BGIOSGA021216
| Gene Name |
BGIOSGA021216 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA021216, complete gene. |
| LocusTag |
OS06G0488600 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA021216-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA021216-PA |
| Length |
5694 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:17706588..17712281 |
| Sequence Coding Region |
17711868..17712281,17709810..17711158,17709624..17709734,17709254..17709530,17708989..17709077 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:17706588..17712281 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:17706588..17712281 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCCGGGGGGAGGAGGAGCAGGACAAGCAGGAGGCTCAAGCTGAAGCTCAGCGCATTGTACACCTTCGCGCTATGCAGCAAGGGATCCGGCGAGGACCATTCTTCGCGGATTGGGACGACAGGGTTCTCCAGGGTTGTTTATGTCAATGAGCCCGACAGGCATGAAGAGGAGGGGTTCAGGTATCAGCCGAATGAGGTGTCGACGACAAAGTACAGTTTGGTGACTTTCATTCCAAAGTCCCTCTTTGAGCAGTTCAGGAGGGTGGCCAACTTCTACTTCCTGGTCTCCGGTATCCTCGCGTTGACCCCTCTCGCACCCTACACCGCTGTCAGCGCACTCCTCCCGCTGTGCGTTGTGATTGCGGCGACAATGGCAAAAGAAGGCATTGAGGATTGGAGGAGGAAACATCAGGATCATGAACTCAATAATCGGACAGTAAAGGTGCATAGAGGCGACGGCGATTTTGAAGAGAAAAAATGGAAGGATATCAAAGTTGGTGATGTAATAAAGGTGGAGAAGGATAATTTCTTTCCTGCAGATTTGGTTCTGCTTTCATCTAACTATCCAGATGGAATCTGTTATGTAGAGACTATGAACCTTGATGGTGAAACGAATTTGAAAATTAAGCAAGCTCTTGATGTGACATTGCATTTGGAAGAGGATAATAGTTTTGTAAATCTCAGGCAGACAATCAAATGTGAAGATCCAAACGCGAATCTCTATTCTTTTATTGGTACTATGGAATGGAAGGACAAGCAGTACAATCTGTCACCGCAGCAGCTTCTTCTTCGAGACTCAAAACTAAGGAACACTGACTACATATATGGTGCTGTGATCTTCGCAGGCCATGATACAAAAGTAATGCAAAATGCAACTGATCCACCATCTAAAAGAAGCAAAATTGAGAAGAGAATGGATAAAATCATTTATGTGCTAATGTCTTCACTACTCGTAATTGCATTACTTGGTTCAGTGTTGTTTGGTATCTGGACAAAAGAAGATTTAATGAATGGCGAGATGAAACGATGGTATCTTAGGCCAGATGATTCTACTATCTTCTATGATCCAAAGCGAGCAGCTCTAGCTTCTTTCTTTCATTTGTTGACAGCCTTGATGTTGTATAGCTACTTCATCCCAATCTCGTTGTACATATCTATTGAGATGGTCAAGATACTGCAGGCTCTATTCATCAACCAGGACATTGAAATGTATCATGAAGAATCAGATAAGCCAACTCATGCTCGTACTTCGAATCTAAATGAGGAACTTGGTCAAGTTGATACGGTTCTTTCTGACAAGACTGGGACATTGACATGTAACATGATGGAGTTCATTAAGTGCTCGATTGCTGGCATTGCCTATGGTCAGGGTGTCACAGAAGTTGAGAAAGCTATGGCTCTGAGGAAAGGGTCCGTTTTAGGTGATGGGATAGAAAATATAGAGCACACAGACCAAAAAAATGATGGAAGCCCTCACATTAAAGGATTTAATTTCAAGGATCCACGTATCATGGATGGAAACTGGATTCATGAGCCTAACAGTGATATGATAAGAGATTTTTTCCGTCTGCTTGCCATCTGTCACACATGTATACCTGAAGAGGATGAAGAAACCCATAAGGTTTCATATGAAGCTGAGTCCCCTGATGAAGCTGCATTTGTTATTGCGGCAAGAGAGTTGGGGTTTGAGTTTTATCATAGGGCACAGTCAAGTATAGTTGTTCATGAACGGGATCCGATCACGAATATTGTAAAAGATAGAAAGTATGAGCTCCTGAATGTCTTGGAATTCAGTAGTTCACGGAAACGGATGTCTGTGATAGTTAAGGAACCAGAGGGAAGGATATTACTTTTTAGCAAGGGAGCTGATAGTGTTATGTTCAAAAGGCTCGCACCAACTGGAAGAAAATTTGAGGAAGAGACTAAAAGACACATAAATGAGTATTCTGACTCAGGTCTAAGAACCTTGGTTCTTGCGTACCGTTTCTTGGATGAGAATGAGTACATGATATTTAGTGAGAAATTCAACACTGCCAGAACATCTGTAAGTGCTGACAGAGATGAAAAAGTTGAGGCGGCTGCTGAGAGCATCGAGCGAGACTTGCTTCTTCTTGGTGCCACCGCTGTTGAGGACAAGCTCCAGAAAGGGGTGCCCGAATGCATAGACAAGCTTGCACAAGCTGGAATTAAAATATGGGTCCTCACAGGTGACAAAATGGAGACGGCTATCAATATTGGCTTTGCATGTAGCCTACTTAGACAAGGAATGACACAGATAATTGTTACCCTGGAAGCACCTGACATTATTGCATTGGAGAAAAATGGAGACAAGGAATCAATTGCAAGGGAATCAAAGCAAAGGGTAATGGATCAAATAGAGGATGGAATCAAACAGATTCCACCCCCAAGTCAATCAAATACTGAATCCTTTGCACTGATCATTGATGGTAAATCTTTAACATATGCCTTGGAAGATGATGTCAAGTTTAAGTTCTTGGATCTTGCTTTGAAATGTGCTTCAGTTATATGTTGTCGATCTTCACCTAAACAGAAGGCACTGGTTACAAGACTTGTTAAACATACAAATAGAGTGACTTTAGCAATTGGTGATGGGGCAAATGATGTTGGCATGCTTCAGGAAGCTGATATAGGGGTTGGCATTAGTGGTGTTGAGGGGATGCAGGCTGTCATGGCAAGTGATTTTGCAATTGCTCAGTTCCGTTTCCTGGAAAGGTTACTGCTTATTCATGGGCATTGGTGTTACCGTCGCATTTCAGTGATGATATGCTATTTCTTCTACAAGAATGTAACTTTTGGAGTCACTATCTTTCTCTATGAAGCATTTGCGTCTTTCTCAGGGAAACCAGCTTATAATGATTGGTTTTTGTCACTATACAATGTTATTTTCACTTCTCTCCCAGTCATTGCATTGGGGGTATTTGACCAAGATGTGTCTCAAAGGCTGTGTCTGCAGTATCCAGGGCTCTACCAAGAAGGTGTGCAGAATATATTGTTTAGTTGGCGCCGGATACTTGGCTGGATGGCTAATGGCGTAATCAATGCCATCCTAATCTTTTACTTCTGCACTACTGCCTTCGGTATCCAGGCATTCCGTCAGGATGGCCAAGTTGCAGGCTTGGATGCTCTAGGAGTCCTCATGTACACTTGTGTGGTATGGGTAGTGAACTGCCAAATGGCGCTCTCTGTGAACTACTTCACAATAATCCAGCACATATTCATATGGGGAAGCATTGCCGTATGGTACCTCTTCCTCTTGGCTTATGGTGCTGTGGACCCGAGGTTTTCGAAATCAGCTTACATGGTTTTCATTGAACAAGTGGCTCCAGCACTTTCATATTGGTTGGTCACACTTTTTGCTGTGATGGCAACACTCATCCCTTACTTCTGCTATGCCGCAATCCAGATCAGATTCTTCCCTATGTTCCACAACAAGATTCAGTGGAAAAGACACTTAGGGAAGGCTGAAGACCCGGAAGTGGCGAGACAATTGTCGTCACGACACCGGACATCGTCACACCAGAGGATGGTTGGGATCTCTGCTCGCCGTGATGGCAAGGCTATGCAAGTAACGAAGGAAACCGAATTACAAGTTCAGGGATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAGGRRSRTSRRLKLKLSALYTFALCSKGSGEDHSSRIGTTGFSRVVYVNEPDRHEEEGFRYQPNEVSTTKYSLVTFIPKSLFEQFRRVANFYFLVSGILALTPLAPYTAVSALLPLCVVIAATMAKEGIEDWRRKHQDHELNNRTVKVHRGDGDFEEKKWKDIKVGDVIKVEKDNFFPADLVLLSSNYPDGICYVETMNLDGETNLKIKQALDVTLHLEEDNSFVNLRQTIKCEDPNANLYSFIGTMEWKDKQYNLSPQQLLLRDSKLRNTDYIYGAVIFAGHDTKVMQNATDPPSKRSKIEKRMDKIIYVLMSSLLVIALLGSVLFGIWTKEDLMNGEMKRWYLRPDDSTIFYDPKRAALASFFHLLTALMLYSYFIPISLYISIEMVKILQALFINQDIEMYHEESDKPTHARTSNLNEELGQVDTVLSDKTGTLTCNMMEFIKCSIAGIAYGQGVTEVEKAMALRKGSVLGDGIENIEHTDQKNDGSPHIKGFNFKDPRIMDGNWIHEPNSDMIRDFFRLLAICHTCIPEEDEETHKVSYEAESPDEAAFVIAARELGFEFYHRAQSSIVVHERDPITNIVKDRKYELLNVLEFSSSRKRMSVIVKEPEGRILLFSKGADSVMFKRLAPTGRKFEEETKRHINEYSDSGLRTLVLAYRFLDENEYMIFSEKFNTARTSVSADRDEKVEAAAESIERDLLLLGATAVEDKLQKGVPECIDKLAQAGIKIWVLTGDKMETAINIGFACSLLRQGMTQIIVTLEAPDIIALEKNGDKESIARESKQRVMDQIEDGIKQIPPPSQSNTESFALIIDGKSLTYALEDDVKFKFLDLALKCASVICCRSSPKQKALVTRLVKHTNRVTLAIGDGANDVGMLQEADIGVGISGVEGMQAVMASDFAIAQFRFLERLLLIHGHWCYRRISVMICYFFYKNVTFGVTIFLYEAFASFSGKPAYNDWFLSLYNVIFTSLPVIALGVFDQDVSQRLCLQYPGLYQEGVQNILFSWRRILGWMANGVINAILIFYFCTTAFGIQAFRQDGQVAGLDALGVLMYTCVVWVVNCQMALSVNYFTIIQHIFIWGSIAVWYLFLLAYGAVDPRFSKSAYMVFIEQVAPALSYWLVTLFAVMATLIPYFCYAAIQIRFFPMFHNKIQWKRHLGKAEDPEVARQLSSRHRTSSHQRMVGISARRDGKAMQVTKETELQVQG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..414#1124..2472#2548..2658#2752..3028#3205..3293#3381..3489#3703..3915#4014..4136#4240..4338#4413..4604#5047..5694#ATGGCCGGGGGGAGGAGGAGCAGGACAAGCAGGAGGCTCAAGCTGAAGCTCAGCGCATTGTACACCTTCGCGCTATGCAGCAAGGGATCCGGCGAGGACCATTCTTCGCGGATTGGGACGACAGGGTTCTCCAGGGTTGTTTATGTCAATGAGCCCGACAGGCATGAAGAGGAGGGGTTCAGGTATCAGCCGAATGAGGTGTCGACGACAAAGTACAGTTTGGTGACTTTCATTCCAAAGTCCCTCTTTGAGCAGTTCAGGAGGGTGGCCAACTTCTACTTCCTGGTCTCCGGTATCCTCGCGTTGACCCCTCTCGCACCCTACACCGCTGTCAGCGCACTCCTCCCGCTGTGCGTTGTGATTGCGGCGACAATGGCAAAAGAAGGCATTGAGGATTGGAGGAGGAAACATCAGGTATTACTGTTCAGTTTTATATTTGATTCATGTCGTTATTAGGTCTGATATACAACTCCTAACAACTTAACTGATTGTTTCATGAACTACTTGGTGAGTCCAAACAATTTCGGTGTCTGTTTTCTTGCTTTTAATAGTGTTACCCCCCACTCATACACATCTAGGTTTGCATCACTAAAGGCAAAAGGCGTTGCATTATTCTATGATTATGGATGACACAAAGTAGCGATGTATTTAAAGCTAAATGATCTTTCTTTATATAATAAACCTGTGATTTATGGTTACGAATATGCAGAGAAATACAAAGTTCTTTTATCTACTAAAAGAATAAGTTTTGATTTTTATATATACTGGTATATAAATTTTATTATCCTAGAAGGAAGCTGGCAAACTGAGTTACCAAACACTTATCTCAGTCATAGCGCATGATTTATTTTTAGAAGAACTTTCTTTCATTTCTTTATGTGAATCGATCAATAATTGAGCTCATTTGGACATTATGAATTTATGGTATAACATGGCTAAAATTCATAATCATCTTCGTTTTGTTTATCTGGTTTAAATCTATTTGGAGTGATGGTCTTCATGCACACATGTTCATCTGAAATTTTACTGCGGTGCCCCCTGAACATTTAGTTAGCCAGGATATTCGAGTACATTCTATGTGCAATTGGTACATTAATTGGATATATGTAATTACTTCGCCCAGGATCATGAACTCAATAATCGGACAGTAAAGGTGCATAGAGGCGACGGCGATTTTGAAGAGAAAAAATGGAAGGATATCAAAGTTGGTGATGTAATAAAGGTGGAGAAGGATAATTTCTTTCCTGCAGATTTGGTTCTGCTTTCATCTAACTATCCAGATGGAATCTGTTATGTAGAGACTATGAACCTTGATGGTGAAACGAATTTGAAAATTAAGCAAGCTCTTGATGTGACATTGCATTTGGAAGAGGATAATAGTTTTGTAAATCTCAGGCAGACAATCAAATGTGAAGATCCAAACGCGAATCTCTATTCTTTTATTGGTACTATGGAATGGAAGGACAAGCAGTACAATCTGTCACCGCAGCAGCTTCTTCTTCGAGACTCAAAACTAAGGAACACTGACTACATATATGGTGCTGTGATCTTCGCAGGCCATGATACAAAAGTAATGCAAAATGCAACTGATCCACCATCTAAAAGAAGCAAAATTGAGAAGAGAATGGATAAAATCATTTATGTGCTAATGTCTTCACTACTCGTAATTGCATTACTTGGTTCAGTGTTGTTTGGTATCTGGACAAAAGAAGATTTAATGAATGGCGAGATGAAACGATGGTATCTTAGGCCAGATGATTCTACTATCTTCTATGATCCAAAGCGAGCAGCTCTAGCTTCTTTCTTTCATTTGTTGACAGCCTTGATGTTGTATAGCTACTTCATCCCAATCTCGTTGTACATATCTATTGAGATGGTCAAGATACTGCAGGCTCTATTCATCAACCAGGACATTGAAATGTATCATGAAGAATCAGATAAGCCAACTCATGCTCGTACTTCGAATCTAAATGAGGAACTTGGTCAAGTTGATACGGTTCTTTCTGACAAGACTGGGACATTGACATGTAACATGATGGAGTTCATTAAGTGCTCGATTGCTGGCATTGCCTATGGTCAGGGTGTCACAGAAGTTGAGAAAGCTATGGCTCTGAGGAAAGGGTCCGTTTTAGGTGATGGGATAGAAAATATAGAGCACACAGACCAAAAAAATGATGGAAGCCCTCACATTAAAGGATTTAATTTCAAGGATCCACGTATCATGGATGGAAACTGGATTCATGAGCCTAACAGTGATATGATAAGAGATTTTTTCCGTCTGCTTGCCATCTGTCACACATGTATACCTGAAGAGGATGAAGAAACCCATAAGGTTTCATATGAAGCTGAGTCCCCTGATGAAGCTGCATTTGTTATTGCGGCAAGAGAGTTGGGGTTTGAGTTTTATCATAGGGCACAGTCAAGTATAGTTGTTCATGAACGGGATCCGATCACGAATATTGTAAAAGATAGGTAAGTCAAATGCCTTTGTTTCCTTATTAGATAATTCTAATTCTAAATTTGAGACCCTTTTACATTCTTTTACAGAAAGTATGAGCTCCTGAATGTCTTGGAATTCAGTAGTTCACGGAAACGGATGTCTGTGATAGTTAAGGAACCAGAGGGAAGGATATTACTTTTTAGCAAGGGAGCTGATAGGTTAGTTCCATTTATTCTAAATTTCTGTAGCTTTTATTAAAGCTAACTTTTGTTCCTGTCCAAGGTTTCTTAATTGTTTTGCTACTTGAACAGTGTTATGTTCAAAAGGCTCGCACCAACTGGAAGAAAATTTGAGGAAGAGACTAAAAGACACATAAATGAGTATTCTGACTCAGGTCTAAGAACCTTGGTTCTTGCGTACCGTTTCTTGGATGAGAATGAGTACATGATATTTAGTGAGAAATTCAACACTGCCAGAACATCTGTAAGTGCTGACAGAGATGAAAAAGTTGAGGCGGCTGCTGAGAGCATCGAGCGAGACTTGCTTCTTCTTGGTGCCACCGCTGTTGAGGACAAGCTCCAGAAAGGGGTATGACCTTTTTAGAACAGGCTGTCTGTTCCAGCCATACTAAGATGCATTCTAGTTAAAAAAATAAATTTAACTAATATTTTATAGTGAACTAATGCATTAAGTTTCTCTTAAAAACAAAGATGCATTCTAGTGAACACTAATATTTGTCTATGTGCATGCACATTTAAATTTAGGTGCCCGAATGCATAGACAAGCTTGCACAAGCTGGAATTAAAATATGGGTCCTCACAGGTGACAAAATGGAGACGGCTATCAATATTGGGTATGTATCTTTCTTGCATTGGAGAAGAAACGTTTTAGTCCAACATCGGTATTTTCTGTTCTGATTCATGTGCTTCTTCATCTTCAGCTTTGCATGTAGCCTACTTAGACAAGGAATGACACAGATAATTGTTACCCTGGAAGCACCTGACATTATTGCATTGGAGAAAAATGGAGACAAGGAATCAATTGCAAGGGTGGGTAAATCATTGCATTACCATTATTTTTTGAATCATTAGATATTAAGTGTTTTATTTATAGAAGAACTGTAATTTGGGATGATAATATTCTCTCCAAGAGCGCCCAAATGTTGAAAAAAATTGTAGGTGTAACGAAACAGGCAGTTATATTTATACACGTTGTAATAGAAATTTAAAATCTTGATAGTTTACTCTTTATTGGCTCTCCAGGAATCAAAGCAAAGGGTAATGGATCAAATAGAGGATGGAATCAAACAGATTCCACCCCCAAGTCAATCAAATACTGAATCCTTTGCACTGATCATTGATGGTAAATCTTTAACATATGCCTTGGAAGATGATGTCAAGTTTAAGTTCTTGGATCTTGCTTTGAAATGTGCTTCAGTTATATGTTGTCGATCTTCACCTAAACAGAAGGCACTGGTCAGTGTTTTGTTTTCTGAAGTTCAGATTACTCTACTATTGTTTCTAGAAGAATGCATGTGAATACATTGACTTGATAGTTGGTGCAATAATTGCAGGTTACAAGACTTGTTAAACATACAAATAGAGTGACTTTAGCAATTGGTGATGGGGCAAATGATGTTGGCATGCTTCAGGAAGCTGATATAGGGGTTGGCATTAGTGGTGTTGAGGGGATGCAGGTTACAAATTTGATGCTTTGTGAATCTTGTGAACGTACTTATGCCTTATGCCCACTACAATGCTTATTTTATTAACACCCTGTTCCTGTTCTCAACGTTTTAGGCTGTCATGGCAAGTGATTTTGCAATTGCTCAGTTCCGTTTCCTGGAAAGGTTACTGCTTATTCATGGGCATTGGTGTTACCGTCGCATTTCAGTGATGGTATGCTTTTGTTATTGTTTCAAAATTACCTTTTACAATTCAAGCTTCATGTTGATTTTTTTTTCTGTGTGCAGATATGCTATTTCTTCTACAAGAATGTAACTTTTGGAGTCACTATCTTTCTCTATGAAGCATTTGCGTCTTTCTCAGGGAAACCAGCTTATAATGATTGGTTTTTGTCACTATACAATGTTATTTTCACTTCTCTCCCAGTCATTGCATTGGGGGTATTTGACCAAGATGTGTCTCAAAGGCTGTGTCTGCAGGTACCTTAATGTCAAAATGTTTGAGAAAAAAATTACTGTCTTTTCTGAATATTACAAAATTGGCAAAATATCTGGTATGGATCCAAATTACACAATGAACATATTTTCAGTCTCTTGTTCCTCTTTATTACTGTTGTTCCTCATCAGAGTTGATAATGTTCTACACCCTTCCCTACTCAAGGAGATATATGTAGACATTTATATATTGGTAGTTCGTGTGCATAGGTAGGTGGCTACTTGATCATGCGGTTATATATACCATCTA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|
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