Os08g0319900
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Structured Information
| Gene Name |
Os08g0319900 |
|---|---|
| Description |
Putative cyclase family protein |
| Version |
NM_001068058.1 GI:115475853 GeneID:4345252 |
| Length |
6852 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0319900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:14000940..14007791 |
| Sequence Coding Region |
14001430..14001555,14002361..14002431,14005404..14005501,14006094..14006166,14006291..14006335 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:14000940..14007791 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgatggctcatctggcgccgctcttcctcctcctcctcctcctcctcctcccgctccacgccgccgccacgccgtccgcccacccggcctaccccaacgagccgccgtcctgcgcggcggcggtgccggtgccggagcggcgggaggcgcatggcggggggcgcatcctggacataacccactactaccgggaggacatgccgtcgtgggagtcggacggcggggtcggccaattcctgtggctccccgcctccatgcgcaacggttcccgcgccaacaactccgagatgcgcctgcccacccacaccggcacccacgtagacgccccgggccacgtcttccagcactacttcgacgccggcttcgacgtcgactccctcgacctcgaagtgctcaatggtctggcattgttagttgatgttccaagagatgataatattacagctaaaatgatggaatcattacatattcctaaaggaattcaacgagtgctatttagaacactaaatactgacaggcaactaatgtggaagaaagaatttgacactagttatgtgggttttatggaggatggcgcacaatggttggtagacaacacagatattaaacttgtcggaatagactatttgtctgttgcagcttttgatgacttgatcccgtcacatttagttcttctcaaaaacagggatatcattcttgtcgagggcctcaaactggaaaatatcatgcctgggatatactccttgcactgcctgccacttcggctgcggggtgctgaaggttcaccaatcagatgcatccttataaagtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MMAHLAPLFLLLLLLLLPLHAAATPSAHPAYPNEPPSCAAAVPV PERREAHGGGRILDITHYYREDMPSWESDGGVGQFLWLPASMRNGSRANNSEMRLPTH TGTHVDAPGHVFQHYFDAGFDVDSLDLEVLNGLALLVDVPRDDNITAKMMESLHIPKG IQRVLFRTLNTDRQLMWKKEFDTSYVGFMEDGAQWLVDNTDIKLVGIDYLSVAAFDDL IPSHLVLLKNRDIILVEGLKLENIMPGIYSLHCLPLRLRGAEGSPIRCILIK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6237..6362#5361..5431#2291..2388#1626..1698#1457..1501#100..499#atcattcgcctcgccgccgcccgcctgttttctcggtcgcgtgctagtcgccctgagaagaagacccgctacagtagggctccaaaatccaatcctccgatgatggctcatctggcgccgctcttcctcctcctcctcctcctcctcctcccgctccacgccgccgccacgccgtccgcccacccggcctaccccaacgagccgccgtcctgcgcggcggcggtgccggtgccggagcggcgggaggcgcatggcggggggcgcatcctggacataacccactactaccgggaggacatgccgtcgtgggagtcggacggcggggtcggccaattcctgtggctccccgcctccatgcgcaacggttcccgcgccaacaactccgagatgcgcctgcccacccacaccggcacccacgtagacgccccgggccacgtcttccagcactacttcgacgccggcttcgacgtcgactccctcgacctcgaagtgctcaatggttggttagctcaagcactcaatcgcatcatggattgattggattccttccttttgcttattttgtgatttttttttgattgtatactagtatgtgggaatttttcattgccgatctgagagagagagagagagagagagagagagagagagagggagagggagagggagagggagagagagggagagagagagagttaattgaaaatgttaaggatttgaggtattattactagaaactattggaatatatggcgtggctttgagccttcggatctgcgatgcaaagtttgtagattagatgaatgacagctatgagattcgagcttttctgtgacatccatgaagcagatttcaacaggaggagaggaacagtccatgtgttccttgtgtaagtgagtgaagggagtttggggctaaaaacctacatgacatcaatgaaattagcctaatgaaacccctctttctagttcttcctacttccagttctcgaagcattcccatatttcttgtttcgtgtctcagtttgatctcagatcaccataatcttcccatggacaatcttgactagttagttcggtggtggagttctcatgttgttgcgattcttttgcaataggaaatttgtgccagctattctggataaaatgaacacatggtattctgttggtagcagatttccatcagaagtttccccaattaaaattggtgctaccatccaaactgtattttagtgtacaaattacagtgctattcttttggagaaagacgtgtcatggtatggatatgatgtcttaacctctaattcggcaattcgaatacccaagctgaaaatccaatgtccacaactgcataatcatgtcttatactgacattggaatcattacatggcaaccaattagatctacatgagaatatatggaattgcattacattaacaactgattttctgttacaggtctggcattgttagttgatgttccaagagatgataatattacaggtaactaattcttgttgtttaatccatcaagatactgttagcatagtaaaattgtagttattgtttacttatctcagcatgtgttagtcaaacctaactattgaatttattgtattcgatgcagctaaaatgatggaatcattacatattcctaaaggaattcaacgagtgctatttagaacactaaatactgacaggtaatggactccagcatagttatatgctcatttgtggtaagcatgcctagttaactgttatgccaaaaaaaaatccattatatatatgagcacacatatagttcaaaatcttctgctttatctgttcagcatggtaaaggcattctttctctcttccttaatctatgtctaccgaccctctatatttccttctgagatccaccccattgattgttaaatctgttggcagtgggtcctactgtatactccttgcatttacatttagtttactcactcttgttttctcagatattttaacatcatgattaattgagctcattatgctactagagccactagccaaaatcaccaccttttggtttctatatgaaaacccaaagtgcgtggagtttttttagttgctgcaacggcatgcccttttcatgtgtttctctatctatttagaaatgatgcgctgctgtttaccctatttcttcctaattgtgtattttgtgcatccgtagtctacggatagttttattgcgtattcttataatctatctattatggaatttcctgaaataccgcacttagtaaagctgtcatcttgcaggcaactaatgtggaagaaagaatttgacactagttatgtgggttttatggaggatggcgcacaatggttggtagacaacacagatattaaacttgtcggtgagtttgaagtagcaatgcatccttttgaggttccttcactatatttgtaaccgactcttatattatttagcgtatgcaactatccgtacaattgactcttatcttaagcttgctcatgcaaatgattattgttttggcatggtttgctttgcaactttttgtttttacaaatatatctccaatgagacttttgctaaaaatggaccctaagcagagaggtgacatttggcgctgtgtgtacatagcacaacatagcaagatttggcatcgtgtaggtttctgtatggatgttgcgtggaaccttatggtgtgtttggttgggcgtatgagactggatgggagatggccgcccgagtttttgtggtgtttggttggagggcatgatggatggggcggcccggaatagggaatattccctcaatatgctggatgagtgcatatggccgatttggctggatgaagccatccagttttggactgggtgatgtgtcctgttctgatttgctgtggttggtttgatttcgtgttaagcaagctccaaatgattttttctcgtaaaccgtttatctaatttatgatttgattacacaattatatttgttataattaaatctttaaaacaagatctcggatgattatattttgataaaaaaatatatatgacaaatgggtcccactaacttttggtttttcccatccatgctatatccctccaaccaaacaagaaattggatcgccatatccatacaaaccaaacaaaaaattggatcaccatatccaacaaaatatggatggctatatcctatccatgcatgaccgtgaaccaaacacacccttagtggctccactggccattttacatgccagcctacatgttgttcaatcctgcagcatcgtgttatgaacagacggcaccaaatgtcatagcaccatttggaagggttctatttctgtaaaaagttttttctaggggtccatttgtaaaaaaatgttttccgaaaggtctactttgtgaaaatcactagtctattcctgtttttttttttgggtaccatttatcatattagattaaaattacagtgtcttccttccaaaaacatattattgtttcttgtacttacggacttaccctcccttgataatcatctcaatgtctagtttggtccgatgaataagcatttagctggaagcctcttctcatgtttcacaagtgtgcatccccatcttacatgtcttcctgtttgagcaatgtaattgtgcaaatttgcacttctaatgtgatgatcttcagaaatcatgaccttaagggacttcaaagagtttttgtgtgttatttcatactagtatacttgaactcatctttcaggatattgtgtgtctcaggcagaagcagacatcagctgaccttctgttcaaggatgatattaatattgaatagcacgtttgcaggtttaagtttgtgtcacgagataggtcttgaaacatataacacctatggaaatggtatactgatctagtatggttgcctgggggatggggtactgcatgctgtgtatactccatgcgacatagcattagctcctgtgaaaatccagaattattatgtacttgtatataaaaaacatgggccaaaactaataagtttctgagtaccctgggtcagctttttcttttttttaatattgaatgatttttttttcaaataatagtgtctggagcatacatgacatgctaactaatacacatttttctatgaatcaatgctgaaaaaccagagaaaaaaattacttaggaacaaaagatttttcttgacttgtgaccctccacttaaggtcctatttaatcaagtagtgatgcaaatgaataagattgaaagcatggtaattaaagtcaagtaggaaatgtcatggtctgttttgacactttttggtagataatgctccttttttttgttttttagttctttcattcactttctatgtagagaaaattccttgtgtacacctcagaactctctcaatcccttctatgcacctgaaaaataccgaatcccttgtgtgccctcgaaaatttgtttggaacccttgcgtacccctcccgtcaagtttctgtcagtttagatgttaattttcttagaaatgtccattatgccctttgagaatggtggatatgaaatttgatcatagttggctgattaaagagctccctatatgttgaatattttttttcatgatgtgtgctttatgatactaaataatcagttgatagaaaatttaaaataaattttgagaaaagttagtacactgcaattttgaaaataaataagtggatatagctagctgaaaatactaagattagtacattgcaattttaaaaataaatatgtggctataactagctgaaaatactaagattagctgaaaatactagatttagtattttcagctaatcttagtattttcagctagttatagccacatatttatttttaaaattgcaatgtactatttttttaaaaaaatattttaaat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