BGIOSGA018053
| Gene Name |
BGIOSGA018053 |
|---|---|
| Description |
BGIOSGA018053 |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA018053, complete gene. |
| LocusTag |
' |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA018053-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA018053-PA |
| Length |
3451 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:21462393..21465843 |
| Sequence Coding Region |
21465789..21465843,21465457..21465498,21465127..21465363,21464136..21464838,21463435..21463677 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:21462393..21465843 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:21462393..21465843 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGTCGGATGCGGAGGCGTTGCGAGGGGGGAAGCGCACGAGACGTTCACAGAGAGGAACTTGGAGCTTCAATGGGGGAACCTAGTGTTGCACGTTCCAAAGACTGTGATATGGAGTATGATGATAGTTCTTCTAGACAAAAGTGGCGAGCCTTTGTGGGAACATGCGGAAGGTGTGGAACGATTTGTCGATTATTCAGATGGCTTGCCCCCTACAAGCAAGGGTATGTTTCAGTCAAATAAAAGAAAGAGCAAAGCTGCAGATGAGGATCTTCATATGAAACTTCGAACTCGATTGGATGCTGAAGTTGCTAGAATGTTCTATTCTTCAGGTTTGTCCCCCACTATTACAAGGAACCCATATNATCGGGGTTCATTCGCTATGGCCGCGTTGTTCCAGATTCCTGGATATGTTCCTCCTGGGGTCGACCAGCTGAAGACAACTCTCTTGCAGAAAGAAAGGGCTGACATTGAAAACATGCTGCAGACCATAAAAAACACGTGGAGGAAAGCAGGTGTGATGATTGTTTCTGATGGGTGGTCAGATTTTAAAAGGCGACCTATCATCAATATCATAGCTGTCAATGAAGCTGGGCCAGTTTTTTTGCAAGCAATTAACAATGAAGATGGGTGGATGTGGATGATGGATGACTACATTGCAGAGAAGCTCATTGCTGCAATTGAAGACGTTGGATCAGAAAATGTTGTCCAAGTGATCACAGACAATTATCCTTTTTGCAGAGCTGCTGGGGTGCTGATTGAACAGAAGTACAGTCACATCCAATGGATGCCAAGTGTTGCTCATTCTTTAAGTCTTGCCTTGGAGAATATTTGTGCTGCTAAGAATGCCGAAAATGTTGTCTTCAAAGACTGCCACTGGATTTCAGAAGTTATAGGGGATGCAAAAATGATAAATGATTTTATAAGTAATCATTCTATGGTACTATCCATGATCAGCGAGTTCAGTAAGCTGAAGATACTTGGCATTGCTCACACAAGATTTGCTTCAGATATTGTCATGCTAAAGAGGTTTCGGTGTTACGCCGATAGTTGGATTGATGAAGGCGCTAATCGTCAACCCCCACATAGTGATGCTGAGATTAATGAAATGGCAAATGACTGCTTGAAGAAATTATTTCCTGCTGCAGATGACTTGACGGCGATTAAAGCAGAGTATGCAAAGTTTTCTCTTTTGAGCACGGAGTTTGCTTCCTCAGGTACAGGATGCTTTAGCTTGAATTCCATCACTGATAGGGATGTTCTTGACCCAAAAACATGTTGTTTGGAGGCATTGGTTGGTGGTTTGGTGACGGCTTCGTTGTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAVGCGGVARGEAHETFTERNLELQWGNLVLHVPKTVIWSMMIVLLDKSGEPLWEHAEGVERFVDYSDGLPPTSKGMFQSNKRKSKAADEDLHMKLRTRLDAEVARMFYSSGLSPTITRNPYXRGSFAMAALFQIPGYVPPGVDQLKTTLLQKERADIENMLQTIKNTWRKAGVMIVSDGWSDFKRRPIINIIAVNEAGPVFLQAINNEDGWMWMMDDYIAEKLIAAIEDVGSENVVQVITDNYPFCRAAGVLIEQKYSHIQWMPSVAHSLSLALENICAAKNAENVVFKDCHWISEVIGDAKMINDFISNHSMVLSMISEFSKLKILGIAHTRFASDIVMLKRFRCYADSWIDEGANRQPPHSDAEINEMANDCLKKLFPAADDLTAIKAEYAKFSLLSTEFASSGTGCFSLNSITDRDVLDPKTCCLEALVGGLVTASL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..55#346..387#481..717#1006..1708#2167..2409#3406..3451#ATGGCGGTCGGATGCGGAGGCGTTGCGAGGGGGGAAGCGCACGAGACGTTCACAGGTTTCCTGGACTGGTTACCCCGTCGGCGAGGAGTGATTTCCCCCCCCCCCCCATTGAGATTAGGTTTTTTTTTTATTTTGACGCGTGCATTTTGAGGCATGGTGATTGGGGGGAAATATTGCATCCGATGCATTTTATTGGTGGGAGTGCCAATTTTGGTGGCAAAATGAAAAATCAAGTGATCTATGGGAGGTTGTTGTTGATCTCCTATATTATTTTTAGATATTTTTTAGGCGACCTTCTGGTAGGTTTTCTTTTTCTTTTTTTAACAAAATCTTTCGTTGGTGTAGAGAGGAACTTGGAGCTTCAATGGGGGAACCTAGTGTTGCACGGTATGTACATTTTCCTGGGATTTTCTAATATCGAGCAAAAAAGGAGCATTTGCATACTCACCTTGTAAACTGTTTATGACATCTTTGTAACAGTTCCAAAGACTGTGATATGGAGTATGATGATAGTTCTTCTAGACAAAAGTGGCGAGCCTTTGTGGGAACATGCGGAAGGTGTGGAACGATTTGTCGATTATTCAGATGGCTTGCCCCCTACAAGCAAGGGTATGTTTCAGTCAAATAAAAGAAAGAGCAAAGCTGCAGATGAGGATCTTCATATGAAACTTCGAACTCGATTGGATGCTGAAGTTGCTAGAATGTTCTATTCTTCAGGTTAATACCTTAAACATGAAATCTTTGTGTTCATGTTGTATGGAATGCCATTGAACGCATGTTTCAATTTTCAAGATTATCCTTAAAGGCCGCGACGGACCCATTCTTTAAGAGCGCATTCTCTCGTGCCACCTCCATGCCTGGTTTCGCGGCTGAAGAGGATGAGCATCAAGATGACCAGCCTTCCCTAGTTACACAAATGTTCTTTTCCATAGGTTAACATCTCAAACTTGAAGGTCTTTCAGTTTGTATGTATGGATTGTCCTTTAGTATCATTCATATTTGCAGGTTTGTCCCCCACTATTACAAGGAACCCATATNATCGGGGTTCATTCGCTATGGCCGCGTTGTTCCAGATTCCTGGATATGTTCCTCCTGGGGTCGACCAGCTGAAGACAACTCTCTTGCAGAAAGAAAGGGCTGACATTGAAAACATGCTGCAGACCATAAAAAACACGTGGAGGAAAGCAGGTGTGATGATTGTTTCTGATGGGTGGTCAGATTTTAAAAGGCGACCTATCATCAATATCATAGCTGTCAATGAAGCTGGGCCAGTTTTTTTGCAAGCAATTAACAATGAAGATGGGTGGATGTGGATGATGGATGACTACATTGCAGAGAAGCTCATTGCTGCAATTGAAGACGTTGGATCAGAAAATGTTGTCCAAGTGATCACAGACAATTATCCTTTTTGCAGAGCTGCTGGGGTGCTGATTGAACAGAAGTACAGTCACATCCAATGGATGCCAAGTGTTGCTCATTCTTTAAGTCTTGCCTTGGAGAATATTTGTGCTGCTAAGAATGCCGAAAATGTTGTCTTCAAAGACTGCCACTGGATTTCAGAAGTTATAGGGGATGCAAAAATGATAAATGATTTTATAAGTAATCATTCTATGGTACTATCCATGATCAGCGAGTTCAGTAAGCTGAAGATACTTGGCATTGCTCACACAAGATTTGCTTCAGATATTGTCATGCTAAAGAGGTTTCGGTTTGACTAAGCAATCTCTTATAGGGATTGTCATCAGTGACAAGTGGTCCGTTTACAGTAAAGATGACGAGGGGAAAGCAAAGCTTGTGATGAAAAAACTTACTGATGAATTGTGGTGGGATCAAGTTGATTACATTCTTGCTTTCACAGAACCGATATATTCAATGATACGCATCATGGACACTGAAAAGCAATGCATTCATTTGATCTATGGAATGTGGAATGATATGACAGAGAAGGTAAAGGCTATTATTTATAAACATGAAGTCAAGGGGGCTGATGAAGAATCAACTTTTTACTCTGCTGTAAATGGCATTTAGTAGATTGGTGGGGCAAGACCAGAACTCCACTCCACTGTTTAGCACATGCACTAAATCCAAGGTGAGTCCTGGTTTAAGTTACTAAATGATTTCTTTTTTAAGCCATGTAATATCACTATCTTTTGGTCTGTTCTGTAGGTGTTACGCCGATAGTTGGATTGATGAAGGCGCTAATCGTCAACCCCCACATAGTGATGCTGAGATTAATGAAATGGCAAATGACTGCTTGAAGAAATTATTTCCTGCTGCAGATGACTTGACGGCGATTAAAGCAGAGTATGCAAAGTTTTCTCTTTTGAGCACGGAGTTTGCTTCCTCAGGTACAGGATGCTTTAGCTTGAATTCCATCACTGATAGGGATGTTCTTGACCCAAAAACATGGTGGGTGACCCATGGCAGTCCAACACCTAAGTTGCAGGAGCTAGCCCTCACGATTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTCTCACTCGACGAACCTGAGTTCGAGCTTGCCATTCTTGAAGGGCTGGAAGGTGATGATTTGGCATGAAGATGGAGGTGGATTGGTGGAAGACTTTCTAGAATCCTAGCTCAATCTGTGAATGGCCTGATGCCACCTTTCCTATCAGGCTGTCACTCGGGTCTACCTTGTCTTTTGGGGAAAGTGGTGTGTTTTGGTTATGTACTTATGTGGCCACTCTGGTAGTATGCAAAACTTTGCAGTATGCAATGCTACTACCTCCGTCCCAAAATATAACCACTTTTAGCTACGAATCTGGACACGGTTGTCTAGATTCATAGCTAAAAATGCTTATATTTTGAGACGGAGGGAGTATATAGTAGTGGTAGTGATGGACTGGTGGTAGACTGGAAGTATGCATGCAAAGCTATGCAATGGCAGGTAGTGGTAATGGTATTATGCAAAGCTATGTGATAAGACTTTGCTATTATATATGCAAATCTGTGGAAACTAGACGGTTTGCTTTTTATGCTCGTGTCATTGTGTGGAGGTCATTTTGAGTGCATTCTTCACCTCTTCCAAAACATGTTTGGATTCACCTGACCGGTGTATAGATGTGGTAGGGTGCTGGTCTTTATGTTCTTTATTTTGGTTTTTGCGTGGTCCATGTGTGCATTTTGGAGTACGTGAAATGTGACACGGTGTGGATTGAACAGCCAGGGGCTGTTCAAGGGACGAGTGGATCCTTTTCTCCCTTGCATCCATTCTTGCTGGTGGTGTTCGAATCTTTCTCTCGCTCCATTTACCTTTGCATCCATTTTTGTTTGTAGTGTTTAAAATTCTAGTTCTTATTTTTCAGTTGTTTGGAGGCATTGGTTGGTGGTTTGGTGACGGCTTCGTTGTAG</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
