BGIOSGA021693

From RiceWiki
Revision as of 13:05, 26 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA021693| Description = Japonica Group Os06g0211100 (Os06g0211100) mRNA,| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA021693, complete gene....")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA021693

Description

Japonica Group Os06g0211100 (Os06g0211100) mRNA,

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA021693, complete gene.

LocusTag

NM_001187732.1

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA021693-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA021693-PA

Length

858

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:6510674..6511531

Sequence Coding Region

6510674..6511531

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:6510674..6511531 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:6510674..6511531 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCTAGAACCAGGTTTGTAGCTCTTAGCTTCATCGTGCTACTGAGCATTGGACTGTCCAATGCGGCAAGGGTAGCGAGATATGCTAGTGCCGGGGGCGGCGGTGGTGGAGGGGGAGGTGGTGGTGGATCGGGGAACGGTTCTGGGTGGGGATCTGGCTCTGGCTCGGGGTATGGCCAGTCAAGCGGATCCGGAGGAGCATATGCTAGTGGGGGTGGTGGGGGTGGAGGTGGTGGAGGCGGACNAAATGGTGGTTCTGGATATGGTTCCGGTTCCGGTTCTGGGTACGGCCAAGCAGGGGGATATGGACCTTATGGTGGTGGAGCATATGCTCAAGGAGGAGGTGGTGGTGGAGGTGGCGGCGGTGGACAAAACGGTGGGTCTGGGTATGGTTCTGGTTTCGGTTCTGGCTATGGTCAGGCCAGTGGATATGGTCCTTATGGTGGTAACGCATATGCTCAAGGAGGTGCCCAAGGTGGACCCGGTGGGGTGGCACAAAATGGTGTTTCCGGATCTGTCTCCGCTTCCGTTTCGGGCTATGGTCAACCTGGGGTATATGGTCCTTACTATGGTCCTAATGATGATGATGGTGCATATGCTCAAGGTGGAGCCCAAGCTGGAGTTGATGCCGTTGGACAAAATGGTGGATCTGGTCAGGGCTCGGGTTCTGGTTCTGGATATGGTCAAGCTGGTGGATATGGGCCCTACTATGGCGGATATTGCCCTTACGGTGGTGGATATGCTCAGGCAGGTGGTCAAGCTGGTGATGACGATGGTGGGCAAAGCGTTACAGGCGGTAGTGGTTCTGGGAGTGGCTCAGGAAGCGGTTCTGGATCCGCCGGTGTGCGCTACCCATAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MARTRFVALSFIVLLSIGLSNAARVARYASAGGGGGGGGGGGGSGNGSGWGSGSGSGYGQSSGSGGAYASGGGGGGGGGGGXNGGSGYGSGSGSGYGQAGGYGPYGGGAYAQGGGGGGGGGGGQNGGSGYGSGFGSGYGQASGYGPYGGNAYAQGGAQGGPGGVAQNGVSGSVSASVSGYGQPGVYGPYYGPNDDDGAYAQGGAQAGVDAVGQNGGSGQGSGSGSGYGQAGGYGPYYGGYCPYGGGYAQAGGQAGDDDGGQSVTGGSGSGSGSGSGSGSAGVRYP</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..858#ATGGCTAGAACCAGGTTTGTAGCTCTTAGCTTCATCGTGCTACTGAGCATTGGACTGTCCAATGCGGCAAGGGTAGCGAGATATGCTAGTGCCGGGGGCGGCGGTGGTGGAGGGGGAGGTGGTGGTGGATCGGGGAACGGTTCTGGGTGGGGATCTGGCTCTGGCTCGGGGTATGGCCAGTCAAGCGGATCCGGAGGAGCATATGCTAGTGGGGGTGGTGGGGGTGGAGGTGGTGGAGGCGGACNAAATGGTGGTTCTGGATATGGTTCCGGTTCCGGTTCTGGGTACGGCCAAGCAGGGGGATATGGACCTTATGGTGGTGGAGCATATGCTCAAGGAGGAGGTGGTGGTGGAGGTGGCGGCGGTGGACAAAACGGTGGGTCTGGGTATGGTTCTGGTTTCGGTTCTGGCTATGGTCAGGCCAGTGGATATGGTCCTTATGGTGGTAACGCATATGCTCAAGGAGGTGCCCAAGGTGGACCCGGTGGGGTGGCACAAAATGGTGTTTCCGGATCTGTCTCCGCTTCCGTTTCGGGCTATGGTCAACCTGGGGTATATGGTCCTTACTATGGTCCTAATGATGATGATGGTGCATATGCTCAAGGTGGAGCCCAAGCTGGAGTTGATGCCGTTGGACAAAATGGTGGATCTGGTCAGGGCTCGGGTTCTGGTTCTGGATATGGTCAAGCTGGTGGATATGGGCCCTACTATGGCGGATATTGCCCTTACGGTGGTGGATATGCTCAGGCAGGTGGTCAAGCTGGTGATGACGATGGTGGGCAAAGCGTTACAGGCGGTAGTGGTTCTGGGAGTGGCTCAGGAAGCGGTTCTGGATCCGCCGGTGTGCGCTACCCATAG</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA021693