Os09g0121000
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Structured Information
| Gene Name |
Os09g0121000 |
|---|---|
| Description |
SMC protein, N-terminal domain containing protein |
| Version |
NM_001188787.1 GI:297726704 GeneID:9267891 |
| Length |
20126 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os09g0121000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:1582793..1602918 |
| Sequence Coding Region |
1582793..1582898,1582988..1583093,1584115..1584256,1586382..1586429,1587992..1588078 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008402:1582793..1602918 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MAGTISRIRLENFMCHSSLHIELGQHVNFITGQNGSGKSAVLTA LCIAFGSRAKSTQRAAALKDFIKTDCSYAAIIVDINNQGEDAFKPEVYGDLVRLERRI TESSSSMFLKDQHGNKVAHRKDDLIEIIEHFNIDVENPCVIMSQDKSREFLHSGNNKD KFKFFFKATLLQHVNDLLLAIRELLDNADSVVQELEKSIKPAMMELDELQQKIKNMEH IEEIAHEIDNLKKKLAWSWVYDVDRQIEEQTVKLLKLKERIPACQEKIDGHAAMIVKL KEELTDKERNARSLVEKSREVTMMKEKLEDDIAQAVALKIELEREHVRGTNVLKNMNN RVKQLQKQIHDFREQYIQYTQDESSKAENDKCEIQKEINSLHSNVTRLKEEERGLHET QMGICC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..106#196..301#1323..1464#3590..3637#5200..5286#6027..6347#7035..7154#7955..8089#8737..8813#8889..8934#9578..9586#atggcggggacgatctcccgcatccggctggagaacttcatgtgccactccagcctccacatcgagctcggccaacacgtcaacttcatcaccggccagaacggcagtacgcctcccctccctcccgcaaaccctagcctcctcttttcctcccctctcgatcgatccgtgccttatcatttctctccgtcgcaggcgggaagagcgccgtcctgacggcgctgtgtatcgctttcggctcccgcgccaagagcacccagcgcgccgccgccctcaaggacttcatcaagaccgactgcaggttgcgccctactttgttcatttctactttacctgaatttcgggtattcgtaaattaaaaaaaacaagtcttggatacttgttggccgttgtcgagtttcctctgattcattaaaaaaaaaggctcttttaagtgtgtgtcagtgtttgtgtgggtggtccttcatcggttattccatgaatctgtgcatgtattttggatagttttttttttcacatgctatgcaagcgaccaatggtttcacaccaaatttctcattacagccaaatttttcttttgtgattgaagcggcaagaaatttaattgataataaggatgagtacacatagatcatcgattttaaaagatgagttcttaaaactgaacccaaaaaatagagcctactcatcaggtcatgtgtgtgcagcctctgcattcatacatttacaaactggtaaaaccgtcatcagttgagtcgggcaaactgatagaattgatgtgcaaaggccgagtggctggttggcacagctccaaatcctagattcttgcagaatatggactttgtaggctaaaataaagtgatttaagcctcttttagtctaaaaggcgagcaagatgtctcattcaatcaatcccagtctacctcttgtcctagctccaaggatcattggagcttcttgcagttcaagttctgccagacaggggcacaataatttttcattgtgggcgcatgctaggaggtgaaagcacgccatgcagacgaactctgctcgctttattaagtgttatgctagcagcaaaattctatcaaatcctcttaacgggtgaagtgctggttgaaaacacagaaccagtttgattggatcggtgatggtgctgtttattcagtagctatgaaagacggtagagtggatctttaaatctttgacgcatggtttttcaattcaaaggtcactcgatggttttgtgttttcttctgactgttctgtctgtcttttgtgattgtctgtaatatgtcttatttgttcaattaaaattgcagttatgctgcaattattgttgatatcaataaccaaggggaagacgcattcaagcctgaagtatatggagatttagttagattggaacgcaggattactgagtcaagtagttctatgtttttaaaggatcaacatggtaataaaacttgattcatcctcctgtctaatcgactgttgtccatttttacagttgcattttcttgtttaaagttgctgatattttgttttaagtcattacaatttagccgttggaccttccaatttgcatgccaaattctttctgcaatgttgttttcctttttctgtcaattagggatataagttggtcctagtcagaccaactagtctactcatcctagtactttccagaaccacttatagaagtgtgcacaaaatgaatcatacactaggtgtgaagtgtaccaaggactaagtggaatgagtcaatgtgttggcttgttttcatttcttaaccttgcatttctcatttacttagtcattctcttaagtctattgcatatttctattctatgtagtaacaagcacgattttccaatgtttaggctgttgtttctcttattcttcccttacctttcattaaaaacttaagactggtgaaccagtttgaagatggtaaataacctgcataccgtgcgtacatgagaaaattgtatatataccactctaaatagtgcaactccaagaaatgccactcagaaattcagaatgcaactgttctaatgccactgaaaaaaaagtaaaagttctattttttgccactctaagcccttaacaatatttggtatctgtactacgtattcttctccccttgttccaccacagtaactaggtccatacctctggtcaccattggtatgagcagctcctacccctgagctttggtcttgccttgtactgtttgttggggaggaaaatttgaaacagcaccgaatttctggtgatcaagctggctggagtcagggccaattgagactgcccttccagctctgttttctcaggtcaagaagggtgctctgacggtgaagcaggggctccagtgaaactgatggatgtggtctttacaggtagctccatccacaagggcttttgaagaatattttcaggtacgggatgcagtgcaggaattttcactgagtggtgatcaagatgtggtacgctggaagttggaagctcatggacacttcaaagttgacttggcttaccggctattctctacagtacatgagtgctcgtccttgggcaaattgctctgtcagactgtcacacaagggcaccatcaaaagtgcacttcttcatgtggtttgcaatcaagggtctatgcctgacggtggacaacctgctgaagagaggctggtttcatcagcactgctgacctctgtgccagtcaaaaaagcttttgactcgttctgtctgatgttgtgctgtctcgtgtggaatgaaagaaatagcggggtgcttgatgtgtgaatgcgatcctccactcaactattctcagaaataaaaaaatgaaatcatggtgtggtgtgaagcgggtttgttcaagacaagcaagtgagtatgtggttgctggcacacgcccgcttgtctttcctatggtcctcgacagcctactgtcgacaacagtctgtaatttgtaatttggatttttctcccgaaatcttgatgaaattagttggccatatcttcagtcaactctgctaaaagaaatgtgaaacatacaggggcaaaatggttaagaaagtgtgtatgttcatactagaaataacagtaaagagctcaaagtggcaaagatagcattccatctctttcgagtgattatgaatgattacattttctagagtggcatttcttacagtaggaacttttggagtggcatatatccagttttatctaatttttatgtttgcatggatcataaagtctgcattctggacaatataatcatactcaggcaaattttaggtgtcctggttctacatgttattttaattcccattatagatcattataggcttgccgtgcatgaaaacgaatattactggcatatgaaatcagatatggaactgaatcatggctgaactatagataggctgcaaatgttgtatttaaaagaaggataaccacaacaaatttgctaaaaaagaatactgttccttttgtttctttacctattgaattacatgttttcttatgatttttatgctcgtccaactgtaaatttgtgcatgtgctgtgcacagggaggaaggtggcacatcgtaaagacgatctcattgagataattgaacatttcaatgtaagttgcttatatgcatagaatattcctgtagttttcaaggtagtttcccttccaattgtttgtttaagtccttgagacttgtttggacacttgcgaagcgtaaactaatgataccttctcatatacgtattgtaagtagatgggacatttcctagtactatgaatctggacagtctgtccagattcgtagtactaggaagtaggaaatgtcccatctggtcctaggttcttatattttgggacggaggtagtataatattttgagaacttttagttttgtcaaaattatattgttgacaatgaagttggcatgcacaccaattattttgaatcaagttggcaagtgcatcacatcaccaggatgttaaatttagatgcatgaattcttatttactaccctttgacattaacttatctcattgacaactgctgtggggaaaacaaacaaaaatgcatcccccagccccaaaaagttgaaatttaatcttcctcaagtgtacttttagttctgctaattgccatgtgtgtgtacacctaataacaattgcatacttgccagtcaccatttgctagtgcacctattctggggtttggcatccgaaaacaactgtcatgtacctttgtgccatgtcagaagcattaatgcatctaaggaagggatttcacccctttgtgattgcagaatggaacaatgaatggttttgttgcatgcaataagaaatttgatgtatgaatatgcattcatttatagcactttactaatttcatttatagttcatccttctttaatagttttctttgtgaagcatacttaagagtttggaatcttcaagggtctcgcatatcaccttccatgcttcaacaatcatttgtactattccagtattgttctctagtcacgtgacttgttgcggttagtcctaaagcagtcgtaaagttggccaagtcacactactagagggccatgactcgaccaatagcatgtcgcacgattagtatagattggtaaagtcggttgtagcaaatcaccaaattaccatgctaattggcttattgtgtttagtactatagttttatttcttgttgacttattgtcttgctggctactccatggtcctagtttatactgtatgtagtgcttagtagagtataatagtagtaaagactaatatagtgcatcccctgtttcgcacgagcaagagcaagtcgtggattagttgaccaagtcaac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