BGIOSGA021287

From RiceWiki
Revision as of 12:59, 26 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA021287| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA021287, complete gene.| tag = OSJNBA0...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA021287

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA021287, complete gene.

LocusTag

OSJNBA0021N09.29-1

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA021287-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA021287-PA

Length

8103

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:15011685..15019787

Sequence Coding Region

15019510..15019787,15018308..15018647,15017996..15018214,15016896..15016955,15013962..15014117
,15013803..15013896,15011685..15011863

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:15011685..15019787 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:15011685..15019787 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGAGGGCGGCCGCGGGGGGAAGCGATGGCGCTTCGCGACCCCGAATCTGGCCGTGGCCGCGGCCGGGGAACGCAGCATCCAGCGGTACCTCCTTCAGCTGCACGCGTGCCTGGACGAGCACGGGCCACGGCCCGTCATCCCGCTCAGCCACGGCGACCCTTCCTCCTCCGCCTGCTTCCGCACCGCGCCCGAGGCGGAGGAAGCCGTCGCCGCCGCCGTCCGCTCCGGCGACTACAACGGCTACTCCTCCCCCGCCACCAGCCTCCCTGCTCGCCGAGCTGTTGCAGAGTACCTATCCTGTGATCTTCCTTACAAGCTTTGCACAGATGATATTTTCCTCACATCTGGAGGTACCCAAGCAATCGAGATTGTTATGTCTGTTTTTGGCCAACCAGGTGCCAATATATTGCTTCCAAAGCCCGGGTACCCAAAACATGAAGCACATGCGGTGTTCCACAGGATGGAAGTGCGGCTCTATGATCTTGTTCCAGAGAGAGGATGGGAGATTAATGTTGAAGCTGTTGAAGCTTTAGCAGATGAGAATACTGTTGCAATAGTGATTACTAACCCCAATAACCCTTGTGGTAATGTGTACACTTATGAACATCTGTCCAAGATTGCAGATACAGCAAGCAAGCTCGGTCTGTTAGTCATTGCTGATGAAGTATATGGTCACCTTGTTTATGGAAGCACTCCTTTTGTGCCAATGGGTGTGTTTGGAGAGACTGTTCCAGTACTCACATTGGGAGCTATATCAAAGAGATGGGTTGTCCCTGGCTGGAGATTTGGATGGATAGCAATTTGTGATCCTAAAGGCATTCTGAAAGAAACAAAGGTCGTCGATTCACTCAGAAGCTTTCGAAACCTAACAACAGGTCCTGCAACATTTATTCAGGGAGCTATTCCTCATATTATGAAGAACACAAATGATGAATTCTTCAGAAAGACTCTCGAGTTGTTAAAGGAAACTGCTGAGATATGTTTTGGTGAAATAAAAGAAATAAAGTGTATCACCTGTCCTCAGAAACCTGAGGGGTCGTTTTTTATGATGGTAAAACTTGATATATCACAATTATCGGACATTTGTGACGACATCGATTTCTGCAGCAAGTTGGTAAAGGAGGAGTCTGTCGTACTTTTGCCTGGGAGAGCCTTAGGCATGGAAAACTGGTTGCGCATCACCTTTGCATTGGATCCCCCAAGGCTAAAGCAAGGATTAGAAAGGGTCAAGTCCTTTTGCCGGAGGCATCAGTCACATGCTAATATGCTCAATATAAGTGCGTCGGCGAAAGTGGAGCCCCATTTCGGAATGTCAAAGAGTTAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MEGGRGGKRWRFATPNLAVAAAGERSIQRYLLQLHACLDEHGPRPVIPLSHGDPSSSACFRTAPEAEEAVAAAVRSGDYNGYSSPATSLPARRAVAEYLSCDLPYKLCTDDIFLTSGGTQAIEIVMSVFGQPGANILLPKPGYPKHEAHAVFHRMEVRLYDLVPERGWEINVEAVEALADENTVAIVITNPNNPCGNVYTYEHLSKIADTASKLGLLVIADEVYGHLVYGSTPFVPMGVFGETVPVLTLGAISKRWVVPGWRFGWIAICDPKGILKETKVVDSLRSFRNLTTGPATFIQGAIPHIMKNTNDEFFRKTLELLKETAEICFGEIKEIKCITCPQKPEGSFFMMVKLDISQLSDICDDIDFCSKLVKEESVVLLPGRALGMENWLRITFALDPPRLKQGLERVKSFCRRHQSHANMLNISASAKVEPHFGMSKS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..278#1141..1480#1574..1792#2833..2892#5671..5826#5892..5985#7925..8103#ATGGAGGGCGGCCGCGGGGGGAAGCGATGGCGCTTCGCGACCCCGAATCTGGCCGTGGCCGCGGCCGGGGAACGCAGCATCCAGCGGTACCTCCTTCAGCTGCACGCGTGCCTGGACGAGCACGGGCCACGGCCCGTCATCCCGCTCAGCCACGGCGACCCTTCCTCCTCCGCCTGCTTCCGCACCGCGCCCGAGGCGGAGGAAGCCGTCGCCGCCGCCGTCCGCTCCGGCGACTACAACGGCTACTCCTCCCCCGCCACCAGCCTCCCTGCTCGCCGGTCGGTGCCCACTGTCCACTCATGATTGGATTTGCCTTAACTGAATCCCCTATAGGTGGTTCTGTACTTGGGTCGTCCTTGATTTATCTGTGCGCTCAGAGTAGAACTAATCTGCCCTATCTTTTAAGTTATCGTAGGGCTTGTTTAGTTGGCAAAAATTTTTGCCCCTGTATGTCACATCGACACACATTTGAGAGGTATTAAAAGTAGTCTAATAATAAAACAAATTACAAATTCTGCCAGGAAATTGTGAGACGAATTTATTAAGACCAATTAATCTGTCGTTAGTAAATGTTTACCGTAGCACCACCTTGTCAAATCATGACGTAATTAGGTTTAAAAGATTCGTCTCGCAAATTCCTAGCGAACCATGTAATTGGTTTTATTTTTTTTTGTCTACATTTAATACTTCATGCATGTGTCCAAACATTGAATTCAATGTGACAGCGTGAAAAATTTTGTTTGGGAACTAAACAGGCCCGTAATCTGTCGTCAATTCTGAAACAGTATAATTTATCTATTCAAATATCAACAACTGCTTATAGCTTATTAAATTCTTTTTGATCAAATCCTTCACTGCCGTTAACAGTTAAATTGGCATATTAATCAGTCTATATGGCTTCGATTCAAACATAATAATCACACATACTTAAATTAATCAAACATATTTAAAGAACGGGGATGAATACTGTATGTGAAATCATGTAAAGAATGCGGGAACATATTTAAATTAATCACGCATGTCTCATGATTAAGCAATTGCTGATAGTCTTTCACCAGTATATGGAAAAGTGAAAATCCTTGTTTGTACTAATAAACATTCTCTGTGTTGCTTTTGTTGCCATTTTCTGTTGAAATCCAGAGCTGTTGCAGAGTACCTATCCTGTGATCTTCCTTACAAGCTTTGCACAGATGATATTTTCCTCACATCTGGAGGTACCCAAGCAATCGAGATTGTTATGTCTGTTTTTGGCCAACCAGGTGCCAATATATTGCTTCCAAAGCCCGGGTACCCAAAACATGAAGCACATGCGGTGTTCCACAGGATGGAAGTGCGGCTCTATGATCTTGTTCCAGAGAGAGGATGGGAGATTAATGTTGAAGCTGTTGAAGCTTTAGCAGATGAGAATACTGTTGCAATAGTGATTACTAACCCCAATAACCCTTGTGGTAATGTGTACACTTATGAACATCTGTCCAAGGTTGGTATGATGGCTGTACAATGCTGGGTAACACCTTACTTCATTTTATTTGTTCCAATTTCAATGGAGCTTATGTGCCGTATCTTAACTTAGATTGCAGATACAGCAAGCAAGCTCGGTCTGTTAGTCATTGCTGATGAAGTATATGGTCACCTTGTTTATGGAAGCACTCCTTTTGTGCCAATGGGTGTGTTTGGAGAGACTGTTCCAGTACTCACATTGGGAGCTATATCAAAGAGATGGGTTGTCCCTGGCTGGAGATTTGGATGGATAGCAATTTGTGATCCTAAAGGCATTCTGAAAGAAACAAAGGTGATTTGTACATTTTTTTAAGCACACTGTTTACTTTTTGTGATGCGTAGTACTCCCTCCGTCCCAAAATATAACAATTTTTAGCTCTCAGGATTTGTCCCAAAATATAACGACTTCTCCACCAACATTCTCTTCCCAACCAATCACAACCCTCCACAATTCACTTTTCCCACCTACCTCCACTACTCATCCAATCACAACCCTTCACCACCCACTTCTACCTACTTTGTTAATAACCGTGTCCAACTCTAAATCTTGTTATATTCTAGGACGGAGGGAGTAGTATTTTATACTTTAAATGAATTCACATTTCCTTTGTGAGACGTAACTTAAACCTTGTCAATCTTCTTTCACATTAGTAGAACCAGGGAGCTGCCCTATGTCTTTCATAATTTCATATTGTCTAGTCGGCTGTGTGTAGAGGCTGGAGGTGTAAAACACATTTCCATTATTTGTTAAACAAAAAGGGGTGAAAGATGTAGCATATGAAGTATCATTTTACTCATTATTCATGTTCTTTTAATCCACAATTCTCTATTAGAACCTGTTTCATCCGGCAATTGGAACTTTAGTTATTGATATATAACCAATGCTTCAGATCTGGTAGGGAAATAAAATATTTATCACTAAATTCTTATAATTCATCCAATCATGTTGAGGTAATTTCAGAAGGGTTGAAAGAGAATTTTGAATACTGAGAGTAAAGGCATAAAGATGCTTTGAGTTAGCAACTTAGAGTTGGAAGAGGCTATATTCAACATGCTAGTGATTATGTGTCCTGTTAATTAATTTTTTTACCGTGTGTCTTTTTTAATGGACTTTTTACTGTATCATTTATACGGTTTTTGTATTTGCTCTGGTGGAGATGGAATCAACACAAATAATCTGTGAGGAATCATCCTATTTAGTATCATGGAAATACTTTAAAGGAGGCTTTTTGTGTTGTTTCCTTGAATTAGTTTTCTATGTGATTGCTTAGCTAATACCTTTGCTGAATGTTTGATACATAACTGAAGGCACCATTCCTTTTCAATTTTTAGGTCGTCGATTCACTCAGAAGCTTTCGAAACCTAACAACAGGTCCTGCAACATTTATTCAGGTTATTTTATGGACTCATAAGTCTCATATCAAATTATCAGTACCTTGGTAGCTAGCTTGCTTACTTTTGGCAGATTAGCAAAATGCCCTTATGCTTTGATAGGGGTAAAAGAAAATATATAACAATATGTCATGGATAAAATATATTTTTCTGTATTACCTTAAAGGTGGAGTCGTTCTCCTCCCACCGCGTACACCGCGCTCGCATGCGTAGGGTGCGTAGGTAACCACTGGATCCAATGTCTTATATAGCACATCCCTACTTATATGGGGGCCGCTGATCTGCGCCTGATCGCCCAGCCCACCCCATCTAGATTCTATACATATACGTATATATACATATGTATATAAAGTGTATATATATCTGTGTATATACGATAAAATATGTGTAAACTTTGTATATATATCTATAGCAATTTTTTGTATGTATACACATACATTTTTGACGTATAAAAATATATATACACATATACAAAAGTACAAACTTTGTATACGTACGTAGAAGAACGAAAAGAAACAAAAAAAAAGGTCATGTATACAAAGTTTGTATATGTATGTATAAAAACCCAAAAAAGGGGAAAAAAGCATCCCCTCCCTCTCCGCGCACACCACGTGGCTTCGTCGCGTGTTGGGAGAGGGGGGGGGGGGGGACGCGCGCGACTAGGCATGCATTAGCAAATCCGTACTTATATGGGCCTGGCCCGTTACAACTTAGGGGAATGTTACTAGTTTTATCAAATATGATACTACTATTTCCCCGTAAAATGCCAAATGCTAGTATTACTTGTTTTCTTATTTTATATGGTATTCACTTGAGTCAAACAAATATTAGACTATTGTATACTATCAGAATATATTAGGGACTAATGTGTAAAAGCACAAAAGTAGTGGTGGTGGCAGAACTACCACCACTACTAGTGTCTTTTATAGTAGTGTGCATATTTCCTACTTTTGTAAGCTAGCATAGTTACTTGATATGATTGACAGGTGCTCTCTTAGTTGTTGTACTATTGTCTCTTATATTGAAAAATTGGGTTTATAACTGATATATGAGAACTTTGTTATTTACCACTAAAATCTTGTGGTGAACTTTAATACCACCAAAATTGTCCACCATTTCCTGTTTTACAACTACCGTTATGTTTGCCTTTTTTTTCTGTGAACTCAAACTCCTCACTCTTAGAGGCTAAAAATCATCTGCATCACTGTTCTCCCGCATCAAATTTTCTGGATTCCTCGACCGAGGATTTAACTGGTGAATCCAGTCTTGTGCAAGGTGACATTTATATGTCGTTGTTACAGTGCCTTTGCCATGGATGCTGCCTAGCATCCTCCTGCATCTTCATTTTCACTGTCATCGCCAGATCGCTGTTATCTGCAACTCCGCATCACTCAGTTTTCTTGGCAGCTGGCTGCTGCATGCAGCAATGGCGCCGTGTCCATCTTCTTTGGCCCCAACATCCATGTTCATTATTCTGTTGGTCTTATTAGCTAGCAAGAGTGGTAACTGTTAGTAATATTCGTTTTAAGCAGCAGCAAGTTGGATTTAGCTCAGAGTGATCAAAATTTTGAAATGTAATCCAAGTGATCACAATGTTTTGGAAATAGCATTAGTACATACTGTTGGAGCATCTTGACTATTCTCCAGACCAAGCAAATTGGAGTCAGAACTAACTAAAGCAAGGTCGAGATCCATCTCTCCATATTTCACTAGCACATCATTCCTGCGTGAGTGGGGAATAGGGGCAGCTTCAGGTTTCATGTGCCCACAGGTTCCGAATCAGATCGCATGAACCGACCAATAAGCACATGACAGGGTAGGGCAGTGTGGTGTGCCGGGAAATGAGGGTGCCAGCGTGCCGCACCATGCAATGAGAAGTGTGGCAAGCGCGTTGGCCTGCTGGGGTATAAAGACATTTGTCATGTATCTCTGGTGAAATAAAAGAGAGAATATGTAAAAAAGTCAACGATACTAGATGGTATTGCTAAAAGAGGGAACATCAGACATTTTGGTGGTGTGTGCACTAGAAAATCAGCAGCATATATGAAAAAAGTGATATTTCAGTGGTATGGAAACAAAAATTCCTTATCACATAAGTATGCAGCAAGCTTGATTTGCGTCATGGGCTCATGGCAAATCTTCTGATTCAATTTTCCTTATATTCTTTCTTTTATCTTTGTACCTGTTCTGCATTCTGTTATTTGGAGGTCTCAGGTTCATATTAAAGACCTCTTAACTACAAAGAAATTTTAGTCCTTATCCTATAAAAGTGTTATATTATATGTGTTTTGGCTATTTTATTGACCCAAATTCATTAATAATGTAAAACGTGAATACCTGAGCACTTGACACTTAATATGATTACAACAAACACACAACTATGAATATAGTGATATGGACTAGTCTAGAGGTGATGACATTGTTCGAGAAATAAAAGGTCTGATGACATTCTGTCAATGAGTTACTTAATCTTCCTTTTTACATCAATTAGTAGGGAATCTCTTCAGCACATCATGTTTCATATTTATAATTGATGAGGTAGAACTCCCTCTCTATTCTCCTTTCTTGTTCTAAGACAACTACATTTTTGGTGCAAATTGCTAGCTTAATGATGTATTCTTCCACAGATTGCTGTTCTGAGCATTATTTTGTTATGATCAATGGATGAACCCTCCTGTTTTATTTTCAGTTGTAACTGTAGTGCGGATCATGTCTCTTTTTTTTTTCTGAATGATTGAAAATAGCCCAACATTGATGTTATATAATTATCGTCACCAGGGAGCTATTCCTCATATTATGAAGAACACAAATGATGAATTCTTCAGAAAGACTCTCGAGTTGTTAAAGGAAACTGCTGAGATATGTTTTGGTGAAATAAAAGAAATAAAGTGTATCACCTGTCCTCAGAAACCTGAGGGGTCGTTTTTTATGATGGTGAGGCAATCACAAAAAATAATTAATATTTCTTATAGCATTAATGCTGACTCTATGTTCTTCAGGTAAAACTTGATATATCACAATTATCGGACATTTGTGACGACATCGATTTCTGCAGCAAGTTGGTAAAGGAGGAGTCTGTCGTACTTTTGCCTGGTATGTGGTAACACAATAAAGTAGTGAAACATGTTCTTTTAATGCATATTTTTCAGCATTTGGTGTGTAGAGATGTCTCTTCCGTGCCANAATGGCAGACAGTGCCACTGAAAACCATATATAGTGCTAGATTGCTCACCAACCCTTAACTGATTGTAAGGCCTAACTGACATGTGACCGCCCTAACTCACATATCCTAATTTCTATAATACCAAGTGTATAAGTGTTCTTTACGTTAATACCATCATGTTTGACATCCTTAGATAAATAGAATAAAAGACCAACATTGACAATGTTTCATCTGTTCAAAACTAACATCGAGAATAGTGCATGACAGGTGAATAGACACAGGCACTAGAAAGGTTTGAACATTTTACATTATGTGATACTAAAATCAATATAGATACAGTGGTAGTACAACATTAGAAAACACTGTGCAATTCAATTTAAGGGTGTATAAAATGCCCTTCGATAAGACTTGTAAACATTTCCAGTTAGGTACAATTTAACCATAGTGTTATGCACATTCCTTGTTCGTTAAGGATGGCCACAAAAAAGGAAGAGGATAGTTGAAAACACTAGAGCCTACCTGATCAGTGTGCTCTTATTAACATCAGGACAGACATTTTTTTTTATAGCAGGAACAAATAGTATAACAATATAAATTGTTTTGTTCTCTATGGTTCTCTACTTCGGTGTCACACTGTTACAGTACACACGAACTCTGATAAGCGATATATCACAAATATACACGTGCCTTGCTGCCTACCCCATTGGCCAAGCACCTTCCTAGTCTTATCAACTAGCACGTTTTTGTTTCAGATATTTCTTCACATTGACATATTCTCCACCTTTCTTGTCCTATTCTTGGTGAACAATCGTTCCTGCTCTTATTGCGCAAGCATCAGTTATCTTTGCCATCGAGGGCTGAGGTCTTGCCCATTCCCGTGTCCTAGTCACTATTAATTGAAGCATCAAACGGTGCTCCTCCTAGTATTGTTATGGAAAATAATAGCATAAGATCCTTTGTATCATATCCTTCTCATGTGATCCATTCTGTCCAAGTCCCTATTGGCGATCTTCCCAAAGAGCCAAGAATCAAAATTCAAACAAAGGGCCAGATTTGTGAAGTAAAAATTATAACTGTGTCAGAAGTGGATTTTTTGAAAGATAGAGGAAGGAAGACAAAAGCCTCAATGCTTGAATGGTTGAATGTCTAGACTCCGACAAGTGCTCTAGTTCATGTTATCACTAAATTTCATATACCTGTTAATGCTGAAGTTTTGCTGATATTTTAAACAACATTCGTTCAACATTGTGGGAATTAGGTAGCACTTCTTGTTGTATCAAGCAAGTTATTTTTTTTTATTTAAAAATGTTCCAATACGATCATCATTTTCTCTCTTTCGTCTAATCCCCTCTCTCTTGGACTCTCTTTTGACTCTTCCACTACTAAGAAAAGGAGTTGTCAGTGTGAGGGTTTGATGACTTATGCGAGTGCTAGCAAAGTGCCATTCATCGTTCTCATGTGATCCTTTTCTGCACGCATGTATGGCAAAATTTCAGCAATTGAATTCAGCCTGTTCATACGTGGGTTGGGCTGGTTTAGTTGGTTCCCCAGCCGAACCAACTGATGCATACTCATACTGATGCATGAGAGCAGTGTGAATTGGGTGGGTACATGCACTTGTATGGTGTATCGTTCTGGTACAGTGATGCTGGATGCGATCCAGCAGTATTTGCCACTTGCCAACTGCCCAATACACGTATATCATGTCAAGATGTTTCTCTAATGAACGAGAGAATTTCCTCCTTTTTATTAAAAGAAATTCTGATAGATGAGTGGATAGCATTATAATTGCCTGATTAATGTGACTCTAAATTAGGCAAAGATTTTTGTCATTGGTGGGAGTAAATATCTGAAAAAATTTCCCTGCAGGGAGAGCCTTAGGCATGGAAAACTGGTTGCGCATCACCTTTGCATTGGATCCCCCAAGGCTAAAGCAAGGATTAGAAAGGGTCAAGTCCTTTTGCCGGAGGCATCAGTCACATGCTAATATGCTCAATATAAGTGCGTCGGCGAAAGTGGAGCCCCATTTCGGAATGTCAAAGAGTTAG</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA021287