BGIOSGA020919
| Gene Name |
BGIOSGA020919 |
|---|---|
| Description |
CBL-interacting protein kinase 24 isoform 1 |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA020919, complete gene. |
| LocusTag |
CIPK24 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA020919-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA020919-PA |
| Length |
5257 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:24978208..24983464 |
| Sequence Coding Region |
24983297..24983464,24982122..24982184,24981930..24982001,24981564..24981671,24981396..24981470 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:24978208..24983464 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGCGGGGAGGAAGAAGCGGGTGGGGAGGTACGAGGTTGGGCGGACCATCGGGCAGGGGACGTTCGCCAAGGTCAAGTTCGCCGTGGACGCCGACACCGGCGCCGCCGTCGCCATGAAGGTGCTCGACAAGGACACCATCCTCAACCACCGCATGCTCCACCAGATCAAAAGGGAGATATCAATAATGAAGATTGTAAGACACCCCAATATAGTTAGACTAAACGAGGTTCTAGCTGGAAAGACGAAGATATACATAATCTTGGAGCTTATCACTGGAGGCGAATTGTTCGATAAAATAGCTCGCCAAGGGAAGCTTCGTGAAAATGAAGCAAGGAAGTACTTCCAGCAGCTTATTGATGCCATCGATTATTGCCATAGCAAAGGAGTCTATCATAGAGATTTGAAGCCTGAAAACCTGCTTCTTGACTCACGTGGAAACTTGAAAGTTTCTGATTTTGGACTTAGCACTTTGGCCCAGAAAGGAGTAGGCCTTCTTCACACAACTTGTGGAACACCAAATTATGTTGCTCCTGAGGTGCTTAGCAACAATGGTTATGATGGATCTGCAGCAGATGTTTGGTCATGTGGTGTTATTCTCTATGTTTTGATGGCTGGATACCTTCCTTTTGAGGAAGATGATCTTCCAACACTGTATGATAAGATTACTGCAGGTCAGTTTTCATGCCCTTATTGGTTCTCTCCAGGTGCTACATCGCTTATCCACAGAATACTCGACCCAAATCCAAAAACTCGTATCACTATTGAACAGATAAGGGAAGACACATGGTTTAAGAAGACTTATGTAGCCATTAAACGTGGTGAAGATGAAAATGTTGATCTGGATGATGTACAGGCTGTTTTTGACAATATTGAGGACAAGTACGTTTCTGAGCAAGTGACTCATAATGATGGTGGCCCTCTTGTGATGAATGCCTTCGAGATGATTACATTATCTCAAGGTTTGGATCTTTCAGCATTATTTGATAGACAGCAGGAGTTTGTCAAACGTCAAACTCGTTTTGTCTCAAGGAAACCAGCAAAGACTATAGTAGCTACAATTGAAGTTGTTGCCGAGACTATGGGTCTTAAGGTCCACTCTCAGAATTACAAGTTGCGTCTTGAAGGTGTATCTTCAAACAGAATGAGCCCGTTTGCTGTTGTTCTACAGGTTTTCGAAGTTGCTCCTTCTCTGTTCATGGTTGATGTTCGAAAGGTTGCTGGTGACACACTGGAATACCACAGGTTCTACAAGAACTTGTGCAACAAGATGGAAAGCATAATCTGGAGACCGATTGAAGTTTCAGCGAAATCCGCACTGCTGAGGACAGCCACATGCTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAGRKKRVGRYEVGRTIGQGTFAKVKFAVDADTGAAVAMKVLDKDTILNHRMLHQIKREISIMKIVRHPNIVRLNEVLAGKTKIYIILELITGGELFDKIARQGKLRENEARKYFQQLIDAIDYCHSKGVYHRDLKPENLLLDSRGNLKVSDFGLSTLAQKGVGLLHTTCGTPNYVAPEVLSNNGYDGSAADVWSCGVILYVLMAGYLPFEEDDLPTLYDKITAGQFSCPYWFSPGATSLIHRILDPNPKTRITIEQIREDTWFKKTYVAIKRGEDENVDLDDVQAVFDNIEDKYVSEQVTHNDGGPLVMNAFEMITLSQGLDLSALFDRQQEFVKRQTRFVSRKPAKTIVATIEVVAETMGLKVHSQNYKLRLEGVSSNRMSPFAVVLQVFEVAPSLFMVDVRKVAGDTLEYHRFYKNLCNKMESIIWRPIEVSAKSALLRTATC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..168#1281..1343#1464..1535#1794..1901#1995..2069#2154..2207#2710..2835#2963..3052#3406..3528#3614..3733#4518..4634#4718..4774#4878..4952#5162..5257#ATGGCGGCGGGGAGGAAGAAGCGGGTGGGGAGGTACGAGGTTGGGCGGACCATCGGGCAGGGGACGTTCGCCAAGGTCAAGTTCGCCGTGGACGCCGACACCGGCGCCGCCGTCGCCATGAAGGTGCTCGACAAGGACACCATCCTCAACCACCGCATGCTCCACCAGGTAATTCCCCCGCTTCTCCTTTCCCGCTACCCTCCACATCCGCCCCCGCCAGTGCACGAGTCCAAATCAAACTCCTCGCACTCCCCCCTTTGCTTTGATGCGGGCGATTCTTTTTACACTTTTTTTTTATTTGGGTGCTCTCCGCTGCTGCTTTGCTGTTTGCCAAATGGTGAGCAGCCGCGCATCGACGAGGGCGGATGGAGAATTTCCGAATATACCTCGACAGCAATGCGCACCACTGGTTAATTCCTGCAAGTTGCGCGCAGCTCTTGCCGTTTGATGATTAAGAATAAGGAATTAACTGGAGAGCCTTAAATTTCTTGTTCTCCCAAAGGGGAAAATACCTTTTTTAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAGAAAAACTTAATTCGAGCGGTTTGTTTGGTGTTTCATCTCGTTTGGGCTGACAGAAGCTCAGTTGCAGAATTGAAATGGTTGGGTGTTGAAAGTGATTTTACCAAAATTTGGTCTGTTGTAGCTTAATTCGATTTGCGGTGTTTGCAGAAATGCTACAAATAGTTGGTTCATATGGTTATCCAACGACATCTTTTGAGGATGCATCTTGTTGCAAAGTGCTCAAGTTCTCTAATTATAGTGGTGTAAATCTTTTCCTAAGCTTCCTGATTTGCTAGTTGCTATGGAACTTGGTTTCTCTCCAATTGTGTTTGCAATTGCAAGTATATATTTGGTTTGTTTAATATAACTGTTCTATAATCCTAAGCCTACTGCTTTGCCATGAAGCTTGGTTTCTCTCCAATTGTGTTTGCAATTGCAAGTATATATTTGGTTTGTTTAATATAACTGTTCTACAATCCTAAGCCTACTGCTTTGCCATGAAGCTTAGTTTCTCCCCAATTGTGTTTGCAATTGCATGTGTATAAATTTGGTTTGTTTAGTTTAACTGTTCTGCAAATCAATGATGACCACCAGTTTTACCTGATTTTGCTGTGAGCACCCATTTCAGATTTCCAGTTTATGCGAGATGTACTTTCTTTGTGTTGTTTATGCAATATCGCTAATCATGATAACAAAAAAAAGGACTAAACCATTCTAATTCGGCATTAGATTACGAACTCACTTCTCATGTTACTTGACAGATCAAAAGGGAGATATCAATAATGAAGATTGTAAGACACCCCAATATAGTTAGACTAAACGAGGTATGCTAAATATTTACTTGCCATCTGTCCTATATAACTTTTCATTATTAACAAAACTCCTATGTTGGCTATCTTAACTTCCTGTGTCACTACTTTGTTACCATTACTATGATTTTGTAGGTTCTAGCTGGAAAGACGAAGATATACATAATCTTGGAGCTTATCACTGGAGGCGAATTGTTCGATAAAATAGTAAGGAGTCTATTATATACACTACCGAAATAACGATGAGCTGCTGTTCTACTTGAACTAAAAAAATATAAGAATTGTGCCACTCTGGCAGTGTCTCCATATGTAAATTCTTTTTATCACCCATATATACCAGAAACTTTCTGTTCAGTAAATTATAGGCCCATTATATAATCCCAATAGGCAATATAAAGAAAGGAACATTTTTTTATTATTGTGCATTTTCTTAAAATATGAACCTATGCGATCAAATATCTGTAGGCTCGCCAAGGGAAGCTTCGTGAAAATGAAGCAAGGAAGTACTTCCAGCAGCTTATTGATGCCATCGATTATTGCCATAGCAAAGGAGTCTATCATAGAGATTTGAAGGTCCGTTACTGATAAGAGACACTTGGCTATCATTTGTCCTATTCACTAGGTGCAATATCTCATGCTTACCCTTTTTTTGGGCATGTTATGTAGCCTGAAAACCTGCTTCTTGACTCACGTGGAAACTTGAAAGTTTCTGATTTTGGACTTAGCACTTTGGCCCAGAAAGTAAGCTCAGTAATTGCTTTTAATGATGCTGTATTTCTATCCTAGAAGTGTTCTGATTGGGATTTCTTTTTTGAGGGATTTCAGGGAGTAGGCCTTCTTCACACAACTTGTGGAACACCAAATTATGTTGCTCCTGAGGTATGATGCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCAATGCATGGTAAATTGAACTGTACGAAATGTTTTTTTTTTTGGCAAGGAGCTAATTGATTAGCTACACTACATGCAAGAAATATGTCTGCAAAATTAGACGAGTTACTCGGGATGCAATTCAATTTTCCTAGATTTTCTTTATATAGATCATATTTGTATGTATGATACAAATGTCTGTTAGACTAGAAAGAGATTACCTATTTCTTTGTTTCTCTACCTGTCTCGCAGTTATTTGGTTGGTTAGTTCTCTTCAGGGTTCTAAACCTCATTTTTATGCATATTTCTGCCATCATCACTAAATAAATATCTCTAGCTGTCTTATTTCACCATGTTCAAGCTATTGTGATTTTAATTGTCTGAACTAGTTCATAAAATTGTGATATGGGCATTTCAAGCCATTTCCTTAGACAAGATTAGGGGCATTTTTTTAGTACATATATGATATGCGCTTTACCATGTGTCAATGTTTTAGGTGCTTAGCAACAATGGTTATGATGGATCTGCAGCAGATGTTTGGTCATGTGGTGTTATTCTCTATGTTTTGATGGCTGGATACCTTCCTTTTGAGGAAGATGATCTTCCAACACTGTATGATAAGGTATTGGCTTCATTACTAATGTGTGCAGCATAAGTCTTTCTTTCCCTAAATTGTTGATGTGAACACCTACATAATCGTTCTACTCAGATGAGATTGAAACCTGATATGTTTACTCCTACATTAAAAGATTACTGCAGGTCAGTTTTCATGCCCTTATTGGTTCTCTCCAGGTGCTACATCGCTTATCCACAGAATACTCGACCCAAATCCAAAAACTGTAAGTACACACACTAGGTTGTTTCATTGCATCTTCAAGAAACAAATCATCCTTTATAGTAAAGTTTACCTCAAGCTTCCAAAGTACTCTTGTCACCAATTTAATACTTCAGTCTCAGTCTGCATGGCTGCAGAAATTATGTGAGAGAATGCAGAAAACAAAGACTAATTTCTTCATATCAGTGCTGCCATATATGTTACAGAAATACTGTATACAACTATACATGACCAGTGACAGAATCTTGCTAGAATCAAATCTAATAAGTCTAACGCATAGATCTTCAACCAGCATAGAGTGTTTGCTTTTGCAAATTGCCGTCTCCAGTTTCTTAGGCCTTTTTCACTATTTTGCAGCGTATCACTATTGAACAGATAAGGGAAGACACATGGTTTAAGAAGACTTATGTAGCCATTAAACGTGGTGAAGATGAAAATGTTGATCTGGATGATGTACAGGCTGTTTTTGACAATATTGAGGTTTGTGTATGCCATTGGTATATTGCCAATTGTCTGTCACCTATTTGCTTCTATAGTTATATTTATACAACTTTTCTGGCTTCAGGACAAGTACGTTTCTGAGCAAGTGACTCATAATGATGGTGGCCCTCTTGTGATGAATGCCTTCGAGATGATTACATTATCTCAAGGTTTGGATCTTTCAGCATTATTTGATAGACAGCAGGTAATTTCATAGTTCCACTCTTCCTTTTAGTTGGTAACACTCTTGGTATGGTTGACCATTTTGCTGTTGGAGAACCATTAGCGCAATGAAATTTGAAACGCTGATGGGTTTATAGTGTACGGAGATCTGGCATGTCAGCTTATTTCATTTACTTACAAGGCTGTGAGGCACTGGGTTTAGTGACGGTTGGTCACTCAGGGGTTTCTATCTTGTTTATAATAAATGACTTAAACGAACATCCATTTCAATTGGCGTTAGTATTATGTGGAACTATATTCTAGCCACTGTATATGGATTAACCAACTGTAGATCGATCCCATTGTCTATTCTCTTTTCTTACCGCTTAGTGTACTGGTTGGTGGCAGACGGCTTCTGTTTTTTGCCAAATTTGAATGGAAATGGAAACCCTGCATAAAAGGAGAAAAAAACATCTGATTGCTTGCCTCTTAGCTAATCTCCATGGTTTAAATTGCACCTGTTTAGTTTGTGAAGTATTTGACCACACCAACCATATATTCATTCTAGTTGCAATGTTCTCGTATAGCAGAAAGAAGAACCCACTTTTCAATGTTTGTGCTCTTACATTAGATCTTCCTAGACATGTTTAGTACGTATTTTTTTATTTTACGTGGACCATACGTCATAGTGTGCCACACGTCATGAATAACTTTGGTGTTTGCTTTATGCATTAACTGCAGTCCTCATGAATAACTTATGTTGTCTGATGCAACTTTCATCACATGGAGTGCTCATGTTGCAATAATGATGGGTTTTATATTTGTAGGAGTTTGTCAAACGTCAAACTCGTTTTGTCTCAAGGAAACCAGCAAAGACTATAGTAGCTACAATTGAAGTTGTTGCCGAGACTATGGGTCTTAAGGTCCACTCTCAGAATTACAAGGTAATTACAAAACATTTTCTTCAACAAGCAACTCATTTCTTACTCTTGATGTAATGATACTTATTGCTAACTCTTTTCTGCAGTTGCGTCTTGAAGGTGTATCTTCAAACAGAATGAGCCCGTTTGCTGTTGTTCTACAGGTAGTCTTACATTGCCCTTTGTTGGGGAACAACATTTTGCTGTTTGTCATTCACAAACTACA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| External Link(s) |
