Os07g0484300
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Structured Information
| Gene Name |
Os07g0484300 |
|---|---|
| Description |
Zinc finger, RING-type domain containing protein |
| Version |
NM_001066184.1 GI:115472100 GeneID:4343241 |
| Length |
11094 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os07g0484300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:18404377..18415470 |
| Sequence Coding Region |
18404676..18404735,18404823..18405183,18408486..18408692,18409375..18409442,18409528..18409665 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008400:18404377..18415470 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggcggtgaacagcctctacgtcgccgcggcatccaccgcggccagcgccgcggcgctgcagtggtgggcggggtccctcctcgacggggatgccgacgcggcgggcgggggaggaggaggaggaggaggggactggctcggcacggtgctgggctcgcacgtgaccgtcgcgctcctggcgaatctggcggcgcacgtgttcctcgtcctcatcctctccctcaagacactattttttgttcaattaacctcttctgagactagaaaggtgttggaacacatcattaactatgtgctttacaagggaacttttctcccactggttgtgcctcctaattctcaacaaataatcctttggtcaagttggttgggccttctttgttccctgaagatgtttcaatcattggctagagaacgccttgaacagctcaatgcttcaccatcagcgactccatcaaaatactttcgtgtatattctgcactattgctggttctatcggctgatgtactatggataaagctttgtgttgggttctgcaagtcgtgtaattctcaactattttggcttatgttttttgagccacttagtattggctttgagacactgcagtcaatcatggtgcatggatttcagttgtttgacatatggcaacgacatcaaatggacagtggtgtggactatcttgatttccaaaaaacttataagcaagcagcaggatctttttctgagtggagaggcagactagtcagaaattttggttttgtcattgacttgataagcttattgatgtcacttggtcattactcaatgatcttctggctccgtggtatggcgtttcatctggttgacgctgttctcctattgaacttgcgcgctcttatagcttcattttggaagcggataaaaacttatgccaagttacgaaaggcacttagttcactcgacggagcacttccagatgctacatatgatgaaatctgtgcatacgacgatgagtgtgccatctgtaggggaccaatggctcgagctaaaaagttatcctgcaaccatctatttcatctagcttgcttgcgatcatggttggaccaaggattaatggatggttactcatgtccaacttgtcgaagacctctctttctgtcatctcaaggtcacacaagatctacagcagaggtaggaaacgtccagttaattgcagaacaacttaatgcggggttgaatcagcagagggttcctggtcatgaacatcctattgaacatcagaatcctgcagatgctgtttggagaggtgctggtcttgattctagctgggcaccaccatggtcgagccctgggatggacaatcccagttcttccagcgccgtgacatcagtggggcttagtggagttcagatgatgatgaggcagttgacttcagtgactgataattatgggcatccagatgccacctggagtctatggcctgagccagttgcaggatcttcggttgttccatcctcttcctcgaggcctgatggtgcttcagctgctggcttgcggttccgaggcactgcaagacccgcgaatggtagcatgtcggaggttctctccatggtagatagagtacgagaagttttaccccatatccctgacgagctaattattgaggatctgatgagaacaaataatataaacgctactgtaaataatcttctgctgatgcaataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAVNSLYVAAASTAASAAALQWWAGSLLDGDADAAGGGGGGGG GDWLGTVLGSHVTVALLANLAAHVFLVLILSLKTLFFVQLTSSETRKVLEHIINYVLY KGTFLPLVVPPNSQQIILWSSWLGLLCSLKMFQSLARERLEQLNASPSATPSKYFRVY SALLLVLSADVLWIKLCVGFCKSCNSQLFWLMFFEPLSIGFETLQSIMVHGFQLFDIW QRHQMDSGVDYLDFQKTYKQAAGSFSEWRGRLVRNFGFVIDLISLLMSLGHYSMIFWL RGMAFHLVDAVLLLNLRALIASFWKRIKTYAKLRKALSSLDGALPDATYDEICAYDDE CAICRGPMARAKKLSCNHLFHLACLRSWLDQGLMDGYSCPTCRRPLFLSSQGHTRSTA EVGNVQLIAEQLNAGLNQQRVPGHEHPIEHQNPADAVWRGAGLDSSWAPPWSSPGMDN PSSSSAVTSVGLSGVQMMMRQLTSVTDNYGHPDATWSLWPEPVAGSSVVPSSSSRPDG ASAAGLRFRGTARPANGSMSEVLSMVDRVREVLPHIPDELIIEDLMRTNNINATVNNL LLMQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>10736..10795#10288..10648#6779..6985#6029..6096#5806..5943#5560..5717#4900..5005#4583..4679#2910..3031#2746..2832#1824..1901#203..433#tcttcctcccctcaatccccccttttctcacggcgtcgcggcccccccgaaataaagccgtcgtcgacacctcccccgagccgcaagcaaccccgcgattcccccgcatcgccggcgaatcggcggcggcgacgacgaggacgacgaggaggccatagggttgtggaggaggggtgggggacctgtcttcgatgcgcggcgcatggcggcggtgaacagcctctacgtcgccgcggcatccaccgcggccagcgccgcggcgctgcagtggtgggcggggtccctcctcgacggggatgccgacgcggcgggcgggggaggaggaggaggaggaggggactggctcggcacggtgctgggctcgcacgtgaccgtcgcgctcctggcgaatctggcggcgcacgtgttcctcgtcctcatcctctccctcaaggtgagcaatcggtcgatcgggaatgggatgggggttgggattgttgctgctcagggccacgcggtcattcgcttagattgtgctgtttggggaaaaaaaaacttttgtcggttgaccacttgtcagtaataataatataagcaataataatatatgcaagctgatagttgggaagatggaggtgttttttctgcccaaatttgttgattcaaatttgctgcccaatttgttggtttaatttgcgtgctgaagatatgtttgatgtttaggtagaaataaacttaatttgtttagttagaatggacgtgttttccttcattaaatcagctaatgacattttgtttccatgttgtttttggaatcatcaagtgtgtgagataatggagtgatttagtaggaatattgtgctttagctgattgcgaagaaccacatgttctcaggagttgcatttcagttgagtagatgcttatctaaactatggtagttggaacatatggggaagtagcaatgccaatagcaactatacaacaacatgcttgaatacaggcttgaacaccgcgattctgaagtctgaactggatatttgtacgtagtatttttgttgctcgatgctagaggatttctgttatgtggtatttttgttgctcgatgctagaggatttttgttacgttaagcggttctgaaatctgaactggatatttgtatgtggtacttttgttgttcgatgctagaggatttctgttacgtctctgaatggctgttatatggctttgatagagcaagagctaagctgacagtgtgtgacttggttcgttgcgatttccttctagactcatttttgtgcatgtggtttaatattcatgtaagaacttgtattgatacatccacttcttgattcatgtcgtaaactggctgtacttaattatttttacttccataggaatctttaaaaggagcattagagtttgacccaattttgtagttcaatcaaagcattttgtctgttggaaaagctcgtcctccatgtatgcatacagtttgcattgcaaacatgataactatgttatataaaaacactatttcatagaggaagctaaacttctagtctgctatcctagtttagattcttagtgacttatatatgagagaaaggatggttcatactattacaaagccaggtgtccaggtgacctttttgaaggcacaaggcagggcattgttcttcctccattgttccaatccatgatttagcggaaaccattttacctgagcatccagatttcttttaatgatttttagtaaagaggatgttgcagcttagcttatatttaacgtatgcatatcatattagcaatagtggcgttaatgttgttttttcttttatgcagacactattttttgttcaattaacctcttctgagactagaaaggtgttggaacacatcattaactatgtgctttacaaggtaagcgctctatccatctctctctctgtgtgcgcatgcgctccccttttctcctgactttctgctgataagctcgtagtcttcaacacaagagacttgctctaaaatgatgtttgcaatatatgctttagtgaatttaaagcagcttgatagtgagttcttttaaattagataatatgcagtcttacactttgttcaataactatcagccataatacatgtacaatctaatttagatctaatcctatctccttgagaatcttagcacaagtccaatacgtggatactctgatctttcatagatataagggtttttggagggatgtgatgcatcctagtactacgaatctagacatggagtctgtccagattcgtagtactaggatgtgtcacatccccccaaaaacccttatattttgggatggagggagtagaagtttccatgcccttttgtagaagtgaagactacgatttacaagttggaaaagtaaaccgggagatttgatcgtataccctcctttaaatcaaaagttgaggatttagcctcctatgccattgacatgtggggtcatcaacctaacttgtgggccaggagggtacatcctcaatttcaatcttaaggccatgttcggttaatccccaggagggagggattggaggggatttattccacacctattgtggtgtggaattattacacctcaaacccctccaatccccttcaaccccttccaaaccgaacaagccctaagggaggatgtatgatcaatttacagttatttatttatgttcttgttgttgcctgccatgtgaagaaatgccaatgatctctctcgtattccagggaacttttctcccactggttgtgcctcctaattctcaacaaataatcctttggtcaagttggttgggccttctttgttccctgaaggtaatgttttagaacttcaagtcttcaactagttaagattatacccttacattaactaaaatttctcgtacatccagatgtttcaatcattggctagagaacgccttgaacagctcaatgcttcaccatcagcgactccatcaaaatactttcgtgtatattctgcactattgctggttctatcggctgatgtactatggtaatattccctggttagtctgcattttactgttttttgtttagaaatattatttacacataattttttctttgcttaggtgttgggtacacttaaatttattttgattttgtagatgtcagagatgcatgatgtcacttactcacttccaacatgaaattattgtcccttacaatttcttgcaacttgcaacttctgttataaacttactctgtccggtcaaattatttgtcatttagagatgcacttgatagtgcagtggcaaggggtgtgtggtttcaaccctaagatcccttgttcaatccccaacactctcacaatttcttcttaaaaaaagtttggagggacatctctcactccaaatctcgtttatttggtcctgcaacggcttggctactctagctttccaacccaagatactgctaggtttgccaattggtggtcaagaacagtaaggggtttacctgataatgagaaggaagggctaaactctttagggcccctttgaattggaggaaaaacataggaattttggaggatttcaatcctataggaaaatctcctatgaagccctttgaaacaaaggattgaatcatatccaatcctttaaaattcctatggaatggacaatcctatagagattttggaggaaatttagcaagagcttcaacctcttggtaactttctttgagtctatctctctcatccaattcctgcgtttttcctgtggttcaatcaaacggtcattcctgtgtttttcctaagttttgcaatcctctgttttacacttacattcctatcagaatcctacgtttttcctattcctacgttttctcaatcctgcaatcctatcagaatcctacgttaatcatcttggttgcttgggaaatttggaagcacaggaacaattgtgtttttaatggtgccaccccatgcttggttgatgtcctccaagccatcgctaatgagggtgctctttggtgcctagcaggagctgctaggcttcgtgatctctttactagggctgtgctgctaatgcactagtttgttttacttcctttgggtgtgtggtgttctattgtacccttggtggcgggtgtcggagtctttctctaacaccgtccaccttttctcctttttcttaatgaaatgatatgcagatctcctgcgtgttctaaaaaaaatatttgtcatttaggacaagatttggtcaaacttttaaaattctgaccatcaataatttcttaaatgcttagtttaaaaaagaaaacaaatgatatacatagatttgcctcaaaaagtactttcataatatcatgaacttattagactttataaatttattcacataaaattgtattcggaattttaaaagtttgtccaaatctggtcctaaaacgacaaatatttttgaccagagggagtataatggaatgagttgtattgatgcttgagtttaccacatttccttttgttatggtgtccttgacacaactgtagcatgtaatacttttaaaagctcacacttaattgattgtctatcttctccaggataaagctttgtgttgggttctgcaagtcgtgtaattctcaactattttggcttatgttttttgagccacttagtattggctttgagacactgcaggtacttcaacccagattgtgggaagtttctcctccttatcttttcttaatttataacgatcttgcattatcaaagaaatctgcattgcatttaatgttcaaaggaggtggtgcttataaatgccaactagagatgttaaaaatattatgagcatttacctgcatgcagttatt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