BGIOSGA017179
| Gene Name |
BGIOSGA017179 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA017179, complete gene. |
| LocusTag |
OSIGBA0148A10.9 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA017179-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA017179-PA |
| Length |
4209 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 4:30854947..30859155 |
| Sequence Coding Region |
30854947..30855172,30855998..30856119,30856216..30856325,30856479..30856543,30856656..30856822 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome04:30854947..30859155 source=RiceIndica04 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCCCGCCCCAAGAGGACGAAGCCGCCGCCGCCGTCGCGCAAGGCGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCAGCGGCCGTCGTCGTCGTCGTCGCCGTCGCCGTCCCTCCCCGAGGCGCTGCTGCTCGCGACGGTGTGCATGGTCGGCCTCCCCGTGGAGGTGCAGGTCCGCGACGGATCCGCGTACGCGGGCGTCCTCCACACCGCCTCCGTCGAAGGCGGATACGGTGTTGTGCTAAAGAAAGCGCGAAAGATCGCTAACGGGAATGATAATGCCAATATTCCGCTGGGAGCTTTTGTAGATAGTCTTGTTATTCACCCAGATGATCTCGTTCAAGTCATTGCAAAGGATTTTTCACTCCATACAAAAGATGTGTGCAGAACTCCTGTTTGTGATACCGTCGCAGCCAGTGCATCTGTGAAGCCTCAAACTTCACATGTGAATGTGTTTCCACTAAAAGAGGTTAAGAAGTGCAGCACGCCAGGTGAGGAGACTAATATCTCCATTGGGAGAAGTTCTCCTGGGCCACGCCTCTCCTGTAACGAGATAATGAGTTCTGCGGTTGTTGGATCAAAAGATGGAAATGCTAAGAGTGCAGTTTTGACTACACCCACAATGTCTTCAGATGTGAAAATCTCTCCTCCAGCCACAGTTGCGAAAACTGCCACGCCGAGCAAAACCATTGCTAAGGAATCCAAACTCAACCCTTGTGCTAGGGTCTTCTCTCCTTCGTTTGCAAGTTCCAGACCAGTACTTGCAGCTGCACCCTCTGTTAACCCAATCTACATCTCAAACTCTGTAGCTGGAGTTCCAACCGGGTTACCTGTATTTGAAACTAACTCAGTGCCAGGCGGTTCATCTCTGTCCAGCAAGGCTGTTCATTATAATAATCTGGCTGCTGCAAACTATGCTATTTCACCTCAATATACTCAGTCAACCATGGGGCATAATGTGAGCAGGCTGGATCCTGCTAGAATTGGCACACCTTATCATCCCATGCAAGTTGGACCTGCTTACATTAGCCCTAGTCCTCAGCCTGTTACTGGTGGGAAATTTAATCATGTTGTTTATGTACACCCATTTTCTCAGGATGTAATGCATGGAGCACCTGTTATGCCCCAAGGATGGTCTCTTCCTGCACCATTGAACTCACATCAAGCTAGCCTCCAGAAGTTCCAAGGCACAGCCCCTGTATATGTAGCCCCACCTATCATGGCAACTGGGAACCTGCCATTGGTGGTACCAAGCCCTGCACCGCTTGTGCAGCCATTCCAGGCCGTTCGTCCCATCATGGTTCCTGCTGCGAGCAGCATGGTTCCAGGCAAATACATGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MARPKRTKPPPPSRKAEAAAAAAQRPSSSSSPSPSLPEALLLATVCMVGLPVEVQVRDGSAYAGVLHTASVEGGYGVVLKKARKIANGNDNANIPLGAFVDSLVIHPDDLVQVIAKDFSLHTKDVCRTPVCDTVAASASVKPQTSHVNVFPLKEVKKCSTPGEETNISIGRSSPGPRLSCNEIMSSAVVGSKDGNAKSAVLTTPTMSSDVKISPPATVAKTATPSKTIAKESKLNPCARVFSPSFASSRPVLAAAPSVNPIYISNSVAGVPTGLPVFETNSVPGGSSLSSKAVHYNNLAAANYAISPQYTQSTMGHNVSRLDPARIGTPYHPMQVGPAYISPSPQPVTGGKFNHVVYVHPFSQDVMHGAPVMPQGWSLPAPLNSHQASLQKFQGTAPVYVAPPIMATGNLPLVVPSPAPLVQPFQAVRPIMVPAASSMVPGKYM</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..226#1052..1173#1270..1379#1533..1597#1710..1876#2262..2507#3088..3189#3328..3378#3851..3941#4055..4209#ATGGCCCGCCCCAAGAGGACGAAGCCGCCGCCGCCGTCGCGCAAGGCGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCAGCGGCCGTCGTCGTCGTCGTCGCCGTCGCCGTCCCTCCCCGAGGCGCTGCTGCTCGCGACGGTGTGCATGGTCGGCCTCCCCGTGGAGGTGCAGGTCCGCGACGGATCCGCGTACGCGGGCGTCCTCCACACCGCCTCCGTCGAAGGCGGATACGGTGGGCGCTCCTCCCTCTCTCCTCCTCCTCCTCCCCGTCGTTGTTTCTGTGGTTGGGTGGCTCGCTTAGGGTTCGGAGATCGCGGGGATGTGGTTGTGAGCGTGATCCAGCTGTGTGTGCGTAGTGGGTGACGATTTTTAATAGGGTTGGTGCTCCGGCTTTTTTTTTTTCGTTTCGAAGTTAACTGGTTCGTGATCCGCTTGTTGGTTGGGTTGGGTGGCGGTGGACGCTGGAAGCTTGCGTTGTTTGTTTTTTGGATAGTGCCATGGTGGGATGGATTTGGGGGTGGTTGCTGTTTAGAGATCGCTGGATGAGTTTCCCCCATTTGTGGCGTGGCTGTAGATGTACTTTTGTGTTTGCGGTTAAGATCTTGGCTGTTTGGTCTTTGATCGTCGTGATTGCGGTGGGGATTTGGATGAGAGTCCCGTAAATCGTTCCTGGGTTCGTGGTCTAGAGAGGATCTCGCACTGGGTTCCAGGATCATAGGCAATGATCCTGGTCTCTATAATGTAATCGGGTATCATGGTTATGCTATAAACCAACTGCCTGGTTGATTGCAAATAAATGTTGTTTTTCTTCTCTAGAATTGAGATGCCAATTTGCCATGAAGAAATTTATGATTCATTTACTGCTTTCTAGCATTCTGGCAGCAGTCACATTTTTGGGTTTGATTCGTACTCCTTTTGGATTTGTAATATCCTAGGGATGCATTTTTTTTCTTGCCAGATCATGTTTATAATGTTGTTCTTTCTGGTTTCAACAATCAATTTAGTTTTCTTTTTCTGTGTGGAGAAAAAATGATACTGATGTATTTATGTTGAACAGGTGTTGTGCTAAAGAAAGCGCGAAAGATCGCTAACGGGAATGATAATGCCAATATTCCGCTGGGAGCTTTTGTAGATAGTCTTGTTATTCACCCAGATGATCTCGTTCAAGTCATTGCAAAGGTAGGTTTGATGTGCTTAAACATGCTAACAAATTTTCCCGCCAAAAGAAAAGGTATACTAACAGATTGCCTTCTCGTGGACGCTTCTACTTTTCAGGATTTTTCACTCCATACAAAAGATGTGTGCAGAACTCCTGTTTGTGATACCGTCGCAGCCAGTGCATCTGTGAAGCCTCAAACTTCACATGTGAATGTGTTTCCACTAAAGTATATTCTTGATTCATCAATAATAGGATAAAACTCTTTCAATTGTTTCTTTAATGATGCTGGTTAATAATGTAGATTTCTAGCAATCTATTCTGTATATATATTTCAATGTCTATTCATTCTTGAGGTTAATTCATGCTATTTCTGTAACAGAGAGGTTAAGAAGTGCAGCACGCCAGGTGAGGAGACTAATATCTCCATTGGGAGAAGTTCTCCTGGTATTATGTCTAACCTCTTTACTATTTTACTCCGATAATTCTTTTTCCACTTTTCTTCCTTGTACTTAAACCCGTCCAACTGTTATGCTAGCATCTCCAACTGGATATGTAGGGCCACGCCTCTCCTGTAACGAGATAATGAGTTCTGCGGTTGTTGGATCAAAAGATGGAAATGCTAAGAGTGCAGTTTTGACTACACCCACAATGTCTTCAGATGTGAAAATCTCTCCTCCAGCCACAGTTGCGAAAACTGCCACGCCGAGCAAAACCATTGCTAAGGTGAGCTCTCTTGGACCCTTGATACGTAAGCATAGGGAAAACTGTGTCTAGAGAATTAGAGATCCAGAAAAATGTTTCGCTAATATATTTTACCTTTTAAGGAGCCCAGTACTATTTGGAAAGCATTATCAGTTATTTCATCCATGTACATAACAATCTGTACAAGGCTTGCCAACTATGTGATCAATGTTATCAGTGTGTTATTTTCTTATTTTGTATTATTAAGCACAGTTCTCTTTCCTTCCTATGTCATGGATTTCTATGCATCCTGAGGGAATGAAGCCGTGCCAATTCTGTTTTTATGTTTACTGCTGTCCTAGATGTTCTACCTTTGTAACCTTCCTGTGCTTCATCATTGTCATCAGTCCATTCACTACTATTGCAGGAATCCAAACTCAACCCTTGTGCTAGGGTCTTCTCTCCTTCGTTTGCAAGTTCCAGACCAGTACTTGCAGCTGCACCCTCTGTTAACCCAATCTACATCTCAAACTCTGTAGCTGGAGTTCCAACCGGGTTACCTGTATTTGAAACTAACTCAGTGCCAGGCGGTTCATCTCTGTCCAGCAAGGCTGTTCATTATAATAATCTGGCTGCTGCAAACTATGCTATTTCACCTCAATATACTCAGTCAGTAAGTTCTTTGATTAATTCTTTTATAATATCATTGTTGCTTCAATAGTTCATCACTTTCTTCAGATTGCTGTCATATAGTCATGAAGTGATAAACAAGGAAAATTTTGCAATATGGTGCCAACTCCTATTCAGCACCGACATGCCTTTAAGCTGATAATTTGCTTTATGTGACCACTATTACTATCTCTACATATTTTAACTATTATCTTTACTCTGGTGTAATTTTCCATTTATCTTGAGATTAACTATTGAACTACTAATAGCTATCGTCAGGGGCGGAATCAGGCATGGGGCAGCTAGGGCTTGAGCCCCATGCCTAGCTCCATAATCCCCATTATAATCTTGAAAAATGCTATGTAATTTATGAAAATATTTGAGATCCCATTAGCTCAGCCTTAGGCGTGGAAATTTTCTGGCTCCGCCACTGGCTATCGTTTATCGTTATGTTATATTCTGTGCATTGAATTTTCAGATTCTACTTCACTTTGATCTTATTGCTGCATAACTCTGGCATGTACGTTTTGTTCGGATATGATCCTGCCTCCTGAATCCTTATACATGGTTTTTTTGAATGACAGACCATGGGGCATAATGTGAGCAGGCTGGATCCTGCTAGAATTGGCACACCTTATCATCCCATGCAAGTTGGACCTGCTTACATTAGCCCTAGTCCTCAGCCTGTAAGTTCTAATCAGTTGTATATATATAAAATATATATATACTGATATTAATTTCAAAATGCTGTTCATTTGTACCTATTTGTTACTATCATTTGCTCCTGTACTGATCTAATTTATTTTTATGTTATGACATCATAGGTTACTGGTGGGAAATTTAATCATGTTGTTTATGTACACCCATTTTCTCAGGTGAGTAATGCAATAGTGTTATTTCTATTAATAGCTCAAGTGGAACTCTGCGAGAGTAAGATGATGAATTAATGATGCAAGTACAATTTGTGTTGTTTCATACAATACTTTAACTGATTAAATAGTGCTGATTCATTGGAGATATCATGGTTGTCTTTTGTATCGCTCAACCAGTAGATAGTGCAAGTGAGGCACTGTTATCCAAATTGAACTTGGATATTCGTCTGTTTTAAAAAATAAAAACTACTCAGCTACGTTTCACACATTAGATAATGTGAAGCTTCATTTCGTGGCATGCATCTTTGTTGGCAACCCTATACATTGCGTAGAGTCATTTAGGCATATGAAGCTCTCCTGTTAACCGTAATGATTAATATTTGACATTATCATCCCTCTAAAAAACTCATCCTAGTTATATTTACTGCAAATACAAATTGCCCTAACTGCTTTTACTATTTGCTTTCCGCTGAAGGATGTAATGCATGGAGCACCTGTTATGCCCCAAGGATGGTCTCTTCCTGCACCATTGAACTCACATCAAGCTAGCCTCCAGAAGTTCCAAGGTAAAAATCGTACTCATTGTCGACTGCTTCCTTTATTTTAATGGAAGGTATTGAAATGTTTATTTTATTTATTCATTACACTAATCAAAACATTTTACTTCGAAACTCTCCAGGCACAGCCCCTGTATATGTAGCCCCACCTATCATGGCAACTGGGAACCTGCCATTGGTGGTACCAAGCCCTGCACCGCTTGTGCAGCCATTCCAGGCCGTTCGTCCCATCATGGTTCCTGCTGCGAGCAGCATGGTTCCAGGCAAATACATGTAA</dnaseqindica> |
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