Os08g0323600
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Structured Information
| Gene Name |
Os08g0323600 |
|---|---|
| Description |
Glycoside hydrolase, starch-binding domain containing protein |
| Version |
NM_001068077.1 GI:115475891 GeneID:4345271 |
| Length |
11060 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0323600, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:14255795..14266854 |
| Sequence Coding Region |
14256128..14256301,14256398..14256553,14257049..14257168,14257293..14257405,14258216..14258288 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:14255795..14266854 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggccgcccgcgcgctgggtccacctcctcctcacgccctcggcgccacgcggcaggctcctcgctgcccccacgctgccgccgcggacgcctctgcgcccccgacgcatggataccggcgtggcgccgcggcgctcggctccgcgctctccgcccgccggggaaggcatactttgtgttcagtacaattgatggatgctcttagaggtggcaatcttcaagtggaaccaaacatacttcattcccccaagccattgatgtctactagacgtgatgactcagccataacctgtaaaggattctgtacaatatcgtggaacctcaaatcagatgtgctggatggttacataatcttcgtcactggagatccagttaccttgggctgttgggaatcagatatggctgttcagttgtctccttctgttgaaagtaacaacttatggacggccgaaataaaggtaccatatggtgtgcatttcaagtataactattttgttcgagaggagaatgacgcctcttctgatatcatatggaggccaggtcctgagtactccttgtcaatacccccagttggccggaaaaaacatgtcattgttgtgaaagatctgtggatgaaaactagtgtggcaggcattcccactccttcctggggatcatggctgatggaagctaattttcttgaagaccaatttgctaagagtggagagcatcaaaacattgtgaaagcccattctgtcattgatacggtggatcgagcctcatcagtaggtgaacatattattctgaggcttgggaacggcacacctttacatgtcaagaatatatcagagaatccatctgccagtgtccatgatgattttactgtaaccgataaagcaaattcaattaaatcaagtataagtgaacatgaaaggaatcagcctgttgaggaaccatggatccttggatctgtcatggcagcaaagaaatctgttgcagcagggaagcacgagaaaaacagatggaagtttgtcaataagaaacagaacttgagtgaagtaagtgaaaacatacctgaacaggatcaacctgtagaggagccatggctatttcaatccaaggtggtagcaaaaaaacctgtagttcaaactaaaggcaaaatagaagcaaaggatattatcagaaagctaaggaaaatggataaacctccagcgcctttggaggaggataaggcaactagtggagagccttcatcaagagtcatagtaattaattcatcagtctgcaccatgcagaggattgcagtattggaagatggaaaactggttgaactcttgctggagcccatcaagaacaatgtacagtgtgatagtatttatttaggcattgtaacaaaacttgtgcctcatatgggaggtgcatttgtggatattggactttcgaggccttcactcatgagcataaagcaaaaccgtgatccatttgtgtatcctcaaattgtcaagaatgctaaaagagattctgcgaatttttctgattataatgatgatagccttccaacatatgaagacgaagatgatgatatgactgatggggagttggcagatgaagaaaatgatgatgagtcatcagcatttccagctgaggtagtttctgaaaatgaagaacacatggcctttttgcccaattctaagataaatatgattcatagtgctgaatttgaaagtatctctagttatgatgaagaaaaagatgatgaaattgatgatcacatggaagatgaatataatgaggatcttttgcctggtgatcagtcagaagtatccaatgatcttaagacattatcttccattcaacatgctttgagagagtctagtgatgatacaaatggaagtaggtggtctcaagttcgcaagggtacaaaaattatggttcaagttgtcaaggagggattgggttcgaaaggtccaacgctgagtccctttccatgcttaagaagccggttttggatactggtttcccgcggtaacaaagttggagtatcgaaaaaaattactgggatagagcgcacccgattaaaaggcattaccaaattattacgacctcctggatttactctgacagctcgtactgttgctgctggccattcttgggaggagttgcagaaggatcttgatcgcttattatctacctggaaaggaataattgagcatgctcaatctgctgccttagcagctgaggagggtgtagaaggtgctgttcccgtaatgttgcataggtcaaagggtcaggctctatctgttgttcaagatgatttcaatgagaaggtcaagaggctagttgtggattctcctcgcacctaccatgaggtcacaaactatctccaagaagttgcacctgagctctgcaatcgagttgatctttacgaaaaaagaactcctatatttgatgaatataaaatagaaaaggagattgacaatattctgtgcaaaagggttccactacataatggcggttctttagttatagagcagaccgaagctctggtttcaattgatgtaaatggtggtcatagtatgtttggtcaggggacgtcccaggagaaggctatactagaagtaaacctagaagctgcaaaacaaattgctcgtgaattgcgcttgagggatatcggcggcattattgttgtggattttattgatatgaccgatgatacaaacaaaaaactagtttttgaagaaatgaagaaagcagtagaaaaggaccgatcaacagttggtgtttcagaattgtcaaagctgggtttgatggagataactagaaaaagggttcgaccaagtgttacgttcatgatcagtgagccgtgtccttgttgccatggtattggccgtgtggaagctcttgatacttctttttcgaagatagagcgtgaaatctgtcgacgccttgctgcctctggacataaatcagaccctgagaaaccaaaatcatggcccagatttgttcttagggttgaccatgagatgtgcacgtacttgacatcaggcaagaaaacaaaactagggctcctcagcagctctcttaaagtgtggattttgttgaagatcgctagaggttttgctcgtggggcatttgaattgctaccatattctgatgaaaaggaaactgatgagcggaaggaagagacatcagaatcgcctccgaaagaagcaggcagcccaaaactctctgtatttcctatcaagaagtggatgagccgtgcaaagagagcgaagtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAARALGPPPPHALGATRQAPRCPHAAAADASAPPTHGYRRGAA ALGSALSARRGRHTLCSVQLMDALRGGNLQVEPNILHSPKPLMSTRRDDSAITCKGFC TISWNLKSDVLDGYIIFVTGDPVTLGCWESDMAVQLSPSVESNNLWTAEIKVPYGVHF KYNYFVREENDASSDIIWRPGPEYSLSIPPVGRKKHVIVVKDLWMKTSVAGIPTPSWG SWLMEANFLEDQFAKSGEHQNIVKAHSVIDTVDRASSVGEHIILRLGNGTPLHVKNIS ENPSASVHDDFTVTDKANSIKSSISEHERNQPVEEPWILGSVMAAKKSVAAGKHEKNR WKFVNKKQNLSEVSENIPEQDQPVEEPWLFQSKVVAKKPVVQTKGKIEAKDIIRKLRK MDKPPAPLEEDKATSGEPSSRVIVINSSVCTMQRIAVLEDGKLVELLLEPIKNNVQCD SIYLGIVTKLVPHMGGAFVDIGLSRPSLMSIKQNRDPFVYPQIVKNAKRDSANFSDYN DDSLPTYEDEDDDMTDGELADEENDDESSAFPAEVVSENEEHMAFLPNSKINMIHSAE FESISSYDEEKDDEIDDHMEDEYNEDLLPGDQSEVSNDLKTLSSIQHALRESSDDTNG SRWSQVRKGTKIMVQVVKEGLGSKGPTLSPFPCLRSRFWILVSRGNKVGVSKKITGIE RTRLKGITKLLRPPGFTLTARTVAAGHSWEELQKDLDRLLSTWKGIIEHAQSAALAAE EGVEGAVPVMLHRSKGQALSVVQDDFNEKVKRLVVDSPRTYHEVTNYLQEVAPELCNR VDLYEKRTPIFDEYKIEKEIDNILCKRVPLHNGGSLVIEQTEALVSIDVNGGHSMFGQ GTSQEKAILEVNLEAAKQIARELRLRDIGGIIVVDFIDMTDDTNKKLVFEEMKKAVEK DRSTVGVSELSKLGLMEITRKRVRPSVTFMISEPCPCCHGIGRVEALDTSFSKIEREI CRRLAASGHKSDPEKPKSWPRFVLRVDHEMCTYLTSGKKTKLGLLSSSLKVWILLKIA RGFARGAFELLPYSDEKETDERKEETSESPPKEAGSPKLSVFPIKKWMSRAKRAK</aaseq> |
| Gene Sequence |
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|
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