BGIOSGA021160
| Gene Name |
BGIOSGA021160 |
|---|---|
| Description |
Methionyl-trna synthetase |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA021160, complete gene. |
| LocusTag |
OS06G0508700 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA021160-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA021160-PA |
| Length |
8618 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:19361656..19370273 |
| Sequence Coding Region |
19370150..19370273,19369882..19370026,19369239..19369392,19369002..19369157,19368659..19368889 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:19361656..19370273 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:19361656..19370273 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGTCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCCGAAGCTGCCGGTCCCCGGCCGCCGCAACATCCTCGTCACCAGCGCGCTGCCCTACGTCAACAACGTCCCTCACCTCGGGAACATCATCGGCTGCGTGCTCAGCGCCGACGTATTCGCGCGCTACTGCCGGCTGCGGGGCTACAACGTCATCTACATATGCGGCACCGACGAGTACGGGACGGCCACCGAGACCAAGGCCATGGAGGAGAAGTGCTCGCCCAAGGAGATCTGCGACAAGTATCATGCTGTCCATAGTGAGGTTTACAAATGGTTTGACATAAAGTTTGACAAGTTTGGACGGACATCCTCTCCCCAACAGACTGAAGTCTGCCAAGCAATTTTCCAAAAGTTGATGGAAAACAATTGGCTCACAGAAAACACCATGCAGCAGCTGTACTGTGATACTTGCCAACGATTTTTAGCGGATAGGCTCGTGGAGGGGAAATGTCCAACTGAAGGCTGTAATTATGAGGCGGCGCGAGGTGATCAGTGTGAAAACTGCAGCAAATTGTTGAATCCAACTGAGCTAATTGATCCCAAGTGTAAGGTCTGTAAGAATACTCCACGTGTCCGTGACACAGATCACTTATTCCTTGAGCTTCCTCTTTTGAGCGACAAGTTGGTAAACTATATCAATGAAACTTCTGTAGCTGGTATGTGGAGTCAAAATGCTATTCAGGCAACAAACGCATGGCTGAAGGAAGGTTTGAAGCCACGCTGTATCACCCGAGATCTCAAGTGGGGTGTTCCTGTTCCACATGAGAAATATAAGGACAAGGTGTTCTATGTTTGGTTTGATGCACCGATTGGCTATGTATCTATCACAGCTTCCTATACACCTGATTGGGAGAAATGGTGGAAGGATCCTGATAACGTAGAATTGTTTCAGTTCATGGGTAAAGATAATGTGCCATTTCACACGGTCATGTTCCCTTCTACATTACTTGGAACTGGCGAAAAGTGGACAATGATGAAGACCATAAGTGTGACTGAATATTTGAACTACGAAGCAGGAAAATTCTCCAAGAGCCATGGTATTGGAGTCTTTGGTAATGACGCGAAGGATACAAATATACCTCCTGAAGTGTGGCGTTACTACTTGCTTACAAATCGTCCTGAGGTATCAGATACACTATTTACTTGGGCTGATTTGCAAGCCAAATTAAACAGTGAGTTGTTGAACAACTTGGGGAATTTCATCAACCGTGTGCTCAGTTTTGTTGCAAAACCAGCAGGAGCCGGATATGATTCCATCGTACCTGATGCTCCTAACGCTGAGTCGCATCCACTGACAAAGGCACTTGCTGAGAAAACTAATAAATGGGTTGAACAATATCTTGAAGCAATGGAAAAGGTTAAATTGAAACAAGGACTGAAGAGCGCTATGGGCATTTCTAGTGATGGAAATGCATATCTGCAAGAGAGCCAGTTTTGGAAACTTTATAAGGAAGATCCAGCAGCCTGTGCTGTTGTAATGAAAACTTCAGTTGGTGTGGTCTATCTCCTTGCCTGTTTGCTGGAGCCTTTCATGCCTTCATTTTCCAATGAAGTGTTGCTGCAATTAAATATGACCCCTGAAGAAAGCTTGTCTTTCTGTGACGATAAAGGAGAAATCGCCAAGGCAAAAAGACCTTGGGATTTTGTATCAGCAGGCCACAAAATAGGAAAGCCTTCACCTCTATTTAAAGAACTGAAAGATGAAGAAGTAGAGTCCTTCAGGAATAAATTTGCAGGCAGCCAAGCTGAGAGGAGCTCAAAAGCACAAGCTGATGCTGAAGCTAAGAAGGTTGCTGACAAGCTCAAGGGCACAAAATTATCTGATGGAGGTCAAAAGAAGGAACAGAAAAAACAATCAGGTGGTTCAAAATCAAAGAATGCAGAGGTGGATGTCACGGTGGCAAAGTTGGATATTCGAGTGGGGCTTATCAGGAAAGCACAGAAGCATCCAGATGCTGATTCGCTGTATGTAGAGGAGATTGATGTTGGAGAGGAAGCACCAAGAACAGTTGTTAGCGGCCTTGTCAAATTCATCCCTCTTGAAGAAATGCAGAACCGGAAAGTGTGTGTTCTCTGCAATCTGAAACCAGTGGCGATGCGCGGTATAAAATCACATGCAATGGTTCTGGCTGCATCAAATGAGGACCATACAAAGGTTGAGCTGGTTGAGCCACCAGAATCCGCAGCGGTTGGGGAGAGGGTGACCTTTGCTGGGTACTCTGGAGAGCCTGAGGCGTCTCTCAACGCAAAGAGCAAGACGTGGGAGAAGCTATCAGCTGACCTGCACAGCAACGGCGAGCTCGTGGCGTGCTACAAGGATGTACCCTTCACAACTTCAGCTGGAGTTTGCCAGGTGAAGTCGATAGCGAGTGGAGAAATTCGCTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASPPPPPPPPKLPVPGRRNILVTSALPYVNNVPHLGNIIGCVLSADVFARYCRLRGYNVIYICGTDEYGTATETKAMEEKCSPKEICDKYHAVHSEVYKWFDIKFDKFGRTSSPQQTEVCQAIFQKLMENNWLTENTMQQLYCDTCQRFLADRLVEGKCPTEGCNYEAARGDQCENCSKLLNPTELIDPKCKVCKNTPRVRDTDHLFLELPLLSDKLVNYINETSVAGMWSQNAIQATNAWLKEGLKPRCITRDLKWGVPVPHEKYKDKVFYVWFDAPIGYVSITASYTPDWEKWWKDPDNVELFQFMGKDNVPFHTVMFPSTLLGTGEKWTMMKTISVTEYLNYEAGKFSKSHGIGVFGNDAKDTNIPPEVWRYYLLTNRPEVSDTLFTWADLQAKLNSELLNNLGNFINRVLSFVAKPAGAGYDSIVPDAPNAESHPLTKALAEKTNKWVEQYLEAMEKVKLKQGLKSAMGISSDGNAYLQESQFWKLYKEDPAACAVVMKTSVGVVYLLACLLEPFMPSFSNEVLLQLNMTPEESLSFCDDKGEIAKAKRPWDFVSAGHKIGKPSPLFKELKDEEVESFRNKFAGSQAERSSKAQADAEAKKVADKLKGTKLSDGGQKKEQKKQSGGSKSKNAEVDVTVAKLDIRVGLIRKAQKHPDADSLYVEEIDVGEEAPRTVVSGLVKFIPLEEMQNRKVCVLCNLKPVAMRGIKSHAMVLAASNEDHTKVELVEPPESAAVGERVTFAGYSGEPEASLNAKSKTWEKLSADLHSNGELVACYKDVPFTTSAGVCQVKSIASGEIR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..124#248..392#882..1035#1117..1272#1385..1615#1694..1837#2471..2561#3638..3744#3819..3933#4116..4234#4385..4450#4537..4665#4742..4885#4981..5107#7869..8098#8193..8294#8388..8618#ATGGCGTCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCCGAAGCTGCCGGTCCCCGGCCGCCGCAACATCCTCGTCACCAGCGCGCTGCCCTACGTCAACAACGTCCCTCACCTCGGGAACATCATCGGCTGTGAGCCTCCTCCCTCGATTTTGCTTTTTGTTTGTTAGCTTTCCTTGCGCTGACGGATTCAGCTAGTTCTTGCTGCTGATTGATTGGTTGATTGATTGATTGATGGTGGCGGTTGCGATGCAGGCGTGCTCAGCGCCGACGTATTCGCGCGCTACTGCCGGCTGCGGGGCTACAACGTCATCTACATATGCGGCACCGACGAGTACGGGACGGCCACCGAGACCAAGGCCATGGAGGAGAAGTGCTCGCCCAAGGAGATCTGCGACAAGTGAGAGAGGCTTCACCTTCCCTCTGCTTCTAATTTAATTTGGTCTCTCTCACCCTGTTAGTAATCGTATATAGGATTTTGTCTGGGTTTATTATAATTTTGGTTGCGATGGCACTAGTTAGTACAAAAACAGTGTGGTTTAGCTTCAATATGAGCTGACGAATTGAATTGACTAGTCGCAGCAGATGCACTTATAGATTTTTTATTTTCCATGACACTCATCGACAGTGGCGATTGGTGGTCGCACTCTCTGCTTACAACCATAAGATTATGCGCATTAAGTAATATGACGTGCCAAGTATGTTCGTAAACAATTGAAAGTGATGTAGAGTGACAGATCCCATAATTTTTGGAAAGACCATCGCAAACTTTTTTTTAGTTGTAGTTCACAAATGCATGAGTCAGTTGCCTTTCTTTCATGTCCTGTAAACTTAGCACATGAAAAGCGAAGGCATTTTCTTCATAGAGAGCTTTTCCTGTTGAAAATAGGTATCATGCTGTCCATAGTGAGGTTTACAAATGGTTTGACATAAAGTTTGACAAGTTTGGACGGACATCCTCTCCCCAACAGACTGAAGTCTGCCAAGCAATTTTCCAAAAGTTGATGGAAAACAATTGGCTCACAGAAAACACCATGCAGCAGGTATAGATGATTCTTGGTCTTATCCCTGTGTATCTGTCTTTTCATATTCTATCTTTTACACAATATATATTCCTTTTGCAGCTGTACTGTGATACTTGCCAACGATTTTTAGCGGATAGGCTCGTGGAGGGGAAATGTCCAACTGAAGGCTGTAATTATGAGGCGGCGCGAGGTGATCAGTGTGAAAACTGCAGCAAATTGTTGAATCCAACTGAGCTAATTGATCCCAAGTGTAAGGTAAGCTAATTTGTTCATTGAGCATCATTTTTTTATTGCTGCATGATACAAAGCACATAGAGTACTGTGAAGTTTTAATTATGCTTTCCTTTTGCCCTCTATCTTTCTGTAGGTCTGTAAGAATACTCCACGTGTCCGTGACACAGATCACTTATTCCTTGAGCTTCCTCTTTTGAGCGACAAGTTGGTAAACTATATCAATGAAACTTCTGTAGCTGGTATGTGGAGTCAAAATGCTATTCAGGCAACAAACGCATGGCTGAAGGAAGGTTTGAAGCCACGCTGTATCACCCGAGATCTCAAGTGGGGTGTTCCTGTTCCACATGAGAAATATAAGGACAAGGTTTGTGCATATCAGATCTGAAGAAGTCCTGCTTATGTTCTATTTACTTTATCTCTAATGATTTTTTTTTATTTTTAGGTGTTCTATGTTTGGTTTGATGCACCGATTGGCTATGTATCTATCACAGCTTCCTATACACCTGATTGGGAGAAATGGTGGAAGGATCCTGATAACGTAGAATTGTTTCAGTTCATGGGTAAAGATAATGTGCCATTTCACACGGTATGAATTGTTTCTGTTCATGGCATATGAATTATGAACATTTTTAGTTTTTCATTACGTTTTGGATGTGAATGTATGAATAATTAGTTTTCCATGAGTACATGTTTGTAAATATTGTTGTATTTAACTACTTAGTCAAGATAATATTATCTCAAATGTTTAACTGAGTTAGCTTTCTCTGAAAAAAAGACGAATTCTGACTTATATCTTAAACGCCTGATTGGTCTCTATCCAACTTGGTTATATGATTGATAGTATGGTATTAATTTGTAATTTGATGATTTGTTTGATACTTCAATTCATGAACTTGATGGTTACTACGAAAGGACTATAAACCCACAAGCTTTATATCCTTTAAGCCTTCAATGGTCAGTTTGGGGGTTGTTGTACATGTGCTTTGTGGACCTAGTTATGGCCTTATGAGAATAGTTGCCCCCTCCATCTAATCTACTGCTATAGCAAAATATACTGTCAGGTAGTTTATCAAAGTAAAAAATACAAGATCTTTTGCAAATGCAGCCATGTCAAAATGGAGCCTAATATATATGTCATTTACTCATTTTGCAAATACTAGTTATTGTTCTCATGCTTCTAATTATAATTATTAACCATGAACTACTTATTTAATGAAAGGTCATGTTCCCTTCTACATTACTTGGAACTGGCGAAAAGTGGACAATGATGAAGACCATAAGTGTGACTGAATATTTGAACTACGAAGCAGGTATTGCTGCTACAGTTTTTTTTAACCAAAATGCTTGATTGACAAAGAGTCCATATTATTGGTAACTGGTAAATGGTAAATACTTGTTTGCTTATGTGAGCTCAGGAGCCCGTGGAATTCATAGACTTTTATCAACCAAATTTGCCGTGCCCATTTATTTGAACCAAAACATGTTATTTTCTCTCTGCTGAATAATATTAGTTACTCCCTCTATCCCAAATTATAAGGCCTATATTTTTTTACACGGTCTTCAGTGACATACTTTGACCAGTAATTTATTCCATGTTATGTTCCCAACTAATATAAAAATTAGCATCACATGAAAGTACATCAAAATATGAATCTAGTGATATAACATTCATAATACTTAGCATAGATATGTTTAGTATGATTATTAGTTAAAAGCTACCGAGTTTGACAAAGAGAAGTATTGAATTGGATTGAAGATTCTCATCCCAAGAATATTTAAGACATTACATTTTATGGCACCCTCAGACCTGAGTTTTATTACCTATTTTATTCCACCAATCTCTTTCAAACATGCTTCTTTTCATCCATTACACTGGACTGCAAATTTAAACAATGGTGACTAAAATTTAACGGTGTCTGTAGACTAAAACTGTCATTTGATTGAAGTCTGATATATGCCTATGTTCTAACATGTAACTTTCCCTCCGTTTCAAGTTACTTGCCATTCTAGCTTTGTTGTTAGTAAACATTTATATCTTTGACCACCAATTTCTAGAAATTCATATAGTTTAACAACATGCAAATTATCCAATGAATAACATAAATATTATGATGTTAAACTATATGGATTTCCAGAAATTGATGGTCAAGGTACAAACCTTTTGACTTACAACAAAACTAGAATGGCAAGTAATTTGAAACGGAGGGAGTACTTATTCACAAAGGATGCCGTATTTCCTTGCATGAGCATTATCTGAACAGAAAATCCCATACTGCTTTGCATGAGCTTTATCTAAACATGCTGAGTTGCTGACCAAGATGCATGCATGATAAGACAAACATGCACATCTATGTGGATAATAATTGAATATTCATTGCACTTGAAGGAAAATTCTCCAAGAGCCATGGTATTGGAGTCTTTGGTAATGACGCGAAGGATACAAATATACCTCCTGAAGTGTGGCGTTACTACTTGCTTACAAATCGTCCTGAGGTTTGTATTGAATGGTACACTGTAATGGTACAGTGTTTAAGTTTTTTGTCCTAACTATCATCTTTTTAATTCAGGTATCAGATACACTATTTACTTGGGCTGATTTGCAAGCCAAATTAAACAGTGAGTTGTTGAACAACTTGGGGAATTTCATCAACCGTGTGCTCAGTTTTGTTGCAAAACCAGCAGGTCAGTCTAGATGTCTTAATACCTGGCATCTTACTTTCTTTAAGGACTATTAATTGAGTTTGGTATTTTTCTCATAGAGTTTAGATAGGCCATAAGTGATCAGTCGCCATTATCTTGTTCTTACCTCCAAACTTTTGTTTTATGTTCATTATGTTTCTTTCTTTTTTTTCTTTTTTTGTTAGGAGCCGGATATGATTCCATCGTACCTGATGCTCCTAACGCTGAGTCGCATCCACTGACAAAGGCACTTGCTGAGAAAACTAATAAATGGGTTGAACAATATCTTGAAGCAATGGAAAAGGTTATCTATCAATCTGTTATCGTAGGAAATGACACATTCCTATGCTTCCTGCTTAACATCCTGTCAATTCTTCTTCCTTTTTTCTTTTTTCTTTTGGTTTAGCAAGCTAGTAGGTTTTGGAACATATGTTTAATAGTTTTTTCTTGACAGGTTAAATTGAAACAAGGACTGAAGAGCGCTATGGGCATTTCTAGTGATGGAAATGCATATCTGCAAGTAAGTAATTTGTTTTATTGTCATGGTTTTCGTTTAGTCTATTTTAAGTAACACTTTTATATCTTCAATTCGCTAACTGAGTGCAGGAGAGCCAGTTTTGGAAACTTTATAAGGAAGATCCAGCAGCCTGTGCTGTTGTAATGAAAACTTCAGTTGGTGTGGTCTATCTCCTTGCCTGTTTGCTGGAGCCTTTCATGCCTTCATTTTCCAATGAAGTATGATCCTTGTCATCACTGAAACATGTCTGAGTTTTTATAAGAGAGCCGAATCTCACTTCATTTTTTTCATAAGGTGTTGCTGCAATTAAATATGACCCCTGAAGAAAGCTTGTCTTTCTGTGACGATAAAGGAGAAAT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| External Link(s) |
