Os09g0439000
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Structured Information
| Gene Name |
Os09g0439000 |
|---|---|
| Description |
Sterile alpha motif SAM domain containing protein |
| Version |
NM_001069806.1 GI:115479354 GeneID:4347162 |
| Length |
5386 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os09g0439000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:16905884..16911269 |
| Sequence Coding Region |
16905884..16906031,16906389..16906492,16906870..16907081,16907157..16907262,16907368..16907481 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008402:16905884..16911269 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008402:16905884..16911269 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgccggcgaaccccaagctcgcggcgaagccctcgccgtcgccgccgaccgccgccgcagccgcctcccggccgaaagccacagccaaacctcccctcggtgccggataccgcgacaacgacgacgacgacgacgatttccagagccctccccgtgccagcagccgcgccgcccgcgcgttgaagccctccggtaatggcgcggcctcgcgccgccccagcaagaggttgaagccgtcgtcctcgtgttgctccgggaaggagaaccgtccagccgccgccggtagtggcagggctcccgctgggagggccgcctcgaagggcgcgggggttggcgaaaccctaggtgtcgtctcgagggttagcagcggcgttccaggcggggacaaagcgaggggcggaggaatttgcggcctattgaggtgcggatctgatgactttagttcagtttctaatgggaagaaaggattggatagatattggcgtcgcgatggaggtttgcattctcgccccaatccgatggattccacggtttcgatgccggatgccacatgtgatttggaaaatgggggttctcaagtggcgcaaatgctcagctccaatgaccgtatctcagttcagttggaggggaacgctaaggtggagttgggaaagtctgaatctgaccctacgactatgcggaaggaacggaatggctctggggcttgtgaaagtgatcatcctgcaagattgatcgagccgaggcttctgacattggttacaaattgtgattttggaggtgcagactccatggattcaaaagagcttggttcagcgattcatccctctgtttccaaagataggaatgtggagaacgaatctgggggggcatctgtatgtacatttgcacttcataacaggaattgccactcgagttgtgttgaatccgaacttgagatgttgaatgcgaagtatgatttgggtcctcgtgattgcaaggaaagccaagagggtccgggactttgtagcttgatttctgaagagaggacagttgcggcagaaggtgatgcaactttcacattcgaggaaagggggaacacatcaagtggacttgaggcttgtaaggggagtcactgcttggatccagttgaaccaaagcttatggactcatgtgcaacacatgcacttgaaggtgatggttgtgatgattttgagatcggaacacaacttaatgagctcataaacttgtgcatggaggattacacggagggtcctttgagcaacaaggtggcttgccttgaagggaatggaatggattgtgggagttttaattcatcttgtgaagtgcaatgccctttgtgtggatcaaatatttctgacttaagtgaagagctccggctggtgcatactaacagttgccttgatggagataaacctgctaaggaaccgaattccgataaccaaaatgaaccctgcggtgaaagcaatgttgaaaagaggcgtgttatggaatggttaaggaatctggggctatccaagtatgaggagatttttatcaaagaagaagttgactgggaaaccttgcaatggctcacagaagaggatcttctaggtatggggataacctctcttggtccaagaaagaaaattgcccatgctctatgcgagttacggaagaaaaacaatgatgccaatgatttggctgctgatatgttaaatttggagaataccaagaaggctaaaattccaatgaatggaaacaaattaattacggagtactttcggtgtccatcatctgatcaaagacaaaagaaagcatgtaaagtcaacacaccatctaatttgaatagccagaaaaaatccaatgctaaggccactggtggaaggcgtactgttaaaggaaaggttaaagatacacctatttggtgttgtatcccagggaccccttttcgagtggatgcttttcgctacttgagaggagattgctgccactggtttctgacacactttcatgtagaccattaccaaggcttgacaaaaagtttttgtcatgggaaaatatattgttcatcagttacagctaatcttgtacattataagattggtatcccatgggatcgattacatgtattgccactcaatgaaaagattactatcgcaggagttaatttaacatgttttgatgccaatcattgtcctggagcagttattattctctttgagccatctaatggtaaagctgttctacacactggagatttccggttttcttctgagatggcaaacaatcgtgttttgcagtcttctcctatccacactctaatacttgacacaacctactgtaatccacgatacgacttcccaactcaagagattgtaatacagtttgttatcgaggctatccaagctgaagctttcaatccaaagacactttttttgattggcagctatacaattggtaaagaaagactgtatatggaggttgctcgtttgcttcagaagaaaatatatgttggagctgcaaagttgcaaatattaaagcacttggggcttcctcaggaaatcatgcactggtttacagccaatgaagctgaaagtcacatacatgttgttcctatgtggactctggcaagcttcaagcggatgaagtatttgtccactcaatatgctgatcggtttgaccttatagttgcattttgtccaactggttggtcatttggtaaagggaagaaaaggacaccaggcagaaaatggcaacaaggagcaataatcagatatgaagtgccctacagtgaacatagcagcttcacagaactccgggagtttgttaggttcatctcaccagagcacataattcctagtgtaaacaatgatggccctgatagtgcaaatgccatgctggcccaattgttgaatgattag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPANPKLAAKPSPSPPTAAAAASRPKATAKPPLGAGYRDNDDDD DDFQSPPRASSRAARALKPSGNGAASRRPSKRLKPSSSCCSGKENRPAAAGSGRAPAG RAASKGAGVGETLGVVSRVSSGVPGGDKARGGGICGLLRCGSDDFSSVSNGKKGLDRY WRRDGGLHSRPNPMDSTVSMPDATCDLENGGSQVAQMLSSNDRISVQLEGNAKVELGK SESDPTTMRKERNGSGACESDHPARLIEPRLLTLVTNCDFGGADSMDSKELGSAIHPS VSKDRNVENESGGASVCTFALHNRNCHSSCVESELEMLNAKYDLGPRDCKESQEGPGL CSLISEERTVAAEGDATFTFEERGNTSSGLEACKGSHCLDPVEPKLMDSCATHALEGD GCDDFEIGTQLNELINLCMEDYTEGPLSNKVACLEGNGMDCGSFNSSCEVQCPLCGSN ISDLSEELRLVHTNSCLDGDKPAKEPNSDNQNEPCGESNVEKRRVMEWLRNLGLSKYE EIFIKEEVDWETLQWLTEEDLLGMGITSLGPRKKIAHALCELRKKNNDANDLAADMLN LENTKKAKIPMNGNKLITEYFRCPSSDQRQKKACKVNTPSNLNSQKKSNAKATGGRRT VKGKVKDTPIWCCIPGTPFRVDAFRYLRGDCCHWFLTHFHVDHYQGLTKSFCHGKIYC SSVTANLVHYKIGIPWDRLHVLPLNEKITIAGVNLTCFDANHCPGAVIILFEPSNGKA VLHTGDFRFSSEMANNRVLQSSPIHTLILDTTYCNPRYDFPTQEIVIQFVIEAIQAEA FNPKTLFLIGSYTIGKERLYMEVARLLQKKIYVGAAKLQILKHLGLPQEIMHWFTANE AESHIHVVPMWTLASFKRMKYLSTQYADRFDLIVAFCPTGWSFGKGKKRTPGRKWQQG AIIRYEVPYSEHSSFTELREFVRFISPEHIIPSVNNDGPDSANAMLAQLLND</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>5239..5386#4778..4881#4189..4400#4008..4113#3789..3902#3491..3708#3008..3071#2573..2926#2141..2299#1..1422#atgccggcgaaccccaagctcgcggcgaagccctcgccgtcgccgccgaccgccgccgcagccgcctcccggccgaaagccacagccaaacctcccctcggtgccggataccgcgacaacgacgacgacgacgacgatttccagagccctccccgtgccagcagccgcgccgcccgcgcgttgaagccctccggtaatggcgcggcctcgcgccgccccagcaagaggttgaagccgtcgtcctcgtgttgctccgggaaggagaaccgtccagccgccgccggtagtggcagggctcccgctgggagggccgcctcgaagggcgcgggggttggcgaaaccctaggtgtcgtctcgagggttagcagcggcgttccaggcggggacaaagcgaggggcggaggaatttgcggcctattgaggtgcggatctgatgactttagttcagtttctaatgggaagaaaggattggatagatattggcgtcgcgatggaggtttgcattctcgccccaatccgatggattccacggtttcgatgccggatgccacatgtgatttggaaaatgggggttctcaagtggcgcaaatgctcagctccaatgaccgtatctcagttcagttggaggggaacgctaaggtggagttgggaaagtctgaatctgaccctacgactatgcggaaggaacggaatggctctggggcttgtgaaagtgatcatcctgcaagattgatcgagccgaggcttctgacattggttacaaattgtgattttggaggtgcagactccatggattcaaaagagcttggttcagcgattcatccctctgtttccaaagataggaatgtggagaacgaatctgggggggcatctgtatgtacatttgcacttcataacaggaattgccactcgagttgtgttgaatccgaacttgagatgttgaatgcgaagtatgatttgggtcctcgtgattgcaaggaaagccaagagggtccgggactttgtagcttgatttctgaagagaggacagttgcggcagaaggtgatgcaactttcacattcgaggaaagggggaacacatcaagtggacttgaggcttgtaaggggagtcactgcttggatccagttgaaccaaagcttatggactcatgtgcaacacatgcacttgaaggtgatggttgtgatgattttgagatcggaacacaacttaatgagctcataaacttgtgcatggaggattacacggagggtcctttgagcaacaaggtggcttgccttgaagggaatggaatggattgtgggagttttaattcatcttgtgaagtgcaatgccctttgtgtggatcaaatatttctgacttaagtgaagagctccggctggtgcatactaacagttgccttgatggagataaacctgctaaggtgattcttctatgtatttggaaaattaaaaattgttgtgatctagtgtaatgaccgtgataattattgctgctgaattgttaccttgttagaaagctcaaagacaatcatatggtaaccttaggcacaattttgcttcttgaaatttcccggttggccttcagttattcctctgcatgaggatcatgttagtatgtttattcactgggttctaatcattgttgtgacgatttttgtgtgtccatcattaagttcttatctgggacaatagatgaatacatcttactacatagtatatactaatagtattcattgtgaatattttgcatcaataagaatatatgatatttttgcgggaatataagcagtggtgaacctatgtagtcctacccggggtcactggatcccgggtagatgattcaatcctagcttaatttatgccgtgttaactagtatatcactcaataattagatgattagtatgtattgccgtattagacctccataatttttattttgggtttgccactgaataagaatataagattgatgctaccatactatggatacatttctaatttctatccttataaagtttagttgagaatggagacaatagcaattatataattcttatgttatttaatagtttccttttccttactatggaatcaacaaattatcatattttaagttttttgaattatctctgttccaggaaccgaattccgataaccaaaatgaaccctgcggtgaaagcaatgttgaaaagaggcgtgttatggaatggttaaggaatctggggctatccaagtatgaggagatttttatcaaagaagaagttgactgggaaaccttgcaatggctcacagaagaggtaatttcctgtggttttgttgatatggaggtttgtttgtcaagtatagagcttaagttatgggacctacttgtaaattggagattaacattgaccatttgcataactgcgtggatttcatgctagttgatttgttctagttaatgtgtcaaaagatgctcgcgttccttcaacatcttagttttttttggcataactggttggtgcatcgatctacacagcttttctggtttccaatgaaaaaactaacttgttgctgcctatgaattgcaggatcttctaggtatggggataacctctcttggtccaagaaagaaaattgcccatgctctatgcgagttacggaagaaaaacaatgatgccaatgatttggctgctgatatgttaaatttggagaataccaagaaggctaaaattccaatgaatggaaacaaattaattacggagtactttcggtgtccatcatctgatcaaagacaaaagaaagcatgtaaagtcaacacaccatctaatttgaatagccagaaaaaatccaatgctaaggccactggtggaaggcgtactgttaaaggaaaggttaaagatacacctatttggtgttgtatcccagggaccccttttcgagtggtatgatttgttttcaataggctgaaccttacattattcttcgtatgccatcaggctccgtaactgaatatattgctgcaggatgcttttcgctacttgagaggagattgctgccactggtttctgacacactttcatgtagaccgtaagtccaagttctttgttatcgaagagtcaatacaaactgaagaacgaaagaaatatataaagtgtttccttgagtttccattaatgaagacttagccattttttttgtctgacttgctattgaatcatttactgctacctccatcccataaagacttcatttttggctattaaccttgacaaagacttgttgtctaggttcatagccagaaatgagtctttttgggacagaggcagtacatcaatttgacattctagcatactacaagaagtggcatgtttgcatctcattgtttgttccctctatctttagctgtacttatctagtgaaataattagtttccacttttctttcttcgtgctaggcaggtttgcctgatgttttaatatctaaaacaaatgactttctgttcacagattaccaaggcttgacaaaaagtttttgtcatgggaaaatatattgttcatcagttacagctaatcttgtacattataagattggtatcccatgggatcgattacatgtattgccactcaatgaaaagattactatcgcaggagttaatttaacatgttttgatgccaatcattgtcctggagcagttattattctctttgagccatctaatggtaaagtaagtgttgttctaagttgcttcatcatctattcagcataactacttaacatgccatgtttctttacttgctcttttaggctgttctacacactggagatttccggttttcttctgagatggcaaacaatcgtgttttgcagtcttctcctatccacactctaatacttgacacaacctactgtaatccacgagtatgtttatcgcctagctgtatcagaagtgtttcccaagtttataattgacatggtcaggctatcatgtggcctttacataatccaaaaaaaaatgttttgcagtacgacttcccaactcaagagattgtaatacagtttgttatcgaggctatccaagctgaagctttcaatccaaagacactttttttgattggcagctatacaattggtactgtctctgtgtctcatctttgatattctggatattgtagtgggtatatacataaatcgttcatggatgcaggtaaagaaagactgtatatggaggttgctcgtttgcttcagaagaaaatatatgttggagctgcaaagttgcaaatattaaagcacttggggcttcctcaggaaatcatgcactggtttacagccaatgaagctgaaagtcacatacatgttgttcctatgtggactctggcaagcttcaagcggatgaagtatttgtccactcaatatgctgtaagaaaagtacttgatcctaccttcgtttgtaagataggggttttagcttgtttgatatgtccctattaatctgatgagttaatttaagaaaatcatggtctttaaagttgaagttgctatttctactccacctaaggataaggactaagatctgagcatcagagcatatatttgtaatctggctctttaaaattctggattgatacaatacctctgtgttccttttctaatgattagtcacattcttttggactaactagctaaagctgagaccttgttctaaacctgaatatccgtgcattagtcttcatatgttctgtttgcttctgaagttgccatttattctgattttctgatggctatattacttacaggatcggtttgaccttatagttgcattttgtccaactggttggtcatttggtaaagggaagaaaaggacaccaggcagaaaatggcaacaaggagcaataatc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