Os09g0464400
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Structured Information
| Gene Name |
Os09g0464400 |
|---|---|
| Description |
Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2 family protein |
| Version |
NM_001069946.2 GI:297609601 GeneID:4347307 |
| Length |
11995 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os09g0464400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:18250230..18262224 |
| Sequence Coding Region |
18250230..18250330,18254408..18254967,18255083..18255144,18255485..18255697,18255868..18255952 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008402:18250230..18262224 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgtcggcggcgttgtcgctcgcggtggcggtggtggccgtggcggtcgccgcggtggtggcggtggcgcgtggggcgctgcggcgcgccgcggcgcggagggaggaggtgcggcgcctcgccaggctcgcggcggtggaggccgaggtcgcggagcgcgaggcgtactgctacgcgcgggggaggggcggcgtggcgggtgcgccgctgtggacggtgcccgaggtggcttcgccgcgggaggacgaagaggaggaggaggaggaggaggccgcggcggtggagttggaaatgccggcggcccgtcaggcggaggcagcggcggcggcggcggcggtgaaaggggtgtgcgtggtgtgccgaaggccaaccacgtttagatgcaagcgctgcaaaggggtcaaatactgtaccttcaagtgccagatatctcactggagacaaggccataaagatgaatgccatccaccaagagttgatgccaggcctgacaatataacagtagtttctagtgttaaaaagggtgttggaatgtacaattcatttgaacaaagtgtgaaatccagcgtagaaccagcggttgaagtcaacaagtcagttgctgctgtgcctgaattgtctgaggcaaaccttgtctccgatggtgtagataatgaaagaaagaagatgagaggtcagaaggcatctattactgcaaaggtttctgaggatgtccttgacaacaataggattagatctgttgatagttctaggctcccaacttctggtaaagcttgcaatattcaggatgctactgttaatgagaatttctctaagacttcagcaggcagctccagttctcgagttgaacggtctaccacgtcggaacctgaactgaaccattctaacaaacaggcttctggcacagacaaccttaaaagttcgagaggtttgccatctgtgtcaactgttggcacaatttcttctattcatggatcagagaaagaagctgctatgccaaataatcggtcattggtaaagaatattcccaggcaacaagcagctgcaaaagttgtgaggcattatccatcggaaatgacactttttccgtatgaacattttgtcaagctctacaattttgacaaggtggagctgcgcccttttggtcttgtgaaccttgggaatagttgttacgcaaatgctgttcttcagtgcttggcatttacgcggccacttacagcataccttacggaaggacttcattcaagaaattgtaacttaatactaagccagaattgtgttacataccatggttccaaaaaggaatggtgcttcatgtgtgagtttgaaaaactcattctggagggtaggcgaggaaaatctcacttgtcacctactggaatactatctcatttgcgtgacattggaagtagctttggccccggtagagaagaagatgctcatgaatttctcaggtatgcaattgatactatgcaatctgctagcatgaaggaagccaagaaaaacggtgtttatgggctgcctgaagaaacaacactggtgcagttaatatttgggggctatctacgatcgaagataaaatgcacaatgtgtcaaggcagttcagaacaatgtgaacgcattttggatcttactgttgaaatagatggggatatcaatacccttgaagaagcacttcatcggtttacatctacagaaattttagatggtgataatagatacaattgcagcagatgcaagtcatatgaacgtgccaaaaagaagttgacaatatcagaagcaccaaacatcctgactattgcgctgaaaagatatcagtctggtaattttggcaagatcaacaaggctgtcaggttcacggagtacttgaatttgtctaactacatgagtacagcagatgatatttcccccgtgtaccagctctatgctgtggttgtccatcatgatgttatgaatgcagccttttctggccattatgtgtgttatgtcaaagacacacaagggaagtggcacaagatggatgacagccaggtgaaacctgtttctctggaaaaagtcttgtcaaagtgtgcatacatgctattttacgcaaggtgttcaccacgggcaccaaactctgtaaggaaaatgattcttgctcaagactcatcgtgcacaaagaaagccaagcagatggtggatccaggaccaccatctttggaaggaggaagttacttaagcagacaccaaggtgggcagtcatgtagagatcatatagtctatgacctcacctacacattcggtggctcatcttatacagtagtggagtccccgagtccaagtgacagctcctcgctgttcagcaactctgatgcagggtcaaccagcactttcagtagtgatagcactgacagcacaaggaattcgaccagcatggaggagtatgattacatatttggaagctcggatcaaatgtaccctgtaagcacggtggttatacctgaggaacatgaacttagctattcgcggcagaggtctagcttgaaccccagcacttcaagtcaatatgtggatcaagcagctgaggttgagatgctgcaccagcaccagcatcaggccggcagagggggctgggatgagggtgatgtgatgccattcttctattccaaccaagaacgggcatggaggtatgctatcttcaagttggaagcagacaccgtccatcatcgtctccaactccaccaacttgaagaaagcaaaaacttgtatgtttag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASAALSLAVAVVAVAVAAVVAVARGALRRAAARREEVRRLARL AAVEAEVAEREAYCYARGRGGVAGAPLWTVPEVASPREDEEEEEEEEAAAVELEMPAA RQAEAAAAAAAVKGVCVVCRRPTTFRCKRCKGVKYCTFKCQISHWRQGHKDECHPPRV DARPDNITVVSSVKKGVGMYNSFEQSVKSSVEPAVEVNKSVAAVPELSEANLVSDGVD NERKKMRGQKASITAKVSEDVLDNNRIRSVDSSRLPTSGKACNIQDATVNENFSKTSA GSSSSRVERSTTSEPELNHSNKQASGTDNLKSSRGLPSVSTVGTISSIHGSEKEAAMP NNRSLVKNIPRQQAAAKVVRHYPSEMTLFPYEHFVKLYNFDKVELRPFGLVNLGNSCY ANAVLQCLAFTRPLTAYLTEGLHSRNCNLILSQNCVTYHGSKKEWCFMCEFEKLILEG RRGKSHLSPTGILSHLRDIGSSFGPGREEDAHEFLRYAIDTMQSASMKEAKKNGVYGL PEETTLVQLIFGGYLRSKIKCTMCQGSSEQCERILDLTVEIDGDINTLEEALHRFTST EILDGDNRYNCSRCKSYERAKKKLTISEAPNILTIALKRYQSGNFGKINKAVRFTEYL NLSNYMSTADDISPVYQLYAVVVHHDVMNAAFSGHYVCYVKDTQGKWHKMDDSQVKPV SLEKVLSKCAYMLFYARCSPRAPNSVRKMILAQDSSCTKKAKQMVDPGPPSLEGGSYL SRHQGGQSCRDHIVYDLTYTFGGSSYTVVESPSPSDSSSLFSNSDAGSTSTFSSDSTD STRNSTSMEEYDYIFGSSDQMYPVSTVVIPEEHELSYSRQRSSLNPSTSSQYVDQAAE VEMLHQHQHQAGRGGWDEGDVMPFFYSNQERAWRYAIFKLEADTVHHRLQLHQLEESK NLYV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>11895..11995#7258..7817#7081..7142#6528..6740#6273..6357#5802..5959#5569..5689#4936..5098#4766..4890#2975..3063#2227..2893#1..413#atggcgtcggcggcgttgtcgctcgcggtggcggtggtggccgtggcggtcgccgcggtggtggcggtggcgcgtggggcgctgcggcgcgccgcggcgcggagggaggaggtgcggcgcctcgccaggctcgcggcggtggaggccgaggtcgcggagcgcgaggcgtactgctacgcgcgggggaggggcggcgtggcgggtgcgccgctgtggacggtgcccgaggtggcttcgccgcgggaggacgaagaggaggaggaggaggaggaggccgcggcggtggagttggaaatgccggcggcccgtcaggcggaggcagcggcggcggcggcggcggtgaaaggggtgtgcgtggtgtgccgaaggccaaccacgtttagatgcaagcgctgcaaaggggtcaaatactggtcagtgacttaccatcctcctagagttgtttcccgtgcaattcatgtcgagttgtttcccgtgcaattcatgttgattatgatgtggcattgtgcaaatggcataaaaaatagtttggctttcctaaaaaacaagggcgctgctacgccactgatttgaatggttcataaatgttaatagagtaccactgcacctgttctttgtgttgagcttgagcgtgttttccctttcccaaatatttgttgcatagaactttatagaacttggagtaccagaaactgcataacacttcaacacatgatttgctcaacaccgacatgctagaacctgcattacctctgacaattatttctgaagcttctaatataaaatgataaattcaatcaaatgatatgctagtggaataatggtcacggacagcacttgcaagacatgtattctggcacagttgcacagttgtgctaagcagtggtagcattagcgcctgtggaagtgtgggactgtgaagaagatgtgccagaaataggagtaaatcctaaagtatggcaattaacagtgcttctaggaatttaaagtatccattatgtgtaatattcagtatgagaactaatgaccacaaaaatcctttattagttctaactggtaatatttagttttttttttttttggaaaaagcaagattttgctatgtggtgatgttatgtatggagtgtgttatatgtaaataccagataagctataatttcctctgtatgaggatattattgtttgattctgagtaagtatatcagccaattagaattgttgtacaatcaactttggctcaatggattttgagcattggcgctgctttcagagaattaccttattttcagataacctgttaatatgtcttcttcagattaggaaaataaatatgcacatagattacataaaattgttctgttgggtatattatatgtgatctagaccccagcttatcaattcctataatctagaccactgtcaaaatgtcaaacagcctatagactaatatataatcctaataaatatggtaccgtgttctggagttctgtttacatctagtattgtttaacgaaatgctaggtttctatttttttttgtattaacttggatgctactccaaatctctaattgtaggaaaaaaggacatgaaacaaatgcattgggtggtctcaaaacttaaaagttgcgcattaatctaaactcaagaacatgcactttatgtgcatttttatccaacataacctagttattaaaaaatggagcacttcatttattgaattaattttcattccgctatatatttctttaactgggtaattaattgtttccaaattcctggaaatggttggcttggttgtctacattatgcacaattgcacatccttgaaatgtatcacttatatcttaatgtctcttttgaaggtattgagctataaatgaatcctgaaaagcgtttaaacaaattcaaattcccatggaactattatttgtaaatattgcagatcagtatacaattccagacttgatatctccacttcctgttttactccatgtcaaggcttaggtcttttggtccaacaattccacgcttccccttcttatgtgattccatcttatctatatttattggttaatatatcagaaatatttagtttagtgcagttttttttatcatgactttgcaagttatgttgtgtggcatcaatctaagatcgttaataatatctatgttatctgttctataaccaatgtgctacttcagtaattccctttttttggttgcagtaccttcaagtgccagatatctcactggagacaaggccataaagatgaatgccatccaccaagagttgatgccaggcctgacaatataacagtagtttctagtgttaaaaagggtgttggaatgtacaattcatttgaacaaagtgtgaaatccagcgtagaaccagcggttgaagtcaacaagtcagttgctgctgtgcctgaattgtctgaggcaaaccttgtctccgatggtgtagataatgaaagaaagaagatgagaggtcagaaggcatctattactgcaaaggtttctgaggatgtccttgacaacaataggattagatctgttgatagttctaggctcccaacttctggtaaagcttgcaatattcaggatgctactgttaatgagaatttctctaagacttcagcaggcagctccagttctcgagttgaacggtctaccacgtcggaacctgaactgaaccattctaacaaacaggcttctggcacagacaaccttaaaagttcgagaggtttgccatctgtgtcaactgttggcacaatttcttctattcatggatcagagaaagaagctgctatgccaaataatcggtcattggtaaagaatattcccaggcaacaagcagctgcaaaagttgtgaggcattatccatcggaaatggtaaataaaactggaagctcttttaatcattaacatatatcattacactaaaattacctaatggttgtctcaatttttcagacactttttccgtatgaacattttgtcaagctctacaattttgacaaggtggagctgcgcccttttggtcttgtgaaccttgggaataggtaaatcaaataatgaacctgtaaaatatcacatgtgaggaatcatactgatttgaacatttatgtcatttaattaggtcgatcctaatgttttcatttggcaattatttatacctatgcatgtcattactaaactattttcttaaaatgggtttgttcattatttgattttcttcttccactgtagtttgaatgatttgatttatcaatgaccttgtgttaactcatgtgccaactcacacacacacacagatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatgcttatattattgttgtacttcaagtagtccatgtagaagcattttattcagtagaagatagctaataaagatgatgaaatcaaacatgtgatgatgctgttgtcttgaatacatgtacttttgatggtttcacctttttttcacattggacttaactatgttcattgcactggcaataggacttattaacttttacatgatacgggcagacaacgcatttattcagcatagattggtggtcaacccaatcattttctattcagcaacatttgatagttgcactcttgcgacactagtaatattttttacattgttgtaatgcactaaacggtgttgtagattttgcagggccacatgcagtgttaaaggtttaagtaataaatcatatcaatgtacatgatcttaagattgggttatcaatttaatgttattaatttgcaacgatgttcacatatgtattatctgcaatagcatggataaataatcagatttttaaagttgcatatgattccacaatgttattcttttaatgtaaaaaaaaaccacaataatataacaaaacggcagttctattatacgcttccctctactagaaaggaagtgtcctgtgttgttggcaagttgaaaggtgtacataggctgcaacatgagcattaccctactgtatcctgacagaatctagcatactgcattttataagagcccatatctcattgtttcacattagatggttcgaatcaaattgtctaatctttctaagacacgtgcattggtgttatacaccaacagatcaaaagcatactacatggcataccacaaaaattagtatgacgaggtacatattgtaaagtatagaaggtaataatgtgtctaaatgtctagttccctttttttaatgaaacttgaagaggaaaagtctgggttaaagtcttcaatagcatgcaaggctccaatatggcaaattctgcggattaaaaaataacagcatgtgtccgaaatgatttgtggtagcagatactagtgctcaggcaggtagcttagcgcaataggcacacttcagcttgatttttccttgtgtttttggttctcgcccaaacttacaactactgttttttcaaccgtaggattgctttcagcaggattttttgcccctgcattatagtttttctctatcatgttgtgactgattgaatataaaacatgtgtgtggtgtggtgttgtgtttgttcttcttttttaatggaatgacacacagctctcttacacgtacaaggaaaaaaaagaatatataaacatgttagagcacattatgttatgtgtaaataatttgcttaatccaagtgtgatgcttaatgctgtaatatttgcctaaactccctcttttgatttcttttcagttgttacgcaaatgctgttcttcagtgcttggcatttacgcggccacttacagcataccttacggaaggacttcattcaagaaattgtaac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