Os08g0290000

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os08g0290000

Description

Protein prenyltransferase domain containing protein

Version

NM_001067995.1 GI:115475727 GeneID:4345183

Length

6945 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os08g0290000, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:11636012..11642956

Sequence Coding Region

11640524..11642944

Expression

GEO Profiles:Os08g0290000

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgagaccaccaccaccccacctcctcctcctcctcccccgccgccgccgccacgcctcctcctcctccgccgccgccgccgccgccggagagctcgtcggcgccctctccgccttgccctcccccgactcggcgcgacacctcgacgccctcctccgtcgcatcggcggcggtggcctcgccgccgtcctctcgtccctgccctcccctctccccgcggcctccgccctccgcctcctcctccacctcctctccaggacctcctccacctcctcccgctccgaggatgacctcctcaccccgcgcgtctcggcgctcctcctgccctccctcatcgccgatcgcaccgccatccggacggcgcgccgcctcctctcacgactcctccacgtccacccgctccgcaccgccgcggaggcggtcgccgacgccgcctccaccccctcctcggacttcctcatccacaccttcatcacctccccggcccaaggctccctctgcagggccgccgacgcgttccgcgttctctcctcgcgcggcgcgccgccctccatcaagacctgcaatgcgttcctcgaagcccttgttcgtgcaggtcagctcgatgccgcccgcgaggtgttcgacgaaatgcgtgaaagcaggaacgtcgctctgaatgagtactcgtataccgccatgatcaaggcgctctgcaaggctggaaaggtggatgctggttttgagatgcttgcagagttatggcgggctgggcttcagccaacggttgtgacgtacaatgtgcttatggatgcactgtgtaagagtgggagggtggaggaggcctttcgattgaaagggaggatggaacagggagggatgacaccaagcgtggtcacattcggtatattgatcaatggtcttgcaaggggcgagcggtttggggaggttggcattgtattgcaggagatggaacagttaggggtttcccccaatgaggttatttacaatgagcttattggttggcattgtaggaagggccattgctcacaggcactcaggttgtttgatgaaatggttttaaagaagatgaagccaacagccgtgacttataacttgattgcaaaggcactgtgcaaggaaggggagatggagcgggctgagaggatattggaggatatgttgtcaattggaatgacagttcattgtggtttgttcaatacagtggttgcatggcttcttcaaagaaccagaagattggagtcagtggtaagcattacaaatgaaatggttacacgaggtatgcgcccaaatgatcctctgatgacagcttgtatgagggagctttgcaagggagggaaacatcaagaagcagttgggatttggttcaagacattgaacaaaggtttaggtgttaatcttgcaacttccaatgcgctaattcatggtctttgtgaaggtaagtacatgaaagaagctacaaaggttatacagaccatgttaaataagggaattgaattggatagcatcacatataacattatgattcgaggttgctgcaaagacagtaaaatggaggaagctattaaactccatggcgacatgaccagaagagggtttaagcctgatcttttcacatttaatactttattgcatgcttattgcaatttgggtaaaatggaggaaacctttcatctgttggatcagatgaaaactgagggccttcagcctgatatagtgtcatatggcactataatagatggtcattgtaaagcaaaggatattcgtaaagcaaaagaatatttgactgaattgatggatcgtggacttaaacctaatgtgttcatttataatgcacttattggtggttatggtaggaatggtgacatctctggtgcaattgatgctgttgagactatgaagtctaatggcatacaaccaactaatgtgacttatggtagtcttatgtactggatgtgtcatgctggtctagttgaagaggccaagaccattttttcacaagccagggaaaacaatgttgacctgggagtaattggttacacaattatgattcaaggttactgcaaactaggaaaaatggttgaagctgttgcatactttgaggagatgcgttccaggggtatatctccaaataagcttacttacactactcttatgtatgcttactctaaatctggtaacagtgaagaagcttccaagcttttcgatgagatggtgggctcaggtgttattcctgacaatattacttatggtacactaattgcaaggtgttctgaggtaaattcattggataaggatataggacatactgctgaattgtcctcaggcgctttaacaaaagatgatcgtatgtataacatattatctaatggaattaatgctccttggtgccagaaagaagctgcttccagtgttgaatga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MRPPPPHLLLLLPRRRRHASSSSAAAAAAGELVGALSALPSPDS ARHLDALLRRIGGGGLAAVLSSLPSPLPAASALRLLLHLLSRTSSTSSRSEDDLLTPR VSALLLPSLIADRTAIRTARRLLSRLLHVHPLRTAAEAVADAASTPSSDFLIHTFITS PAQGSLCRAADAFRVLSSRGAPPSIKTCNAFLEALVRAGQLDAAREVFDEMRESRNVA LNEYSYTAMIKALCKAGKVDAGFEMLAELWRAGLQPTVVTYNVLMDALCKSGRVEEAF RLKGRMEQGGMTPSVVTFGILINGLARGERFGEVGIVLQEMEQLGVSPNEVIYNELIG WHCRKGHCSQALRLFDEMVLKKMKPTAVTYNLIAKALCKEGEMERAERILEDMLSIGM TVHCGLFNTVVAWLLQRTRRLESVVSITNEMVTRGMRPNDPLMTACMRELCKGGKHQE AVGIWFKTLNKGLGVNLATSNALIHGLCEGKYMKEATKVIQTMLNKGIELDSITYNIM IRGCCKDSKMEEAIKLHGDMTRRGFKPDLFTFNTLLHAYCNLGKMEETFHLLDQMKTE GLQPDIVSYGTIIDGHCKAKDIRKAKEYLTELMDRGLKPNVFIYNALIGGYGRNGDIS GAIDAVETMKSNGIQPTNVTYGSLMYWMCHAGLVEEAKTIFSQARENNVDLGVIGYTI MIQGYCKLGKMVEAVAYFEEMRSRGISPNKLTYTTLMYAYSKSGNSEEASKLFDEMVG SGVIPDNITYGTLIARCSEVNSLDKDIGHTAELSSGALTKDDRMYNILSNGINAPWCQ KEAASSVE</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>13..2433#cgaacctccgccatgagaccaccaccaccccacctcctcctcctcctcccccgccgccgccgccacgcctcctcctcctccgccgccgccgccgccgccggagagctcgtcggcgccctctccgccttgccctcccccgactcggcgcgacacctcgacgccctcctccgtcgcatcggcggcggtggcctcgccgccgtcctctcgtccctgccctcccctctccccgcggcctccgccctccgcctcctcctccacctcctctccaggacctcctccacctcctcccgctccgaggatgacctcctcaccccgcgcgtctcggcgctcctcctgccctccctcatcgccgatcgcaccgccatccggacggcgcgccgcctcctctcacgactcctccacgtccacccgctccgcaccgccgcggaggcggtcgccgacgccgcctccaccccctcctcggacttcctcatccacaccttcatcacctccccggcccaaggctccctctgcagggccgccgacgcgttccgcgttctctcctcgcgcggcgcgccgccctccatcaagacctgcaatgcgttcctcgaagcccttgttcgtgcaggtcagctcgatgccgcccgcgaggtgttcgacgaaatgcgtgaaagcaggaacgtcgctctgaatgagtactcgtataccgccatgatcaaggcgctctgcaaggctggaaaggtggatgctggttttgagatgcttgcagagttatggcgggctgggcttcagccaacggttgtgacgtacaatgtgcttatggatgcactgtgtaagagtgggagggtggaggaggcctttcgattgaaagggaggatggaacagggagggatgacaccaagcgtggtcacattcggtatattgatcaatggtcttgcaaggggcgagcggtttggggaggttggcattgtattgcaggagatggaacagttaggggtttcccccaatgaggttatttacaatgagcttattggttggcattgtaggaagggccattgctcacaggcactcaggttgtttgatgaaatggttttaaagaagatgaagccaacagccgtgacttataacttgattgcaaaggcactgtgcaaggaaggggagatggagcgggctgagaggatattggaggatatgttgtcaattggaatgacagttcattgtggtttgttcaatacagtggttgcatggcttcttcaaagaaccagaagattggagtcagtggtaagcattacaaatgaaatggttacacgaggtatgcgcccaaatgatcctctgatgacagcttgtatgagggagctttgcaagggagggaaacatcaagaagcagttgggatttggttcaagacattgaacaaaggtttaggtgttaatcttgcaacttccaatgcgctaattcatggtctttgtgaaggtaagtacatgaaagaagctacaaaggttatacagaccatgttaaataagggaattgaattggatagcatcacatataacattatgattcgaggttgctgcaaagacagtaaaatggaggaagctattaaactccatggcgacatgaccagaagagggtttaagcctgatcttttcacatttaatactttattgcatgcttattgcaatttgggtaaaatggaggaaacctttcatctgttggatcagatgaaaactgagggccttcagcctgatatagtgtcatatggcactataatagatggtcattgtaaagcaaaggatattcgtaaagcaaaagaatatttgactgaattgatggatcgtggacttaaacctaatgtgttcatttataatgcacttattggtggttatggtaggaatggtgacatctctggtgcaattgatgctgttgagactatgaagtctaatggcatacaaccaactaatgtgacttatggtagtcttatgtactggatgtgtcatgctggtctagttgaagaggccaagaccattttttcacaagccagggaaaacaatgttgacctgggagtaattggttacacaattatgattcaaggttactgcaaactaggaaaaatggttgaagctgttgcatactttgaggagatgcgttccaggggtatatctccaaataagcttacttacactactcttatgtatgcttactctaaatctggtaacagtgaagaagcttccaagcttttcgatgagatggtgggctcaggtgttattcctgacaatattacttatggtacactaattgcaaggtgttctgaggtaaattcattggataaggatataggacatactgctgaattgtcctcaggcgctttaacaaaagatgatcgtatgtataacatattatctaatggaattaatgctccttggtgccagaaagaagctgcttccagtgttgaatgatgtgtggtcaaggaaccttagggcacaccttctttgttctgacaagaaccgtccaagaatgaacagggagtagggagaacatgtggccactgattctgcctttgatcttatgaattttacatctcctaacagttccctccaattcatttggtcatggtcaatctttgggagctatccagcaacagcagaggttgttctgaacatttctgctcaagtttacatgatcatccacctactgtcttgggtggggtatccaacagcagcaacagattgccctgaatgtttataattggtgaggcatatactcttacatgattaattagtaattttgttttcctgacgttatagcatactgtatttcatttatcattgctgcatatatgttctctgccatgttagttaataagttaaacataccacctaattcataagtacttgttctttggtgtagcactcagttgatcctgaaaatattggaacaaaataatcattttgtcacgctggacattcttttgtttttgtttttgagaaagggggaaaaacaacccaatatggacaagaactgcactgtgacctatcaaagctcttatctgcggactggataatggatacacaggttcactttggtcatcaactaaagcaccttgagagccaatgtatggatgataatgcaagatggttgttgaaccataataccagctgcaaatttcaaaaggtaacagtttgtaatgttcaaagctattattccgcatgctggctgttatttacattcatataaattgatcctttgtagtgtagtactgtagtactttgttgtactatatgattcttgttaacagtccagtttaaagtgtctagattagcatcatacttttgtggggcacactgtctttacatttcttgttaccagtccagtctttatgagtatcattgctataccatttatacttttgtttgggcgctatcttacatttcccttattttaatagtgcaatatgctattttctttgaacagattgaggaattattatgcttactatgtatggtactatgttctgttttatttaaccattggcacatgagaaatgaacatacactagaatctgtaattgaaatgattggcctgactccattttcagacttgcaataccatttgaggaattaaggtttttgacatatcgcaatctgtctaaggaattaaggatgtagacattcagttatatgcaagttatatcttgaccttttattttataattgaatcatcgcattggctttttacactgacaactcgaaagacatgaaaatatggaatgaggtgctaggtcagacaaaaattttgttggggacgccatgttcaacagttaaacactccaacagttctgttgattttaattctagactctagactctagagtctagagctcaagaaatgaaaatcagataggatgttaaattgttgctgctgggtttgtttgtttgatctccctctcctattgttgtatggtcagcttaatgtcgagcttttcacttgtcttcctcaagatgaactttcaactttttctaataaccttatcagtagttaatctttttttttcagatgtatgaaatgttaattttctgatctaacatagagctcaatgagcagactggccttcactaatctcaaatgtttgttctggattcttttcactattttttttatttcttgtgtattacgacatgtggcttatgcacatgtgttatgccatcagtgtacacaaggaactggacaaataagtttggctcggtaattttcatagagtattttataatcatcgaaaactattaacttgggtttaaaaatacttctaggattgccagcatactatggcggcgcaatgtgtggtgggaaacctcacaatgctggttattctgcatcctgccacctgctggcataacagccatcaggagtttagtacctggtgactagacagcctgtcaacatggccacatgggcgtttgcaccatgaccccaggtcatgtggaatcacctgtttttatttacatatgtttaagaggacaggaagtgaggaaacttacagatttactgttgcttgggtttatttatggcatcatataaatatttaggctatttctatgaaaatacaatgtccttaaatactggtatataagtttagaacaatctctctctgatctttattggtaattgcgttctttcttatctttttttgtttatgcagttctctgaatactgaattttgtcaggttatttgcgtcgtatcatcctctcagagatttgccattttacaagctctccacaaagaacaccatattctcctcagtaagatcacaacctatatcctcttaaacatattgcgaaaatcgtgatattctgtgagctccatgttttgatgattgagataaacaaaggcttaaaattcatccccacgaaaaattatgggcctctatttattgttcattaccgtctcaagttgtcacaagattgtagcttcatttgtatttcattatatttgaattctgacc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External Link(s)

NCBI Gene:Os08g0290000, RefSeq:Os08g0290000