BGIOSGA022658

From RiceWiki
Revision as of 13:21, 26 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA022658| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA022658, complete gene.| tag = OJ1001_...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA022658

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA022658, complete gene.

LocusTag

OJ1001_B06.1

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA022658-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA022658-PA

Length

5471

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:9651188..9656658

Sequence Coding Region

9651188..9651253,9651740..9651901,9652646..9652699,9653175..9653248,9653324..9653404
,9654306..9654483,9654740..9654910,9655548..9655637,9655719..9655766
,9655882..9655997,9656090..9656168,9656536..9656658

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:9651188..9656658 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:9651188..9656658 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGAAGCTGTTCGTGAAGACCCTGAAGGGCACCAACTTCGAGATCGAGGCGAGCCCCGAGGCGTCGGTGGCTGAGGTGAAGAGAATCATTGAGAGTACTCAGGGGCAGAATGTGTACCCGGCGGATCAGCAGATGCTCATACACCAAGGGAAAATTCTCAAGGATGATACAACTTTGGAAGGCAACAAAGTTGCTGAGAACAGCTTCCTTGTTATAATGCTGTCTAAGGCCAAAGCATCATCAAGTGGAGCTTCAACTGCTTCAAAGGCACCTGTGAGCCAGTCTCAACCAGCAACTCCAGTTGCCTCAGTTGCAAGAACACCACCTCCACAAGCACCTGTTGTTACACCTGAACCGGCACCTCCAAGTGCACAGCCTCCAGTTGCTTCTGCCACTCCAGCTGCTGCTGCCACTCCAGCTGCTGCTGTGACCGCATCAAGTGATGCGGATGTCTACAGTCAGGCTGCATCAAATCTTGTTTCAGGTAGCAACCTAGAACAGACAATCCAACAAATTCTTGACATGGGTGGTGGCACCTGGGAACGTGACATGGTTGTCCGTGCTTTGCGTGCTGCATATAACAACCCTGAGAGAGCTATTGACTATCTGTATTCTGGAATTCCTGAGAATGTGGAGCCCCCACAACCTGTGGCTCGAGCACCTGCTGCTGTTCAACAGGGAAATCCACAGGTTCCATCTCAGGCTCAGGCTGCACCTCCACCGCCTGTGCAGCCAGCTGGTGGTGCCTCAGGACCTAATGCGAATCCTCTAAACCTATTCCCCCAGGGCATTCCAAGTGCTGGGTCAAATCCTGGTGCTGCTGCTGGTGCCGGTGCCGGTGCTGGTGCCCTTGATGCATTGCGACAACTTCCACAGTTCCAAGCGCTGCTTGCATTGGTCCAGGCTAATCCCCAAATCTTGCAGCCAATGCTTCAAGAGCTTGGGAAGCAGAATCCGCAAATCTTGCGGTTGATTCAGGAAAATCAGGCTGAATTTCTCCGTCTGGTGAATGAATCTCCTGATAGTGGCACTGCTGGGGGAAACATACTAGGTCAACTAGCAGCCGCTATGCCACAGGCACTTACAGTTACTCCAGAGGAACGGGAGGCCATTCAGCGGCTGGAGGCAATGGGGTTCAACCGTGAGCTCGTTTTGGAGGTCTTCTTCGCATGCAACAAGGATGAAGAGCTGGCTGCCAACTATCTTTTGGATCATGGCCATGAGTTTGAGGATCAACAATAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MKLFVKTLKGTNFEIEASPEASVAEVKRIIESTQGQNVYPADQQMLIHQGKILKDDTTLEGNKVAENSFLVIMLSKAKASSSGASTASKAPVSQSQPATPVASVARTPPPQAPVVTPEPAPPSAQPPVASATPAAAATPAAAVTASSDADVYSQAASNLVSGSNLEQTIQQILDMGGGTWERDMVVRALRAAYNNPERAIDYLYSGIPENVEPPQPVARAPAAVQQGNPQVPSQAQAAPPPPVQPAGGASGPNANPLNLFPQGIPSAGSNPGAAAGAGAGAGALDALRQLPQFQALLALVQANPQILQPMLQELGKQNPQILRLIQENQAEFLRLVNESPDSGTAGGNILGQLAAAMPQALTVTPEEREAIQRLEAMGFNRELVLEVFFACNKDEELAANYLLDHGHEFEDQQ</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..66#553..714#1459..1512#1988..2061#2137..2217#3119..3296#3553..3723#4361..4450#4532..4579#4695..4810#4903..4981#5349..5471#ATGAAGCTGTTCGTGAAGACCCTGAAGGGCACCAACTTCGAGATCGAGGCGAGCCCCGAGGCGTCGGTACGATCCCTTCCCCCTTCCCCCCTCTCCTTCTCTCTCCCCCAATCCGCGCGATTTCGAGGGAATTCTCCGGGAATCCGCTCGATTCGGGGGGCGTTTGGGTGCGATTTTGGGATAGGGTTTGGTTCGGGGGGATCGGGCGCCTTGCGCGGGTGTGGTTTTGATCTGAATCTAGGGTTTAGAGTAGAGTAGTAGACGACGCGATGCGGAGCTTCGGATCGGTTTTTTTTTTGGGCGCTCGGAGTTTGTTATTAGGGTTGTAATCTGAGTCGTGTGCTACTAATTCGGCTTGTTGTGAACTGATCGGTTTAAGTTACATGTGTAGATGTTTTTTGGTAGAAATTCGAACTCGGCATCTGTAGGAGATGGTTTTGGAAATTAGAACCTGGCTGTTGTCAATGTGGTTGATGCTGCAATGTTTAATGTGTGTATGCTTGGATATGGGACTATTTGTGCCTTATACTTACAGCTAGCTCTGTTTTGCAGGTGGCTGAGGTGAAGAGAATCATTGAGAGTACTCAGGGGCAGAATGTGTACCCGGCGGATCAGCAGATGCTCATACACCAAGGGAAAATTCTCAAGGATGATACAACTTTGGAAGGCAACAAAGTTGCTGAGAACAGCTTCCTTGTTATAATGCTGTCTAAGGTATGTGATGATCTTGTTTAATGGCATTTGATTGTTTAGCAGTAACTACCCTTCTAAATTATTATTTACAGCTAGACAATAAGGGTATTTGCAGACCAGAGTATTCTCGATAATTTGCAGTAAAATCATGCCATATTTTGAATGCTGTGGCTTTGTTTCCCTTAAGCTGGGCCTTGTAGCTTTTTATAATCGTGCTATTATGTGTACATTATTAGTGAATATATGTATTTTTTTTGGTTAATGCTGCAGTTTCATACTAGATATTTCTTTAAATTGTAATGTTATAACTGAATGAATTGCTAAATGTATGGGATGCAAACTTTTGTGTGATTGGGGTATTCTTCCCATCCGATAGCCAAAATCAGAGCCCAAACTTTGTGTTGTGTCATCAAACCCGAACAAATCATTGATATGCAAAATCCGGGTGCAAGCTTTGCATGATATTTATTGCTGTTAAATACATCCTCTAATTACAGGAAGTAATTACCTTTTTTTTTAGTTTTAACAGCCGTTTGTGTTATGTCCAGGAGGCTGAAATTAACATGTTTAGGTGAAGAACATTCCATGATTTGCCTGAGTTCTAAATGATATCTCGACTGCTCTTTGAGCCTTTGACCTCTGATGATCTTATGTTAACATTTTAAATTTTGCTGAAATTAATGGTGGAAGTGTAGTTTGAAGCTCTTTTAATTATTCATTTTTCTGTGAATATTAATCACTTGTTGAATATGTATAAAATTTCAGGCCAAAGCATCATCAAGTGGAGCTTCAACTGCTTCAAAGGCACCTGTGAGCCAGGTAATTTTATTGGCATATATAATTCTGTCAATAATCTCTGCGTGTCTCTGTTCATATGAAAAAGTTTTATCTAATTAGTTAGGGATTCAACCTGCACTCCTCTCTTTTTTTTTTGGTATCCAGTATTTGGGATAAATATATTCTGTTCTGTTATGCACCTTCATCTCTTGTTTGAAAATTTGTTATTTTCCTGGTAATTTTTCCATTTGTTAATTCGTAAATTGTTGCACATCTCCAATTCATGTGATTAATGACTAGAACCAACAAGAGCTTAGAGAGCTGTAAAGAAAGTAATCTTATTTTCTGATTATGGAAAGGTATAATTTGTCATTTTGTTTTTGTTTTAGCTTTAGCTGATTTTAGGTTCAAAAGCAATTGAATATGTTCATCATGTAATTTTGTTATTTCTGCATAACTTTTGAGTGTCTTTGTTTCGTTCATGACCTGAAAATTCCTTACTGTTTATTTGCACTAGTCTCAACCAGCAACTCCAGTTGCCTCAGTTGCAAGAACACCACCTCCACAAGCACCTGTTGTTACACCTGAACCGTGAGTTATATCTATTCCTCTAATTTGTATAATGTCAAATATTGTTTTTCTTATTTATTATCACGTCATTCGTAGGGCACCTCCAAGTGCACAGCCTCCAGTTGCTTCTGCCACTCCAGCTGCTGCTGCCACTCCAGCTGCTGCTGTGACCGCATCGTAAGCTTCCTTTTGGATCCATTATTTCAATTTTTTATTAGGTCCCTGTGTTTGGAACACAATAAATTTGATAGGAATTTTGCACGAGACAATTCGATTCTGGCCTTGAATGAACTTATATTTTGTACTTCACTTGTGCAAAGATGTATATGGAACAGGATTCTGTTAACTGCTGCATTCTATTTTCTTCCACATCATCTGTTGTCATGTCTAGATTAGTTTCTATAAACAATGATCCAGTTTTAGGAATAGTTCCATTAATGTTCCTGTAACTCCATGGTGTAGAAATGTATCACTCGATGAGTTTCAATGTGGCATCCTGAAATGTTTCTCCAGCATGTTGTAAACTAATAGACAATTAAAGAATGCTAAAAAAATTAGGCATACCATAAGCTAGTGTGTGGTACAGTCATACACTATACACAATGTTTCTGGACTATGTGGCTTTGACTTCTGTAGGCATTTAATGTATTTGTCTTTACTACATATTTGTAACTTGCACTGCAACTATAATAGATAACACTATACTAAACAGTAGAATAGTTTTACAAGTGTATTTATGGAATTTTAAAGATTCAGCAATTCACATCGTATAGGTATCATGTTTAGAACATCACGACTGATTGTCCTGGTCAAAAAAATAGAACACAACTGATTTGTTTATAACCAGAACGTTTTGGTACTGTCCATATTATTTTTTGTTGGTAAGATTTATGAATTAAAGTTAAGACTACGTAGTTGTGTATATTTGGCATAAACACATATGGTGCTCAGCTTGCTCGATTCATCTGTAATCTTGAAACTTACAAAGCTCCTGGATTTGGTTTTGTTTCACGTCCACTGTGATGATTCCTCTTTTAATGTCATATTAATGTTTCCCTTTTATTGTTATGATAAACAGAAGTGATGCGGATGTCTACAGTCAGGCTGCATCAAATCTTGTTTCAGGTAGCAACCTAGAACAGACAATCCAACAAATTCTTGACATGGGTGGTGGCACCTGGGAACGTGACATGGTTGTCCGTGCTTTGCGTGCTGCATATAACAACCCTGAGAGAGCTATTGACTATCTGTATTCTGTAAGTTCCATGTTTGATAATTTCTTTTCACAAATGCACATTTCTATGCTGATGGGGAATTGGAAAACTCATTTAAAGAACTTATGTTTTTAAAGAGAATTCTGCAAGGGCAACGCCCAGCAGTTTTAAAATTTATATAGAACAAGAGAGTTCAATCCAATTTTCTTACATTGTTTGTAACCAAATTATAATCCAATGTTAATTTTACTGTGCATAAAATTCAACTATTGATGTTGTACTCTGGTTCATCTGTTAGGGAATTCCTGAGAATGTGGAGCCCCCACAACCTGTGGCTCGAGCACCTGCTGCTGTTCAACAGGGAAATCCACAGGTTCCATCTCAGGCTCAGGCTGCACCTCCACCGCCTGTGCAGCCAGCTGGTGGTGCCTCAGGACCTAATGCGAATCCTCTAAACCTATTCCCCCAGGTATGTGTAAATGTAAATTTCTACCTTTATATTTGGAGGTTAGTTTTATAAGAAACCAAAATGTTTCCAACTTCTGGACTGCTTGTAAGTCTATAAGGATCGAGGCAGACCAGTTAACATCTTATTAGGAAGCTGTCATCATCATTTTGTCAAGAATATTCTTGAAAACATTAGCACTGATGTTCTTGGGTAAGACAATTTCAGGACATCCGGCATTGTATTATATGCTTTTGAATTGTTAGTTCCATACATCCATGGTATTTTGCACTGGCACATATACATACAAGCAGTTCAGCACCTGTTTTGACTTTTGACAATGCATAGTCCAATGTATCCATATTCTGGGTTCAAATTCTGGTTAGCTGGTTACGCGTATTCCTCATGGGTGTTGGTAGAGCTGATATTACCAGTAACTGTCACCCATATTTGTAGTTTTCCTATATGTTGCTTGGATGTTTTGAGTTAAAGTCTGTGTGGAACAATCGAATTAGATTCATATAGAACCATTTTTATAGAAAGTTGCTTTTGCTTTATTAAACCAGTGGTTTCACAGAAACTGCTGTGTTTCCTGGAATTTTGTTTCTATTTGCTTGCTATTGTGTTTGTTTTGAAAACATGATTTTTAAAATATGTTTAGGGCATTCCAAGTGCTGGGTCAAATCCTGGTGCTGCTGCTGGTGCCGGTGCCGGTGCTGGTGCCCTTGATGCATTGCGACAACTTCCACAGGTATTATTATATGTTGGTGTAACTTTTATACTAGTTAAAATAATGCATTGCCCTAACAGCTATTTACTTGTTTCTGCTCAGTTCCAAGCGCTGCTTGCATTGGTCCAGGCTAATCCCCAAATCTTGCAGGTGCTAATATAAATCAACTCATAAGTTTCTTGTTGCTTTTCTTTTTCTTTGTAGACATTAAAATGCCAGTGCATATGCTATTTTATGTGACTTGAGCAATTCTGTTGATTCACAGCCAATGCTTCAAGAGCTTGGGAAGCAGAATCCGCAAATCTTGCGGTTGATTCAGGAAAATCAGGCTGAATTTCTCCGTCTGGTGAATGAATCTCCTGATAGTGGCACTGCTGGGGGGTAAGAACCAAGAGAACTACAAAACATGTATTATATTCTAATTGATACACATACAATATTTACATTACATTTTATACGCTCTGGTAAATCAGAAACATACTAGGTCAACTAGCAGCCGCTATGCCACAGGCACTTACAGTTACTCCAGAGGAACGGGAGGCCATTCAGCGGGTATGTTTGCTTTATATGCTATTTTGGATTTTCTAATGAAAGACGATTCGCTGCTTCTGAAATTTTCACACCTCAGTTTCCAAATGTTGACACTTATGTCCAATTTGTGATTTACATCAAGAAACTTACCCAAAATACTCATTAGTCCTTTTTGAAAGTTCTAAATTTGAACTTTTGTTTTATAACCATTGAATGGATATTTTAAATTTTATGACCAGTTAGGGCTGTTCTTTTAACATGAGCCTGTTCTATTATTAGTTCTTTTGTTGAGACAATGGCATCCTTAAATAACAGCTTTTTCATTGATTTAATCATCAGCATGGTTTTCGAGTTTCCTTGTAAACTTTCATGTATACTTTCTTGACAGCTGGAGGCAATGGGGTTCAACCGTGAGCTCGTTTTGGAGGTCTTCTTCGCATGCAACAAGGATGAAGAGCTGGCTGCCAACTATCTTTTGGATCATGGCCATGAGTTTGAGGATCAACAATAG</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA022658