANVY VSYISQQLSQYAMSNNSEHIAALIIEPVIQGAGGMHLIDPLFQRLLVKECKNRKIPVI FDEVFTGFWRLGVESASELLGCFPDISCYAKLMTGGIVPLAATLATEPIFEAFRSDSK LTALLHGHSYTAHPMGCTAAVKAIQWYKDPSTNSNIDLDRMKLKELWDSALVNHLSSL PNVKRVVSLGTLCAIELKAEGSDAGYASLYASSLIRQLREEDNIYARPLGNVIYLMCG PCTTQDSCTRQLAKVHRRLQKLN</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>7723..7894#7013..7125#6277..6411#6007..6138#5530..5663#5055..5201#4863..4978#4551..4645#2668..2816#2396..2516#2166..2243#1808..2069#1433..1603#89..729#ccaacaccagtcggactgtgccaaaaccccgtccaaaaaccgattaccccggcaattaaccccgtccaaaaacccaacccccgccgccatgctccgcctcctccgccacgctcgccgccactccacctcctcctcctcctccgccgccgccgccgccgtgcccctcacctcgccggccttcgccgtcttcggcgccaacacgggcgtcggcaagacgctcgtctccgcgggcctcgtcgcctcccttctcgcctccccctccccttccccttccaccgtcgcctacctcaagccgctccagaccggcttccccgatgactccgacgcgcgcttcgtcttcgaccgggcccccgcgctcctccgccgcctccgcctcgccggcggcggcgcctccacccgcctcgtcgcgtccaaccacaccctcttcccttcccccgccgtggatcccctccccgagcgccaggacacggtggtgaactacggcggtgaggagggggtggaggagaaggcgctcgtgtgcaggacggtgtacgcgtggcgggagcccgtgtcgccgcacctggcggcggagagggaggggatgccggtggaggacgaggaggtcaggtggctcgtggaccggtggctggcggaggaggacgggggtggggaggtgtggaaggtgctcgagacggccggcggcgtcgccagccctggcccttctggcacgctccaatgtgatctctatcggtgcgcgcggttcagcttctgatttatgtcattcttcatttttggctagtcgtagtgaattcaagtacttgaatgtgtatgcgttcgttcaagtagaaattaaattgggtacatttgattactttagcatgttttgtttcgtgcatattattcattcaatgacatttgcttggtcgagctaattgatgtgatgcttgcgctgtatagttcctctacttaggagagctcaacgctagcaaatttcatctgcctcttacagatgtaagagagtaatgtgcacgttgtgaatgaacatattagctatgctaaattgtggcgagcaatcttgttgttttaatattttgtgaggttttatgttctgtacatgttaggatttttcatttgagtagttgatattcatgagctgagtaaatattcatgtcctacatcaatttctatgttcaatttacactactgtacacagtggcatatccatttgtcacttcttttaatatatgttttattcgttcagaagttatcacctgtggtgaactggcaatgccacctaatatttcttatcatgcattaaagtaccgtagataccttgaatttcttagaatgatttatggagaaccttgtaatatgtcaaagttaaactttggtatctctacatgctggtttgctttactttctggtgtaattgatcacatacaactcttaacaggtcctctaggttacctgcagttcttgttggagatggtcgtctaggtggtatttcatctactttatctgcctacgaaactctgttgctcagaggatatgatgtgggctcagttattttggaagatcgtggcttgtcgaatgacagattcctgctctcatacttgagaaagaggtgattaatgcctttctgttctttgtcaaatcactctgaaagtgtgcaggagcatagaagcatctcttttattttaattatattatcctgttaataataattatttcagtctttcatttggatatatgataaacctactgcaacttgcttgtattgtttctgtatttcaatgtatgactgatttgtgctatttctgttatttagggtacctgtgcatgtcctgccaccaattcctgaggatcccaaagacgacctaactgattggttttctgagtcatcctcagcttttagttcacttaaagatagtctgcaatcttttcattcacgaagagttcaaaggctaaacagtatgcagagaaaatcaaagtatttgttgtggtggcctttcactcagcatgatcttgtacctgtagattctgttacagttattgattcgcgttttggtgagaatttctcagcatacaaggtttgccaagcatctaggactattttgtaaaaaggaaaattatgatgaaaatctaatagaattttagttacattgttgctcattcttttggtgcaggttaaagacaaaacgattgttccccagtttgatgcatgtgctagttggtggacacaaggacctgattctaacttacaggttattgtctacacatcttccatcatccgtgaaatttcttgtcttctcgtttgctaagggaactattgttagtagtgttttatttctaaagctctgtatgttgaacttttgacaggcaatttttgtagcctaaatttctctttgctcattagattgaacttgcaagagatatgggttatgctgctgcaaggtatggtcatgtgatgtttccagagaatgttcatgaacctgctcttcgttgtgcagaacttttgcttggtggtgttggtaaaggtatgtgctgtaacttcactatgattttgcataattattatcactgacaaattctaagtacagctgttgtttaatgttacttttatgttactatacaagtcacgttgttgagaaacacttcattcattagacaccttctcttgtatgttagattgggcttctcgagtttatttttcagacaatggatctactgcaattgaaattgctttgaagatggcatttcgtaaatatgcatgtgaccatgggattatagtggacagcgaaaaagatatcagaagtgaaggaagtgttcattttaaggtctgttctggttatatcgaatatccttgtcaatctactttgttttttcaactatattaaagttcactgcaagaaattttttttttccctatagtccatagatgttgaatcgacatgatctctatatgcattgatggcttgatgcactgttgtttcttatgcttttagttgaatgctgggcaatatctgcatagtaacttcaataatcatccagctactcgaatttggcaatacattttctaaaccactagttattttgcatattttcttagtgacaaatgaacaaagtagattttttgcacatgtttgtgtggatttgatgtttaattcattatattttctatgcaatgatcaatggtgtggaattgtttttatttttatttttatttgacatgatgaatgtgtgcattgactggagcgcagcatcagtcttaagtgtgtaatgcatgctaaatttaccttttgattgattcaggaaatgcatttaaaatcgagtaaattgtttaggaatgaaccctttttgtaacagtgcccaaatttccacgtggcagatcgccactgtagaatagtacaggcatcaattttccttatttacctatacctgttggacccctacatgcattctattttcttcctccctggctcagtgcgctccctcttccccattcccctccaattcttatgccatccttgctgatctcgacaatctgtaatgctgatgtcctttcatccctctgtgtgatctgatacaagtctatttaagtgtccatggaagatcatggatggacatggttaatgcatactgcagtagttgatggtttcaccattatagctatcagggccaacgtctaggcccaccagagagcggagttttccagcgacatagctatgttcctggacagctgtagggccagcagttttcacccctctagatgctttaactctgatttagtggcctcttcttcctgcttatcctcctggcgagttcttgcaaggcattagaaactgttgtatctgagctgctcctttacatttcctgatttcacaatacctcatcacttgccacgtctagcagatttttcatctgtgctgtggtcattggcatggcttagatatagctctcataaaacgtggtgaatgttgtggtcatctacccatccacactggcagatattttgtatcaggaaaatcaagttagtagaaccagaactccaaaagactgaaatatggagtaaaactcaaagtatcatgaagtagttacacctccagctcaacaagtaagctgatttctgtgcactattctgttcttttcttttcttatccaccaccatgctcatttgatcacagtgaactgcctatattaaactgactcttggggagaggtgccccacaaggctttgagctcagatcgagaaagccccgaacactgactaccaaggtgcttttcgtgtatgactctgaaagcagctatctcagcgaggatcttttttggtgggacccaggaatcgaaccctggttagcagccccataactaggtggcttaccgccatgctattcacgtgttctcagtgaactacatatgctgaccttgcatttttaaaggaaaacctgtatttacagttcatctcaccattttgtagttaatactaatatgatgaagaaataatgcaatgtggaattcttgctccatgtttcttcttttgatatatgcatttttaattgaatcctctctaggtccttgctttaaatggttcctaccacggggatactttgggtgctatggaagcacaagctccatcagcttacacatcttttcttcagcagccatggtaaccatgaatttcatgtgcattgatgtatctgtagccttcttaagtgatttgctatagcaactttgtttatctgtttatatggcctagtagagatttcttatcttgtcgttaaagcatggtgcatatttttttcctgtactggaagcattatcattgaattttcacttctgaaatcaataaagctgagatcattcacttgagttttgttctgtaggtactcggggcgaggactttttctagatcctcctacagtgtacattaaaaacaaaagcgccaacctttctcttcccccatcgataatgcatgatcaactgagttcttgtgatacatgtcagtaacacaaattttacatgaagttatattttatataggttcttatctgattattcttttgttgggactgcaggtttttcctcattaactgaagttttttgcaagaccagggacacatcgtctgctgctaatgtatatgtttcatacatatcacaacaactatcacagtatgctatgtcaaataattcagagcatattgcagcattaattatagagccaggttactataaatattccctgttttgagtacctcttttccaatatatgatgtcactcatgctgaatttaatctctctatattgtctattctggtactttagtacttgttatgtttggactatacaaaatctgatgctgatattttctggcaaatgtgtgcccacagataactttgcttgtgcaattgcattcacattcactattttaaatcggactaagtatttgtgtgttagggtgggatgtacttcaatagtctaatttggttgcctcttttaatttgtgtaaactctaatataggattttaacatcattaactcttattcatgcagtaatacaaggtgcagggggaatgcatttgatagatccccttttccagagattacttgtcaaagagtgtaaaaatcgaaaaattcctgtcatatttgatgaggtatttacaggattttggcgtctcggtgtggaggtaatgtataaaatatgttcttttggatgattataccttaaaagttactccatccatccaagtttatatggctcacaagtattctgtgattcaaacttagtaagctttgacgaattaggccagctttgtacaggtttagatgtttagtgacataaaagtgtcaccatcacattatcatttcaatgcacttccatgttttggttttcttagtagtaactgcaagataaatttgtggtgaaactacacttcaatggacttgtgccaagtcaaacgacatcttatagaaatggatggtgggggtaactagtgtattcaaactcttgactactttcctctcttccagtctgcttcagagttgcttggctgttttcctgatatctcttgttatgctaaattgatgactggtggcattgtaccattggctgcaactttagctacagagcctatttttgaagccttcagaagtgactctaaggtattcatctaattatcatgaatgtatttttggcatgcacaaacagttcattaacgatttttatgatgttatatcagagagtatcacaaggagtctactcttttaggttaacattgacttatcttttatctgacccagctaacagcactcttgcatggccattcctataccgcgcatcccatgggctgtaccgcagcagtaaaagctatccaatggtataaagatccctccaccaattcaaatattgatcttgatcgtatgaagctgaaggaggtaatgaaaatttgttcactcaattactttttgtatattagagtcaccagagtcagttgttctgatttatccatttgaccaagaaatggttggctgttggcactttgctaagaatgtcctcattttggtcttaatataagtgtgttatcatatattaatatattactatataatatgttcagtttataatttgctcattaaaaagcatctgtgtgttatgtcctttatgatgtttgtatttcaatctatctttcatatagaaatatacagtactccctctgtcccactgaataaggcacatgcctttttgaaattcaactcttcaaatatttgaccaacgattagtctaatataaattaaagtttagttgataaaaataatatcattagttgacatttaaatttactttcacatggttatgatgttgttacaaacattgtagatatgagaaatttaaattcaaagattatttttgaagactctgccaggtttgacagagggagtaatacaatttccaggaacacctcttttttgctaatgctatatacagtcaatttatttaagtatattgacacttaaaagttcactctggtatttgcagctatgggatagtgcactagtgaaccatttatcgtccctgccaaatgtgaaaagagtggtgtccttaggaactctgtgtgcaatcgagctaaaggctgagggatcagatgctgggtatgacaatcttgagtcatttatagctggtgtccttcgctgatattattctatattttttttatataactgctcggttaagagcacccaatgggcagtttagcattctgtgttgtgcttagcttctagataatttagtttcctgttgatattctatgcttgtccaaaaaactagtaatatcatagttttaagatctagttgccaaatagttaggagttgatgcgacctttatatggggcatatgactgttcatttaaacaaaaaaaaaggtaattgacgtatttggaagcagtgaaaatatctagcatccaatgcaaaactggaagttttttttataagaaggaagtacctctatatttgcagatttgcttagcaaataaaatattcaaatacctttgcccctctcataactgtctagattcttaatttagctggttaaccctcagcgtgggtacacaaatctctcctttgccctgcacatattatcttttcaatataatctacgctgttatgtaatacctttaccctttctcgctccagttcttggtactattgttgtattccacttaacatgtttggttctgttattcctgcaggtacgcatcactttatgcgagttccttaatccgacaacttcgtgaggaggataacatctacgctcggcccctgggtaatgtgatataccttatgtgtggtccatgcacaactcaagatagctgcactcgccagctcgccaaagtgcatcgtagacttcaaaagttgaattgagttcgccactaacaatagtgagcagaataatgaggtatcagacagtcccataaaataaaagggtttgtgtccatgccattataattttcgcgttgaattgagtttgccaataatatttaatgagcagaataatgaggtgtcagacagtacccgtaaaataaaagggttaattgtatccatgatattataactttcacggttttgaaatatgtcattactattgacataattggaaccatataaaaggtggggtgtgagacatgctatctggttatgttcacacgagtttgtggcc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os08g0245400, RefSeq:Os08g0245400