BGIOSGA018591

From RiceWiki
Revision as of 02:37, 27 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA018591| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA018591, complete gene.| tag = OsI_188...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA018591

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA018591, complete gene.

LocusTag

OsI_18885

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA018591-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA018591-PA

Length

5954

Source

Oryza sativa Indica Group 

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:7271877..7277830

Sequence Coding Region

7277813..7277830,7276653..7276808),complement(7276433..7276538,7275757..7275939),complement(7275464..7275495
,7273559..7273665),complement(7272598..7272881,7272040..7272123),complement(7271877..7271932

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:7271877..7277830 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:7271877..7277830 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGAAGGAGGGTTCCCAGGATGTTGAGAGCAAGGCAAAGGTGCATCCATTGGTGCAAGGTGATGATGAAATCAAGGGTGAACAGCCAAATACTGATGCACCTTTAGGGGATTCTGATTCCTTATCCGCTGCAAGTAATGATAATAAAAGGGTTTCTCGTGAAGATATTGAACTTGTCCAGAATTTAATAGAACGCTGTCTACAGCTATATATGAATAGAGGAGAAGTTGTTAGGACTCTTTCTACTCGTGCAAGAATTGAACCTGGTTTCACTACTTTAGTATGGCAGAAACTCGAAGAAGAAAATTCTGAGTTCTTTCGGGCTTACTACATAAGGTTGAAATTGAAAAAACAGATTAACTTGTTTAACCACTTATTGGAGCACCAATACCATCTTATGAAGTACCCAGTACCACAGCAGGTTCCGTTGACCCCAACACAGAACGGTATTCGTCCTATGCCTGTGTTACCCACTCATGTATCATTGTTCATTATTTTAACAATTTGCCTATGGGATATCCAGTACTCCAACAACCTGGAATACCTGCTCCTGTTCAGCCTCATGTTAATTCGATGTCTTGTGGTCCACCTGGTTGCCATGTGCATGACAGAGAATGAAGTTCCTGGATCTGCACATGCTGGAGCCATGTCATCAGAGATGGCTGTGAGTCCATCATCTGCAATGTCAAGCAATCATGTTTCTTTCACTCCTGATATATCAGGGATGGATGTGGATGCATCTACTGTAAATGCCACCTTTGGAGATGATTTAGGGAATGGAGGACCTCTGCAAATAGGACCAAATGGTGGTGATAGCTCTTCCTTGGGGCAGCAGATCTGGGATTTCAGTCTTTCTGATTTATCAGCAGATTTGACAAATCTGGGAGACCTGGCAGCCCTTGAAAACTATTCAGGCAACCCATTCCTGCCTTCAGACTCTGATATTTTTGAATCCCCGGATGATGACATAGTTGAGTATTTTGCTGATGCCATCAATGGGCCTTCTCAGTCAGACGAAGAGAAATAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MKEGSQDVESKAKVHPLVQGDDEIKGEQPNTDAPLGDSDSLSAASNDNKRVSREDIELVQNLIERCLQLYMNRGEVVRTLSTRARIEPGFTTLVWQKLEEENSEFFRAYYIRLKLKKQINLFNHLLEHQYHLMKYPVPQQVPLTPTQNGIRPMPVLPTHVSLFIILTICLWDIQYSNNLEYLLLFSLMLIRCLVVHLVAMCMTENEVPGSAHAGAMSSEMAVSPSSAMSSNHVSFTPDISGMDVDASTVNATFGDDLGNGGPLQIGPNGGDSSSLGQQIWDFSLSDLSADLTNLGDLAALENYSGNPFLPSDSDIFESPDDDIVEYFADAINGPSQSDEEK</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..18#1023..1178#1293..1398#1892..2074#2336..2367#4166..4272#4950..5233#5708..5791#5899..5954#ATGAAGGAGGGTTCCCAGGTGAGCTTGTTTGTTGCGCTGTGTTTCTTTTTGTTTGGAGTGCTGATGTCGTAGTACCTCGTACTGTAAGAATCTTTCTTGAAAAAAAAATAAATTCGATGCACTGTCTTTTGTTTAAAGTGCTGATGTCAGTCACACTGTGAGAGAACCTTTCATATAAATTAATTCGGAAATAGATAGCTTGCCAACTCGGAAGAGATAGCTTGCCAACTCGGAAGATTGGATTTTACTTCTTAGAATCTATATGCAATGTACTTAGATGACTTTTGGAGTGTAAAATGCTAGAAGATTTACCATCCAGGCTAATATGGTAATTTAATTTTTATGCAACTCTTAGACAAGAGCAATATATTTTTTCCAGTCTCTTTTTTTTTTTGAGAATTTGTTTGTACTGAACTGTAAAATGAAAATCATGTCCCTTGTAATCTTCTCCCCCCTTCAACTTTGAGGAACAACAAGTCGGAGCTTGCCAACTATTGGCTCCAAGAACAGTGTTGGCCATGCAACTGATTTTTAATCAGTTTTGAACATGATGAATCTACCGCAATGATCGATTTGGCAAAGATAGCCTCCAGTAGCCTAGTGCCATGCACTGTGAGGTCCCCAGTGTGAAATGTAGCAGCTGCACAATTCTAGTAAGGAGAACTTGGATGGTGTAGTTGATGGACTTCAATGAAGACTGGAGAGGTGTAAGAATGTCTATGAAAGGCAAAATAAAGAACATCTCTAGTAACCGGCCTGTTAACTCTGTATTAGTCAGTAGAGTCACTTGGTAAATATAAGAGCAACCGTTCAAGATACCAAGTGCTCATGAGGTAAACTCTTGTGGATCTCTGACACAAAAACTAGTTCATTCAAGGTTATATATTCTTTGTATTGGCACCTCTCACTTTTTTGCTGATGTCATGACCATTGATTGCCCTTGCTTTCACCTTTTGTTACTACATCTTTACATTTATACCACATTTCAAGTGAACTATATCCTAATGAGCATATTTCTACAGGATGTTGAGAGCAAGGCAAAGGTGCATCCATTGGTGCAAGGTGATGATGAAATCAAGGGTGAACAGCCAAATACTGATGCACCTTTAGGGGATTCTGATTCCTTATCCGCTGCAAGTAATGATAATAAAAGGGTTTCTCGTGAAGATATTGAACTTGTAAGATGGCTAGTCTTTTCTATTATGGAGGCAATGTTGAAAAGTGTATAATTTTTGTATACAAAGTATAATACCTTCCATTATTAACTAACCAAATATTTTGCGCTGTTGTAGGTCCAGAATTTAATAGAACGCTGTCTACAGCTATATATGAATAGAGGAGAAGTTGTTAGGACTCTTTCTACTCGTGCAAGAATTGAACCTGGTTTCACTACTTTAGGTAAGGTTCTTATGTTGAGTTGGTTCGTAACACCTGTTTCTTATAATCTGCTCAGGGTATGCTATTTTAAGAAGAGAGCTCACCTGGATATAATATAGGAGTAGTTCTTTCTTCTTCAGTCAGGACAATTTTGGTCACCTTATTGAGTTGAGTAAAAAGATTCTCCCTAATCTGTTTTGTGAACATCAGCTGTGCATCTACAACTCTGCTTATTTGCATTTTATTATAGCCAAGATCGATCGTGTAGTACTATAAATATGTATGGATACTGAAATAATCCACTAATTCCTTTCGTTTAGTATTCTGTTCCTGAATATGGAAGTTATAGTGAAAACTTGAAAGCTGTTTTTTTACGTCATACATATATTAACATTGTTTATTAATGAAAAAGATCTATTGAATACTTGAGTGACTTCTATGATGCTTGGAGACAGTTCAGCATTTTGATGTATCTAGTATAGCTCTAAAGCCTTCCCTTTTGTTTTTTGTTCAGTATGGCAGAAACTCGAAGAAGAAAATTCTGAGTTCTTTCGGGCTTACTACATAAGGTTGAAATTGAAAAAACAGATTAACTTGTTTAACCACTTATTGGAGCACCAATACCATCTTATGAAGTACCCAGTACCACAGCAGGTTCCGTTGACCCCAACACAGAACGGTATTCGTCCTATGCCTGGTAATGTCTATCTCTATAGTATTAATATCTAACTCTATAGTGTGATTTCACAAAAATCAAATTATCCATGTAGGATATGTGCTATTCTGCCATAACTGTGATAATGTGCATATTTGACTTGTGTGAAAATTAATTGAAAACCTGATTTCACTTATAATCATAATTTACAAAATTTATTGTACTTATAATGTTACACATTCCTTTTAAGATTCCATGCTTCAGAGTTTCTTGCCATCATTTAGCCTTTTTTGTTTGTTTCAGTGTTACCCACTCATGTATCATTGTTCATTATTGTAAGTTCAGAATGTTGTTGTTTTACTAGTTTCCATGCTACTTTTATGTGCCATTTGCCAGTTGGTGGTGCCTACTACTACTACATACAAAGCACTGCCCTTAATTGATGCCCTATTCTCTGTTAGGTCATCAGTTTATCACCTGATAGACCGATGTGCATCTAAGGCAATGTACTTTCATTGATATTACTGGCTCTGCTGTGTACAGCTTGGCACTGAACCAGAGTATAGAAAGAGACAAATTAATTCACTCTGATCCTGCAATGCTTGGTTCATAGTAAAATTTTGGAAATCATAGTAAGGTCAATGCTAATCTTGAACATCCGACACACATAGTTTCAGTCCAGAGCTGTCATAAAGAAATTTCTTCATAGATTTTATCAAACAGATATGAACTTAACTAGTTCAAGGCACTATGCTACGTTCAACCCTTAATTTGGAAAGTAAGCCCTTTGCTTTTTTGTCTCCATGCATTCACATAAGGTAGTCTGTAGTCATCCGCGCTTGATCACAATCATGGATTTTTGGAGTTCAACTAGACAAGTACTTTAGGGACCGTTATAAGAATATGGCAAAATCTGGAGCACAAACAAACCACCAATTCATGTAAAAGGATTAACTTGGGATTGGAATATGTTTGGCACTTGGATTTCTAAGTTGGTTTCTCCCTTCTCCCCCATACTCTCATGCCCCTACATGGTCTTATAGATACCAATAGTTGTACAAGGTGTAACACCCCAACTTCAAAATTCCGCATTAGCCCAACTCTTCCAAGGAGCGGCCATGTACAGATAGCACCCTACTTACACTTCTGGCCTTGCTTTGTATAGAAGAGTTAACCTTGAGGTATAATTGTAACGTGGGTTTATATGCTAGTTCCAACCAATCTAAGTTCTCCATGTGAGACTAATCCAACCAGCGCCGCAACATGGACCACACAGGCCTCTATCAGCGTCCAAAATCCGTATTAGCCTAGATCTTTGGAGGAGCAGACCCACTTACACATAGCGTCCCCTTGTATTTCATGATCATTTCGTGTTAGAGGGTTAAACAATAGGTGTTATAGTTAAAATGTTTAGGGTTGTATGTTGGCCCTGACCTATCTAACACCATGTGCTGCATGGCCTTGTACTTGTAGGCCAGTGTATTACAGGACTCAAGGACCACTTAGCACTGACAAAATGAAAAATAAATACAAAAGCACTGATTTATGAAGTAAAATATGTATGAATACATTGCTTTCGCCTTTGTCCACAAATTTCTTTCATATCGATGCCATAACATTGGAAGAATTCCTAAACACTTGCATTTCTGCTCTTACAAAACTGTCTTGATATGGAGAATGGCTATTGCACTTTGGAAGACTCATTTCATCATTTTGTGGAATTTTCATTTGTTTATGTCCTAGCCACAGATGTTTGATAAACTGTGTTGAAATGTCACGGGCTATTTGCGATGTGCATGGTTTTCTTAAAAGATATGTAGCTTAGCTAATTGATAAATATGTATCTTCTAGATAACTTCGAGAAAAGATGCTAAATGAGCACATTTTTGAAAGATAGGTGTATCAGTGCCTGCTGCTCTGGGAGTTCTTGAGGCCCACATGACACTGAAGTGGGTTACTTGTGTCTCAGTTCTATATAGTTCATGCTAAATAGTGTTAATTCGTGTGTTTTCATCATAACATTGCTGATATCACCTCTGTTTGGTCTGGATGCTTAGCTGGCTAATTTTGTTGGCTGGCCTGCTTTATGAAGTCCCATTTGTTTTCCTTACAATTTACTTGGTACCATTGCAGTTAACAATTTGCCTATGGGATATCCAGTACTCCAACAACCTGGAATACCTGCTCCTGTTCAGCCTCATGTTAATTCGATGTCTTGTGGTCCACCTGGTTGCCATGTGGTAAATGGAATTCCCGCACCAGGTGGTTATAATCCGATTCGCATGAGCTCAGGAAATGGGTAAAGAATATTTTTCTTATGTTTTGTTCTAATGCTTGTCTTGTTGTTTTATCGCTCTATAAACGGCATTATGATAAGATGGACAATGTAAACTCTGTTTTGTCTTGAATACAGCCCTCCCTCTTTCCTTTTTAGTCTTAGAAAGAATTAACATCACACTGACTATTGCTACTATTGAGATTATCTCATATATTTTCTCTTTTGTTGTTTACTGGAAACCCTCCAAATCAGGTGTTTGGAAAGAAATCAAAGAATGAAACCATTTATACAGACTTGGACAACATACATAATGATAATAATTTGTTCTTGGTGCAGTATCAAACCACTTGATAGCCATGTTGTAAATTTGAATGCTTATTTAATTTAGAGTAAATTTCTGATGCATTAGCTCTCCCAAGTAATGCAATATGTTGTAGTTTCAAAATTACCAAATTGCCCTCTTTATTTCAGCAAATGTTCATTTTGACTGTAAAAATTGAATACATTTTTCTTATACTAATTATTTTCTTGTGTCTTGTAAGACAATGGCATACATATGTACCTATCAGGTAGCTACAGTTAAAATCTTGCTGTCAGCACCTATACAATTCGTTTGATTTTTGCATTATGTTTCTGAAGCATGACAGAGAATGAAGTTCCTGGATCTGCACATGCTGGAGCCATGTCATCAGAGATGGCTGTGAGTCCATCATCTGCAATGTCAAGCAATCATGTTTCTTTCACTCCTGATATATCAGGGATGGATGTGGATGCATCTACTGTAAATGCCACCTTTGGAGATGATTTAGGGAATGGAGGACCTCTGCAAATAGGACCAAATGGTGGTGATAGCTCTTCCTTGGGGCAGCAGATCTGGGATTTCAGTCTTTCTGATTTATCAGCAGATTTGACAAATCTGGGAGGTAATGTCCTATGTTGTGAGATATTATCTTGTATAACACTTGCATTTTTAATTAGTTCTCTGGGATTCTCATTGCTTGTTTGATATCTTGGTTAATTAGTTGAACTTATGCCATATATAGTGTTGTATTTCTCTCCTCAATTTTGTTTACCCCTTGTTGGAGTAAATCAAGATCTTCGCTTGGCTAAAATGTTTGAGTAGTGCTGCTTCTGTTCTCCCCCACATACTGAATTACCTGACTTATAGACAGTATTCTAGCAGTGTAGTATTTGAAAACAAGCTCCTGAATGTGCTTTTCACTTTTTGTCAGTGCTTAAAAGAATATATTTCTACTTAATATTTTTCTGGGACAATCATATTTCATCTAGAATTGACCTGTAGACGGGAAACAAAAACGTTCACCACTTTGCTAAATGAACTTATTTTCAGCTTTTGCTACTGCTTACATCTAACTACTGTTGGCATTGACTTTCAGACCTGGCAGCCCTTGAAAACTATTCAGGCAACCCATTCCTGCCTTCAGACTCTGATATTTTTGAATCCCCGGATGATGACATAGGTAATTTTGTACTTGTCTATTTAAAATATATGCAGTACAGTGAATTTTGAAAAACCTATATTCACTACTATAAAAGTTTGATGATTTGTATGTTGACATGATTCCAGTTGAGTATTTTGCTGATGCCATCAATGGGCCTTCTCAGTCAGACGAAGAGAAATAG</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA018591

Retrieved from "https://ngdc.cncb.ac.cn/ricewiki/index.php?title=BGIOSGA018591&oldid=47347"