BGIOSGA017012
| Gene Name |
BGIOSGA017012 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA017012, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_17172 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA017012-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA017012-PA |
| Length |
6418 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:28602328..28608745 |
| Sequence Coding Region |
28602328..28602524,28603043..28603120,28603701..28603873,28604036..28604082,28604171..28604390 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:28602328..28608745 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGAGGGCGGAGACCGGATCGGCGCGGAGGGGAGGCGCGGCGACGTGACGGGGAGGCGCGGCGATGCGGAGGAGGCGGAGGGCGGAGACCGGATCGGCGCGGAGGGGAGACGCGGCGATGTGACGGGGAGGCGCGGCGATTTCTGCGGAGGAGGCGCGGCGATTTCGGCGATCGAAAGAGAGAGAGAGGGGGGAGATCCATATCGCCATCTTTGGGAGTTAACTACTGCTCGAAGGGCCGTAATAAGTCTTCAATGGTTGAAGGATGCAAGAGGTATTGTCATATCATTGGAAGATGGCACGTTAAAGTTCGTTAGCTTGTCGAGAATCGCAAATGATGTTCCTGTTACTGGAAGGCCATTTGTTGGAATGAAAACTCAGGGTGTTTCTACCTATCAATTGTCTGAATATTTGATCTGGAGTGTCCATGCCTCAGAAATTGCAGGCTATGCGGCTTATTGTGTGGCTGATGGAACTGCTGTTTGCTTTGAGCTTACTCCGAGATTGTGGGAAAAGGAACCTGGGAGGAACCGTGTACCATATTTTCTTTGTGGTTCATTATCAGAGGAGGGAACAACCATTAAAATTGGTATTGCATTACCAAACTCTCCTTTGTCAAATGTTCCTCTGGGGACCAAACGGGCTACTAAAACTTGCAAAGATGTAGCTCAATTGCATGTTATAGAAGAAGGGGAACTTCTTACCAACTCAGAATACAATTGTGCTATAAATCCAAGCATCAGAGATGGTCAACAAGATGAACCTGATGAAGGACAAGAAACTGGTGCCATAGTTTTAGCTGCTCCTTCAATGCAAGAGAATTTTGGCACAAGCACCAGCAGGGGTAGCGAATCCCCTGAAAAATTTGAGGGATGGTTATGCCTTATATTTTGGAATGGAGGGAGTAACAGATTATCTTTGGAACTCCCGACAGAGATGTATAAGCCTTATGGACTGAAGCTTTACCTGAGCAGCGAGGTTCTCTGTGTTTTGGGACCAGCAATTCATTACAGTGTAGGCTGCGTGTTCACGGTGGTATCATTTGCAGGGGTCCCTTGGTTCTTTGAGTTCATCCGGTCTGGAAATGTAACAAGATCAGTCTCAAAACCTCATGGGCGGAACTTGTTTCTGCAAAGCTTAGTTGAAGAAGGGCAGAATCCAAGCACTAGCAATGGTGCCAGCAACTCCCAGAAAAGTGTTGAAGATAAGGACCTGATCGACTGTCTAGAGAATGGCGTCAACTTTTGGACGGATTATTCAAAAGTTCAGTATCATCCTCAGAGTTTATATGAGTTACATGGGTCATGGACAGACTTTGACAAGTTTGATAACTATGGCAGTGCACAAGAGGTTGTTTCAGACTGGTCGCAAATAGAGGAAATGAATGAGAGGCTAAGGTTCTTTGTTGAAGAATGCGACCATATTCAGGGCATCCAGTTTATTGTGGGTGATTCAGGAAGTTTTTCCAGTGTAGCTGCACAGTTTTTGGAGAACATTGCTGATGATTACACAAATACACCTGTATTGCTTTACTGTGTGAGGGATCCAATGACCCTTGGATCATCCAGGATGAATCAAAGGGAGTCCATTATGAGAGCTCTTCATGATGCTGTTTCATTTTCAAAACTTTCGTCCTTTTGCAACCTGATGGTCCCCATAGGACCGCCTTCATTAAGTAGAAGTTACATGTCACCGTATCTTTATATACAAGACGAGAAACCATTCCATGCTAGTGCTGTTTGTGCTGCAGCAATACATTCAATTACTGCTCCATTTAGATTGCAACGAACGGGCCCGAGTTCAGACTTAGCACATTCATCTGGTAATCTTGACATTGGTGAACTTCTGCACATTTTATCTGATCAAGGTCGGCAGAATATGATAGAGATGCTATTGGGGAACATAGAGATGAAGCTGCACTCTTTGACCCCTGAAATCAGCGACGAGGACGAAGATCCTTATTCAGTTGAATCGCTGGTGGTTCATGGAGCTCTTGATAGAGGTGGGCAAAGGACTTCCATATCACGAGTGAAAGACTCGCATCTCTTTGCTCCCTCCCTGTCCCCCTTCCGTTCCCGTCAATCTTCAGGCAACATTGGCCGGCACGGGGAGATCCTTAGCGACCATGCAGAAGAATCCCAGCCAAAGGGCTCACTCGATATTGAATCGATACCGATGGCGGCACGATTACGATCAAGCAGCACCGTCCTGCCTTTCATAGAGAGGCGATCGGGGAGCCTCCAGAAGCACGGTGTCGCAAGAGGTGCCATCGGGTCTCTGGTCCTCCGTGACTGGGGCTTCGGGAGGGAGGAGGTGGATGACATGGGGGAGCACCTAGCAAAGTTACTCCGCCCGTTTCACCCTGAAATGGATCTTACTTCGGATTCTGATTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAEGGDRIGAEGRRGDVTGRRGDAEEAEGGDRIGAEGRRGDVTGRRGDFCGGGAAISAIEREREGGDPYRHLWELTTARRAVISLQWLKDARGIVISLEDGTLKFVSLSRIANDVPVTGRPFVGMKTQGVSTYQLSEYLIWSVHASEIAGYAAYCVADGTAVCFELTPRLWEKEPGRNRVPYFLCGSLSEEGTTIKIGIALPNSPLSNVPLGTKRATKTCKDVAQLHVIEEGELLTNSEYNCAINPSIRDGQQDEPDEGQETGAIVLAAPSMQENFGTSTSRGSESPEKFEGWLCLIFWNGGSNRLSLELPTEMYKPYGLKLYLSSEVLCVLGPAIHYSVGCVFTVVSFAGVPWFFEFIRSGNVTRSVSKPHGRNLFLQSLVEEGQNPSTSNGASNSQKSVEDKDLIDCLENGVNFWTDYSKVQYHPQSLYELHGSWTDFDKFDNYGSAQEVVSDWSQIEEMNERLRFFVEECDHIQGIQFIVGDSGSFSSVAAQFLENIADDYTNTPVLLYCVRDPMTLGSSRMNQRESIMRALHDAVSFSKLSSFCNLMVPIGPPSLSRSYMSPYLYIQDEKPFHASAVCAAAIHSITAPFRLQRTGPSSDLAHSSGNLDIGELLHILSDQGRQNMIEMLLGNIEMKLHSLTPEISDEDEDPYSVESLVVHGALDRGGQRTSISRVKDSHLFAPSLSPFRSRQSSGNIGRHGEILSDHAEESQPKGSLDIESIPMAARLRSSSTVLPFIERRSGSLQKHGVARGAIGSLVLRDWGFGREEVDDMGEHLAKLLRPFHPEMDLTSDSD</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..197#716..793#1374..1546#1709..1755#1844..2063#2133..2290#2817..2959#3227..3289#3967..4318#4462..4714#5128..5327#5459..5579#5972..6009#6065..6418#ATGGCGGAGGGCGGAGACCGGATCGGCGCGGAGGGGAGGCGCGGCGACGTGACGGGGAGGCGCGGCGATGCGGAGGAGGCGGAGGGCGGAGACCGGATCGGCGCGGAGGGGAGACGCGGCGATGTGACGGGGAGGCGCGGCGATTTCTGCGGAGGAGGCGCGGCGATTTCGGCGATCGAAAGAGAGAGAGAGGGGGGGTGCGGGAGGGGATGAGGAGCGACACGCGCGATGATTGCGGCGAGCTGCGAGCGCGAGAGAGAGAAGGGGGTGCGGGCGCATCTGGGACGTTGGATCCTCATTCTTCAGAAGGTTTTGGACCGTTAGATGTGTGATATGATGAATGATGAATGAGTAAATTATTTGTTTAACTATAGGCTAGATTTGTTTCTGTTTGTTTCCTAATGGTAAAAATTCCGAGTTAACAAACAAAAGATAGGCACGATATGCAGAATATGTTATTATCATATGGACCAATGATGTCAGCAGGAGTTTCTTTATGAATCCAGTGCGATATACGGTTTTTTTTCTTTAGCTTTTCAATGGGCACTAAGAAACTTGTTCTAGAAGCTGCAGTGTGTTTGGCTATGGATATACTGATTGTTATGGTTAAATCACTACCTGTCACAGCCCCCTTGGATTTGCTGTTGTTTTCTACCGTTTTTGTTTTGTAATATTTGGGAATTTTAGTGCATCTCATAAGATATCTTTGCTGCAGAGATCCATATCGCCATCTTTGGGAGTTAACTACTGCTCGAAGGGCCGTAATAAGTCTTCAATGGTTGAAGGATGCAAGGTAATATTTGTTAAGCACTAAATGTACTTGTTTTTTTTTTCACTACAGAAGATTTTTCATCACTAACACGGTGTTTACGTTGTTTTCCTTGTCTTTGAAACACTGCACTAATTTTAAATGGAGATGTATGTTTTCATTAATGTTGGAACACATACTAGAAACCAAATTTGCTAGAATGTTGACAATTGTTTTAGTCATGTAATTTATGTTCATAGGGCCTGTACTTCTCTGTTAGTGTGTGCTAAGGTGGATATTGTCTTTGTTTATATAATTTGTTCCATTAAAGCATCAGCGTATTTTTTTAAGTAATTCTATTTGCACTTTTTTTTTTGCAAACGCTCTATTTGCACTTGTTTACGTAATTATTAATATAAATGTTTGTATTTGCCCACGTACCTTCTAAATATGCAAGCTTCCTTCACTGGACATGGTCTTGATGTGTTACTGGATCAAAGTAGACGTGATTAAATAGACCACATTGTTTCATTCATGGTGATATTGTGTGTATATATGCCAGACATACCCTTTTGTTTACAAGAATGGTAATGTTAACTGTTATATTTTTTATCTTTGTGTTCAGAGGTATTGTCATATCATTGGAAGATGGCACGTTAAAGTTCGTTAGCTTGTCGAGAATCGCAAATGATGTTCCTGTTACTGGAAGGCCATTTGTTGGAATGAAAACTCAGGGTGTTTCTACCTATCAATTGTCTGAATATTTGATCTGGAGTGTCCATGCCTCAGAAATTGCAGGTGCATTTCACCTCATGTCCAACCATAGTATATCTATGTCAAGTATCGGAATATCGGTTATAGCCTTATATCAATATTTAGTTCCACACATGTGAGCAGAGTAAAAATGTCAAATATTCATGATAATTCATGAATTTGTAATTTTGTTTTGCTGATATCCAGGCTATGCGGCTTATTGTGTGGCTGATGGAACTGCTGTTTGCTTTGAGGTAAACTAAACAGCACATATACTATTGATTTATGCATGCTATTGTGATTCTCTATAACATTGCTAAAGAAATATTCAACTTACTGTAGCTTACTCCGAGATTGTGGGAAAAGGAACCTGGGAGGAACCGTGTACCATATTTTCTTTGTGGTTCATTATCAGAGGAGGGAACAACCATTAAAATTGGTATTGCATTACCAAACTCTCCTTTGTCAAATGTTCCTCTGGGGACCAAACGGGCTACTAAAACTTGCAAAGATGTAGCTCAATTGCATGTTATAGAAGAAGGGGAACTTCTTACCAACTCAGGTAATCTCTGTCACCTGCAACTTGTATCATTTTGCTTGTACCTGACATGCCTGCTTAACCACCATACAGAATACAATTGTGCTATAAATCCAAGCATCAGAGATGGTCAACAAGATGAACCTGATGAAGGACAAGAAACTGGTGCCATAGTTTTAGCTGCTCCTTCAATGCAAGAGAATTTTGGCACAAGCACCAGCAGGGGTAGCGAATCCCCTGAAAAATTTGAGGTCTTTCCTCCTAAAGCTGTAGCATTGCATCGGTTGAGATGGAACATGAATAAAGGTAGCGAGAAATGGTTGTGCTATGGAGGTGCTGCAGGCATTATCCGGTGTCAGAGGATCTAAGGAACAAGAGCACACTTGAGGAATCTCCTTGCATATCAGGAAAATCTGCATGTGTCCATCTACACAATAAACTGTTGCATGCTGTGGTATGTTTCATCCGTTTCTTTCCTCTACTGTTATTTTGATCACCGTGTCCATTTTGGGTTATATGTATTAACTTCTTGCACTGTGCTTGCAATATACTCCCTCCATTCCATAATATAAGGCACAACCACTTTTTTTAGATGTTCCATAATATAAGGCATCCATGCATGTAGGCCATTAACTATGACCATTTCTCCATTAAATTATTACTTTTTTAAATCCTCCATTATCATGTTCTATAATTCTATTGGATGCATGCATTGTATTTATTATAATGATCCAAACTACAAGATGATAATAATTATTTTCTTGGTCTTTGGATTAGGGATGGTTATGCCTTATATTTTGGAATGGAGGGAGTAACAGATTATCTTTGGAACTCCCGACAGAGATGTATAAGCCTTATGGACTGAAGCTTTACCTGAGCAGCGAGGTTCTCTGTGTTTTGGGACCAGCAATTCATTACAGGTTGGTTTGAAAATAGAAAATACTGTCACTCCATGCGATTCTTCCTCGACATTAGTCTGAAATAAGTGTAATAAGTGCCTTTGGTGATCCAGATTCGCAAAATCTGTTGTAATTGTAATTGATAGCTACTAGCATACAATGCTTGATTTCACCAGGGTGTACCCACATACTGCCCTCGTCTGGTATCGGTTGGTTCTCGAGGTAATCTGACTGTGAATTTGATCCAATTATTGTAGTGTGTAACAACTGTTATTTTGTTACTGATAGTGTAGGCTGCGTGTTCACGGTGGTATCATTTGCAGGGGTCCCTTGGTTCTTTGAGTTCATCCGGTAATCTCTGTCAGACCAGTGCTTCTGCAGATCAGCTCAATGTTGCTACATGGCAAGTGGTGCTCTAACTTCTCCAGAATATGCTTCCATGTTTGGTTTTGCTTATTGTGCCCACCATGCATAAATGATCGTTGTAATTTGGCATGTACAAGCTACGCAGAAGAATACTGTTGTTTCAGTTTAGTATCGGATTGCTTGTGCAAATGGGTTACAGAGTTAAATAAGCTTTTTTAGGTATCTACAGCTGGGGGATAATTCTGACAAATGGAGGAAGCATGTCTGCATTGTCAAAGAAAGCAGATAGCAAATATAGCAGCTTTGCTCTAGCAATGTTTGATTGATACAGTTCTAGGAAATTTCTGCAGCCTGAGAAAGCAATGAGCTGCTCTTAGGCTGATAATAAGGGAGCGATGGACTGGTAGTAACGATGCATATACCCATCCAGCTTCTGTGGAAGTGATGCATTGCATTTGCCTATTATTTTCGTAGAGTTGCATTCATCTTTTGGCCTGCTGTTGCTTGTTATGTGCTGCTGTCATTCATGCTATCAGTAACTATATGCTAATATCATCGACGAGAATAGGGCTAACTCTTGTATTCCTGTTAGGGGCACCTATATGTTGAATAATGTGTTGGGCTCATATATTACCATGATGATTTTTTCCTGGTTTATATAGGTCTGGAAATGTAACAAGATCAGTCTCAAAACCTCATGGGCGGAACTTGTTTCTGCAAAGCTTAGTTGAAGAAGGGCAGAATCCAAGCACTAGCAATGGTGCCAGCAACTCCCAGAAAAGTGTTGAAGATAAGGACCTGATCGACTGTCTAGAGAATGGCGTCAACTTTTGGACGGATTATTCAAAAGTTCAGTATCATCCTCAGAGTTTATATGAGTTACATGGGTCATGGACAGACTTTGACAAGTTTGATAACTATGGCAGTGCACAAGAGGTTGTTTCAGACTGGTCGCAAATAGAGGAAATGAATGAGAGGCTAAGGTTCTTTGTTGAAGAATGCGACCATATTCAGGTCCAACTTTTCCCCAGTAAATTATCAGCAAACTCTACTATAGTTTTGCAACAAGCTAATGTTCACTTATGCACATCATTTTCGATATCATGCATATTTTGAGACCATTATTTTTAGCTTAATTGATTCATAATTTACCACAGGGCATCCAGTTTATTGTGGGTGATTCAGGAAGTTTTTCCAGTGTAGCTGCACAGTTTTTGGAGAACATTGCTGATGATTACACAAATACACCTGTATTGCTTTACTGTGTGAGGGATCCAATGACCCTTGGATCATCCAGGATGAATCAAAGGGAGTCCATTATGAGAGCTCTTCATGATGCTGTTTCATTTTCAAAACTTTCGTCCTTTTGCAACCTGATGGTCCCCATAGGACCGCCTTCATTAAGTAGAAGTATGCCCTCTGCCTGAACTCCACGATTTTAGTTTATTTTTTTATTCTTTTTTGAAAACTTTCCATTCGAACACTTTTAGGTCTGAGGAGTTCTCGTAAGTTGGCTAAATACACAGGAGGATAC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