BGIOSGA018290
| Gene Name |
BGIOSGA018290 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA018290, complete gene. |
| LocusTag |
OJ1005_D04.1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA018290-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA018290-PA |
| Length |
5468 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:16167430..16172897 |
| Sequence Coding Region |
16172800..16172897,16171063..16171321,16170764..16170958,16170215..16170465,16169772..16169988 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:16167430..16172897 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCGGCGTCGGGGGGATTGAGCTTGGTGCGCCGCGCCGTCGAGGCCGCGCGCCGCACGCCGCGGTGGCAGAAGAGGCTCCTCGTCCTCACCGCCGGTGTTGGTTCTTTGACTTATGCTTGCCAGGATAATCAAGTACTTCAAATAAATGATGGAACTGGCAAGAAGAGGGTGGTTATCGTTGGAACTGGTTGGGCAGGCGCAAGTTTCTTGAGAAATATTGACACTTCCTTGTACGATGTTCATGTCGTATCACCTCGCAACTATTTTACCTTCACACCTTTGTTGCCTAGTGTGACATGTGGCACAGTTGAAGCACGTAGTATTGTAGAGCCTATCCGTAATATTGTGAGAAAGAGAGGCGGCGCATTTAGATTTTGGGAAGCAGAGTGCTACAAGATTGATCCAACTAACAAAAAGATCCACTGCAGATCAGACTCAGATGGAAATAGTGAATTTGTTGTAGATTATGATTACCTGGTCGTCAGTGTTGGAGCTAGACCTAATACATTCAATACCCCTGGTGTTGTTGAAAACTGCCATTTTCTAAAGGAAGTAGAAGATGCTCAAAAAATTAGGAAGAGTGTCCTGAAATGTTTCGAAAGAGCGTCCCTTCCAAACCTAACTGAGGAAGAGAGGAAGAAGAATCTTCATTTTGTTGTTATTGGTGGTGGCCCAACAGGTGTAGAATTTGCTGCAGAGCTTCATGACTTTGTCAATGAGGACTTGGCAAAGTTGTATCCTGATGTGAAGAAGTATGCGAATATTTCAGTAATTGAAGCTGGAGATCATATCCTTACAATGTTTGACAAGAGAATTACCCAATTTGCTGAAGATAAATTCAAGAGGACAGGCATAGATTTGAAGACGAATTTTAAGGTTGTGAAGGTGTCTGATAAGGCTATCACTATGACTAATTCTGCAACTGGAGAGATTGCTGTGCCTTATGGCATGGCTGTTTGGTCCACTGGTATTGGAACCCGTCCCCTCATAATGGATTTCATGAAGCAAGTTGGTCAGGCAAACCGACGAGTGCTAGCTACTGATGAATGGCTCAGGGTTCATGGATGTGATGATGTATATGCTCTTGGTGATTGCGCGACAATAACTCAAAGAAAAGTTATGGAAGATATTGCTTCAATTTTCCGGGTAGCAGACAAGGACAATTCTGGCTCTTTGACTGTCAAGAAAATTAAAAATGTTCTTGGCGACATCTATGAAAGGTACCCACAGGTTGAGTTGTACCTTAAAACTAACCAAATGAAGGACTTCCATGACCTACTCAAAGATTCAGACGGGAATGCTATTAAGGAGTCAAAAGAGCTGAACATAGAGGAATTCAAGAAAGCCCTTGCTCGAGTGGACTCGCAAGTTAAGATGCTCCCAGCAACAGCTCAGGTTGCTTCACAAGAGGGAGCCTATCTGGCAAACTGCTTCAACAAGATGAAATACTGTGAAGAGAACCCTGAAGGTCCGTTGAGGATCAGAGGCACAGGGCGTCATCGGTTCAAACCTTTCAGGTACAGGCACCTTGGCCAGTTTGCTCCACTGGGTGGAGAGCAAACAGCCGCTCAATTGCCGGGTGATTGGATACATGTTGGTCACAGCACCCAATGGCTATGGTATTCTGTCTATGCCAGTAAGCAATTCAGCTGGCGCACCAGGATGCTGGTAGTATCTGATTGGGGCAGGCGGTTCATCTATGGAAGGGACTCAAGCAGCCTATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSASGGLSLVRRAVEAARRTPRWQKRLLVLTAGVGSLTYACQDNQVLQINDGTGKKRVVIVGTGWAGASFLRNIDTSLYDVHVVSPRNYFTFTPLLPSVTCGTVEARSIVEPIRNIVRKRGGAFRFWEAECYKIDPTNKKIHCRSDSDGNSEFVVDYDYLVVSVGARPNTFNTPGVVENCHFLKEVEDAQKIRKSVLKCFERASLPNLTEEERKKNLHFVVIGGGPTGVEFAAELHDFVNEDLAKLYPDVKKYANISVIEAGDHILTMFDKRITQFAEDKFKRTGIDLKTNFKVVKVSDKAITMTNSATGEIAVPYGMAVWSTGIGTRPLIMDFMKQVGQANRRVLATDEWLRVHGCDDVYALGDCATITQRKVMEDIASIFRVADKDNSGSLTVKKIKNVLGDIYERYPQVELYLKTNQMKDFHDLLKDSDGNAIKESKELNIEEFKKALARVDSQVKMLPATAQVASQEGAYLANCFNKMKYCEENPEGPLRIRGTGRHRFKPFRYRHLGQFAPLGGEQTAAQLPGDWIHVGHSTQWLWYSVYASKQFSWRTRMLVVSDWGRRFIYGRDSSSL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..98#1577..1835#1940..2134#2433..2683#2910..3126#3212..3316#3931..4203#4694..4815#5142..5261#5381..5468#ATGTCGGCGTCGGGGGGATTGAGCTTGGTGCGCCGCGCCGTCGAGGCCGCGCGCCGCACGCCGCGGTGGCAGAAGAGGCTCCTCGTCCTCACCGCCGGGTACGTTTCCGCCTCTCCCCCTCATGCTCCGCGCGCCCCTGATATACACCTCACCCCCGTTGATCGATCTAGTTATACGCGTGCGCAACCGTGTCCTTGCGCTGGATATGGTGCGTTGGGCCGCCGTACGTGCGCGCGTCCGCGCTTTGGTTTGATTGCCGAACTTTGATACACCGTGTAAGTGTTTTCGTCGCGATTTTGCGATAGTTCTATCAAGGCGGCTGTATAAACATGAGAGTAGTTAAAGCCTTTCCTCCAAAACATGAGATTAGTTTAATCGGGGATGTTCTTTTCAATGGATTTTTTTTTTCGGTTTAAGAATTAAGTCGGTGGTGATCTGTCAACCTGCAACTTTTCTTTTGCCCCTGAAGTCCGTAGCCCGACGCTTACTTTACACCTAGCCCAACACTTAAACACCGCACTACGTTGTTTATTAAGATTTGGGTGAAAAAGTTGTTCAGAAGTTCGATCATTTATTGGTAAAATTACTCATAGATCTAACAAATCTGGTTCACGTTTATATTCATAATTGGTTATGGTGAAATCTAAAAAATATTATCTATGTCATCTTGACACTTGAAAAAGAATGTGATTGTGATGTGAAAGTGAAACAACAAATTATTTGAAGTGTGCTGGAACCATGGTGCCTACTAGGCCAATCGTCTAAATCGGATTGTATTATTCTTGTTCATTGACATTGTAATATTGAAATCACCGCCTCACGATTCTAGGGAGACGAGTATGTATTGTGTCACCAAAAGTCCAAAACATGTCCTACTTGTTTATTTAACGTCATAAATAATAAATAATAATATATTCGTCCAACAAAAAGTCCAATCCTGAAGATGTATTTAGACACGTACGTTGTCCTGGTACATCTTCAGATATATTGGGGTTTTTTTGGGACAGAGGAGTGGGCATTTAAGCAGATTGTATTCTCACCCTTTTGCTTAAGAGAATGTGCTATAGCTATTAATCCATGATGCTAGACATGTTTGTCCCAGATAGATTCATGGTGATGGTTTGTCCTTCATATTTCTTATTGTAACCCGGGATCATATTGGAATTGTGCACAGCAGATACTGTTCATGATATTGTTTGATCACAAAAGTGAAATAACATTTGTATTGCCAGATTTCTGTTTTTGGGCCATGTAGCAAAATCTTGTAAGCGTCTCAAGCAATTTTAGTGAATACTTCTCTTGTGGTTCTTTCTGTTTTGAAAGTGAAGAAGACTAGCAGCAGAGGTGTGCTATTCATTATAGCTGGAAGAAATTTTTATTTACATGTTCTGTTATGGCTCTGATAAGTTCATTAGTTGGTATTCATTGGCAAATCAAAAACTAGTAAATGCAACTTAAAACTCACTGAGATGGCAAATGCACTCTTAATATTAGTTTTCATAATATTTTATGTTGTATATATTTCAGGACTCTGAGTCTCTCCTCTCACACACCTTTTATTCAAATATCTTTGCAGTGTTGGTTCTTTGACTTATGCTTGCCAGGATAATCAAGTACTTCAAATAAATGATGGAACTGGCAAGAAGAGGGTGGTTATCGTTGGAACTGGTTGGGCAGGCGCAAGTTTCTTGAGAAATATTGACACTTCCTTGTACGATGTTCATGTCGTATCACCTCGCAACTATTTTACCTTCACACCTTTGTTGCCTAGTGTGACATGTGGCACAGTTGAAGCACGTAGTATTGTAGAGCCTATCCGTAATATTGTGAGAAAGGTAAGACCTTACTGAATTAATAATCAATTAGCTATATTATTGATATATTGCATCATTTTGTAATGCAAGAATTCTCACAAATATTACATGTACATTATTTCCAGAGAGGCGGCGCATTTAGATTTTGGGAAGCAGAGTGCTACAAGATTGATCCAACTAACAAAAAGATCCACTGCAGATCAGACTCAGATGGAAATAGTGAATTTGTTGTAGATTATGATTACCTGGTCGTCAGTGTTGGAGCTAGACCTAATACATTCAATACCCCTGGTGTTGTTGAAAACTGCCATTTTCTAAAGGTCAGTACTAATAAGGCAGTAGGTTAATGAAAGAAATTAACTGTTGTAACAAAACTCGGTTTTATTTTATCATCTTATCAGTTACGACTCTTTCAGCTTATCTCTTGGTCAATGTCTGAATTACCTTCAGCAAACTTGCTTTTACATCTTTACATATACTTGTTCTTTGTCAAACAAAGAATATCCTTGTTCCATCTTTCGTCATAACTTCTTTTTCTTTAGTATGTTATCCATTATGTTGTTCAATTTTGCAACATATTTTGCATGGTGAATTGAATCGTCATGTGCATTCTGTCAGGAAGTAGAAGATGCTCAAAAAATTAGGAAGAGTGTCCTGAAATGTTTCGAAAGAGCGTCCCTTCCAAACCTAACTGAGGAAGAGAGGAAGAAGAATCTTCATTTTGTTGTTATTGGTGGTGGCCCAACAGGTGTAGAATTTGCTGCAGAGCTTCATGACTTTGTCAATGAGGACTTGGCAAAGTTGTATCCTGATGTGAAGAAGTATGCGAATATTTCAGTAATTGAAGCTGGAGATCATATCCTTACAATGTAAGACCTTGAGATCTGTTGTACTTGTTGAACCATTGCAAAATATTCACATTTTTAGTTTTATGTTAGTAATTTTGAACCTTCACCCTTTTAGTTTTACCGATCAGAAGCATTTTAGTTGATAATTACATATGTAGGAGGCCTTCAAATTTCAGAAAATTCTGTTTCTTGATGCAGTTTTATGATATTCTTTGCAAAAAAAAGTTTTAATGTTCTATATATGCAGGTTTGACAAGAGAATTACCCAATTTGCTGAAGATAAATTCAAGAGGACAGGCATAGATTTGAAGACGAATTTTAAGGTTGTGAAGGTGTCTGATAAGGCTATCACTATGACTAATTCTGCAACTGGAGAGATTGCTGTGCCTTATGGCATGGCTGTTTGGTCCACTGGTATTGGAACCCGTCCCCTCATAATGGATTTCATGAAGCAAGTTGGTCAGGTATATCTCGTACAGAACTCATAAGAGAATACATTTCAACATATTACACTAAATTATGTTTTTAAAACACTTATTTAATTTATAGGCAAACCGACGAGTGCTAGCTACTGATGAATGGCTCAGGGTTCATGGATGTGATGATGTATATGCTCTTGGTGATTGCGCGACAATAACTCAAAGAAAAGTTATGGTATGTGTGTACTTCTCAATGCAAAGATACCATATTTTTTGTTCAAGTAAAGAATGCACCATATTTTGTCACTGGCAAGAACATCTCGATATGTTATGGTATAATTATAATTTAACATGTTTCATCGCCTGCTCTCTAGAATACTAAGCTAGCATAATTGAATTTCAAATAGTGGCCTATGTACAGCAATTAGCCCTTTTCAGTGTTAAGTTGCCAGTTAATTATATCTAAGTCTTTGTTTTGATAATAAGTTCATATGATTAAATATAAAAAATTACAAATGCTGAAATTATTATGGTTTAAAGACTGCAACTTTGTGTGAAGCTGTTTAGCCATCTCAAACATATCACTATTATAGTTATAAAGATTTACACCGTGGTGTTCCTTTCTGAACCAACTTCAAAATTTTTGGAGGATGTTTTCAGTTCCTACTTCAAATTCTTTTTGTGAGAAAGGCAAGATTGACATGATCTAGCATCTACCTGTTGTAGTGTTAATGCCATCTTAACATAAATGCTAGTAATTGTTTAGCAAACAAATTTCATGTATTGTCAACTACTTTTGTTTATGAATTTCTGACATTCTTAATGGATTGTGTTGATATGTATATTCAGGAAGATATTGCTTCAATTTTCCGGGTAGCAGACAAGGACAATTCTGGCTCTTTGACTGTCAAGAAAATTAAAAATGTTCTTGGCGACATCTATGAAAGGTACCCACAGGTTGAGTTGTACCTTAAAACTAACCAAATGAAGGACTTCCATGACCTACTCAAAGATTCAGACGGGAATGCTATTAAGGAGTCAAAAGAGCTGAACATAGAGGAATTCAAGAAAGCCCTTGCTCGAGTGGACTCGCAAGTTAAGATGCTCCCAGCAACAGCTCAGGTAATTATTCATGTCTACCATTAGAGAGTTTGCACTTTGCACATAGGGAAAGAAATCTGTTGCAATATATGTCAAATTGATGTGTCCTTAAATATCTACAAACCATTATATGTTTTCCAAATGAGATTGGGTATATTTGTAGTCTTTATGTGCCAAATTAAATTGTTGACCCAAACACAAAGAACCATCTTACTAATTGGTTGTATGGATGTATATAGTTCCTTGGTTTTGTCACATATGGTGGATGAGGTAATTTCTTGATCTTAGTGACAAAAAAAGTGCCTTAGACTTCTGAATGGAGGGAGTAAATTTTTGTGGTTTTGTCACATGGTGGATGAGGTAATTTCTTGATCTTAGTGACAAAAAAAGTGCCTTAGACTTTTGAATGGAGGGAGTAAATTTTTGTTTGGCATTTTATATGTCAAATTGATGTGTCCTTGAATATCTACAAACCGTTTCATGTATTCTGAATTTTCGTTTGGCACTTCAGGTTGCTTCACAAGAGGGAGCCTATCTGGCAAACTGCTTCAACAAGATGAAATACTGTGAAGAGAACCCTGAAGGTCCGTTGAGGATCAGAGGCACAGGGCGTCATCGGTTCAAACCTTTCAGGTTTGTTTTCCCTTGCTCTCTTAGCATACATACATTAGGCACTTAAACACTGCTGATCATGTTGAT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